Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0557
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0557, 450 aa
1>>>pF1KE0557 450 - 450 aa - 450 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6358+/-0.00113; mu= 7.4060+/- 0.068
mean_var=161.0726+/-31.734, 0's: 0 Z-trim(107.8): 95 B-trim: 75 in 1/51
Lambda= 0.101056
statistics sampled from 9725 (9819) to 9725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 3.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 2901 435.3 6.2e-122
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 2354 355.5 6.4e-98
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 2161 327.4 1.9e-89
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 2025 307.6 1.8e-83
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1496 230.5 3.5e-60
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1473 227.1 3.3e-59
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1392 215.3 1.1e-55
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1352 209.4 6.2e-54
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1343 208.1 1.5e-53
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1319 204.6 1.7e-52
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1291 200.5 2.9e-51
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1289 200.2 3.3e-51
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1264 196.6 4.2e-50
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1218 189.8 4.2e-48
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1143 179.1 1.1e-44
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1088 170.9 2.4e-42
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 993 157.1 3.4e-38
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 979 155.0 1.4e-37
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 978 154.9 1.5e-37
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 958 151.9 1.1e-36
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 957 151.8 1.2e-36
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 956 151.7 1.3e-36
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 897 143.1 5.4e-34
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 891 142.2 1e-33
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 889 141.9 1.2e-33
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 884 141.2 2e-33
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 875 139.9 5.5e-33
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 804 129.5 6.7e-30
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 797 128.5 1.4e-29
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 645 106.2 4.5e-23
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 544 91.7 1.9e-18
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 543 91.5 2e-18
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 536 90.5 4e-18
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 536 90.7 6.7e-18
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 512 87.0 5.1e-17
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 490 83.7 3.9e-16
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 490 83.7 3.9e-16
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 490 83.7 4e-16
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 490 83.8 5.1e-16
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 482 82.6 8.6e-16
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 474 81.4 2.2e-15
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 474 81.5 2.3e-15
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 472 81.1 2.6e-15
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 470 80.9 3.4e-15
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 467 80.5 4.9e-15
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 460 79.6 1.6e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 445 77.2 4e-14
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 440 76.5 7.8e-14
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 433 75.5 1.4e-13
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 430 75.1 2e-13
>>CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 (450 aa)
initn: 2901 init1: 2901 opt: 2901 Z-score: 2302.5 bits: 435.3 E(32554): 6.2e-122
Smith-Waterman score: 2901; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-450)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE0 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
430 440 450
>>CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 (459 aa)
initn: 2434 init1: 1995 opt: 2354 Z-score: 1871.4 bits: 355.5 E(32554): 6.4e-98
Smith-Waterman score: 2354; 81.3% identity (92.5% similar) in 454 aa overlap (1-447:1-446)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRR--SCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSS----
::.:.::.::: :: :::.:: .::..::.::.::. ::::::: :::::::
CCDS11 MSVRFSSTSRRLGSCG--GTGSVRLSSGGAGFGAGNTCGVPGIGSGFSCAFGGSSSAGGY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GGNTGGGNP-CAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
::. :::. ::.:: ::.::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::
CCDS11 GGGLGGGSASCAAFTGNEHGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLENVRALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
:::::::::::::::::::::::::.::::::..:::::..::: :::::::::::::.:
CCDS11 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDELKNQIISATTSNAHVVLQNDNARLTADDFRLKFE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
::::::::::::.:::::::::.:::::::::: ::::::..::::::.:::..::::::
CCDS11 NELALHQSVEADINGLRRVLDELTLCRTDLEIQLETLSEELAYLKKNHEEEMKALQCAAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS11 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISDDAGATT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SARNELIEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
::::::::::::::::::::.::::::::::::: :.::.: ::. : :. :.:.
