Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0388
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0388, 610 aa
1>>>pF1KE0388 610 - 610 aa - 610 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5821+/-0.00105; mu= 5.7301+/- 0.063
mean_var=283.4592+/-64.854, 0's: 0 Z-trim(112.4): 258 B-trim: 633 in 1/51
Lambda= 0.076178
statistics sampled from 12835 (13129) to 12835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75016.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 610) 4036 457.5 2.3e-128
CCDS77820.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 607) 4002 453.8 3e-127
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 743 96.0 3.2e-19
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 743 96.0 3.3e-19
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 743 96.0 3.4e-19
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 735 95.0 5e-19
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 733 94.9 7.3e-19
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 733 94.9 7.3e-19
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 695 90.4 7.8e-18
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 695 90.5 9.8e-18
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 695 90.5 9.9e-18
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 673 88.1 5.1e-17
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 673 88.1 5.2e-17
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 644 85.2 6.3e-16
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 644 85.2 6.4e-16
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 637 84.1 7.7e-16
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 629 83.5 2e-15
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 629 83.5 2e-15
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 622 83.0 4.8e-15
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 612 81.4 5.3e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 599 79.9 1.4e-14
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 599 80.0 1.4e-14
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 597 79.7 1.5e-14
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 597 79.7 1.5e-14
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 597 79.7 1.6e-14
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 597 79.7 1.6e-14
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 597 79.7 1.6e-14
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 597 79.7 1.6e-14
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 597 79.7 1.7e-14
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 586 78.7 4.7e-14
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 571 76.7 9.5e-14
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 571 76.8 1e-13
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 571 76.8 1.1e-13
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 571 76.8 1.1e-13
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 571 76.8 1.1e-13
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 571 76.8 1.1e-13
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 571 76.8 1.1e-13
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 571 76.8 1.1e-13
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 571 76.9 1.2e-13
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 571 76.9 1.2e-13
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 571 76.9 1.2e-13
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 574 77.4 1.3e-13
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 570 76.8 1.4e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 567 76.3 1.4e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 567 76.4 1.5e-13
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 567 76.4 1.5e-13
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 570 76.9 1.5e-13
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 570 76.9 1.6e-13
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 567 76.4 1.6e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 567 76.4 1.6e-13
>>CCDS75016.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 (610 aa)
initn: 4036 init1: 4036 opt: 4036 Z-score: 2418.2 bits: 457.5 E(32554): 2.3e-128
