Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0560, 464 aa
1>>>pF1KE0560 464 - 464 aa - 464 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4827+/-0.00109; mu= 2.6201+/- 0.065
mean_var=160.0411+/-32.725, 0's: 0 Z-trim(108.9): 86 B-trim: 82 in 1/50
Lambda= 0.101381
statistics sampled from 10442 (10528) to 10442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 3003 451.4 9.1e-127
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 2291 347.3 2e-95
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 2161 328.2 1.1e-89
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 2029 308.9 7e-84
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1536 236.9 4.3e-62
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1440 222.8 6.3e-58
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1439 222.7 7.4e-58
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1394 216.1 6.5e-56
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1369 212.4 7.9e-55
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1350 209.6 5.6e-54
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1343 208.6 1.1e-53
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1327 206.3 5.3e-53
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1324 205.8 7e-53
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1213 189.6 5.2e-48
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1116 175.5 1.4e-43
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1106 173.9 3.1e-43
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1049 165.6 9.1e-41
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1044 164.9 1.6e-40
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 984 156.1 7e-38
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 979 155.3 1.1e-37
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 966 153.4 4e-37
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 964 153.1 4.8e-37
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 929 148.0 1.8e-35
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 924 147.3 2.9e-35
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 916 146.1 6.6e-35
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 909 145.1 1.3e-34
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 892 142.7 8.5e-34
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 858 137.7 2.5e-32
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 847 136.1 7.6e-32
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 669 109.9 3.5e-24
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 576 96.4 7e-20
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 558 93.8 4.1e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 553 93.1 6.9e-19
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 533 90.3 9.3e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 519 88.1 2e-17
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 517 87.8 2.5e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 517 87.8 2.5e-17
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 502 85.6 1.4e-16
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 489 83.7 4.6e-16
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 489 83.7 4.9e-16
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 480 82.4 1.1e-15
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 471 81.0 2.5e-15
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 472 81.3 3.1e-15
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 468 80.7 4.2e-15
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 467 80.5 4.8e-15
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 467 80.6 8.2e-15
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 461 79.6 8.4e-15
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 459 79.4 1.1e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 445 77.3 3.9e-14
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 438 76.2 8.2e-14
>>CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 (464 aa)
initn: 3003 init1: 3003 opt: 3003 Z-score: 2389.3 bits: 451.4 E(32554): 9.1e-127
Smith-Waterman score: 3003; 100.0% identity (100.0% similar) in 464 aa overlap (1-464:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE0 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
430 440 450 460
>>CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 (459 aa)
initn: 2344 init1: 1923 opt: 2291 Z-score: 1826.6 bits: 347.3 E(32554): 2e-95
Smith-Waterman score: 2291; 77.1% identity (92.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::..::. ::.. .:.:::: .:::::.....:: :: ::::.:: .: ::
CCDS11 MSVRFSSTSRRLGSCGGTGSVRLSSGGAGFGAGNTCGVPGIGSGFSCAFGG--SSSAGGY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
.: . :.:.: .:.:.: ::::::::::::::::::::::.::::::::::.::.::::
CCDS11 GGGLGGGSASCAAFTGNEHGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLENVRALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :..:::.:::.::.::.:.:: :::::.:::::::.:
CCDS11 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDELKNQIISATTSNAHVVLQNDNARLTADDFRLKFE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
:::.:::.::::::::::::::::::::: :.: :.::::..::::::::::::::::::
CCDS11 NELALHQSVEADINGLRRVLDELTLCRTDLEIQLETLSEELAYLKKNHEEEMKALQCAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: :.::.:
CCDS11 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISDDAGATT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::..: ::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 SARNELIEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
::::::::::::::.:::.:::::::::::: ::::. .:::::::.:. :::..:: :
CCDS11 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKVHLEKEIETYCLLIDGEDGSCSKSKGYGG--PGNQTKDSS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460
pF1KE0 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
:::.:::::::.: ::::::::.:..:::..:. :.:.::::
CCDS11 KTTIVKTVVEEIDPRGKVLSSRVHTVEEKSTKV-NNKNEQRVSS
420 430 440 450
>>CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 (450 aa)
initn: 2041 init1: 1876 opt: 2161 Z-score: 1724.0 bits: 328.2 E(32554): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 2161; 74.0% identity (89.9% similar) in 454 aa overlap (1-450:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
:::..:..::. : : .::.: .::..:. ...:: : :: :: :.:: : ::.
CCDS11 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGG---SSSGGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
.:: : ::. .: :::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::::
CCDS11 TGGGN----PCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :.::::.::.:::.:::..::::::::.:::::::::
CCDS11 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
:::.:::.::::.:::::::::.:::::: :.:::.::::::::::::.:::..::::::
CCDS11 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::.:
CCDS11 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::..::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCS----KSKGFGSGSPGNSS
::::::::::::::.:::.:.:::::::::: :: :: ..:. ::: .:::. :..
CCDS11 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 KDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
:: .:. .:: :.::.:::.:.:..:.::.:::.
