Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0559
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0559, 295 aa
1>>>pF1KE0559 295 - 295 aa - 295 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7147+/-0.000743; mu= 13.5698+/- 0.045
mean_var=71.6294+/-14.487, 0's: 0 Z-trim(109.2): 24 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.151540
statistics sampled from 10708 (10727) to 10708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 1.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 ( 295) 2023 451.1 4.7e-127
CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 ( 295) 2023 451.1 4.7e-127
CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 295) 1892 422.4 2e-118
CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 ( 295) 1833 409.5 1.5e-114
CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 302) 1153 260.9 8.7e-70
CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 ( 296) 1142 258.4 4.5e-69
CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 ( 217) 1128 255.3 2.9e-68
CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 ( 304) 1084 245.8 3e-65
CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 296) 1083 245.5 3.4e-65
CCDS3531.1 SULT1E1 gene_id:6783|Hs108|chr4 ( 294) 1051 238.5 4.4e-63
CCDS2076.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 ( 307) 752 173.2 2.2e-43
CCDS12724.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 350) 739 170.4 1.7e-42
CCDS12723.1 SULT2B1 gene_id:6820|Hs108|chr19 ( 365) 739 170.4 1.8e-42
CCDS12707.1 SULT2A1 gene_id:6822|Hs108|chr19 ( 285) 691 159.8 2.1e-39
CCDS82492.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 ( 227) 581 135.7 3e-32
CCDS33182.1 SULT6B1 gene_id:391365|Hs108|chr2 ( 265) 534 125.5 4.2e-29
CCDS14051.1 SULT4A1 gene_id:25830|Hs108|chr22 ( 284) 523 123.1 2.4e-28
>>CCDS32427.1 SULT1A4 gene_id:445329|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 2023 init1: 2023 opt: 2023 Z-score: 2394.5 bits: 451.1 E(32554): 4.7e-127
Smith-Waterman score: 2023; 100.0% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
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CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
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CCDS32 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
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CCDS32 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
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CCDS32 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS10674.1 SULT1A3 gene_id:6818|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 2023 init1: 2023 opt: 2023 Z-score: 2394.5 bits: 451.1 E(32554): 4.7e-127
Smith-Waterman score: 2023; 100.0% identity (100.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
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CCDS10 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
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CCDS10 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS32420.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1892 init1: 1892 opt: 1892 Z-score: 2239.7 bits: 422.4 E(32554): 2e-118
Smith-Waterman score: 1892; 92.9% identity (98.0% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS32 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
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CCDS32 IYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKAPGIPSGMETLKDTPAPRLLKTHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
::::::::::: ::::::::::..: :.:::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS32 QKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGTWDSFLEKFMVGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::
CCDS32 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDFVVQHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS10636.1 SULT1A2 gene_id:6799|Hs108|chr16 (295 aa)
initn: 1833 init1: 1833 opt: 1833 Z-score: 2170.0 bits: 409.5 E(32554): 1.5e-114
Smith-Waterman score: 1833; 90.2% identity (97.3% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS10 MELIQDISRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPKSGTTWVSQILDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLD
::::::::::.::::..:::::: . :: :::.::::.:: :::.:.:::::::::::::
CCDS10 IYQGGDLEKCHRAPIFMRVPFLEFKVPGIPSGMETLKNTPAPRLLKTHLPLALLPQTLLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
::::::::::: ::::::::::..: :..:.::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QKVKVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVYPHPGTWESFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::
CCDS10 ELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETVDLMVEHTSFKEMKKNPMTNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 TTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
::: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS10 TTVRREFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAKKMAGCSLSFRSEL
250 260 270 280 290
>>CCDS2077.1 SULT1C4 gene_id:27233|Hs108|chr2 (302 aa)
initn: 1174 init1: 1145 opt: 1153 Z-score: 1366.4 bits: 260.9 E(32554): 8.7e-70
Smith-Waterman score: 1153; 55.4% identity (80.0% similar) in 285 aa overlap (7-291:14-298)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTW
:.: ..::::. . . .:::.::::::.::::.::::
CCDS20 MALHDMEDFTFDGTKRLSVNYVKGILQPTDTCDIWDKIWNFQAKPDDLLISTYPKAGTTW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPGEPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLAL
...:...: . ::.:: .::: . : ::::.. :. :::: . : ::..:.:::. :
CCDS20 TQEIVELIQNEGDVEKSKRAPTHQRFPFLEMKIPSLGSGLEQAHAMPSPRILKTHLPFHL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWY
:: .::... :..:::::::: ::::::.::.:: : ::::. ..: :.::.: .:::.
CCDS20 LPPSLLEKNCKIIYVARNPKDNMVSYYHFQRMNKALPAPGTWEEYFETFLAGKVCWGSWH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMK
.::. ::: . : .:::::::::.:::.::::. ::.:..: ....: .:..::: ::
CCDS20 EHVKGWWEAKDKHRILYLFYEDMKKNPKHEIQKLAEFIGKKLDDKVLDKIVHYTSFDVMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRS
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CCDS20 QNPMANYSSIPAEIMDHSISPFMRKGAVGDWKKHFTVAQNERFDEDYKKKMTDTRLTFHF
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EL
CCDS20 QF
>>CCDS3530.1 SULT1B1 gene_id:27284|Hs108|chr4 (296 aa)
initn: 1130 init1: 867 opt: 1142 Z-score: 1353.5 bits: 258.4 E(32554): 4.5e-69
Smith-Waterman score: 1142; 53.1% identity (80.8% similar) in 292 aa overlap (5-295:5-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILDM
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CCDS35 MLSPKDILRKDLKLVHGYPMTCAFASNWEKIEQFHSRPDDIVIATYPKSGTTWVSEIIDM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 IYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPG-EPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLL
: . ::.:::.:. : .::.::.. :: . ::.: :. .: ::..:.::: :::...
