Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0383, 1048 aa
1>>>pF1KE0383 1048 - 1048 aa - 1048 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9977+/-0.000946; mu= 18.0088+/- 0.057
mean_var=81.3464+/-16.335, 0's: 0 Z-trim(106.1): 67 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.142202
statistics sampled from 8731 (8798) to 8731 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 4.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12937.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1048) 7165 1480.5 0
CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1029) 5794 1199.2 0
CCDS7776.1 NLRP14 gene_id:338323|Hs108|chr11 (1093) 2168 455.3 3.2e-127
CCDS33119.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19 (1043) 1571 332.8 2.3e-90
CCDS82401.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19 (1036) 1561 330.8 9.4e-90
CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1040) 1543 327.1 1.2e-88
CCDS54318.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1039) 1539 326.3 2.2e-88
CCDS12913.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1062) 1534 325.2 4.5e-88
CCDS12938.1 NLRP5 gene_id:126206|Hs108|chr19 (1200) 1496 317.5 1.1e-85
CCDS12936.1 NLRP4 gene_id:147945|Hs108|chr19 ( 994) 1346 286.7 1.7e-76
CCDS33109.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 ( 980) 1280 273.1 2e-72
CCDS46183.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 (1037) 1280 273.1 2.1e-72
CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1004) 1262 269.4 2.7e-71
CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1061) 1260 269.0 3.7e-71
CCDS62785.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19 (1062) 1255 268.0 7.6e-71
CCDS12912.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19 (1009) 1045 224.9 6.8e-58
CCDS44346.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 979) 1042 224.3 1e-57
CCDS1632.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 (1036) 1042 224.3 1.1e-57
CCDS1633.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 922) 1037 223.3 2e-57
CCDS44347.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1 ( 979) 1037 223.3 2.1e-57
CCDS12934.1 NLRP9 gene_id:338321|Hs108|chr19 ( 991) 1016 219.0 4.1e-56
CCDS12935.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19 (1033) 972 209.9 2.2e-53
CCDS74458.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19 ( 934) 967 208.9 4.2e-53
CCDS60680.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11 ( 891) 711 156.4 2.6e-37
CCDS7693.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11 ( 892) 707 155.5 4.6e-37
CCDS32537.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1375) 658 145.6 7e-34
CCDS58508.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1399) 658 145.6 7.1e-34
CCDS42245.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1429) 658 145.6 7.3e-34
CCDS42244.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1443) 658 145.6 7.3e-34
CCDS42246.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17 (1473) 658 145.6 7.4e-34
CCDS7784.1 NLRP10 gene_id:338322|Hs108|chr11 ( 655) 635 140.7 9.8e-33
CCDS7697.1 RNH1 gene_id:6050|Hs108|chr11 ( 461) 393 91.0 6.4e-18
CCDS73817.1 NLRC3 gene_id:197358|Hs108|chr16 (1065) 377 87.9 1.3e-16
CCDS10746.1 NOD2 gene_id:64127|Hs108|chr16 (1040) 285 69.0 6e-11
>>CCDS12937.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1048 aa)
initn: 7165 init1: 7165 opt: 7165 Z-score: 7938.1 bits: 1480.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7165; 100.0% identity (100.0% similar) in 1048 aa overlap (1-1048:1-1048)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE0 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
1030 1040
>>CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19 (1029 aa)
initn: 6115 init1: 5768 opt: 5794 Z-score: 6418.2 bits: 1199.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6988; 98.2% identity (98.2% similar) in 1048 aa overlap (1-1048:1-1029)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
490 500 510 520 530 540
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pF1KE0 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LERLS-------------------QSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
950 960 970 980 990 1000
1030 1040
pF1KE0 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
1010 1020
>>CCDS7776.1 NLRP14 gene_id:338323|Hs108|chr11 (1093 aa)
initn: 3221 init1: 1196 opt: 2168 Z-score: 2397.5 bits: 455.3 E(32554): 3.2e-127
Smith-Waterman score: 2168; 37.6% identity (68.2% similar) in 974 aa overlap (40-1005:14-981)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 TPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLLLTELSTGTM
:..::......:::. :: :.: :
CCDS77 MADSSSSSFFPDFGLLLYLEELNKEELNTFK-LFLKETMEPEH
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PIT-WDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRREINAILPTL
.: :..:. : ....:. . .::..::.:. .::. :: .: ...::: :.
CCDS77 GLTPWNEVKKARREDLANLMKKYYPGEKAWSVSLKIFGKMNLKDLCERAKEEINWSAQTI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQGVHRHEEY
:.: ..:::: . .:. : .:.. . ::: :: . :. .:: . ... ..
