Result of FASTA (ccds) for pF1KE0367
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0367, 754 aa
  1>>>pF1KE0367 754 - 754 aa - 754 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4305+/-0.00185; mu= 11.4088+/- 0.106
 mean_var=345.6175+/-98.989, 0's: 0 Z-trim(101.7): 230  B-trim: 382 in 1/49
 Lambda= 0.068988
 statistics sampled from 6408 (6626) to 6408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.204), width:  16
 Scan time:  3.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13        ( 754) 5068 520.6 3.5e-147
CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13       ( 730) 3096 324.3 4.2e-88
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 757) 2689 283.8 6.6e-76
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 724) 2428 257.8 4.3e-68
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 784) 2414 256.5 1.2e-67
CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 626) 2307 245.7 1.7e-64
CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 601) 1906 205.8 1.7e-52
CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 709) 1867 202.0 2.7e-51


>>CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13             (754 aa)
 initn: 5068 init1: 5068 opt: 5068  Z-score: 2755.9  bits: 520.6 E(32554): 3.5e-147
Smith-Waterman score: 5068; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750    
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
              730       740       750    

>>CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13            (730 aa)
 initn: 2973 init1: 2973 opt: 3096  Z-score: 1695.3  bits: 324.3 E(32554): 4.2e-88
Smith-Waterman score: 4853; 96.8% identity (96.8% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-730)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::              
CCDS53 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVL--------------
              250       260       270       280                    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ----------DLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
                  290       300       310       320       330      

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
        340       350       360       370       380       390      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
        400       410       420       430       440       450      

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
        460       470       480       490       500       510      

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
        520       530       540       550       560       570      

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
        580       590       600       610       620       630      

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
        640       650       660       670       680       690      

              730       740       750    
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
        700       710       720       730

>>CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (757 aa)
 initn: 2629 init1: 1919 opt: 2689  Z-score: 1476.2  bits: 283.8 E(32554): 6.6e-76
Smith-Waterman score: 2689; 55.0% identity (79.9% similar) in 716 aa overlap (24-730:8-721)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
                              : .::  : :.   :. .  .:. :::::::.:::::
CCDS43                 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
                               10        20          30        40  

               70        80        90       100              110   
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
       . .::.: ::::: :::.::::..::.  :    ..  ..       : : ::.. . : 
CCDS43 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
             50        60        70        80        90       100  

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
        : :.  ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..::   : .:  :.:..::.: :
CCDS43 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
            110       120       130       140       150       160  

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE0 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
         ::  :: :: .:  :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..:::   : :::
CCDS43 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
            170       180       190       200       210       220  

           240        250       260       270       280       290  
pF1KE0 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
       ::..: ..:: :  :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
CCDS43 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
            230       240       250       260       270       280  

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE0 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
       :. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. :
CCDS43 INHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYL
            290       300       310       320       330       340  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE0 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
        .:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS43 VKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
            350       360       370       380       390       400  

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE0 LANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVG
       ::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..::  .::::  :::::::::.::: .:
CCDS43 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
            410       420       430       440       450       460  

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pF1KE0 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
        ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::  .:
CCDS43 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
            470       480       490       500       510       520  

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pF1KE0 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
       ::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS43 PGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVA
            530       540       550       560       570       580  

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pF1KE0 IFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWI
       ::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.::   .:. .:.:::::::.::.:::
CCDS43 IFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWI
            590       600       610       620       630       640  

            660       670       680       690       700        710 
pF1KE0 PVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QR
       :.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.:::::::::::::  ::. .... ... ::
CCDS43 PIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQR
            650       660       670       680       690       700  

             720       730       740       750                
pF1KE0 KSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS            
       ::. .  .:. . :..:.:                                    
CCDS43 KSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
            710       720       730       740       750       

>>CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (724 aa)
 initn: 2556 init1: 1919 opt: 2428  Z-score: 1336.0  bits: 257.8 E(32554): 4.3e-68
Smith-Waterman score: 2596; 54.6% identity (78.6% similar) in 709 aa overlap (24-730:8-688)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
                              : .::  : :.   :. .  .:. :::::::.:::::
CCDS58                 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
                               10        20          30        40  

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pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
       . .::.: ::::: :::.::        . :.:                  :  : :.  
CCDS58 QLLHCNGVDDCGNQADEDNC--------VVGSV------------------PVQCLCQGL
             50        60                                  70      

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pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
       ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..::   : .:  :.:..::.: :  ::  :
CCDS58 ELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYA
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pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
       : :: .:  :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..:::   : :::::..: .
CCDS58 FRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVL
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pF1KE0 VNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEK
       .:: :  :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.:. . :.
CCDS58 MNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNEN
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pF1KE0 TFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLD
       ::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.
CCDS58 TFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLS
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pF1KE0 LERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILR
       :: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :
CCDS58 LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQR
        320       330       340       350       360       370      

