FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0377, 494 aa 1>>>pF1KE0377 494 - 494 aa - 494 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9818+/-0.000364; mu= 20.0147+/- 0.023 mean_var=66.3834+/-12.985, 0's: 0 Z-trim(113.3): 176 B-trim: 82 in 1/52 Lambda= 0.157414 statistics sampled from 22469 (22650) to 22469 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16 Scan time: 8.870 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 3305 759.6 0 NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 3109 715.1 1.1e-205 NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 3033 697.9 1.7e-200 NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 2329 538.0 2.1e-152 NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1867 433.1 8.9e-121 NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1788 415.1 2.2e-115 XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1788 415.2 2.5e-115 NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 1746 405.6 1.7e-112 NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 1709 397.2 5.6e-110 NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 1702 395.6 1.7e-109 XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 1697 394.5 3.7e-109 NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 1697 394.5 3.7e-109 XP_016881872 (OMIM: 608054) PREDICTED: cytochrome ( 293) 1682 390.9 2.6e-108 NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1642 382.0 2.2e-105 NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 1620 377.0 6.8e-104 XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1614 375.6 1.7e-103 XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1589 369.9 9.1e-102 XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1589 369.9 9.1e-102 XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1589 370.0 1e-101 NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1451 338.6 2.2e-92 NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1451 338.6 2.2e-92 XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1429 333.6 6.9e-91 XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1427 333.1 9.7e-91 XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1419 331.3 3.3e-90 XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1416 330.6 5e-90 NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 1336 312.5 1.8e-84 NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 1330 311.0 3.8e-84 NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1139 267.7 5.3e-71 XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 1133 266.2 8.9e-71 XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 1122 263.9 7.6e-70 XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1122 263.9 7.7e-70 XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 1117 262.7 1.6e-69 NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1116 262.5 1.9e-69 NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1105 260.0 1.1e-68 XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1071 252.3 2.6e-66 XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1062 250.2 9.3e-66 XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 1038 244.8 3.7e-64 NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 1036 244.4 6.2e-64 XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 995 235.0 3.4e-61 XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 992 234.3 5.4e-61 XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 992 234.3 5.5e-61 XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 930 220.3 1.1e-56 XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 906 214.8 3.7e-55 NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 869 206.4 1.4e-52 >>NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Homo sa (494 aa) initn: 3305 init1: 3305 opt: 3305 Z-score: 4054.3 bits: 759.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3305; 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NP_085 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPQDFIDSFLIHMQEEEKNPNTEFYLKNLMMSTLNLFI 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::: NP_085 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRTKMPYMEAVIHEIQ 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK ::::..::.::.::.::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::: : NP_085 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLDDK 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF ::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::.:: ::::::::::::: : NP_085 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVVF 370 380 390 400 410 420 490 pF1KE0 ATIPRNYTMSFLPR :::::::::::::: NP_085 ATIPRNYTMSFLPR 430 440 >>NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B6 pr (491 aa) initn: 1867 init1: 1867 opt: 1867 Z-score: 2289.4 bits: 433.1 E(85289): 8.9e-121 Smith-Waterman score: 1867; 53.4% identity (84.5% similar) in 489 aa overlap (6-494:3-491) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK : .. .:: :: ..:. : :. ... .::::: :::..:: ::.. . . .:... NP_000 MELSVLLFLALLTGLLLLLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLLQMDRRGLLKSFLR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN . :.:: :::.::::: ::.::: .:..:::::.:: :::::. : : .:.:::: :.: NP_000 FREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGKIAMVDPFFRGYGVIFAN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN :.: : :::::..:.: ::.:::..:::::::: ::. :: ..:: .::::... ..: NP_000 GNRWKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLIEELRKSKGALMDPTFLFQSITAN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE .: ::::: :: :.:.:::..: .. .:.. .. :::.:.::. .:..:: ..:..:. NP_000 IICSIVFGKRFHYQDQEFLKMLNLFYQTFSLISSVFGQLFELFSGFLKYFPGAHRQVYKN 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF :: .. .:...::....::::..:.:.::..:..:..:..: ..:: .:: ..::.::: NP_000 LQEINAYIGHSVEKHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEFSHQNLNLNTLSLFF 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ :::::.::::::::::..:.:.: .:..::..::: .: :...::::::::::::.::: NP_000 AGTETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDRAKMPYTEAVIYEIQ 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK ::.:.::::. : :.. :.:: ...:: :::: .:...:.::..: .: :::.:::: . NP_000 RFSDLLPMGVPHIVTQHTSFRGYIIPKDTEVFLILSTALHDPHYFEKPDAFNPDHFLDAN 