Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0543
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0543, 315 aa
1>>>pF1KE0543 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0325+/-0.000932; mu= 16.9792+/- 0.056
mean_var=59.8171+/-12.034, 0's: 0 Z-trim(104.1): 74 B-trim: 12 in 1/50
Lambda= 0.165829
statistics sampled from 7642 (7717) to 7642 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 1.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 ( 315) 2078 505.7 1.9e-143
CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 ( 323) 1347 330.8 8.8e-91
CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 675) 391 102.2 1.2e-21
CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 676) 391 102.2 1.2e-21
CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 ( 678) 386 101.0 2.6e-21
CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 ( 308) 345 91.1 1.2e-18
CCDS76020.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 353) 339 89.6 3.7e-18
CCDS72943.1 SLC25A44 gene_id:9673|Hs108|chr1 ( 322) 267 72.4 5.3e-13
CCDS13758.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 311) 240 65.9 4.5e-11
>>CCDS13744.1 SLC25A18 gene_id:83733|Hs108|chr22 (315 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 2688.6 bits: 505.7 E(32554): 1.9e-143
Smith-Waterman score: 2078; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQHGKAMYKGMIDCLMKTARAEG
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CCDS13 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQHGKAMYKGMIDCLMKTARAEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVT
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CCDS13 FFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIAWELLRTQGLA
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CCDS13 CPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIAWELLRTQGLA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVT
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CCDS13 GLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 VYFIGIGERILKCFD
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CCDS13 VYFIGIGERILKCFD
310
>>CCDS7715.1 SLC25A22 gene_id:79751|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1159 init1: 674 opt: 1347 Z-score: 1743.3 bits: 330.8 E(32554): 8.8e-91
Smith-Waterman score: 1347; 65.6% identity (84.9% similar) in 317 aa overlap (1-311:1-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH-GKAMYKGMIDCLMKTARAE
:. ...:. :::::::.:::.::::::::::::::::::. :. .: .: :::.::.:.:
CCDS77 MADKQISLPAKLINGGIAGLIGVTCVFPIDLAKTRLQNQQNGQRVYTSMSDCLIKTVRSE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVV
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CCDS77 GYFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFRHQLSKDGQKLTLLKEMLAGCGAGTCQVIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TCPMEMLKIQLQDAGRLAVHH-----QGSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIAWELL
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CCDS77 TTPMEMLKIQLQDAGRIAAQRKILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAP--RPTATQLTRDLL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCVAGSI
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CCDS77 RSRGIAGLYKGLGATLLRDVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEKSPFYVSFLAGCVAGSA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKGAGCRALVIAPL
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CCDS77 AAVAVNPCDVVKTRLQSLQRGVNEDTYSGILDCARKILRHEGPSAFLKGAYCRALVIAPL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 FGIAQGVYFIGIGERILKCFD
::::: :::.::.: .:
CCDS77 FGIAQVVYFLGIAESLLGLLQDPQA
300 310 320
>>CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (675 aa)
initn: 477 init1: 292 opt: 391 Z-score: 502.4 bits: 102.2 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 687; 43.4% identity (66.1% similar) in 295 aa overlap (15-302:335-600)
10 20 30 40
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH----
:.::: ::.: :.::::.:::.:::.
CCDS56 LAEAQRQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS
310 320 330 340 350 360
50 60 70 80 90
pF1KE0 --GKAMYKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFR-RLLMEDG
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CCDS56 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGS
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CCDS56 -SVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEI-----------------TTG-
430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ASTHRRPSATLIAWELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAG
: .. : ..: :. :.:.: : .::::::: :::: .:... .: . :
CCDS56 ------PRVS--ALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKA-SFANEDG
470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGP
..: . ...: .:: :: ::: ::.:::.:. .. :. :::. :: ::. .:::
CCDS56 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310
pF1KE0 SAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD
.:. :::: :.. .: ::.. .:
CCDS56 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD
580 590 600 610 620 630
>>CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 (676 aa)
initn: 477 init1: 292 opt: 391 Z-score: 502.4 bits: 102.2 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 687; 43.4% identity (66.1% similar) in 295 aa overlap (15-302:336-601)
10 20 30 40
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQH----
:.::: ::.: :.::::.:::.:::.