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pF1KE0 IFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYR
       .::::.. .:::::.::: :: .:..::  .::::  :::::::::.::: .: ::.:.:
CCDS58 VFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFR
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pF1KE0 GQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTS
       :.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::  .:::: .: 
CCDS58 GEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTI
        440       450       460       470       480       490      

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE0 VILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNL
       ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.::
CCDS58 TVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINL
        500       510       520       530       540       550      

     600       610       620       630       640       650         
pF1KE0 LAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKI
        ::.:::::: .:: :....:. .::.::   .:. .:.:::::::.::.::::.::::.
CCDS58 AAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKF
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pF1KE0 LSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIK
       :::..:::: :.:::.:::.::.:::::::::::::  ::. .... ... ::::. .  
CCDS58 LSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKG
        620       630       640       650       660       670      

      720       730       740       750                
pF1KE0 KKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS            
       .:. . :..:.:                                    
CCDS58 QKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
        680       690       700       710       720    

>>CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (784 aa)
 initn: 2601 init1: 1919 opt: 2414  Z-score: 1328.1  bits: 256.5 E(32554): 1.2e-67
Smith-Waterman score: 2635; 53.3% identity (77.1% similar) in 743 aa overlap (24-730:8-748)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
                              : .::  : :.   :. .  .:. :::::::.:::::
CCDS75                 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
                               10        20          30        40  

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pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQEC-------
       . .::.: ::::: :::.::::..::.  :    ..  ..       : : ::       
CCDS75 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECSFHFFLF
             50        60        70        80        90       100  

          110                         120       130       140      
pF1KE0 --FLKQYPQC------------------CDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKK
         .:   :.:                  : :.  ::.: . .:..:: .:.::: .::. 
CCDS75 ITLLFLVPHCHHALPLPLDSVVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQW
            110       120       130       140       150       160  

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pF1KE0 NKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFK
       : :..::   : .:  :.:..::.: :  ::  :: :: .:  :::.:: :: :.::.:.
CCDS75 NLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFE
            170       180       190       200       210       220  

        210       220       230       240        250       260     
pF1KE0 DLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLE
       :::.: :::..:: ..:::   : :::::..: ..:: :  :: : .: .::.:.:.:::
CCDS75 DLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLE
            230       240       250       260       270       280  

         270       280       290       300       310       320     
pF1KE0 GNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLF
       ::.:. : : ::.::..:::: . .:.:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .:
CCDS75 GNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIF
            290       300       310       320       330       340  

         330       340       350       360       370       380     
pF1KE0 KDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFK
       :::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::
CCDS75 KDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFK
            350       360       370       380       390       400  

         390       400       410       420       430       440     
pF1KE0 NFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKA
       .:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..
CCDS75 KFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRS
            410       420       430       440       450       460  

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE0 ENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLS
       ::  .::::  :::::::::.::: .: ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.::
CCDS75 ENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILS
            470       480       490       500       510       520  

         510       520       530       540       550       560     
pF1KE0 TEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGN
       :::::::::.:::::.. ::.::  .:::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :
CCDS75 TEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKN
            530       540       550       560       570       580  

         570       580       590       600       610       620     
pF1KE0 FYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTE
       .:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::
CCDS75 YYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATE
            590       600       610       620       630       640  

         630       640       650       660       670       680     
pF1KE0 VRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSA
       .::   .:. .:.:::::::.::.::::.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.:::
CCDS75 IRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSA
            650       660       670       680       690       700  

         690       700        710       720       730       740    
pF1KE0 LNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKIT
       ::::::::::  ::. .... ... ::::. .  .:. . :..:.:              
CCDS75 LNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKP
            710       720       730       740       750       760  

          750                
pF1KE0 LGDSIMKPVS            
                             
CCDS75 DLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
            770       780    

>>CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (626 aa)
 initn: 2214 init1: 1760 opt: 2307  Z-score: 1271.5  bits: 245.7 E(32554): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 2307; 57.5% identity (82.6% similar) in 591 aa overlap (142-730:1-590)

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE0 PQCCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHN
                                     .::. : :..::   : .:  :.:..::.:
CCDS75                               MSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNN
                                             10        20        30

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE0 CIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTG
        :  ::  :: :: .:  :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..:::   : :
CCDS75 KITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYG
               40        50        60        70        80        90

             240        250       260       270       280       290
pF1KE0 LNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPR
       ::::..: ..:: :  :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .
CCDS75 LNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRK
              100       110       120       130       140       150

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 NQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFE
       :.:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::.
CCDS75 NKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFD
              160       170       180       190       200       210

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pF1KE0 SLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFE
        : .:.:: :: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:
CCDS75 YLVKLKSL-LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLE
               220       230       240       250       260         

              420       430       440       450       460       470
pF1KE0 DLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFF
       .:::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..::  .::::  :::::::::.::: 
CCDS75 NLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFV
     270       280       290       300       310       320         

