Result of FASTA (omim) for
pF1KE0366
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0366, 634 aa
1>>>pF1KE0366 634 - 634 aa - 634 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8300+/-0.000459; mu= 21.9612+/- 0.028
mean_var=73.0862+/-15.969, 0's: 0 Z-trim(109.4): 98 B-trim: 200 in 1/49
Lambda= 0.150023
statistics sampled from 17515 (17614) to 17515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 9.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) s ( 634) 4296 940.0 0
NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral ( 628) 2350 518.8 2.2e-146
NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 592) 2016 446.5 1.2e-124
XP_011532149 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 493) 1569 349.7 1.4e-95
XP_006710706 (OMIM: 610299,616269) PREDICTED: sodi ( 727) 1519 339.0 3.4e-92
NP_001010898 (OMIM: 610299,616269) sodium-dependen ( 727) 1519 339.0 3.4e-92
NP_877499 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 730) 1498 334.5 7.9e-91
XP_011532150 (OMIM: 138500,242600,605616) PREDICTE ( 321) 1363 305.0 2.7e-82
NP_001139807 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutr ( 623) 1240 278.6 4.6e-74
XP_011536827 (OMIM: 607971) PREDICTED: sodium-depe ( 554) 1218 273.8 1.1e-72
XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599) 980 222.3 3.9e-57
XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 980 222.3 3.9e-57
NP_071800 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and ( 555) 912 207.6 9.9e-53
XP_005258877 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 854 195.1 7.3e-49
NP_054756 (OMIM: 607972) orphan sodium- and chlori ( 736) 854 195.1 7.3e-49
XP_006723231 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 736) 854 195.1 7.3e-49
XP_011525162 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 758) 854 195.1 7.4e-49
XP_016882201 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 818) 854 195.2 7.9e-49
NP_060527 (OMIM: 607971) sodium-dependent neutral ( 289) 819 187.2 7e-47
XP_016865256 (OMIM: 606205) PREDICTED: sodium-depe ( 754) 810 185.6 5.4e-46
XP_011525163 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 589) 727 167.5 1.2e-40
XP_011525161 (OMIM: 607972) PREDICTED: orphan sodi ( 781) 611 142.6 5.2e-33
XP_006719068 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 570) 571 133.8 1.7e-30
XP_005253805 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 571) 571 133.8 1.7e-30
XP_005253804 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 610) 571 133.8 1.7e-30
XP_011519312 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 614) 571 133.8 1.8e-30
NP_003035 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-depe ( 614) 571 133.8 1.8e-30
NP_001116320 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 571 133.8 1.8e-30
NP_001193860 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 571 133.8 1.8e-30
NP_001116319 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 571 133.8 1.8e-30
NP_001315559 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 465) 550 129.1 3.3e-29
NP_001315555 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 522) 550 129.2 3.6e-29
NP_001315557 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 568) 550 129.2 3.9e-29
XP_016857642 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 595) 550 129.2 4e-29
XP_016857641 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 606) 550 129.2 4.1e-29
NP_001315556 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 612) 550 129.3 4.1e-29
XP_011540319 (OMIM: 601019) PREDICTED: sodium- and ( 618) 550 129.3 4.1e-29
NP_001315558 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 633) 550 129.3 4.2e-29
NP_001020016 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 633) 550 129.3 4.2e-29
NP_001248309 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-d ( 637) 550 129.3 4.2e-29
NP_008865 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-depe ( 652) 550 129.3 4.3e-29
NP_964012 (OMIM: 601019) sodium- and chloride-depe ( 706) 550 129.3 4.5e-29
NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520) 544 127.9 8.9e-29
NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635) 544 128.0 1e-28
>>NP_001003841 (OMIM: 138500,234500,242600,608893) sodiu (634 aa)
initn: 4296 init1: 4296 opt: 4296 Z-score: 5025.3 bits: 940.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4296; 100.0% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
610 620 630
>>NP_872438 (OMIM: 610300) sodium-dependent neutral amin (628 aa)
initn: 2343 init1: 2217 opt: 2350 Z-score: 2749.1 bits: 518.8 E(85289): 2.2e-146
Smith-Waterman score: 2350; 55.2% identity (84.7% similar) in 576 aa overlap (32-606:18-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPYL
::::::::::.:.: :: :::::.::::::
NP_872 MAHAPEPDPAACDLGDERPKWDNKAQYLLSCTGFAVGLGNIWRFPYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASMLT
::..:::::.::..: ::.::::....:.:::::::.::.:::..: : :.:.::. .