CCDS55 AEAQRQQKASGDSARPVLLQVAESAYRFGLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRSTGS
310 320 330 340 350 360
50 60 70 80 90
pF1KE0 --GKAMYKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFR-RLLMEDG
:. :::. .::. :. : :::::.::: .: :.:::::::..::: : ... .::
CCDS55 FVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLLPQLLGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFMHKDG
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGS
. : :.::: :: ::. : :.:..::.:: ::.. :::
CCDS55 -SVPLAAEILAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEI-----------------TTG-
430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ASTHRRPSATLIAWELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAG
: .. : ..: :. :.:.: : .::::::: :::: .:... .: . :
CCDS55 ------PRVS--ALSVVRDLGFFGIYKGAKACFLRDIPFSAIYFPCYAHVKA-SFANEDG
470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGP
..: . ...: .:: :: ::: ::.:::.:. .. :. :::. :: ::. .:::
CCDS55 QVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310
pF1KE0 SAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD
.:. :::: :.. .: ::.. .:
CCDS55 KALWKGAGARVFRSSPQFGVTLLTYELLQRWFYIDFGGVKPMGSEPVPKSRINLPAPNPD
580 590 600 610 620 630
>>CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 (678 aa)
initn: 591 init1: 283 opt: 386 Z-score: 495.9 bits: 101.0 E(32554): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 679; 44.1% identity (66.4% similar) in 295 aa overlap (15-302:333-598)
10 20 30 40
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQHGKA-
:.::: ::.: :.::::.:::.:::.:..
CCDS33 NLAELQRQQSPGLGRPIWLQIAESAYRFTLGSVAGAVGATAVYPIDLVKTRMQNQRGSGS
310 320 330 340 350 360
50 60 70 80 90
pF1KE0 -----MYKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDFFR-RLLMEDG
:::. .::. :. : :::::.::: .: :.:::::::..::: : .. .::
CCDS33 VVGELMYKNSFDCFKKVLRYEGFFGLYRGLIPQLIGVAPEKAIKLTVNDFVRDKFTRRDG
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGS
. : :.::: :: ::. : :.:..::.:: ::.. :::
CCDS33 -SVPLPAEVLAGGCAGGSQVIFTNPLEIVKIRLQVAGEI-----------------TTG-
430 440 450 460
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ASTHRRPSATLIAWELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAG
: .. : ..:: :. :::.: : .::::::: ::::..:. . : .: :
CCDS33 ------PRVS--ALNVLRDLGIFGLYKGAKACFLRDIPFSAIYFPVYAHCKLLLADE-NG
470 480 490 500 510
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGP
... . ...: .:: :: ::: ::.:::.:. .. :. :::. :: ::. .:::
CCDS33 HVGGLNLLAAGAMAGVPAASLVTPADVIKTRLQVAARA-GQTTYSGVIDCFRKILREEGP
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310
pF1KE0 SAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD
::: ::.. :.. .: ::.. .:
CCDS33 SAFWKGTAARVFRSSPQFGVTLVTYELLQRWFYIDFGGLKPAGSEPTPKSRIADLPPANP
580 590 600 610 620 630
>>CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 157 init1: 131 opt: 345 Z-score: 448.1 bits: 91.1 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 345; 26.3% identity (54.7% similar) in 300 aa overlap (12-298:3-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGVTCVFPIDLAKTRLQNQHGKAMYKGMIDCLMKTARAEG
.. :...:. ::. .:.: .:.:.:.. : :. :. : . :
CCDS99 MDFVAGAIGGVCGVAVGYPLDTVKVRIQTE---PKYTGIWHCVRDTYHRER
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 FFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKLAANDF----FRRLLMEDGMQRNLKMEM-LAGCGAGMC
.:.::: .. . :. ....... . :: . . . : .. :.::..:.
CCDS99 VWGFYRGLSLPVCTVSLVSSVSFGTYRHCLAHICRLRYGNPDAKPTKADITLSGCASGLV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQ-----GSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIA
.: .: : :. :..:: . ... : ..: . .: : : .