CCDS11 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKVHLEKEIETYCLLIDGEDGSC------SKSKGYGGPGNQT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE0 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
:: .:. .:: :.::.: :.:.:..:.:..::::
CCDS11 KDSSKTTIVKTVVEEIDPRGKVLSSRVHTVEEKSTKVNNKNEQRVSS
420 430 440 450
>>CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 (464 aa)
initn: 2041 init1: 1876 opt: 2161 Z-score: 1719.3 bits: 327.4 E(32554): 1.9e-89
Smith-Waterman score: 2161; 74.0% identity (89.9% similar) in 454 aa overlap (1-447:1-450)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGG---SSSGGN
:::..:..::. : : .::.: .::..:. ...:: : :: :: :.:: : ::.
CCDS11 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TGGGN----PCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
.:: : ::. .: :::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::::
CCDS11 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :.::::.::.:::.:::..::::::::.:::::::::
CCDS11 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
:::.:::.::::.:::::::::.:::::: :.:::.::::::::::::.:::..::::::
CCDS11 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::.:
CCDS11 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
::..::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
::::::::::::::.:::.:.:::::::::: :: :: ..:. ::: .:::. :..
CCDS11 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCS----KSKGFGSGSPGNSS
370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE0 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
:: .:. .:: :.::.:::.:.:..:.::.:::.
CCDS11 KDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
420 430 440 450 460
>>CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 (468 aa)
initn: 2037 init1: 1851 opt: 2025 Z-score: 1612.1 bits: 307.6 E(32554): 1.8e-83
Smith-Waterman score: 2025; 71.7% identity (85.4% similar) in 453 aa overlap (1-447:1-451)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGG---N
::.:::..::: : : ::: :: ::::.: .:: : :: :.:: .. : :::: :
CCDS11 MSFRLSGGSRRICSR--TGSGRLSGGGTGFVAGNVCVGSGARSSFSCTLEGISSGGSFCN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TGGG---NPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGW
.::: . :::: ::..:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS11 SGGGLGSGACAGFLGNEHSLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDHVHALEEANADLEQKIKGW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYEN
::: ::: : :::::::: .:.::: :::..: ::. ::: ::::::::::::::::
CCDS11 YEKCEPGSSREHDHDYSRYFSVIEDLKRQIISATICNASIVLQNDNARLTADDFRLKYEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGG
:::::.:::::..::::::::.::: :::::: ::::::.:::::.:.:::.::: .:::
CCDS11 ELALHHSVEADTSGLRRVLDELTLCTTDLEIQCETLSEELTYLKKSHEEEMEVLQYTAGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTS
::::::::.::::::::::::::::: ::::::.::::::::.::.::::::. ::.:.
CCDS11 NVNVEMNATPGVDLTVLLNNMRAEYEDLAEQNRKDAEAWFNERSATLQQQISDHEGAATA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQ
:::::::.::.:::::::::::.:.::: ::::.:::.::: :: ::: :::..::::.:
CCDS11 ARNELTELKRNLQTLEIELQSLMAVKHSYECSLAETEGNYCNQLQQIQDQIGVMEEQLQQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 VRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVK
.::::::::::::::::.:. :::::. :: :. :.. :: :::: : : :.:.:
CCDS11 IRTETEGQKLEYEQLLDVKIFLEKEIDIYCNLLDGEERKSKSTCYKSKGYRPVNSGNQAK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE0 DPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
: .. .:: :.::.:: ...:. :.::.::::
CCDS11 DSTEETIVKTVVEELDQIGNLLSLRVHSVEEKSSKISNITVEQRVPSKAP
420 430 440 450 460
>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSA
::.: :..::: :. :: : :: ...
CCDS11 SGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFG-GSYGGIFGGGSFGGGS
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FGGSS-SGGNTGGGNPCAGFTVN---ERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEAN
:::.: .::. :::. .:: . . :::::::::::::::::::::::.:.::::.:
CCDS11 FGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESN
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLT
.:: ::: :::: : .: .: .:::.:. ::::::::. ::.::: .::::::::.
