Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0379
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0379, 794 aa
1>>>pF1KE0379 794 - 794 aa - 794 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4178+/- 0.001; mu= 19.7407+/- 0.061
mean_var=69.9862+/-14.002, 0's: 0 Z-trim(104.6): 193 B-trim: 6 in 1/49
Lambda= 0.153309
statistics sampled from 7806 (8004) to 7806 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 5157 1150.4 0
CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 4259 951.7 0
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 4028 900.7 0
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3994 893.1 0
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 3993 892.9 0
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 3935 880.1 0
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3926 878.1 0
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 3923 877.4 0
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 3857 862.8 0
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3817 854.0 0
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3813 853.1 0
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3779 845.6 0
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 3712 830.8 0
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3702 828.6 0
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 3695 827.0 0
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3654 817.9 0
CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2567 577.5 3e-164
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2172 490.2 6.6e-138
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2145 484.2 4.1e-136
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2104 475.1 2.1e-133
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2104 475.2 2.2e-133
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2102 474.7 2.7e-133
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2102 474.7 3e-133
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2101 474.5 3.2e-133
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2101 474.5 3.5e-133
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2098 473.8 5e-133
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2098 473.8 5.6e-133
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 2096 473.4 6.9e-133
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 2096 473.4 7.6e-133
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2082 470.3 5.8e-132
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2082 470.3 6.5e-132
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2078 469.4 1.1e-131
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2078 469.4 1.2e-131
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2068 467.2 4.9e-131
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2068 467.2 5.5e-131
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2061 465.6 1.4e-130
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2061 465.6 1.6e-130
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2057 464.7 2.6e-130
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2057 464.8 3e-130
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 2054 464.1 4.2e-130
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 2054 464.1 4.7e-130
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2052 463.6 6e-130
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2052 463.7 6.6e-130
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2047 462.5 1.3e-129
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2047 462.5 1.4e-129
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 2044 461.9 2e-129
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 2044 461.9 2.2e-129
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2039 460.7 4.2e-129
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2039 460.8 4.7e-129
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 2033 459.4 1.1e-128
>>CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 (794 aa)
initn: 5157 init1: 5157 opt: 5157 Z-score: 6158.5 bits: 1150.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5157; 99.9% identity (100.0% similar) in 794 aa overlap (1-794:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQASL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDVNQPFEINAITGEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDVNQPFEINAITGEIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENLPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNITIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNITIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSGI
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSGI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 NAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPALS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAWL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAASV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 GRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTERE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE0 MEETPTSRNSFPFS
::::::::::::::
CCDS42 MEETPTSRNSFPFS
790
>>CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 (658 aa)
initn: 4259 init1: 4259 opt: 4259 Z-score: 5086.3 bits: 951.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4259; 99.8% identity (100.0% similar) in 658 aa overlap (137-794:1-658)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 VLLENPLQFFQASLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGL
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QRYTISSNPHFHVLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QRYTISSNPHFHVLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSE
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 IQIQVLDINDNVPEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IQIQVLDINDNVPEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDV
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NQPFEINAITGEIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NQPFEINAITGEIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELT
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 MSFFISLIPENLPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MSFFISLIPENLPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGA
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 LDRESRAEYNITITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS78 LDRESRAEYNITITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPAL
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 HIGSVSATDRDSGINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HIGSVSATDRDSGINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFE
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 FRVGATDRGSPALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FRVGATDRGSPALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTK
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 VVAVDGDSGQNAWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VVAVDGDSGQNAWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNG
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 EPPRSATATLHVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EPPRSATATLHVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLF
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 VAVRLCRRSRAASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VAVRLCRRSRAASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLK
580 590 600 610 620 630
770 780 790
pF1KE0 PIMPNFPPQGTEREMEETPTSRNSFPFS
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PIMPNFPPQGTEREMEETPTSRNSFPFS
640 650
>>CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 4023 init1: 4023 opt: 4028 Z-score: 4808.9 bits: 900.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4028; 78.6% identity (91.7% similar) in 784 aa overlap (9-791:10-792)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFF-ILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGEL
.:::: :. :::.:: :.:::...::. :::::: ::::.::::: ::::
CCDS42 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLW-EAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
:.::::. .:::.. ::.: .: .::: :::::: .::.::::.: ::.:::::.::::.
CCDS42 ATRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
.:.. :::::::::: .:::::: : :.:: .::::.:.:.: ::: .: :::: : :::
CCDS42 DLQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
: :.::..:::.::::::: :::::.:.: ::: :::::.::::::. :.: ::: :::.
