Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0491
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0491, 323 aa
1>>>pF1KE0491 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8842+/-0.00101; mu= 12.9249+/- 0.060
mean_var=72.0648+/-14.446, 0's: 0 Z-trim(104.1): 50 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.151082
statistics sampled from 7697 (7734) to 7697 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 ( 323) 2109 469.0 2.2e-132
CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 ( 315) 1592 356.3 1.8e-98
CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 ( 327) 1271 286.4 2.1e-77
CCDS33104.1 CACNG8 gene_id:59283|Hs108|chr19 ( 425) 764 175.9 4.9e-44
CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 ( 275) 418 100.4 1.7e-21
CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 ( 275) 387 93.7 1.8e-19
>>CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 (323 aa)
initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 2490.3 bits: 469.0 E(32554): 2.2e-132
Smith-Waterman score: 2109; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTH
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CCDS13 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPSKSDSKKNSYSYGWSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPSKSDSKKNSYSYGWSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVH
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 NCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
:::::::::::::::::::::::
CCDS13 NCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
310 320
>>CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 (315 aa)
initn: 1322 init1: 1002 opt: 1592 Z-score: 1881.5 bits: 356.3 E(32554): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 1592; 74.6% identity (90.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMTH
: . :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::::.::::::::
CCDS10 MRMCDRGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMTH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMGGL
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CCDS10 SGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPEDADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFGGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPSKSDSKKNSYSYGWSF
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CCDS10 CVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPGQRDSKK-SYSYGWSF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQRRSRSS
::::.::::::.:::.:::..:..:.:::: .. ...:. :...:.: ::::..::: :
CCDS10 YFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKHQQLRAKSH-SEFLKKSTFARLPPYRYRFRRRS--S
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVH
:::::: .::: ::.. :::.:.:::.:::.:::::: : : . :::::..::: :
CCDS10 SRSTEP-RSRDLSPIS-KGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKI--TMGTLLNSDRDHAFLQFH
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 NCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
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CCDS10 NSTPKEFKESLHNNPANRRTTPV
300 310
>>CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 (327 aa)
initn: 971 init1: 551 opt: 1271 Z-score: 1503.1 bits: 286.4 E(32554): 2.1e-77
Smith-Waterman score: 1271; 59.3% identity (85.6% similar) in 327 aa overlap (5-323:5-327)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRG-VCKTKSVSENE--TSKKNEEV
:::.::::::.:::::::::.::.:::::::: . .:. ... .. .. .
CCDS11 MVRCDRGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARGD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFM
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CCDS11 LTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHFPEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTILLLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPS--KSDSKKNSYS
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CCDS11 GGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKNHYN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAIT---RIPSYRYR
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CCDS11 YGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEKNKELRFKTK-REFLKASSSSPYARMPSYRYR
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YQRRSRSSSRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDR
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CCDS11 -RRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTA--ASYSPDQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 DNSFLQVHNCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
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CCDS11 EASFLQVHDFFQQDLKEGFHVSMLNRRTTPV
300 310 320
>>CCDS33104.1 CACNG8 gene_id:59283|Hs108|chr19 (425 aa)
initn: 1267 init1: 567 opt: 764 Z-score: 904.0 bits: 175.9 E(32554): 4.9e-44
Smith-Waterman score: 1134; 59.1% identity (80.8% similar) in 308 aa overlap (2-281:12-317)
10 20 30 40
pF1KE0 MGLF-DRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRG-VCKTKSVSEN
::. ..:::.:::::::::::.:::::..::::::.:. .:.: ... .