CCDS11 YELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLA
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEE
:::::::::::.::.::::::.:::::::::.:: ..:::.: :.:.::..::::::.::
CCDS11 ADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEE
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 MQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQ
:. :. .. :.:::::::::::::: ::::::..:: ::::::.:::::::::: : .
CCDS11 MKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTE
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQ
:.... .: ..:.::..:..:.::::::: :: :.::: ::.:::. ::.::.:::::
CCDS11 IDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQ
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLI---GGDDGACKSGGYKS
:.::::::.:.:.::: :. ::.::::::..::.::.:: :. :.. :. ..:: .
CCDS11 ISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFG
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
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::.:. :
CCDS11 GGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGY
480 490 500 510 520 530
>>CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 (525 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIG--SGF
.:: .:::.::: :.::.: :::
CCDS11 SLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFG-----GVSGFGRGSGF
60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 --SSAFGGSSSGG--NTGGGNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALE
:: :.....:: . ::: : :.. ::.::.:: ::::::::::.:::.:.:::
CCDS11 CGSSRFSSGATGGFYSYGGG---MGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALE
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLD-HDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDN
:::.:::.::: ::.:.:::: : . .:::.:. ::.::.:::::.:. ::. .:.:::
CCDS11 EANTDLENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDN
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKN
:::.:::::::::::: :.::::::.::::.:::..:. :.:::.: :...::..::.::
CCDS11 ARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKN
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSAS
:.:::. .: ..::.:.::::::::.::: :::.:::.:: :::::::.:: ::..:::
CCDS11 HEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSAS
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQ
:: ::: :.::.:::.::.::.:::::.::::::: :: : ::: .:..::..: :::..
CCDS11 LQAQISTDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSE
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYK
::.::.::::.. :. ::. :. ::.:::::: .:: ::::: :. :. :. . . .
CCDS11 IQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFG
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440
pF1KE0 SKDYGSGNVGS---------------QVKDPAKAIVVKKVLEE-VDQRSKILTTRLHSLE
... :: :.:: : .: .:. :.: ..:: :: .:...... :.
CCDS11 GRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVD--GKVVSSQVSSIS
470 480 490 500 510 520
450
pF1KE0 EKSQSN
:
CCDS11 EVKVK
>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 (494 aa)
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10 20 30
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYG-GGTSFGTGNSCG------
.: :::: : . :: ..: : ::..:: : :::
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KE0 -----------------ISGIGSGFSSAFGGSSSGG-NTG-GGNPCAG----FTVNERGL
.:.:.:.. :.::.: :: . : ::.: .: .. :. ::
CCDS11 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 LSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYF
:::.:: ::::::::::::::.:.::::::..::.::. ::: : :. . . :::.:.
CCDS11 LSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYY
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 PIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLD
:.:.::.:.::... .::. .::::::::.:.:::.::::::::.:.::::.::::::::
CCDS11 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNN
:.:: :::::.: :.:.::..:.::::..:.: .. .. :.:.:::.:::::::: :::.
CCDS11 ELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLND
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 MRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQ
:::.::..:::::.:::::: :::. :...:: .. :...:.:...:..:.::::::
CCDS11 MRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQ
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 SLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKL
: :: :.::: ::.:.:..:::::.:.: :. :: :: :::...: :......::..:
CCDS11 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 HLEKEIETYCLLIGGD---DGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQ
.:: ::::: :. :. :: .: . . . .... .. :::.:. .: :..:. .
CCDS11 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESL-FVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVN
430 440 450 460 470
440 450
pF1KE0 RSKILTTRLHSLEEKSQSN
......... .::
CCDS11 -GEVVSSQVQEIEELM
480 490
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10 20
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: :.::. . :: :.: :::: :
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPST-----YGGGLSVSSS
10 20 30 40 50
30 40 50 60 70
pF1KE0 -FGTGNSCGISG-IGSGFSSA-------FGGSSSGG-NTG-GGNPCAGFTVNERGLLSGN
:..:..::..: :.::::. :::. .:: ..: ::. .::. .. ::: :.