CCDS35 ILNDGDIEKCKRGFITEKVPMLEMTLPGLRTSGIEQLEKNPSPRIVKTHLPTDLLPKSFW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEW
... :..:.::: :::.:::::: :.. .: ::::. .::::..:.:.::::. ::..:
CCDS35 ENNCKMIYLARNAKDVSVSYYHFDLMNNLQPFPGTWEEYLEKFLTGKVAYGSWFTHVKNW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTN
:. .. ::.:.:.:::::::::.::.::..:. ..: .: .: ...::::. :: ::..:
CCDS35 WKKKEEHPILFLYYEDMKENPKEEIKKIIRFLEKNLNDEILDRIIHHTSFEVMKDNPLVN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 YTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
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CCDS35 YTHLPTTVMDHSKSPFMRKGTAGDWKNYFTVAQNEKFDAIYETEMSKTALQFRTEI
250 260 270 280 290
>>CCDS10637.1 SULT1A1 gene_id:6817|Hs108|chr16 (217 aa)
initn: 1128 init1: 1128 opt: 1128 Z-score: 1339.1 bits: 255.3 E(32554): 2.9e-68
Smith-Waterman score: 1128; 94.7% identity (98.8% similar) in 171 aa overlap (125-295:47-217)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TLKDTPPPRLIKSHLPLALLPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGT
::::::: ::::::::::..: :.::::::
CCDS10 VSAFYAGMSILQGKDDIFLDLKQKFWNTYMVVYVARNAKDVAVSYYHFYHMAKVHPEPGT
20 30 40 50 60 70
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 WDSFLEKFMAGEVSYGSWYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRS
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WDSFLEKFMVGEVSYGSWYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRS
80 90 100 110 120 130
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LPEETMDFMVQHTSFKEMKKNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNE
:::::.::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPEETVDFVVQHTSFKEMKKNPMTNYTTVPQEFMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNE
140 150 160 170 180 190
280 290
pF1KE0 RFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
:::::::::::::::::::::
CCDS10 RFDADYAEKMAGCSLSFRSEL
200 210
>>CCDS33267.1 SULT1C3 gene_id:442038|Hs108|chr2 (304 aa)
initn: 1093 init1: 851 opt: 1084 Z-score: 1284.8 bits: 245.8 E(32554): 3e-65
Smith-Waterman score: 1084; 55.3% identity (75.5% similar) in 282 aa overlap (15-295:23-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MELIQDTSRPPLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTT
: ::: . : . .:::.::::.. ::::::::
CCDS33 MAKIEKNAPTMEKKPELFNIMEVDGVPTLILSKEWWEKVCNFQAKPDDLILATYPKSGTT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WVSQILDMIYQGGDLEKCNRAPIYVRVPFLEVNDPG-EPSGLETLKDTPPPRLIKSHLPL
:. .::::: . ::.:::.:: : :::.. : : :: . . :.:::.:::
CCDS33 WMHEILDMILNDGDVEKCKRAQTLDRHAFLELKFPHKEKPDLEFVLEMSSPQLIKTHLPS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ALLPQTLLDQKVKVVYVARNPKDVAVSYYHFHRMEKAHPEPGTWDSFLEKFMAGEVSYGS
:.: .. .. :.::::::::: ::::::::: . :.: . . : ::::.:.: ::
CCDS33 HLIPPSIWKENCKIVYVARNPKDCLVSYYHFHRMASFMPDPQNLEEFYEKFMSGKVVGGS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WYQHVQEWWELSRTHPVLYLFYEDMKENPKREIQKILEFVGRSLPEETMDFMVQHTSFKE
:..::. :: . : .:::::::.:..:::::.:::.:. ... :: .. .. ::::
CCDS33 WFDHVKGWWAAKDMHRILYLFYEDIKKDPKREIEKILKFLEKDISEEILNKIIYHTSFDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MKKNPMTNYTTVPQELMDHSISPFMRKGMAGDWKTTFTVAQNERFDADYAEKMAGCSLSF
::.::::::::.: .::::::::::::: ::::. :::::::.:: :: .:::: .:.:
CCDS33 MKQNPMTNYTTLPTSIMDHSISPFMRKGMPGDWKNYFTVAQNEEFDKDYQKKMAGSTLTF
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RSEL
:.:.
CCDS33 RTEI
>>CCDS2075.1 SULT1C2 gene_id:6819|Hs108|chr2 (296 aa)
initn: 1068 init1: 1068 opt: 1083 Z-score: 1283.8 bits: 245.5 E(32554): 3.4e-65
Smith-Waterman score: 1083; 51.4% identity (77.7% similar) in 296 aa overlap (1-295:1-296)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MELIQDTSRP-PLEYVKGVPLIKYFAEALGPLQSFQARPDDLLINTYPKSGTTWVSQILD
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