Smith-Waterman score: 4036; 100.0% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGAARLGRPGRSCLPGARGLRAPPPPPLLLLLALLPLLPAPGAAAAPAPRPPELQSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGAARLGRPGRSCLPGARGLRAPPPPPLLLLLALLPLLPAPGAAAAPAPRPPELQSASA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GPSVSLYLSEDEVRRLIGLDAELYYVRNDLISHYALSFSLLVPSETNFLHFTWHAKSKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GPSVSLYLSEDEVRRLIGLDAELYYVRNDLISHYALSFSLLVPSETNFLHFTWHAKSKVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YKLGFQVDNVLAMDMPQVNISVQGEVPRTLSVFRVELSCTGKVDSEVMILMQLNLTVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YKLGFQVDNVLAMDMPQVNISVQGEVPRTLSVFRVELSCTGKVDSEVMILMQLNLTVNSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KNFTVLNFKRRKMCYKKLEEVKTSALDKNTSRTIYDPVHAAPTTSTRVFYISVGVCCAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KNFTVLNFKRRKMCYKKLEEVKTSALDKNTSRTIYDPVHAAPTTSTRVFYISVGVCCAVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLT
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE0 EFHAALGAYV
::::::::::
CCDS75 EFHAALGAYV
610
>>CCDS77820.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 (607 aa)
initn: 2103 init1: 2103 opt: 4002 Z-score: 2398.0 bits: 453.8 E(32554): 3e-127
Smith-Waterman score: 4002; 99.5% identity (99.5% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRGAARLGRPGRSCLPGARGLRAPPPPPLLLLLALLPLLPAPGAAAAPAPRPPELQSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MRGAARLGRPGRSCLPGARGLRAPPPPPLLLLLALLPLLPAPGAAAAPAPRPPELQSASA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GPSVSLYLSEDEVRRLIGLDAELYYVRNDLISHYALSFSLLVPSETNFLHFTWHAKSKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GPSVSLYLSEDEVRRLIGLDAELYYVRNDLISHYALSFSLLVPSETNFLHFTWHAKSKVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YKLGFQVDNVLAMDMPQVNISVQGEVPRTLSVFRVELSCTGKVDSEVMILMQLNLTVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YKLGFQVDNVLAMDMPQVNISVQGEVPRTLSVFRVELSCTGKVDSEVMILMQLNLTVNSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KNFTVLNFKRRKMCYKKLEEVKTSALDKNTSRTIYDPVHAAPTTSTRVFYISVGVCCAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KNFTVLNFKRRKMCYKKLEEVKTSALDKNTSRTIYDPVHAAPTTSTRVFYISVGVCCAVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITS---
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTL
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLT
540 550 560 570 580 590
610
pF1KE0 EFHAALGAYV
::::::::::
CCDS77 EFHAALGAYV
600
>>CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294 aa)
initn: 700 init1: 371 opt: 743 Z-score: 458.5 bits: 96.0 E(32554): 3.2e-19
Smith-Waterman score: 743; 40.0% identity (67.4% similar) in 310 aa overlap (302-606:944-1242)
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSV-TLLEAKGKVKDIAISR
: :: :. .::.. . : :. :::. : .
CCDS82 GLALPAIDGLDSTTCVHGASFSDSEDESCVPLLRKESIQLRDLDSALLAE--VKDVLIPH
920 930 940 950 960 970
340 350 360 370 380
pF1KE0 ERI-TLKD-VLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKL
::. : .: :. .: :: ..:: ::. ... : .:... . :: .: :. .
CCDS82 ERVVTHSDRVIGKGHFGVVYHGEYIDQA--QNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLM
980 990 1000 1010 1020
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 RGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHM
:::.: :.: . . . : :.:::: :.: :.:. . :: . .::. .
CCDS82 RGLNHPNVLALIGIMLPPEGLPHVLLPYMCHGDLLQFIRSPQ----RNPTV---KDLISF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 AIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENR-
..:.: :: :::... .:.:::::::..:... ::..: .:.::.. .:. . ....
CCDS82 GLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFTVKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHAR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 -PVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQ
::.::::::: . .:.. ::::.::: ::::.: : :: ::::... .: .: :. :
CCDS82 LPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELLTRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
570 580 590 600 610
pF1KE0 PINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
: ::: :. :: :: :: :: :. :: . .. .::
CCDS82 PEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRPTFRVLVGEVEQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
CCDS82 HEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRPLSEPPRPT
1270 1280 1290
>>CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351 aa)
initn: 700 init1: 371 opt: 743 Z-score: 458.2 bits: 96.0 E(32554): 3.3e-19
Smith-Waterman score: 743; 40.0% identity (67.4% similar) in 310 aa overlap (302-606:1001-1299)
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSV-TLLEAKGKVKDIAISR
: :: :. .::.. . : :. :::. : .
CCDS58 GLALPAIDGLDSTTCVHGASFSDSEDESCVPLLRKESIQLRDLDSALLAE--VKDVLIPH
980 990 1000 1010 1020
340 350 360 370 380
pF1KE0 ERI-TLKD-VLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKL
::. : .: :. .: :: ..:: ::. ... : .:... . :: .: :. .
CCDS58 ERVVTHSDRVIGKGHFGVVYHGEYIDQA--QNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 RGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHM
:::.: :.: . . . : :.:::: :.: :.:. . :: . .::. .