CCDS42 VATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDVNQPFEINAITGE
::: : .::.:::::.::.:::..:::::::::..:.:.::::: :.:.::: :. :.:
CCDS42 PEFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDEVTQPFVIDEKTAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENL
:::..::::: :.:.. :::::::::::.....:.:::::::::::: . : :::
CCDS42 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNIT
:: .:::::::: ::: : ..::::.:.:::::.:...:::::::. .:::::.::::::
CCDS42 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:::::.:::::::...::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPA
: ::::::::::::.::: :.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 LSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 WLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::: :::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTE
::: ::::::::::::::::::::::::.:.::::: : ..::::::::.::. :::.
CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KE0 REMEETPTSRNSFPFS
.:. .: . ::::
CCDS42 EEIGKTAAFRNSFGLN
780 790
>>CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 (796 aa)
initn: 2828 init1: 2828 opt: 3994 Z-score: 4768.3 bits: 893.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3994; 77.9% identity (90.1% similar) in 787 aa overlap (9-794:10-796)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELA
..::: ...... . .:::: .::: :: :.: ..:::.::::::: :::
CCDS42 MEAGGERFLRQRQVLLLFVFLGGSLAGSESRRYSVAEEKEKGFLIANLAKDLGLRVEELA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQAS
.:::.:: :::.::.:.. :: ::::::::::::::: ::::.: ::.::.:::::
CCDS42 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHV
::. :.:::.: : :: ::: : :.:: ..:: :.:::.: :.:: :::. : ::::
CCDS42 LRIIDVNDHSPVFFENEMHLKILESTLPGTVIPLGNAEDLDVGRNSLQNYTITPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVP
:::.: .:::.::::::: :: ::::.: ::: ::::::::::::..:.:::::::::.:
CCDS42 LTRSRRDGRKYPELVLDKALDPEEQPELSLTLTALDGGSPPRSGTAQINIQVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAITGE
:::: :::. : ::.:..:...:::: :::.:::: .:::.:.. ... . :..: :::.
CCDS42 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENL
..: : :.:: :.::.::.:: :::::::: ...:.:.::::: ::::.: : ::::
CCDS42 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNIT
: ..::::::: ::: : .:.:::::::::.:.::::::::::.:::::::.:.:::::
CCDS42 GETVLAVFSVSDLDSGDNGRVMCSIENNLPFFLKPSVENFYTLVSEGALDRETRSEYNIT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::.::::::::::. .::: :::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITDLGTPRLKTKYNITVLVSDVNDNAPAFTQISYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPA
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 LSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 WLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTE
:::: :::::::::..:::::::::::::::.::::::: ::::::::::.::: ::.:
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE0 REMEETPTSRNSFPFS
: : .:. :.:: ::
CCDS42 RVSEANPSFRKSFEFS
790
>>CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 2809 init1: 2809 opt: 3993 Z-score: 4767.1 bits: 892.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3993; 77.7% identity (90.4% similar) in 785 aa overlap (11-794:11-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELAS
::: :::... ..: : :.::::::::::.:::.:.::::: .:::::
CCDS42 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQASL
:.:::. ..:.::.: :: :::: :::::::::: ::::: :::.:: :.::::. :
CCDS42 RSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHVL
..:::::.: :: ::.:::: : ..:: .::: .:.:::.::::::.:::: : :::.:
CCDS42 LIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVPE
:::.:::.:.:.:: ::::::::::.. :::.:::::::::::: ..: ..:::::.::
CCDS42 TRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 FAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAITGEI
:.. : .:: ::.:: : .. : :::.:::.::.:::.:::. :...: : :: .::::
CCDS42 FVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENLP
:.: ::::.:.:: :..::::::::::: ..:..:.::::: ::: .: . : :::: :
CCDS42 LLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENAP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNITI
: .:..: . : :::.: ..:::: .::::.:.:...:::::::: ::::. :::::::
CCDS42 ETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNITI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
.:::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 INAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPAL
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::
CCDS42 TNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
:::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAS
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 VGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTER
::: ::::::::::::::::::::::::::.::::: : :.::::::::.::. : : :
CCDS42 VGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTGR
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE0 EMEETPTSRNSFPFS
:..:.: :::. ::
CCDS42 EVKENPKFRNSLVFS
790
>>CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 4093 init1: 2741 opt: 3935 Z-score: 4697.8 bits: 880.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3935; 76.2% identity (89.6% similar) in 787 aa overlap (9-794:12-798)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGE
:.::: .:..:. .... . .::: ::::::.::::: :::::..::
CCDS42 MEAGEGKERVPKQRQVLIFFVLLGIAQASCQPRHYSVAEETESGSFVANLLKDLGLEIGE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
:: :::::: ::...::::: :: ::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS42 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ASLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHF
: ::.::.:::.: : .:.:::: : :: : .. :.:::.:.:.:: :::: : ::
CCDS42 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HVLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDN
:. .. .: .:.:::.. :::::::..:::: ::::::::::::. ..:.:.:::::
CCDS42 HLNLQDSLDGIILPQLVLNRALDREEQPEIRLTLTALDGGSPPRSGTALVRIEVVDINDN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VPEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAIT
:::::. :::.:.::..:.:: : ::::::: :. :..:::. :. .:. . :...: .