CCDS77 GPDDAKAGETQED-QEAVLGDGTEYRNRIKEKFCITWDKKSLAGKPEDFHHGIAEKDRKL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCAFYFHCQEV
: :. : ::. :..::: :.::: :..:.:..::....: .. .::.. .:.
CCDS77 LEHLFDVDVKTGAQPQIVVLQGAAGVGKTTLVRKAMLDWAEGSLYQQRFKYVFYLNGREI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLEDLSEDWRQ
:: ..::..:: . ::... . .:: .:..::...:.:.::. .. . : ::: :
CCDS77 NQLKERSFAQLISKDWPSTEGPIEEIMYQPSSLLFIIDSFDELNFAFEEPEFALCEDWTQ
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 KLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTMEKIKYFQM
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CCDS77 EHPVSFLMSSLLRKVMLPEASLLVTTRLTTSKRLKQLLKNHHYVELLGMSEDAREEYIYQ
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pF1KE0 YFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSCPNATSVFV
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CCDS77 FFEDKRWAMKVFSSLKSNEMLFSMCQVPLVCWAACTCLKQQMEKGGDVTLTCQTTTALFT
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pF1KE0 RYISSLFPTRAENFSRKI-HQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLDQTGVTAF
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CCDS77 CYISSLF-TPVDGGSPSLPNQAQLRRLCQVAAKGIWTMTYVFYRENLRRLGLTQSDVSSF
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pF1KE0 LGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQRLIASPRG
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CCDS77 MDSNIIQKDAEYENCYVFTHLHVQEFFAAMFYMLKGSWEAGNPSCQPFEDLKSLLQSTSY
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CCDS77 KDPHLTQMKCFLFGLLNEDRVKQLERTFNCKMSLKIKSKLLQCMEVLGNSDYSPSQLGFL
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CCDS77 ELFHCLYETQDKAFISQAMRCFPKVAINICEKIHLLVSSFCLKHCRCLRTIRLSVTVVFE
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pF1KE0 NVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFLKALAAAL
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CCDS77 K--KILKTSLP-TNTWDGDRITHCWQDLCSVLHTNEHLRELDLYHSNLDKSAMNILHHEL
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pF1KE0 RHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLCRVLRSPR
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CCDS77 RHPNCKLQKLLLKFITFPDGCQDISTSLIHNKNLMHLDLKGSDIGDNGVKSLCEALKHPE
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pF1KE0 CRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVA------QL
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CCDS77 CKLQTLRLESCNLTVFCCLNISNALIRSQSLIFLNLSTNNLLDDGVQLLCEALRHPKCYL
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pF1KE0 ERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQRL
::::.:.:.::. :: :. : ..: :::: ::.:.: : :.: . .:: : .: :. :
CCDS77 ERLSLESCGLTEAGCEYLSLALISNKRLTHLCLADNVLGDGGVKLMSDALQHAQCTLKSL
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pF1KE0 VLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILELE
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CCDS77 VLRRCHFTSLSSEYLSTSLLHNKSLTHLDLGSNWLQDNGVKLLCDVFRHPSCNLQDLELM
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pF1KE0 NCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPAW
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CCDS77 GCVLTNACCLDLASVILNNPNLRSLDLGNNDLQDDGVKILCDALRYPNCNIQRLGLEYCG
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CCDS77 LTSLCCQDLSSALICNKRLIKMNLTQNTLGYEGIVKLYKVLKSPKCKLQVLGLCKEAFDE
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. .... .. .:. :. .: : ...::...::..:. : ..:: : .:
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.:: : :. : :: : . ::. : . :. : : : :.. : : .:
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:::: . :.:. .:. :.. : :.. ::::.:..:.:.:::.: . .:: .
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1020 1030 1040
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CCDS33 G
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CCDS82 AQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKYRENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEE-L
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190 200 210 220 230 240
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CCDS82 QRLLDPNRTRA-QAQTIVLVGRAGVGKTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIR
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEEL--TSTLIDRLEDLSE--D
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CCDS82 YMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFMSQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTD
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CCDS82 WYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLLITIK--TWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLR
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pF1KE0 KYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSCPNA
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CCDS82 VYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTT
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CCDS82 TSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQWRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPF
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pF1KE0 SPRGSK-SYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPPSP
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CCDS82 HVLLDKEAYWTPVVLFFFGLLNKNIARELEDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASL
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CCDS82 QFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGRIFEVDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSV
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pF1KE0 TLNFMNV-WKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFLK
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CCDS82 SSHILERDLEILETSKFDSR------MHAW-NSICSTLVTNENLHELDLSNSKLHASSVK
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pF1KE0 ALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLCR
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CCDS82 GLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEWVLQDLIIALQGNSKLTHLNFSSNKL-GMTVPLILK
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pF1KE0 VLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVA--
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CCDS82 ALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQDLALFLTSIQHVTRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALT
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pF1KE0 ----QLERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLR
:::: . :.:. .:. :.. : :.. ::::.:..:.:.:::.: . .:: .