CCDS11 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
420 430 440 450
>>CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 (468 aa)
initn: 2008 init1: 1657 opt: 2029 Z-score: 1619.4 bits: 308.9 E(32554): 7e-84
Smith-Waterman score: 2029; 68.4% identity (87.0% similar) in 469 aa overlap (1-463:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::...:.:::..: :.:.: : .::.::.....: :: : : :::.: : ..: :::
CCDS11 MSFRLSGGSRRICSRTGSG--RLSGGGTGFVAGNVCVGSGARSSFSCTLEG-ISS--GGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 --HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKI
..::.::..:: :: :.: .::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::
CCDS11 FCNSGGGLGSGACAGFLGNEHSLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDHVHALEEANADLEQKI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLK
:::::: ::: : ::::::: .::::: .:::.: ::...:: :::::.:::::::
CCDS11 KGWYEKCEPGSSREHDHDYSRYFSVIEDLKRQIISATICNASIVLQNDNARLTADDFRLK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCA
:::::.::..:::: .:::::::::::: :: :.: :.::::.:::::.:::::..:: .
CCDS11 YENELALHHSVEADTSGLRRVLDELTLCTTDLEIQCETLSEELTYLKKSHEEEMEVLQYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGA
:::::::::::.:::::.::::::::::: :::::::::::::::.::.:::::: ::
CCDS11 AGGNVNVEMNATPGVDLTVLLNNMRAEYEDLAEQNRKDAEAWFNERSATLQQQISDHEGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQ
:: ::..:::..:.::::::.::::::.::: ::::.:::.:::.:: ::: :::..:::
CCDS11 ATAARNELTELKRNLQTLEIELQSLMAVKHSYECSLAETEGNYCNQLQQIQDQIGVMEEQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGD----GNSCSKSKGFGSGSPGN
:.:.::::::::::::.:::::. :::::. :: :.::. ..: ::::. . ::
CCDS11 LQQIRTETEGQKLEYEQLLDVKIFLEKEIDIYCNLLDGEERKSKSTCYKSKGYRPVNSGN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 SSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
..:: .. :.:::::::::: :..:: :.::.:::.::..: .:::::
CCDS11 QAKDSTEETIVKTVVEELDQIGNLLSLRVHSVEEKSSKISNITVEQRVPSKAP
420 430 440 450 460
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10 20
pF1KE0 MSLQFSNGSRHV-CL---RSGAGSVRPLNGGA--
:: :: :. .: :.. ..::.
CCDS11 GGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGL---GSVPGGSHAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGN
: :::. ::: .: . ..::: :: ::. .::..:.. :: :..:::::::
CCDS11 GSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGF-GGDGGLLSGN
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIE
:::::::::::::::::.::::::.: ::: ::: ::::.: .: .: .:::.:. ::.
CCDS11 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTID
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTL
::::.:.. :: :::..::::::::::::::::::::..:.:.:::::::::::::::::
CCDS11 DLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTL
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 CRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAE
..: :.: :::.::..::::::::::: :. .. :.:::::::::::::. ::::::..
CCDS11 TKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQ
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 YEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMA
:: ::::::::::::::::: : .:... . .:..::.::..:.:::.::: .:
CCDS11 YEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLA
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 TKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEK
:.::: ::.:::. ::.::.::::::.::::::.:.:.::: :. ::..:::.:..::.
CCDS11 LKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLEN
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 EIETYCRLIDGDGNSCSKSKG---FGSGSPGNSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSR
::.:: :..:.:.: . ..: ::.: :.::
CCDS11 EIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSS
450 460 470 480 490 500
450 460
pF1KE0 IHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
CCDS11 GGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSG
510 520 530 540 550 560
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGG--
.: .: .::: :: :: .. :::::
CCDS11 SVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAASMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAG--YGRALGGGSF
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60 70 80 90 100 110
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:: ::: .::.:: ..:..::::::.:: ::::::::::::::.:::::::
CCDS11 GGLGMGFGGSPGGGSLGI-----LSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 NAELERKIKGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARL
:.::: ::. ::: : :. . . :::.:. ::::.:::::.. ::...::::::::
CCDS11 NTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARL
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AADDFRLKYENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEE
::.:::.::::::.:.:.::::::::::::::::: ::: :.: :::.::..:.:::::.
CCDS11 AAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHED
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EMKALQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQ
:..... .. :.:.:::.:::::::. :::.:::.::..:::::::::::: :::. :..
CCDS11 ELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRK
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QISHDSGAATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQA
.:: .. ..:..:..::..:.:::.::: .: :.::: ::.:.:..::.::.:.:
CCDS11 EISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQ
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400
pF1KE0 QIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGD--GNSCSKSKGFG
:. :: :: :::...: :......::.::..:: ::::: ::.::. :.. .: :
CCDS11 LISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESL-FV
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 SGSPG-----NSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVP
. : . .:::: .:: .::::.:. . :.:.::... :::
CCDS11 TDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVN-GEVVSSQVQEIEELM
450 460 470 480 490
pF1KE0 F
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10 20 30
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAG---FAGSS-
::.::: : :..:.. . :::. ..:.:
CCDS11 MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSSGSR--C-GLGGSSAQGFRGGASSCSLSGGSS
10 20 30 40 50
40 50 60 70
pF1KE0 -ACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPG-------GSHAGGALGNAACIGFAGS---------
: ::: .:. ::..:::.:.. : :: ::. : . :: ::
CCDS11 GAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFGGVSGFGRGSGFCGSSRFSSGATG
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120
pF1KE0 --------------EGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYE
.:::.::.:: ::::::::::.:::.::::::::..:: ::: ::.
