FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0390, 488 aa
1>>>pF1KE0390 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8800+/-0.00115; mu= 6.5740+/- 0.067
mean_var=313.6859+/-72.684, 0's: 0 Z-trim(111.4): 625 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.072415
statistics sampled from 11561 (12338) to 11561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 3374 366.8 3e-101
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 1264 146.4 6.9e-35
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 1258 145.8 1.1e-34
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 1258 145.8 1.1e-34
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 1255 145.4 1.3e-34
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 1255 145.5 1.4e-34
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 1230 142.8 7.6e-34
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 1224 142.2 1.3e-33
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 1218 141.6 2e-33
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 1211 140.8 3.2e-33
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 1192 138.9 1.3e-32
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 1190 138.7 1.5e-32
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 1187 138.4 1.9e-32
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 1174 137.0 4.6e-32
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 1174 137.0 4.7e-32
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 1169 136.4 6.1e-32
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 1050 124.5 5.9e-28
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 1050 124.5 5.9e-28
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 1038 122.8 9.2e-28
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 1038 123.2 1.3e-27
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 1038 123.2 1.4e-27
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 1038 123.3 1.4e-27
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 1003 119.2 1.2e-26
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 893 107.6 3.1e-23
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 893 107.6 3.2e-23
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 893 107.6 3.2e-23
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 893 107.9 4.2e-23
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 887 106.9 4.6e-23
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 846 102.7 9.4e-22
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 823 100.6 6.5e-21
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 823 100.6 6.7e-21
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 814 99.3 9.2e-21
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 814 99.5 1.1e-20
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 807 98.8 1.9e-20
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 807 98.8 1.9e-20
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 789 96.9 7.1e-20
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 781 96.0 1.1e-19
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 771 95.0 2.5e-19
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 748 92.7 1.4e-18
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 748 92.7 1.5e-18
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 712 89.1 2.3e-17
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 695 87.4 8e-17
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 688 86.6 1.3e-16
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 687 86.5 1.4e-16
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 687 86.5 1.4e-16
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 687 86.5 1.4e-16
>>CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 (488 aa)
initn: 3374 init1: 3374 opt: 3374 Z-score: 1931.3 bits: 366.8 E(32554): 3e-101
Smith-Waterman score: 3374; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQLFLALY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAKVCHYRVSMAADGSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAKVCHYRVSMAADGSLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQKAPRQDVWERPHSEFALGRKLGEGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCMPQKAPRQDVWERPHSEFALGRKLGEGY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGEPVYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNVLVDD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLLHEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 TYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATLREKL
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 HAIHRCHP
::::::::
CCDS13 HAIHRCHP
>>CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 (509 aa)
initn: 1095 init1: 730 opt: 1264 Z-score: 739.8 bits: 146.4 E(32554): 6.9e-35
Smith-Waterman score: 1264; 44.5% identity (69.6% similar) in 454 aa overlap (39-480:46-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAE--PCSPFPQ-LFLALYDFTAR
::. : . : ::. . : .::...
CCDS35 NIDVCENCHYPIVPLDGKGTLLIRNGSEVRDPLVTYEGSNPPASPLQDNLVIALHSYEPS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLS-GQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSG
:.:. ..:..: ::..: . :. :. :: :..:.. ::::. .: .::.:..
CCDS35 HDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQE--GFIPFNFVAKAN--SLEPEPWFFKN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE0 VSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVR----AQAKVC-HYRVSMAADGSL
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CCDS35 LSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPHSEFALGRKL
:.. ::::.::. .: . . : .::. ::: .: :: :. . : ..:
CCDS35 YISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGE
: : ::::: : . : ::.: .:...:. . : . .: :.:.::.::.:: . :
CCDS35 GAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQ-E
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNV
:.::.:: :..:.: :: :: : : . :: .: :.::::...::. .:::: : :.
CCDS35 PIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANI
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLL
::.: :.::.::::::::..:. :. ..:.:.::::::: :: .:. ::::::::.::
CCDS35 LVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILL
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 HEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATL
:. :.:. :: :::: :..:.. ::::. :: :: :.: :: ::. ::.::.: :
CCDS35 TEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYL
440 450 460 470 480 490
480
pF1KE0 REKLHAIHRCHP
: :
CCDS35 RSVLEDFFTATEGQYQPQP
500
>>CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 (505 aa)
initn: 1176 init1: 732 opt: 1258 Z-score: 736.4 bits: 145.8 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:32-490)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
:: . . ::. : . . .
CCDS54 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
.::::. : .:: ..::.. .:::.: . :: :. . . : .: ..::.. ..:
CCDS54 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
. :.:.:.:: .:.. ::.: : :.:.:: ::.. :.:::::: : ::.
CCDS54 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
. .:..:.. : :.::. .:: . . . : ::: ::: ..:.:: :.
CCDS54 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
. : .::: : ::::: . . ::.:..: ..:.. . : ...: :.:..:..
CCDS54 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
:::: . ::.::.::.: ::.: :: . :: :: :. :. :.::::...:.. .
CCDS54 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
:::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :. ..:.:.::::::: :. :. ::
CCDS54 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.::: :: :.: .:..::.. :
CCDS54 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
420 430 440 450 460 470
470 480
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP
::::.: .. :
CCDS54 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
480 490 500
>>CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 (526 aa)
initn: 1176 init1: 732 opt: 1258 Z-score: 736.3 bits: 145.8 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:53-511)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
:: . . ::. : . . .
CCDS33 GCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDII
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
.::::. : .:: ..::.. .:::.: . :: :. . . : .: ..::.. ..:
CCDS33 VVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATR-KEGYIPSNYVARV--DSL
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
. :.:.:.:: .:.. ::.: : :.:.:: ::.. :.:::::: : ::.
CCDS33 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
. .:..:.. : :.::. .:: . . . : ::: ::: ..:.:: :.
CCDS33 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
. : .::: : ::::: . . ::.:..: ..:.. . : ...: :.:..:..
CCDS33 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
:::: . ::.::.::.: ::.: :: . :: :: :. :. :.::::...:.. .
CCDS33 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
:::: : :.::. .:.::.:::::::...:. :. ..:.:.::::::: :. :. ::
CCDS33 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
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CCDS54 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
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CCDS54 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
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CCDS13 EKVLPVSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKED
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CCDS30 LIKDDEYNPCQGSKFPIKWTAPEAALFGRFTIKSDVWSFGILLTELITKGRIPYPGMNKR
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CCDS13 GAGGGAFPASQTPSKPASADGHRGPSAAFAPAAAEPKLFGGFNSSDTVTSP---QRAGPL
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CCDS13 AGGVTTFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLSTGQ--TGYIPSNYV
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CCDS13 APS--DSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAENPRGTFLVRESETTKGAYCLSVSDFDNAK
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CCDS13 ALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHD
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CCDS59 MGLVSSKKPDKEKPIK-EKDKGQWSPLKVSAQDKDAPPLPPLVVFNHLTPPPP
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CCDS59 DEHLDEDKHFVVALYDYTAMNDRDLQMLKGEKLQVLKGTGDWWLARSLVTGRE--GYVPS
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CCDS59 NFVARV--ESLEMERWFFRSQGRKEAERQLLAPINKAGSFLIRESETNKGAFSLSVKDVT
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CCDS59 TQGELIKHYKIRCLDEGGYYISPRITFPSLQALVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVRPAPQNP
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CCDS59 WAQDEWEIPRQSLRLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNMKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANVM
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