              480       490       500       510       520       530
pF1KE0 VGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSN
       .: ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::  
CCDS75 IGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRC
     330       340       350       360       370       380         

              540       550       560       570       580       590
pF1KE0 IRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYS
       .:::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::
CCDS75 VRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYS
     390       400       410       420       430       440         

              600       610       620       630       640       650
pF1KE0 LGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAIC
       ..::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.::   .:. .:.:::::::.::.:
CCDS75 VAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALC
     450       460       470       480       490       500         

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pF1KE0 WIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-
       :::.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.:::::::::::::  ::. .... ... 
CCDS75 WIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYR
     510       520       530       540       550       560         

     710       720       730       740       750                
pF1KE0 QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS            
       ::::. .  .:. . :..:.:                                    
CCDS75 QRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
     570       580       590       600       610       620      

>>CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (601 aa)
 initn: 2033 init1: 1760 opt: 1906  Z-score: 1055.9  bits: 205.8 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 2109; 55.7% identity (80.0% similar) in 566 aa overlap (167-730:24-565)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE0 NNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNC
                                     .::.: :  ::  :: :: .:  :::.:: 
CCDS75        MVTCTQNMKAALKSLLYHSRNLGYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNR
                      10        20        30        40        50   

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pF1KE0 ITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQ
       :: :.::.:.:::.: :::..:: ..:::   : :::::..: ..:: :  :: : .: .
CCDS75 ITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQH
            60        70        80        90       100       110   

         260       270       280       290       300       310     
pF1KE0 MPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSN
       ::.:.:. .. :.:..:.                        :.::. :..: ::::.::
CCDS75 MPRLHWLVMRKNKINHLN------------------------ENTFAPLQKLDELDLGSN
           120       130                               140         

         320       330       340       350       360       370     
pF1KE0 TITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQP
        : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.:: ::: ::. :::.:
CCDS75 KIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRP
     150       160       170       180       190       200         

         380       390       400       410       420       430     
pF1KE0 MKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLF
       . ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :.::::.. .:::::.:
CCDS75 LMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIF
     210       220       230       240       250       260         

         440       450       460       470       480       490     
pF1KE0 VIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQC
       :: :: .:..::  .::::  :::::::::.::: .: ::.:.::.:.:.: :::::..:
CCDS75 VICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHC
     270       280       290       300       310       320         

         500       510       520       530       540       550     
pF1KE0 RLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVI
       .:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::  .:::: .: ..:: ::..::..: :
CCDS75 QLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFI
     330       340       350       360       370       380         

         560       570       580       590       600       610     
pF1KE0 PFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCS
       :. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.:: ::.:::::: .:: :
CCDS75 PLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYS
     390       400       410       420       430       440         

         620       630       640       650       660       670     
pF1KE0 IQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWI
       ....:. .::.::   .:. .:.:::::::.::.::::.::::.:::..:::: :.:::.
CCDS75 VHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWV
     450       460       470       480       490       500         

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pF1KE0 VIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSS
       :::.::.:::::::::::::  ::. .... ... ::::. .  .:. . :..:.:    
CCDS75 VIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPL
     510       520       530       540       550       560         

          740       750                
pF1KE0 LKLGVLNKITLGDSIMKPVS            
                                       
CCDS75 QEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
     570       580       590       600 

>>CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4              (709 aa)
 initn: 2275 init1: 1565 opt: 1867  Z-score: 1034.3  bits: 202.0 E(32554): 2.7e-51
Smith-Waterman score: 2419; 51.3% identity (74.6% similar) in 716 aa overlap (24-730:8-673)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
                              : .::  : :.   :. .  .:. :::::::.:::::
CCDS58                 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
                               10        20          30        40  

               70        80        90       100              110   
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
       . .::.: ::::: :::.::::..::.  :    ..  ..       : : ::.. . : 
CCDS58 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
             50        60        70        80        90       100  

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
        : :.  ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..::   : .:  :.:..::.: :
CCDS58 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
            110       120       130       140       150       160  

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE0 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
         ::  :: :: .:  :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..:::   : :::
CCDS58 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
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pF1KE0 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
       ::..: ..:: :  :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
CCDS58 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
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pF1KE0 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
       :. . :.::. :..: :..:                                        
CCDS58 INHLNENTFAPLQKLDEFSL----------------------------------------
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pF1KE0 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
               : ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS58 --------EGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
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       ::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..::  .::::  :::::::::.::: .:
CCDS58 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
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pF1KE0 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
        ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::  .:
CCDS58 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
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pF1KE0 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
       ::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS58 PGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVA
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       ::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.::   .:. .:.:::::::.::.:::
CCDS58 IFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWI
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       :.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.:::::::::::::  ::. .... ... ::
CCDS58 PIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQR
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          660       670       680       690       700         




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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