CCDS58 RGLNHPNVLALIGIMLPPEGLPHVLLPYMCHGDLLQFIRSPQ----RNPTV---KDLISF
1090 1100 1110 1120 1130
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 AIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENR-
..:.: :: :::... .:.:::::::..:... ::..: .:.::.. .:. . ....
CCDS58 GLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFTVKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHAR
1140 1150 1160 1170 1180 1190
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 -PVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQ
::.::::::: . .:.. ::::.::: ::::.: : :: ::::... .: .: :. :
CCDS58 LPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELLTRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
570 580 590 600 610
pF1KE0 PINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
: ::: :. :: :: :: :: :. :: . .. .::
CCDS58 PEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRPTFRVLVGEVEQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
CCDS58 HEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRPLSEPPRPT
1320 1330 1340 1350
>>CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400 aa)
initn: 700 init1: 371 opt: 743 Z-score: 458.1 bits: 96.0 E(32554): 3.4e-19
Smith-Waterman score: 743; 40.0% identity (67.4% similar) in 310 aa overlap (302-606:1050-1348)
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GLSQPSTQTTQYLRADTPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSV-TLLEAKGKVKDIAISR
: :: :. .::.. . : :. :::. : .
CCDS28 GLALPAIDGLDSTTCVHGASFSDSEDESCVPLLRKESIQLRDLDSALLAE--VKDVLIPH
1020 1030 1040 1050 1060 1070
340 350 360 370 380
pF1KE0 ERI-TLKD-VLQEGTFGRIFHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVKDQASEIQVTMMLTESCKL
::. : .: :. .: :: ..:: ::. ... : .:... . :: .: :. .
CCDS28 ERVVTHSDRVIGKGHFGVVYHGEYIDQA--QNRIQCAIKSLSRITEMQQVEAFLREGLLM
1080 1090 1100 1110 1120 1130
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 RGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHM
:::.: :.: . . . : :.:::: :.: :.:. . :: . .::. .
CCDS28 RGLNHPNVLALIGIMLPPEGLPHVLLPYMCHGDLLQFIRSPQ----RNPTV---KDLISF
1140 1150 1160 1170 1180
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 AIQIACGMSYLARREVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENR-
..:.: :: :::... .:.:::::::..:... ::..: .:.::.. .:. . ....
CCDS28 GLQVARGMEYLAEQKFVHRDLAARNCMLDESFTVKVADFGLARDILDREYYSVQQHRHAR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 -PVRWMALESLVNNEFSSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQ
::.::::::: . .:.. ::::.::: ::::.: : :: ::::... .: .: :. :
CCDS28 LPVKWMALESLQTYRFTTKSDVWSFGVLLWELLTRGAPPYRHIDPFDLTHFLAQGRRLPQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
570 580 590 600 610
pF1KE0 PINCPDELFAVMACCWALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
: ::: :. :: :: :: :: :. :: . .. .::
CCDS28 PEYCPDSLYQVMQQCWEADPAVRPTFRVLVGEVEQIVSALLGDHYVQLPATYMNLGPSTS
1310 1320 1330 1340 1350 1360
CCDS28 HEMNVRPEQPQFSPMPGNVRRPRPLSEPPRPT
1370 1380 1390 1400
>>CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 (999 aa)
initn: 565 init1: 495 opt: 735 Z-score: 455.0 bits: 95.0 E(32554): 5e-19
Smith-Waterman score: 735; 41.0% identity (69.6% similar) in 283 aa overlap (318-595:572-850)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRI
: ..:..:..:.:. . : .: :: :: .
CCDS20 DSELVVNYIAKKSFCRRAIELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSV
550 560 570 580 590 600
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 FHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVK-DQASEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIE-
..: : .: : .. : : :::.: :..:. .. .:.:. .. . : :.. . ::::
CCDS20 MEGNLKQE-DGTSLKVA-VKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEM
610 620 630 640 650
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 --EG-EKPMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARR
.: :::::::.:..:.:. .: .: ..:. : : :... ..:: :: ::. :
CCDS20 SSQGIPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRL--ETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNR
660 670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 EVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNEF
. .:.:::::::.. : . : ..: .::. .. ::. : . ::.:.:.:::.. .
