Result of FASTA (omim) for
pF1KE0367
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0367, 754 aa
1>>>pF1KE0367 754 - 754 aa - 754 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3793+/-0.000731; mu= 16.8515+/- 0.044
mean_var=353.2801+/-88.701, 0's: 0 Z-trim(107.6): 445 B-trim: 948 in 1/51
Lambda= 0.068236
statistics sampled from 15167 (15709) to 15167 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 10.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_570718 (OMIM: 219050,606655) relaxin receptor 2 ( 754) 5068 515.5 3.2e-145
NP_001159530 (OMIM: 219050,606655) relaxin recepto ( 730) 3096 321.3 8.8e-87
NP_067647 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 isofor ( 757) 2689 281.3 1e-74
XP_016864007 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 756) 2677 280.1 2.3e-74
XP_016875878 (OMIM: 219050,606655) PREDICTED: rela ( 383) 2586 270.6 8.6e-72
XP_016864010 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 676) 2436 256.3 3.1e-67
NP_001240657 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 724) 2428 255.6 5.5e-67
XP_016864011 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 675) 2424 255.1 7e-67
XP_016864008 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 2414 254.2 1.4e-66
XP_016864009 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 2414 254.2 1.4e-66
NP_001240656 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 784) 2414 254.2 1.5e-66
XP_011530476 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 783) 2402 253.1 3.3e-66
NP_001240659 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 626) 2307 243.5 2e-63
NP_001240661 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 625) 2261 239.0 4.6e-62
XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 1965 210.0 2.9e-53
XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 1956 209.1 5.3e-53
XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 1953 208.8 6.6e-53
XP_016864015 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 601) 1906 204.0 1.5e-51
NP_001240662 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 601) 1906 204.0 1.5e-51
NP_001240658 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 709) 1867 200.3 2.3e-50
XP_016864012 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 385) 1188 133.0 2.3e-30
XP_016864014 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 352) 927 107.2 1.2e-22
XP_011530481 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 412) 913 106.0 3.4e-22
XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 898 104.4 8.8e-22
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 468 62.6 6.4e-09
NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leuc ( 811) 445 60.4 3.3e-08
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 428 58.6 1e-07
XP_011531035 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 729) 415 57.4 2.5e-07
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618) 407 56.5 4e-07
NP_001258 (OMIM: 602178) chondroadherin precursor ( 359) 401 55.4 4.7e-07
XP_011522516 (OMIM: 602178) PREDICTED: chondroadhe ( 440) 401 55.6 5.2e-07
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 401 55.8 5.7e-07
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 401 55.8 5.7e-07
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 401 55.8 5.7e-07
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 399 55.8 7.1e-07
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 398 55.6 7.3e-07
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 399 55.9 7.5e-07
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 399 55.9 7.5e-07
NP_001264156 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 835) 392 55.2 1.3e-06
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 378 53.4 2.6e-06
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 378 53.4 2.6e-06
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 378 53.5 2.7e-06
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 368 52.3 4.6e-06
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 367 52.1 4.9e-06
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 367 52.1 4.9e-06
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 365 52.0 6e-06
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 365 52.0 6e-06
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669) 365 52.4 7.2e-06
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695) 365 52.4 7.3e-06
NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat trans ( 518) 360 51.7 9.1e-06
>>NP_570718 (OMIM: 219050,606655) relaxin receptor 2 iso (754 aa)
initn: 5068 init1: 5068 opt: 5068 Z-score: 2728.1 bits: 515.5 E(85289): 3.2e-145
Smith-Waterman score: 5068; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
730 740 750
>>NP_001159530 (OMIM: 219050,606655) relaxin receptor 2 (730 aa)
initn: 2973 init1: 2973 opt: 3096 Z-score: 1679.0 bits: 321.3 E(85289): 8.8e-87
Smith-Waterman score: 4853; 96.8% identity (96.8% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVL--------------
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ----------DLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
640 650 660 670 680 690
730 740 750
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
700 710 720 730
>>NP_067647 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 isoform 1 (757 aa)
initn: 2629 init1: 1919 opt: 2689 Z-score: 1462.4 bits: 281.3 E(85289): 1e-74
Smith-Waterman score: 2689; 55.0% identity (79.9% similar) in 716 aa overlap (24-730:8-721)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
NP_067 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
NP_067 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
NP_067 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
NP_067 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
NP_067 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. :
NP_067 INHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
.:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
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::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .:
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:.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::
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: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
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. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
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pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
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:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
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XP_016 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
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:::::::::::::::::::::.
XP_016 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHMC
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::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .: ::.:.::.:.:.: ::
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.:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.::::.::::.:::..::::
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:.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::::. . .:. . :..:
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.:
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. .::.: ::::: :::.:: . :.: : : :.
NP_001 QLLHCNGVDDCGNQADEDNC--------VVGSV------------------PVQCLCQGL
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::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: : :: :
NP_001 ELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYA
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pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::::..: .
NP_001 FRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVL
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pF1KE0 VNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEK
.:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.:. . :.
NP_001 MNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNEN
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pF1KE0 TFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLD
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NP_001 TFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLS
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:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :
NP_001 LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQR
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NP_001 VFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFR
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pF1KE0 GQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTS
:.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:::: .:
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pF1KE0 VILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNL
..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.::
NP_001 TVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINL
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NP_001 AAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKF
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pF1KE0 LSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIK
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NP_001 LSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKG
620 630 640 650 660 670
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pF1KE0 KKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
.:. . :..:.:
NP_001 QKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
680 690 700 710 720
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.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]