CCDS11 GFYSYGGGMGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTDLENKIKEWYD
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
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:::::: : . .:::.:. ::::.:.::..:. ::..::.::::::::::::::::::
CCDS11 KYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAADDFRLKYENE
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pF1KE0 LTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGN
: :.:.:::::::::.:::.::. :.: :.: ::..::..::.:::::::: .: ..::.
CCDS11 LCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEMKNMQGSSGGE
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFA
:.::::::::.::. :::.:::.:: ::::::..:: ::..::::: ::: :.:::: :
CCDS11 VTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQISTDAGAATSA
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
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....::..::::.:::.::: .: : ::: .:..::..: .::..::.::.::::.. :.
CCDS11 KNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQISALEEEICQI
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410
pF1KE0 RTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSK--GFGSGSPGNSSKDL-
::. :. ::..:::.:..:: ::::: ::.::.:.. : .. : .::: . .:.::
CCDS11 WGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSGSVNMGSRDLV
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460
pF1KE0 ----------------SKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVP
::: ..::.:::: . :::.::.. :: :
CCDS11 SGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVD-GKVVSSQVSSISEVKVK
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pF1KE0 F
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10 20 30 40
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:.:: : : ::. : :. :: ::..:.::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
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:.:::: .:: ::...:: .::.. ::::..: :: :.:::::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGSEKVTM
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pF1KE0 QNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNK
::::::::::::.:::::::::.:: ::. ::.. :. . ::: : :::::.::
CCDS11 QNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK----DYSPYFKTIEDLRNK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 IISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQ
:...:. ::::.:::::::::::::: :::.::.:...::::::::::::::::: :.:
CCDS11 ILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALA
:.: :::.::..::::::::::.::. .::.:::::.:::::::. .::.:: .:: .:
CCDS11 EMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSL
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CCDS11 EKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETY
: :: ::.. :: :::::: .::..:::: :.: : : :. ::. :::::..::.:: ::
CCDS11 ENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATY
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE0 CRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLSKTT-LVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEK
::..:. :.:. :.::: .::.:..... ..: : .. . :::.:.. . .. :
CCDS11 RRLLEGEDAHLSSSQ-FSSGS--QSSRDVTSSSRQIRTKVMDV-HDGKVVSTHEQVLRTK
420 430 440 450 460 470
450 460
pF1KE0 TSKMTNGKTEQRVPF
CCDS11 N
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10 20 30 40
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::.:. : ...... ::. ::. .:.
CCDS11 LQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGYGGGMR
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:..::: ::: ::. .:: .:.. ::.:..:::::::::.::::::::::::::.::
CCDS11 VCGFGGGAGSVFGGGFGGG-VGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVR
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:::::::.:: ::. ::.: : : : :::.: :::.:..::...: :. :::
CCDS11 ALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPEC-----DYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVIL
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.:::::::::::::::::::.:.:.::::::::::::::::: ::: :.: :.:.::..:
CCDS11 EIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAY
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:::::::::: .. .:.:::::.:::::::. .: .:: .:::.::.::.:.::::
CCDS11 LKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFS
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:. :..... .. .....:..:::.: :::.::: .. : .:: ::.::: : :
CCDS11 KTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYAT
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pF1KE0 QLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDG-DGNSCS
:: :::. ::.:: :: ..: : :.:. ::. :::.:..::.:: :: :..: :.. .
CCDS11 QLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAG
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. .:.. :.::... .: : .: :.:.::. . :
CCDS11 IAIREASSGGGGSSSNFH-----INVEESVD--GQVVSSHKREI
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pF1KE0 PF
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10 20
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.: ...:: .. :.: : : .::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
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30 40 50 60 70 80
pF1KE0 AGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGSHAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEK
: :.. :: ..: :. ..::: :. :.. ::.:: . ::::..: :: :.::
CCDS11 ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGF-GGGLGAGFGGGFAGGDG-LLVGSEK
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pF1KE0 VTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDL
:::::::::::::::.:::::::::.:: ::. ::.. :. . ::: : :::::
CCDS11 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIK----DYSPYFKTIEDL
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pF1KE0 KNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCR
.::::..: ::. ::::::::::::::: :::.::.:.:.::::.:::::::::::: :
CCDS11 RNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLAR
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210 220 230 240 250 260
pF1KE0 TDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYE
:: :.: :.:.::..::.::::::: ::. .::.:::::.:::::::. .::.:: .::
CCDS11 TDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 ALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATK
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CCDS11 QMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMK
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CCDS11 ASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEI
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CCDS11 ATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
450 460
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464 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]