CCDS20 NFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVY
720 730 740 750 760 770
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 SSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCW
.: :::::::::.::. : :.::: .. :: :: :.:. :: .: :::. .: ::
CCDS20 TSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCW
780 790 800 810 820 830
590 600 610
pF1KE0 ALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
:: .:: :. :
CCDS20 RTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPDVRNQADVIYVNTQLLESSEGLAQGSTLAPLDLNI
840 850 860 870 880 890
>>CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390 aa)
initn: 702 init1: 356 opt: 733 Z-score: 452.2 bits: 94.9 E(32554): 7.3e-19
Smith-Waterman score: 737; 35.0% identity (68.8% similar) in 349 aa overlap (265-609:1016-1348)
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VCCAVIFLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATP
: ..: . .. : :. . : . . ..:
CCDS43 ARSVSPTTEMVSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTSGDSDISSP
990 1000 1010 1020 1030 1040
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ITSSLGYPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILID
. .. :..:. . : . :..: .: :. : . ...:. .: :: ..:: :.:
CCDS43 LLQN----TVHIDLSAL-NPELVQAVQHVV-IGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLD
1050 1060 1070 1080 1090
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EKDPNKEKQAFVKTVKDQASEI-QVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVI
. .:. . ::.. .. ..: .:...:::. .. . : :.: . .:.. .:.:.
CCDS43 --NDGKKIHCAVKSL-NRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVV
1100 1110 1120 1130 1140 1150
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARN
::::. :.:. :.:. :..:: . .::. ...:.: ::.::: .. .:.::::::
CCDS43 LPYMKHGDLRNFIRN----ETHNP---TVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARN
1160 1170 1180 1190 1200
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 CVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENR--PVRWMALESLVNNEFSSASDVWAF
:..:. . ::..: .:.::.. .:. . .. . ::.::::::: ...:.. ::::.:
CCDS43 CMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 GVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPK
:: :::::: : :: :.. :....:: .: :. :: ::: :. :: :: : ::.
CCDS43 GVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
600 610
pF1KE0 FQQLVQCLTE-FHAALGAYV
:..::. .. : . .: .
CCDS43 FSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTRPASFWET
1330 1340 1350 1360 1370 1380
>>CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408 aa)
initn: 702 init1: 356 opt: 733 Z-score: 452.1 bits: 94.9 E(32554): 7.3e-19
Smith-Waterman score: 737; 35.0% identity (68.8% similar) in 349 aa overlap (265-609:1034-1366)
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VCCAVIFLVAIILAVLHLHSMKRIELDDSISASSSSQGLSQPSTQTTQYLRADTPNNATP
: ..: . .. : :. . : . . ..:
CCDS47 ARSVSPTTEMVSNESVDYRATFPEDQFPNSSQNGSCRQVQYPLTDMSPILTSGDSDISSP
1010 1020 1030 1040 1050 1060
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ITSSLGYPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRIFHGILID
. .. :..:. . : . :..: .: :. : . ...:. .: :: ..:: :.:
CCDS47 LLQN----TVHIDLSAL-NPELVQAVQHVV-IGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLD
1070 1080 1090 1100 1110
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EKDPNKEKQAFVKTVKDQASEI-QVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEEGEKPMVI
. .:. . ::.. .. ..: .:...:::. .. . : :.: . .:.. .:.:.
CCDS47 --NDGKKIHCAVKSL-NRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLARREVIHKDLAARN
::::. :.:. :.:. :..:: . .::. ...:.: ::.::: .. .:.::::::
CCDS47 LPYMKHGDLRNFIRN----ETHNP---TVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARN
1180 1190 1200 1210 1220
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 CVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENR--PVRWMALESLVNNEFSSASDVWAF
:..:. . ::..: .:.::.. .:. . .. . ::.::::::: ...:.. ::::.:
CCDS47 CMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSF
1230 1240 1250 1260 1270 1280
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 GVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACCWALDPEERPK
:: :::::: : :: :.. :....:: .: :. :: ::: :. :: :: : ::.