NP_872 CQTYGGGAFLIPYVIALVFEGIPIFHVELAIGQRLRKGSVGVWTAISPYLSGVGLGCVTL
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pF1KE0 SFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRETL
::...::::::..:..:::.::::.:::::.:: . :.::.:.:: :: :.:::::.::
NP_872 SFLISLYYNTIVAWVLWYLLNSFQHPLPWSSCPPDLNRTGFVEECQGSSAVSYFWYRQTL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIRG
::...:.::::::::.:.::: .:.:.:::.:::::::::..:.:. .::.:::::::::
NP_872 NITADINDSGSIQWWLLICLAASWAVVYMCVIRGIETTGKVIYFTALFPYLVLTIFLIRG
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCEK
::: :::.:...:::::. : .: .::::..:.:::.:::::: :.:.:::: .:.:.:
NP_872 LTLPGATKGLIYLFTPNMHILQNPRVWLDAATQIFFSLSLAFGGHIAFASYNSPRNDCQK
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 DSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENFV
:.:.....: .::.:..:.:.::.::.::. :. :.. :::.::: ::.:: .......
NP_872 DAVVIALVNRMTSLYASIAVFSVLGFKATNDYEHCLDRNILSLINDFDFPEQSISRDDYP
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 DMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLFF
. .. ::. : ::: ...: .. ::.... : ::::.::::. .:: .:.:..:::
NP_872 AVLMHLNATWPKRVAQLPLKACLLEDFLDKSASGPGLAFVVFTETDLHMPGAPVWAMLFF
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 IMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKW-PKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
::: ::::.:::..:.:..:: :. :.: .: :::.::::.:: :: . :::.::.:
NP_872 GMLFTLGLSTMFGTVEAVITPLLDVGVLP-RWVPKEALTGLVCLVCFLSATCFTLQSGNY
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
:: ..:..:.: ::..:: :. .::::::. :: :: .: :..:. .:..::::::::
NP_872 WLEIFDNFAASPNLLMLAFLEVVGVVYVYGMKRFCDDIAWMTGRRPSPYWRLTWRVVSPL
470 480 490 500 510 520
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pF1KE0 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
: : ::. .... . : :. :.: :: ::. :. ::.:. .. :... .: : .:
NP_872 L-LTIFVAYIILLFWKPLRYKAWNPKYELFPSRQEKLYPGWARAACVLLSLLPVLWVPVA
530 540 550 560 570 580
610 620 630
pF1KE0 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
:. .:.
NP_872 ALAQLLTRRRRTWRDRDARPDTDMRPDTDTRPDTDMRPDTDMR
590 600 610 620
>>NP_064593 (OMIM: 138500,242600,605616) sodium- and chl (592 aa)
initn: 1978 init1: 1426 opt: 2016 Z-score: 2358.7 bits: 446.5 E(85289): 1.2e-124
Smith-Waterman score: 2016; 46.3% identity (80.4% similar) in 588 aa overlap (31-615:4-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
.:: : :. :....:... :::::::::::
NP_064 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
::: .:::.:..:..:.:..::.::::::.:.:::.:.::.:.: .: : :.:.:.::..
NP_064 LCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
.::....:::.: .: .::::.:::.::::: :::: :.::: .:: ..: ..:::::.:
NP_064 VSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
:::: :....:..:: ::: :: :.:.: .:: :.:::.::.:..::: :: :.:::
NP_064 LNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
::::.:::::....:::.. .::.: .:..:..:.:::..:.::.::.:.::: :::.
NP_064 GLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
: ..:::.::.:::....::..:. ::.:: :..:.. : : : ::: .: .: :.
NP_064 KHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE0 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQ--TCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSV
... .. :. :... : .:.... :. ::.::::::::.:::: .: .: ::::
NP_064 EQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSV
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LFFIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSG
:.:.::. ::..::.:: ....:: : ..: . :::...::.:: . ::..::...:
NP_064 LYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 QYWLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVS
.::......::... ::.:.. : ..: ::::. ::..:.. : :. . .:.: : ::
NP_064 NYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVS
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PLLMLIIFLFFFVVEV-SQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTI
:::.. .:.:.. . . : :. :: . .. .. :: .. .:. .... .. :
NP_064 PLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKD---YPAYALAVIGLLVASSTMCI
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::::: ::::.. :.:. .:: .:::.. . .: .: .:..::::...:.:::.:.:
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::::. :::. :.:.::.:: :::: ...::..:.::.:. . :.. : :... :
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10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]