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGD-GLLVGS
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIID
:::::::::::::::::.:.:::::::::: ::. ::.. :. . ::: :: :.
CCDS11 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK----DYSPYFKTIE
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 DLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITL
::.:.:...:..:::..::::::::.::::: :::.:: :..:::::.:::::::::.::
CCDS11 DLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTL
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 CRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAE
:.:::.: :.:.::..::::::.:::..:. .::.:::::.:::::::. .::.:: .
CCDS11 ARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQ
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 YEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLA
:: .::.::.::: :: :. :..... . . :...:..:..::.:.::::::: :.
CCDS11 YEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLS
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 TKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEK
: ::: :: ::.. :: :::::: .::..:::: :.: : : :. ::. :::.: .::.
CCDS11 MKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQ
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 EIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTT
:: :: :. :.:. .:. ..: . .: .: :. .. . ::.. : .:...:
CCDS11 EIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQ-----IRTKVMDVHD--GKVVST
420 430 440 450 460
440 450
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. . :. :.
CCDS11 HEQVLRTKN
470
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10 20
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: :.::. . :: :.: :::: :
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPST-----YGGGLSVSSR
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30 40 50 60 70
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:..:..::..: :.::::. :::. .:: ..: ::. ::: .. ::: :
CCDS11 FSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVG
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pF1KE0 NEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPII
.:::::::::::::::::.:.:::::::::: ::. ::.. :. . ::: :: :
CCDS11 SEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIK----DYSPYFKTI
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 DDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEIT
.::.:.:::.: ::. .::::::::.::::: :::.::::.:.::::::::::::::.:
CCDS11 EDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELT
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
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: :::::.: : :.::..::.:::.::: .:. .::.:::::.:::::::. .::.::
CCDS11 LARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRD
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 EYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLL
.:: .::.::::::.:: :. :..... . . :.:.:.::..:.:: ::::::: :
CCDS11 QYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQL
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLE
. : ::: :: ::.. :: ::.:::. ::..:::: :.: : : :. ::. :::.: .::
CCDS11 SMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLE
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.:: :: :. :.:. .: ....:.: .:
CCDS11 QEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQ
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440 450
pF1KE0 TRLHSLEEKSQSN
CCDS11 SS
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1217 init1: 962 opt: 1319 Z-score: 1056.0 bits: 204.6 E(32554): 1.7e-52
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFS
...: :. ..:.. : :.. . :.:.: .
CCDS11 GGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGAG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SAFGGSSSGGNTGGGNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANAD
:.:::. ::..::: .:: .. ::::::::.::::::::::::::.:.::::::::
CCDS11 SVFGGGF-GGGVGGGFG-GGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANAD
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTAD
:: ::. ::.: : : . :::.:: :..:...:.:.: .:. ..:.::::::.::
CCDS11 LEVKIHDWYQKQTPTSP---ECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAAD
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQ
::::::::::::.:.::::.:::::::::.:: :::::.: : :.::..::::::.:::.
CCDS11 DFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQIS
.. .:.:::::.:::::::: .: .:: .:::.::.::::.:::: :. :.....
CCDS11 EFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 EDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIG
.. ....:.:...::.: ::::::: :. : .:: ::.::: : .:: :::. ::
CCDS11 SNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIG
310 320 330 340 350 360
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pF1KE0 ALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGS
.:: :: ..: : :.:. ::..::::: .::.:: :: :. :.:. : .: .. .:
CCDS11 GLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDA--KMAGIAIREASS
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:. ::
CCDS11 GGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
430 440 450
450 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sat Nov 5 01:43:48 2016 done: Sat Nov 5 01:43:49 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]