CCDS47 GVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPS
1290 1300 1310 1320 1330 1340
600 610
pF1KE0 FQQLVQCLTE-FHAALGAYV
:..::. .. : . .: .
CCDS47 FSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKCVAPYPSLLSSEDNADDEVDTRPASFWET
1350 1360 1370 1380 1390 1400
>>CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (626 aa)
initn: 517 init1: 517 opt: 695 Z-score: 433.7 bits: 90.4 E(32554): 7.8e-18
Smith-Waterman score: 695; 37.6% identity (69.2% similar) in 295 aa overlap (318-606:253-542)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRI
: : :..:. ..:....: .: :: :: .
CCDS62 RGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAV
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 FHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVKDQA-SEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEE
..: : ..: . : : :::.: .. .. .:.:. .. . : :.. . ::..
CCDS62 MEGQL--NQDDSILKVA-VKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQG
290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GEK-----PMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLAR
.:. :.::::.:. :.:. :: .: ...: . : ::.. .:: :: ::.
CCDS62 SERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRL--GDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLST
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 REVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNE
.. ::.:::::::.......: ..: .::. .. ::. : . ::.:.:.:::..
CCDS62 KRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRV
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 FSSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACC
..: ::::.::::.::. : ::::: .. :. ::..: :. :: .: : :.:.:. :
CCDS62 YTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRC
460 470 480 490 500 510
590 600 610
pF1KE0 WALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
: :.:..::.: .: . : . ::
CCDS62 WELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQ
520 530 540 550 560 570
>>CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (885 aa)
initn: 566 init1: 517 opt: 695 Z-score: 431.9 bits: 90.5 E(32554): 9.8e-18
Smith-Waterman score: 695; 37.6% identity (69.2% similar) in 295 aa overlap (318-606:512-801)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TPNNATPITSSLGYPTLRIEKNDLRSVTLLEAKGKVKDIAISRERITLKDVLQEGTFGRI
: : :..:. ..:....: .: :: :: .
CCDS12 RGELVVRYRVRKSYSRRTTEATLNSLGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAV
490 500 510 520 530 540
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 FHGILIDEKDPNKEKQAFVKTVKDQA-SEIQVTMMLTESCKLRGLHHRNLLPITHVCIEE
..: : ..: . : : :::.: .. .. .:.:. .. . : :.. . ::..
CCDS12 MEGQL--NQDDSILKVA-VKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQG
550 560 570 580 590
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GEK-----PMVILPYMNWGNLKLFLRQCKLVEANNPQAISQQDLVHMAIQIACGMSYLAR
.:. :.::::.:. :.:. :: .: ...: . : ::.. .:: :: ::.
CCDS12 SERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRL--GDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLST
600 610 620 630 640 650
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 REVIHKDLAARNCVIDDTLQVKITDNALSRDLFPMDYHCLGDNENRPVRWMALESLVNNE
.. ::.:::::::.......: ..: .::. .. ::. : . ::.:.:.:::..
CCDS12 KRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRV
660 670 680 690 700 710
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 FSSASDVWAFGVTLWELMTLGQTPYVDIDPFEMAAYLKDGYRIAQPINCPDELFAVMACC
..: ::::.::::.::. : ::::: .. :. ::..: :. :: .: : :.:.:. :
CCDS12 YTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRC
720 730 740 750 760 770
590 600 610
pF1KE0 WALDPEERPKFQQLVQCLTEFHAALGAYV
: :.:..::.: .: . : . ::
CCDS12 WELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQ
780 790 800 810 820 830
610 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:51:58 2016 done: Thu Nov 3 12:51:58 2016
Total Scan time: 3.670 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]