CCDS82 HPKCALERLELWFCQLAAPACKHLSDALLQNRSLTHLNLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPD
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900 910 920 930 940 950
pF1KE0 CPLQRLVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTL
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CCDS82 GNLQSLNLSGCSFTREGCGELANALSHNHNVKILDLGENDLQDDGVKLLCEALK-PHRAL
930 940 950 960 970 980
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE0 QILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVI
. : : .: .:. ::: . :.: ... : .:.: : . . :. ::
CCDS82 HTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNLNLLGNELDTDGVKMLCFKKTCTM
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pF1KE0 FCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
>>CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19 (1040 aa)
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pF1KE0 SSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLLLT-ELSTGTMPITW
....:..::..:: :. : :. . :
CCDS54 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPH
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.:. :. ..:..: . . . .. ..: :. . .. :. .: : ..
CCDS54 KEVDKADGKQLVEILTTHCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRK
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pF1KE0 ---------EPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFY
: :.: : .. . : : . . :: .: .:::....
CCDS54 PLSLGITRKERPPLDVDEMLERFKTEAQDKDNRCRYILKTKFREMW--KSWPGDSKEVQV
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pF1KE0 QGVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWC
.. .:.. .: . :. : ::.. : :.::: ::.:.:..::.... ::
CCDS54 MA-ERYKMLIP-FSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLI-HKFKY
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AFYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRL
:::. :.:... ::.::. . :: :: . .:... ..:...:::.:: .. .
CCDS54 AFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGALI
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 EDLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNT
::. ::..: : :::.:::...:::.:.::. : . . . : . : . . ::
CCDS54 EDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFLE
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pF1KE0 MEKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQS
.. :: .:: ... ... . :. ::.. .:.:::.::. :: :::.:.. . .
CCDS54 EDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVPT
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pF1KE0 CPNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKL
: . :..:.:.. : :: :. .. :. : :::...: . :: .::::. .
CCDS54 CLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQ------LRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGV
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pF1KE0 DQTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRL-KNFHVLSHVNI
... . :: .:::. . : : ..::.:..::::.: .. .. :. . ..
CCDS54 QESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDV
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:.:... : . : . : . ::. :: :. .: .: :..: :..::. :
CCDS54 QKLLSGVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLR-------C
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pF1KE0 DPPSPG-----SGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRC
: : . . .:. ::.: .:: .:.... ..... :.. : .: :.::.:.:
CCDS54 DISCKGGHSTVTDLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHL-NAVDVVPSSFCVKHC
570 580 590 600 610 620
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pF1KE0 QYLHEVELTVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPES-NGLHR--WWQDLCSVFATNDKLEVLT
. :... : : . :. . ..:. .:. .: . : .: ::::.:..: : :.
CCDS54 RNLQKMSLQVIKE--NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLA
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pF1KE0 MTNSVLGPPFLKALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHV
...: :. ... : . :.::..... .. . ...: .: :.. . :: .:
CCDS54 INDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGN
690 700 710 720 730 740
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pF1KE0 EVESKAVKLLCRVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLE
. .. ::.::: :.: :. : : .: :: . :.::. :. : : . : : :
CCDS54 D-QDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELL
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pF1KE0 NCGAYYLSVAQ------LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEG
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CCDS54 DEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTG
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pF1KE0 AKHIWNALPHLRCPLQRLVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVIL
.: . ..: . .: :: ::: .::.: . : :. . : ....: :::..: . :. .
CCDS54 VKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKF
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pF1KE0 LCEALKNPDCTLQILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCE
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CCDS54 LCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFE
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1010 1020 1030 1040
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...
CCDS54 TLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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CCDS54 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPH
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CCDS54 KEMASLQVFEKMHRMDL---SERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDVDEML
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CCDS54 ERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMW--KSWPGDSKEV
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CCDS54 QVMA-ERYKMLIP-FSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLI-HKF
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CCDS54 KYAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGA
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CCDS54 LIEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGF
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.. :: .:: ... ... . :. ::.. .:.:::.::. :: :::.:.. .
