Result of FASTA (omim) for
pF1KE0390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0390, 488 aa
1>>>pF1KE0390 488 - 488 aa - 488 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7058+/-0.000531; mu= -12.5705+/- 0.032
mean_var=754.6188+/-172.264, 0's: 0 Z-trim(118.8): 1122 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.046689
statistics sampled from 30589 (32171) to 30589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 8.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 1264 101.2 7.1e-21
NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 1264 101.2 7.1e-21
NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1258 100.8 9.4e-21
NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1258 100.8 9.4e-21
NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 1258 100.8 9.4e-21
NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 1258 100.9 9.6e-21
NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 1255 100.6 1.1e-20
NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 1255 100.6 1.1e-20
NP_005966 (OMIM: 602004) protein-tyrosine kinase 6 ( 451) 1230 98.9 3.3e-20
NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1224 98.6 4.7e-20
NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 1224 98.6 4.7e-20
XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1224 98.6 4.7e-20
XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1224 98.6 4.7e-20
NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1224 98.6 4.7e-20
XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 1218 98.2 6.3e-20
NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1218 98.2 6.3e-20
NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1218 98.2 6.3e-20
NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein k ( 505) 1211 97.7 8.4e-20
XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_011533955 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_011533957 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1192 96.4 2e-19
XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 1190 96.3 2.3e-19
NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 1190 96.3 2.3e-19
NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 1187 96.1 2.7e-19
XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 1187 96.1 2.7e-19
NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 1174 95.1 4.7e-19
XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 1174 95.1 4.7e-19
NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 1174 95.2 4.8e-19
XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 1175 95.4 5.3e-19
NP_001317394 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protei ( 434) 1169 94.7 5.5e-19
XP_011533958 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 392) 1148 93.2 1.4e-18
XP_016883515 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1151 93.7 1.4e-18
XP_016883513 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1151 93.7 1.4e-18
XP_016883516 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1151 93.7 1.4e-18
XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1151 93.7 1.4e-18
NP_005148 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1130) 1050 87.3 2.4e-16
NP_009297 (OMIM: 189980) tyrosine-protein kinase A (1149) 1050 87.4 2.4e-16
NP_001129473 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote ( 542) 1038 86.1 2.8e-16
NP_001161711 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1043) 1038 86.5 4e-16
NP_001161710 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1058) 1038 86.5 4.1e-16
NP_001129472 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1064) 1038 86.5 4.1e-16
NP_001161709 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1079) 1038 86.5 4.1e-16
XP_005245145 (OMIM: 164690) PREDICTED: Abelson tyr (1146) 1038 86.5 4.2e-16
NP_001161708 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1161) 1038 86.6 4.3e-16
NP_005149 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-protein (1167) 1038 86.6 4.3e-16
>>NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein kinas (509 aa)
initn: 1095 init1: 730 opt: 1264 Z-score: 495.8 bits: 101.2 E(85289): 7.1e-21
Smith-Waterman score: 1264; 44.5% identity (69.6% similar) in 454 aa overlap (39-480:46-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAE--PCSPFPQ-LFLALYDFTAR
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NP_005 NIDVCENCHYPIVPLDGKGTLLIRNGSEVRDPLVTYEGSNPPASPLQDNLVIALHSYEPS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLS-GQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSG
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NP_005 HDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQE--GFIPFNFVAKAN--SLEPEPWFFKN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE0 VSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVR----AQAKVC-HYRVSMAADGSL
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NP_005 LSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPHSEFALGRKL
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NP_005 YISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGE
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NP_005 GAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQ-E
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNV
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NP_005 PIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANI
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360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLL
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NP_005 LVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILL
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420 430 440 450 460 470
pF1KE0 HEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATL
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NP_005 TEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYL
440 450 460 470 480 490
480
pF1KE0 REKLHAIHRCHP
: :
NP_005 RSVLEDFFTATEGQYQPQP
500
>>NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein ki (509 aa)
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Smith-Waterman score: 1264; 44.5% identity (69.6% similar) in 454 aa overlap (39-480:46-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAE--PCSPFPQ-LFLALYDFTAR
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NP_001 NIDVCENCHYPIVPLDGKGTLLIRNGSEVRDPLVTYEGSNPPASPLQDNLVIALHSYEPS
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pF1KE0 CGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLS-GQPSAGLVPITHVAKASPETLSDQPWYFSG
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NP_001 HDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQE--GFIPFNFVAKAN--SLEPEPWFFKN
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pF1KE0 VSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVR----AQAKVC-HYRVSMAADGSL
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NP_001 LSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPHSEFALGRKL
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NP_001 YISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIRLHAVCSGGE
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NP_001 GAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQ-E
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300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVVHRDLAARNV
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NP_001 PIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANI
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360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKSDVWSFGVLL
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NP_001 LVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILL
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pF1KE0 HEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSPEERPSFATL
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NP_001 TEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYL
440 450 460 470 480 490
480
pF1KE0 REKLHAIHRCHP
: :
NP_001 RSVLEDFFTATEGQYQPQP
500
>>NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase HC (505 aa)
initn: 1176 init1: 732 opt: 1258 Z-score: 493.6 bits: 100.8 E(85289): 9.4e-21
Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:32-490)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
:: . . ::. : . . .
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pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
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pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
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NP_001 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
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pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
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NP_001 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
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pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
. : .::: : ::::: . . ::.:..: ..:.. . : ...: :.:..:..
NP_001 ESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVK
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pF1KE0 LHAVCSGGEPVYIVTELMRKGNLQAFLGTPEGRALRLPPLLGFACQVAEGMSYLEEQRVV
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NP_001 LHAVVTK-EPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYI
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 HRDLAARNVLVDDGLACKVADFGLARLLKDDIYSPSSSSKIPVKWTAPEAANYRVFSQKS
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NP_001 HRDLRAANILVSASLVCKIADFGLARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKS
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pF1KE0 DVWSFGVLLHEVFTYGQCPYEGMTNHETLQQIMRGYRLPRPAACPAEVYVLMLECWRSSP
::::::.:: :. :::. :: ::.: :... . ::::.::: :: :.: .:..::.. :
NP_001 DVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGMSNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRP
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470 480
pF1KE0 EERPSFATLREKLHAIHRCHP
::::.: .. :
NP_001 EERPTFEYIQSVLDDFYTATESQYQQQP
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>>NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase HC (505 aa)
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Smith-Waterman score: 1258; 41.3% identity (68.3% similar) in 463 aa overlap (26-480:32-490)
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pF1KE0 MEPFLRRRLAFLSFFWDKIWPAGGEPDHGTPGSLDPNTDPVPTLPAEPCSPFPQL
:: . . ::. : . . .
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pF1KE0 FLALYDFTARCGGELSVRRGDRLCALEEGGGYIFARRLSGQPSAGLVPITHVAKASPETL
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pF1KE0 SDQPWYFSGVSRTQAQQLLLSPPNEPGAFLIRPSESSLGGYSLSVRAQAK-----VCHYR
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NP_001 ETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYK
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pF1KE0 VSMAADGSLYLQKGRLFPGLEELLTYYKANWKLIQNPLLQPCM---PQKAPRQDVWERPH
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NP_001 IRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPR
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pF1KE0 SEFALGRKLGEGYFGEVWEGLWLGSLPVAIKVIKSANMKLTDLAKEIQTLKGLRHERLIR
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