CCDS42 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 GEIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPE
::. ::. :::: ::.: :...::::::::: : . :.:.:.::: :::::: .:. :::
CCDS42 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 NLPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYN
:: . .::::::: ::: : ...:::...:::.:.:::::::::: :::::.:.:::
CCDS42 NLQDTLIAVFSVSDPDSGDNGRMVCSIQDDLPFFLKPSVENFYTLVISTALDRETRSEYN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ITITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR
:::::::.:::::::...::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITVTDFGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 DSGINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGS
::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::.:::::::.::::
CCDS42 DSGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGAADRGS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 NAWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATL
::::::::::::: :::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::
CCDS42 NAWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLRERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 HVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
::::::::::::: :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HVLLVDGFSQPYLLLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 AASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQG
:::::: :::::::::..:::::::::::::::.::::::: ::::::::::.::: ::
CCDS42 AASVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQG
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE0 TEREMEETPTSRNSFPFS
.:: : .:. :.:: :.
CCDS42 AERVSEANPSFRKSFEFT
790
>>CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 (787 aa)
initn: 3916 init1: 2772 opt: 3926 Z-score: 4687.1 bits: 878.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3926; 77.3% identity (90.6% similar) in 775 aa overlap (9-782:10-784)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELA
..::: ...::. .: : .:::.:::: :.:::::..:::: :::::
CCDS42 MEPAGERFPEQRQVLILLLLLEVTLAGWEPRRYSVMEETERGSFVANLANDLGLGVGELA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQAS
:::::: . :.: ::.: :: .:.::::::::.::: ::::.. :::::..::. :.:
CCDS42 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHV
: : :::::.:::: ::: ::: : . : .:::: :.:::.:::..: :.:: : ::::
CCDS42 LLVTDINDHSPEFPEREMTLKIPETSSLGTVFPLKKARDLDVGSNNVQNYNISPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVP
::.:..:::.:::::: :::::: .::::: :.:::::::::: .: : ::: :::.:
CCDS42 STRTRGDGRKYPELVLDTELDREEQAELRLTLTAVDGGSPPRSGTVQILILVLDANDNAP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALF-QVDDVNQPFEINAITGE
::.: :::.:::::.:.::::. :::::::.:. :..::.:. . .....:::.....::
CCDS42 EFVQALYEVQVPENSPVGSLVVKVSARDLDTGTNGEISYSLYYSSQEIDKPFELSSLSGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENL
::: : :::: ..:::.:.::.::::::::::. :.::::::: :::..: . : ::::
CCDS42 IRLIKKLDFETMSSYDLDIEASDGGGLSGKCSVSVKVLDVNDNFPELSISSLTSPIPENS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNIT
:: ::.: . : :::.: ..::::....:: :.::::::: ::::::::::.:::::::
CCDS42 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITDLGTPRLKTEQSITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPA
: :::::::::::.::::::.::::::.::::::::.::::::::.::::::::::: ::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPRDPHLPLTSLVSINTDNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGATDRGFPA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 LSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 WLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDVAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVFLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTE
:::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::::::.::. : ..
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE0 REMEETPTSRNSFPFS
:. :
CCDS42 RKSEFLE
>>CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 (776 aa)
initn: 4083 init1: 2729 opt: 3923 Z-score: 4683.6 bits: 877.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3923; 77.7% identity (91.5% similar) in 768 aa overlap (9-774:10-776)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQV-AFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGEL
..::: .::.:: : : .:.: .:::.:::: :.::::: ::::: . :.
CCDS42 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSG-AGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
..: ::.. .::.::::. :: :::.::::::::::: ::::.: ::::.::::..:::
CCDS42 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
::: :::::.: : .::.::: : . : :::. : :::.:::..: : :: . ::.