CCDS54 LEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPV
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CCDS54 PTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQ------LRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERL
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pF1KE0 KLDQTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRL-KNFHVLSHV
.... . :: .:::. . : : ..::.:..::::.: .. .. :. .
CCDS54 GVQESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIG
460 470 480 490 500 510
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:: : . . .:. ::.: .:: .:.... ..... :.. : .: :.::.:
CCDS54 -CDISCKGGHSTVTDLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHL-NAVDVVPSSFCVK
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.:. :... : : . :. . ..:. .:. .: . : .: ::::.:..: :
CCDS54 HCRNLQKMSLQVIKE--NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMG
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pF1KE0 LTMTNSVLGPPFLKALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQ
:....: :. ... : . :.::..... .. . ...: .: :.. . :: .:
CCDS54 LAINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQ
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. .. ::.::: :.: :. : : .: :: . :.::. :. : : . : :
CCDS54 GND-QDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNE
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CCDS54 LLDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGN
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pF1KE0 EGAKHIWNALPHLRCPLQRLVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGV
:.: . ..: . .: :: ::: .::.: . : :. . : ....: :::..: . :.
CCDS54 TGVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGM
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pF1KE0 ILLCEALKNPDCTLQILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTL
.:::::..: :.:. : : .: . . :. . : : :: : :::..: .: :. :
CCDS54 KFLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKML
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pF1KE0 CEAFSSQKKREEVIFCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
:...
CCDS54 FETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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CCDS12 EMASLQVFEKMHRMDL---SERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDVDEMLE
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CCDS12 RFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMW--KSWPGDSKEVQ
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pF1KE0 YQGVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRW
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CCDS12 VMA-ERYKMLIP-FSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLI-HKFK
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pF1KE0 CAFYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDR
:::. :.:... ::.::. . :: :: . .:... ..:...:::.:: ..
CCDS12 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
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pF1KE0 LEDLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFN
.::. ::..: : :::.:::...:::.:.::. : . . . : . : . . ::
CCDS12 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
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pF1KE0 TMEKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQ
.. :: .:: ... ... . :. ::.. .:.:::.::. :: :::.:.. .
CCDS12 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
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pF1KE0 SCPNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAK
.: . :..:.:.. : :: :. .. :. : :::...: . :: .::::.
CCDS12 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQ------LRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLG
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pF1KE0 LDQTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRL-KNFHVLSHVN
.... . :: .:::. . : : ..::.:..::::.: .. .. :. . .
CCDS12 VQESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGD
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CCDS12 VQKLLSGVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLR-------
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CCDS12 CDISCKGGHSTVTDLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHL-NAVDVVPSSFCVKH
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CCDS12 CRNLQKMSLQVIKE--NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGL
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pF1KE0 TMTNSVLGPPFLKALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQH
....: :. ... : . :.::..... .. . ...: .: :.. . :: .:
CCDS12 AINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQG
710 720 730 740 750 760
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. .. ::.::: :.: :. : : .: :: . :.::. :. : : . : : :
CCDS12 ND-QDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNEL
770 780 790 800 810 820
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pF1KE0 ENCGAYYLSVAQ------LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDE
. :: : .. :.:::.:::.::. .:..::. : :. :::: ::.: . .
CCDS12 LDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNT
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pF1KE0 GAKHIWNALPHLRCPLQRLVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVI
:.: . ..: . .: :: ::: .::.: . : :. . : ....: :::..: . :.
CCDS12 GVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMK
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pF1KE0 LLCEALKNPDCTLQILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLC
.:::::..: :.:. : : .: . . :. . : : :: : :::..: .: :. :
CCDS12 FLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLF
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pF1KE0 EAFSSQKKREEVIFCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
:...
CCDS12 ETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KE0 ERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRREINAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGK
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CCDS12 VQQDSATAAETKEQEISQAMEQEGATAAETEEQEISQAMEQEGATAAETE---EQGHGGD
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CCDS12 TWDYKSHVMTKFAEEEDV------RRSFENTAADWPEMQTLAGAFDSDRWGFRPRTVVLH
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...:.::.: ..: .:. : :.... . :.. . .. .: : : :. .
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.. :. .:..:....:.:: :. .:: : .. . :.. :.:: . :..:.
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:: :::....: : :..: .. .:.:::..: ::..... : ... . :..
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.: ... ... :.:.::...:. .:. : . .:.: .:.: : :::: ::.:
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..: :.:::: : ... :::: :..:.: .::.. . . ::: : ::::.: .:
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