CCDS33 MESLKRWNEERGLWCEKGVQVLLTTVGAFAAFGLMTIAISTDYWLYTRALICNTTNLTAG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 ------------ETSKKNEEVMTHSGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPEDADYEADTAEY
. ::. .::::::: ::::: .:.: .:.:::::.::. :.:::
CCDS33 GDDGTPHRGGGGASEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRGVCVKINHFPEDTDYDHDSAEY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FLRAVRASSIFPILSVILLFMGGLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVY
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CCDS33 LLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNIIGVIVY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ISANAGDPS--KSDSKKNSYSYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARA
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CCDS33 ISANAGEPGPKRDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREAHCQSR-
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE0 TDYLQA------------SAITRIPSYRYRYQRRSRSSSRSTEPSHSRDASPVGIKGFNT
.: :.: ::: :.::::.::.:::::::::.::: :::::: : :
CCDS33 SDLLKAGGGAGGSGGSGPSAILRLPSYRFRYRRRSRSSSRSSEPSPSRDASPGG-PGGPG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 LPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDNSFLQVHNCIQKENKDSLHSNTANRRTTP
. ::.:::::::::: :..
CCDS33 FASTDISMYTLSRDPSKGSVAAGLAGAGGGGGGAVGAFGGAAGGAGGGGGGGGGAGAERD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 (275 aa)
initn: 396 init1: 132 opt: 418 Z-score: 499.4 bits: 100.4 E(32554): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 418; 33.2% identity (68.2% similar) in 211 aa overlap (1-205:1-204)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLY-SRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMT
:. : . ::..: : ...:. :::.:::::: .:: : .:.... ..
CCDS11 MSACGRKALTLLSSVFAVCGLGLLGIAVSTDYWLYLEEGVI----VPQNQSTEI--KMSL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 HSGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDH-FPEDADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMG
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CCDS11 HSGLWRVCFLAGEERGRCFTIEYVMPMNTQLTSESTVNVLKMIRSATPFPLVSLFFMFIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGDPSKSDSKKN----SY
. ... : . . .::::. .::: ..:...:::. .: . .: .:
CCDS11 FILNNIGHIRPHRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISS-INDEMLNRTKDAETYFNY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQ
.::::: :.:.::...: .::..:..:. :.
CCDS11 KYGWSFAFAAISFLLTESAGVMSVYLFMKRYTAEDMYRPHPGFYRPRLSNCSDYSGQFLH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RRSRSSSRSTEPSHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSRDPLKAATTPTATYNSDRDN
CCDS11 PDAWVRGRSPSDISSEASLQMNSNYPALLKCPDYDQMSSSPC
240 250 260 270
>>CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 (275 aa)
initn: 359 init1: 129 opt: 387 Z-score: 462.9 bits: 93.7 E(32554): 1.8e-19
Smith-Waterman score: 387; 30.1% identity (60.5% similar) in 286 aa overlap (6-284:7-274)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGLFDRGVQMLLTTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCKTKSVSENETSKKNEEVMT
:.. .: .. :: .. :. :::.:::::: . . . .:.:.. ..
CCDS12 MSHCSSRALTLLSSVFGA-CGLLLVGIAVSTDYWLY---MEEGTVLPQNQTTEV--KMAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 HSGLWRTCCLEGNFKGLCKQIDHFPE-DADYEADTAEYFLRAVRASSIFPILSVILLFMG
:.::::.: . : :: : ..: : . . ....: .:..::... ::..:..:.: .
CCDS12 HAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GLCIAASEFYKTRHNIILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGD----PSKSDSKKNSY
. ... : . . .::::. .::: ..:...:::. . ::.:. . :
CCDS12 FVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSE-QYFHY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQ
::::: :.: ::.. : .::..:..: :. :. : :. :: : .
CCDS12 RYGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRY------AEEEMYRPHPAF-----YRPRLS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RRSRSSSRSTEP-SHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSR-DPLKAATTPTATYNSDR
: :.. .: . : :: :.. .. :. ... : :. .:.:
CCDS12 DCSDYSGQFLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC
230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE0 DNSFLQVHNCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV
323 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:36:28 2016 done: Thu Nov 3 04:36:28 2016
Total Scan time: 2.490 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]