CCDS42 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
:: .. .:::.::::::: :::::.::::::: ::::::::::::....:.:.:::::.
CCDS42 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQ-VDDVNQPFEINAITG
::: : .:..:.:::.:::::: ::::::::.:. ::.::.::: .:... .:.: .::
CCDS42 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 EIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPEN
:.:::: .::: . ::.: ..:::::::::::.:...:.::::: :..::: . : ::::
CCDS42 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNI
:::.:::::::: :::.: ..: ::...:::::.:::.:::::::: :::::.::::::
CCDS42 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:.::::.:::::::...::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSP
:: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 ALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
::: :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS42 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
::::::::::.::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 ASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGT
::::: :.:::::::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.::: :
CCDS42 ASVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KE0 EREMEETPTSRNSFPFS
>>CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 2783 init1: 2783 opt: 3857 Z-score: 4604.5 bits: 862.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3857; 75.4% identity (88.9% similar) in 784 aa overlap (9-791:10-793)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGELA
.:::: .:..:. ...:.:: .::: :::: :.:::::..:::: : ::.
CCDS42 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQAS
:: :::: :...:..: : .:::::::::.::::::::::: :::.::::::::.
CCDS42 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFHV
: :.:::::.: : .:.:.:::: : : : .. :.:::.:::.:: :::: : ::..
CCDS42 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNVP
. :. . .::::::. :: :.. .::::: :.::::::.:::. . :.:::::::.:
CCDS42 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAITGE
:: : :::.::::. :::: . :.::.:::::..::.::..:.. .:. . :::: :.::
CCDS42 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENL
. ::. :::: :::: ....:::::::::::.:.:.:.:.::: ::.:.: . . ::::
CCDS42 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNIT
: ::.::. : ::: : ..::::..::::.:.:. .::.:::.: ::::::.::::::
CCDS42 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 ITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:::::::::::::. .::: .::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSPA
: ::::.:::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 LSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 WLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGTE
:::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::: ::::::::::.::: . :
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE0 REMEETPTSRNSFPFS
:.: : . ::::
CCDS42 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
790
>>CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 3198 init1: 3198 opt: 3817 Z-score: 4556.7 bits: 854.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3817; 73.7% identity (89.8% similar) in 792 aa overlap (5-794:6-796)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMQTKVQNKKRQVAFFILLMLWGEVGS-ESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGEL
:. ..::: : .::. . .:. : .:::.::::...::.::.:::::. :.
CCDS42 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
. ::.::: .::. :::.. .: :::::::::::.::: :::::: ::::::.:..::::
CCDS42 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
:.: :::::.: : ..::.:.:: . :: :::: :.:::.:.:... : :: : .:.
CCDS42 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTTFPLKNAEDLDVGQNNIENYIISPNSYFR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
::::.::.:::.::::::: :::::. .::::: ::::::::::::... :.:::.:::.
CCDS42 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVLDVNDNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQV-DDVNQPFEINAITG
::: : .:..:. :..:.: ::. ::: :.:.: :..::.:::. ..... :.:: .::
CCDS42 PEFEQPFYRVQISEDSPVGFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASEEIGKTFKINPLTG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 EIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPEN
::.:.: ::::..:::.:..:: :.: .::::.....:.::::.:::.::: : : ::::
CCDS42 EIELKKQLDFEKLQSYEVNIEARDAGTFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNI
:: .::.::::: :::.: .. :::...:::::. :.::::::.:: :::::::::::
CCDS42 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLK-SAENFYTLLTERPLDRESRAEYNI
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 TITVTDLGTPRLKTQQSITVQVSDVNDNVPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:::::::::: : :: ..:: ..:::::.:::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 TITVTDLGTPMLITQLNMTVLIADVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIRSVSATDRD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQSFEFRVGATDRGSP
:: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:.:::::.:.:::
CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLTSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGASDHGSP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 ALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
:::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSSEALVRVVVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
:::::::::::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPTQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 ASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGT
::::: :::::.::::::.::: ::::::::.:::.::: ::::::::::.::::::
CCDS42 ASVGRCLVPEGPLPGHLVDMSGTRTLSQSYQYEVCLAGGSGTNEFKFLKPIIPNFPPQCP
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KE0 EREMEETPTSRNSFPFS
.:.. . : :.: :.
CCDS42 GKEIQGNSTFPNNFGFNIQ
780 790
794 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:22:03 2016 done: Thu Nov 3 13:22:04 2016
Total Scan time: 3.640 Total Display time: 0.260
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]