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE0 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF : .::..::.:::.::: :.:::.:: :::::::::.::: . :: .:.:::..:.. : NP_000 GALKKTEAFIPFSLGKRICLGEGIARAELFLFFTTILQNFSMASPVAPEDIDLTPQECGV 420 430 440 450 460 470 490 pF1KE0 ATIPRNYTMSFLPR . :: .: . :::: NP_000 GKIPPTYQIRFLPR 480 490 >>NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precursor (491 aa) initn: 1772 init1: 1772 opt: 1788 Z-score: 2192.4 bits: 415.1 E(85289): 2.2e-115 Smith-Waterman score: 1788; 53.0% identity (82.4% similar) in 489 aa overlap (6-494:9-491) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNS :::. :.:: ...: : ...::::::: :: ..:: : : ...: .: NP_000 MDSISTAILLLLLALVCL-LLTLSS-----RDKGKLPPGPRPLSILGNLLLLCSQDMLTS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 LMKISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVA : :.:..:: ..:.:::::::::: :..:::::::::.:::::::. .: . :: :.: NP_000 LTKLSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 FSNGERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRT ::.:.: : ::.::: ::.::.:::.::::: ::..::. :: :.: .:::: :::. NP_000 FSSGDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAELRKTEGEPFDPTFVLSRS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 VSNVISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQA :::.: :..::.::::.:...:...:.. .::. .. :.::..: :.. .:::.:. NP_000 VSNIICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELYDIFPSLLDWVPGPHQRI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 FKELQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLN :.... :.:.::..:. .: .::: ::::::. :: .: ::...: ..:.. .:.::: : NP_000 FQNFKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LFFAGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIH :.:.::.::::::...:: :::.:.:.:.:.:::: :.:. : : ..::: ::::.:::: NP_000 LLFGGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARLPALKDRAAMPYTDAVIH 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 EIQRFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFL :.:::.:..::.: :::..:: :: :..::::.:. .:..: :: : .:..:::.::: NP_000 EVQRFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 DKKGQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKH : . .:::: ::.::: :.: :.::.::::::::..:.:.:.: .. .:.:::..: NP_000 DANQSFKKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFLYLTAILQSFSLQPLGAPEDIDLTPLS 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE0 VGFATIPRNYTMSFLPR :....:: . . . :: NP_000 SGLGNLPRPFQLCLRPR 480 490 >>XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome P450 (566 aa) initn: 1772 init1: 1772 opt: 1788 Z-score: 2191.5 bits: 415.2 E(85289): 2.5e-115 Smith-Waterman score: 1788; 53.0% identity (82.4% similar) in 489 aa overlap (6-494:84-566) 10 20 30 pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPP :::. :.:: ...: : ...::::: XP_016 WKGGISDVLSHFALHTPAAAFTMDSISTAILLLLLALVCL-LLTLSS-----RDKGKLPP 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 GPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMKISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQA :: :: ..:: : : ...: .:: :.:..:: ..:.:::::::::: :..:::::::::. XP_016 GPRPLSILGNLLLLCSQDMLTSLTKLSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQG 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 EEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSNGERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGF :::::::. .: . :: :.:::.:.: : ::.::: ::.::.:::.::::: ::..: XP_016 EEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIAFSSGDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSF 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 LIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSNVISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATS :. :: :.: .:::: :::.:::.: :..::.::::.:...:...:.. .::. .. XP_016 LLAELRKTEGEPFDPTFVLSRSVSNIICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSP 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 TGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKELQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRM :.::..: :.. .:::.:. :.... :.:.::..:. .: .::: ::::::. :: .: XP_016 WGELYDIFPSLLDWVPGPHQRIFQNFKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKM 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 QEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFFAGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVI ::...: ..:.. .:.::: ::.:.::.::::::...:: :::.:.:.:.:.:::: :. XP_016 AEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHNLLFGGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVV 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 GKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQRFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPML :. : : ..::: ::::.:::::.:::.:..::.: :::..:: :: :..::::.:. .: XP_016 GRARLPALKDRAAMPYTDAVIHEVQRFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLL 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 GSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKKGQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTT ..: :: : .:..:::.:::: . .:::: ::.::: :.: :.::.::::::::..:. XP_016 NTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFLDANQSFKKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFLYLTA 470 480 490 500 510 520 460 470 480 490 pF1KE0 IMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGFATIPRNYTMSFLPR :.:.: .. .:.:::..: :....:: . . . :: XP_016 ILQSFSLQPLGAPEDIDLTPLSSGLGNLPRPFQLCLRPR 530 540 550 560 >>NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C19 p (490 aa) initn: 1741 init1: 1714 opt: 1746 Z-score: 2140.9 bits: 405.6 E(85289): 1.7e-112 Smith-Waterman score: 1746; 51.9% identity (82.3% similar) in 486 aa overlap (8-493:4-489) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK .:.:. ::. ..:.:.::: ..:::::::::::: ::: ::.. ... .:: . 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NP_000 LAFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ :::::.::::::..:::.::::: :::.:::.::::.::.: ..::..::::.::.::.: NP_000 AGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQ 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK :. :..: .: : :. :.:::....:::: .. : :::.: . : ::. :.:.::::. 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