CCDS99 RVFLTSPTEVAKVRLQTQTQAQKQQRRLSASGPLAVPPMCPVPPACPEPKYRGPLHCLAT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCV
. : .:: :::.: .: .::: :: .: : . .. . .:.:
CCDS99 --VAREEGLCGLYKGSSALVLRDGHSFATYFLSYAVLCEWLSPAGHSRPDVPGVLVAGGC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE0 AGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKG---AGCR
:: .: ...::.::.:.:.:. : :. : :. : .::: ...:: ::
CCDS99 AGVLAWAVATPMDVIKSRLQA--DGQGQRRYRGLLHCMVTSVREEGPRVLFKGLVLNCCR
230 240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KE0 ALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILKCFD
:. . . .:
CCDS99 AFPVNMVVFVAYEAVLRLARGLLT
290 300
>>CCDS76020.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (353 aa)
initn: 276 init1: 140 opt: 339 Z-score: 439.4 bits: 89.6 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 339; 26.7% identity (58.7% similar) in 303 aa overlap (1-283:29-326)
10 20 30
pF1KE0 MTHQDLSITAK-LINGGVAGLVGVTCVFPIDL
..:. ... : .. ::.:..:. .::.::
CCDS76 MGIFPGIILIFLRVKFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KE0 AKTRLQNQHGKAM--------YKGMIDCLMKTARAEGFFGMYRGAAVNLTLVTPEKAIKL
.::::: : :... :.::. :.. . :: ...: : : : . .::.
CCDS76 TKTRLQVQ-GQSIDARFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKI
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 AANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGCGAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGS
. . ..::..: ...: ..:. : .:. . ... : ..:::..: : : :::
CCDS76 GIYQSLKRLFVERLEDETLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSL---FQGS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KE0 ASAPSTSRSYTTGSASTHR----RPSATLIAWEL-----LRTQGLAGLYRGLGATLLRDI
. . :. . : . . . : . : . .: .:. : :
CCDS76 MIGSFIDIYQQEGTRGLWRCLCSKAVTGCVLWLMPVIPALWEANAGGSLEGVVPTAQRAA
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 PFSIIYFPLF-ANLNNLGFNELAGKASFAHSFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLK
. .:.. . ..: .. . : . ..: :::. . : .:.: .:.::..::... .
CCDS76 IVVGVELPVYDITKKHLILSGMMGDTILTH-FVSSFTCGLAGALASNPVDVVRTRMMNQR
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 KGLGE-DMYSGITDCARKLWIQEGPSAFMKGAGCRALVIAPLFGIAQGVYFIGIGERILK
.:. :.:.: .: :.: .:: :..::
CCDS76 AIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFITYEQLKRLQI
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 CFD
>>CCDS72943.1 SLC25A44 gene_id:9673|Hs108|chr1 (322 aa)
initn: 343 init1: 160 opt: 267 Z-score: 346.9 bits: 72.4 E(32554): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 361; 28.4% identity (59.2% similar) in 289 aa overlap (16-293:24-295)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTHQDLSITAKLINGGVAGLVGV-TCVFPIDLAKTRLQNQHGKAMYKGMIDC
::: . . . :.:. : .:::: :.::..:.: .:
CCDS72 MEDKRNIQIIEWEHLDKKKFYVFGVAMTMMIRVSVYPFTLIRTRLQVQKGKSLYHGTFDA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LMKTARAEGFFGMYRGAAVN-LTLVTPEKAIKLAANDFFRRLLMEDGMQRNLKMEMLAGC
..: ::.:. :.::: :: .::.. . . .. .. :... : : : ..::
CCDS72 FIKILRADGITGLYRGFLVNTFTLISGQCYV--TTYELTRKFVA-DYSQSNTVKSLVAGG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GAGMCQVVVTCPMEMLKIQLQDAGRLAVHHQGSASAPSTSRSYTTGSASTHRRPSATLIA
.:.. .: :.... . .: ....: . :. :.. . . .:
CCDS72 SASLVAQSITVPIDVV------SQHLMMQRKGEKMGRFQVRGNPEGQGVVAFGQTKDIIR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 WELLRTQGLAGLYRGLGATLLRDIPFSIIYFPLFANLNNLGFNELAGKASF------AH-
..:...:: :.::: :.:: :: : ...:.. . : . . :. :
CCDS72 -QILQADGLRGFYRGYVASLLTYIPNSAVWWPFYHFYAAIVFPWIPEQLSYLCPKECPHI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 --SFVSGCVAGSIAAVAVTPLDVLKTRIQTLKKGLGEDMYSGITDCARKLWIQEGPSAFM
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