Result of FASTA (omim) for
pF1KE0560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0560, 464 aa
1>>>pF1KE0560 464 - 464 aa - 464 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0382+/-0.000447; mu= -0.6997+/- 0.028
mean_var=180.0716+/-37.438, 0's: 0 Z-trim(116.1): 127 B-trim: 573 in 2/51
Lambda= 0.095577
statistics sampled from 26873 (27010) to 26873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16
Scan time: 10.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 3003 426.7 6.4e-119
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 2291 328.6 2.3e-89
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 2161 310.6 5.5e-84
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 2144 308.3 2.8e-83
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 2029 292.4 1.7e-78
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1544 225.6 2.8e-58
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1536 224.5 6.4e-58
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1440 211.2 5.1e-54
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1439 211.1 5.9e-54
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1412 207.4 7.4e-53
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1384 203.5 1e-51
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1373 202.0 2.9e-51
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1350 198.8 2.7e-50
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1345 198.1 4.2e-50
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1343 197.8 5.1e-50
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1334 196.6 1.1e-49
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1327 195.6 2.2e-49
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1324 195.2 2.9e-49
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1260 186.4 1.3e-46
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1260 186.4 1.3e-46
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1213 179.9 1.1e-44
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1116 166.6 1.7e-40
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1106 165.2 3.5e-40
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1049 157.3 7.6e-38
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1044 156.6 1.3e-37
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1044 156.6 1.3e-37
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 984 148.3 4e-35
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 979 147.6 5.8e-35
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 966 145.8 2.1e-34
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 964 145.5 2.5e-34
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 929 140.7 7.1e-33
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 929 140.7 7.4e-33
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 924 140.0 1.2e-32
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 916 138.9 2.5e-32
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 916 138.9 2.5e-32
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 909 138.0 5e-32
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 909 138.0 5.5e-32
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 892 135.7 2.8e-31
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 858 131.0 6.7e-30
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 847 129.4 2e-29
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 669 104.8 3.2e-22
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 669 104.8 3.2e-22
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 669 104.8 3.2e-22
NP_116116 (OMIM: 605338) alpha-internexin [Homo sa ( 499) 576 92.1 3.7e-18
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 558 89.6 2e-17
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 558 89.6 2e-17
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 553 88.9 3.2e-17
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 533 86.3 3.9e-16
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 519 84.2 7.7e-16
XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472) 519 84.2 8.3e-16
>>NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskeletal (464 aa)
initn: 3003 init1: 3003 opt: 3003 Z-score: 2256.0 bits: 426.7 E(85289): 6.4e-119
Smith-Waterman score: 3003; 100.0% identity (100.0% similar) in 464 aa overlap (1-464:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE0 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
430 440 450 460
>>NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskeletal (459 aa)
initn: 2344 init1: 1923 opt: 2291 Z-score: 1725.5 bits: 328.6 E(85289): 2.3e-89
Smith-Waterman score: 2291; 77.1% identity (92.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::..::. ::.. .:.:::: .:::::.....:: :: ::::.:: .: ::
NP_853 MSVRFSSTSRRLGSCGGTGSVRLSSGGAGFGAGNTCGVPGIGSGFSCAFGG--SSSAGGY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
.: . :.:.: .:.:.: ::::::::::::::::::::::.::::::::::.::.::::
NP_853 GGGLGGGSASCAAFTGNEHGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLENVRALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :..:::.:::.::.::.:.:: :::::.:::::::.:
NP_853 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDELKNQIISATTSNAHVVLQNDNARLTADDFRLKFE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
:::.:::.::::::::::::::::::::: :.: :.::::..::::::::::::::::::
NP_853 NELALHQSVEADINGLRRVLDELTLCRTDLEIQLETLSEELAYLKKNHEEEMKALQCAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: :.::.:
NP_853 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISDDAGATT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::..: ::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_853 SARNELIEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCSKSKGFGSGSPGNSSKDLS
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NP_853 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKVHLEKEIETYCLLIDGEDGSCSKSKGYGG--PGNQTKDSS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460
pF1KE0 KTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
:::.:::::::.: ::::::::.:..:::..:. :.:.::::
NP_853 KTTIVKTVVEEIDPRGKVLSSRVHTVEEKSTKV-NNKNEQRVSS
420 430 440 450
>>NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cytosk (450 aa)
initn: 2041 init1: 1876 opt: 2161 Z-score: 1628.7 bits: 310.6 E(85289): 5.5e-84
Smith-Waterman score: 2161; 74.0% identity (89.9% similar) in 454 aa overlap (1-450:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
:::..:..::. : : .::.: .::..:. ...:: : :: :: :.:: : ::.
NP_853 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGG---SSSGGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
.:: : ::. .: :::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::::
NP_853 TGGGN----PCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :.::::.::.:::.:::..::::::::.:::::::::
NP_853 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
:::.:::.::::.:::::::::.:::::: :.:::.::::::::::::.:::..::::::
NP_853 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::.:
NP_853 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::..::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_853 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCS----KSKGFGSGSPGNSS
::::::::::::::.:::.:.:::::::::: :: :: ..:. ::: .:::. :..
NP_853 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 KDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
:: .:. .:: :.::.:::.:.:..:.::.:::.
NP_853 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
420 430 440 450
>>XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: keratin, (448 aa)
initn: 2041 init1: 1876 opt: 2144 Z-score: 1616.1 bits: 308.3 E(85289): 2.8e-83
Smith-Waterman score: 2144; 74.2% identity (89.8% similar) in 449 aa overlap (6-450:4-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
.:.::. : : .::.: .::..:. ...:: : :: :: :.: :: ::.
XP_011 MSPANASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFG---GSSSGGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
.:: : ::. .: :::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::::
XP_011 TGGGN----PCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :.::::.::.:::.:::..::::::::.:::::::::
XP_011 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
:::.:::.::::.:::::::::.:::::: :.:::.::::::::::::.:::..::::::
XP_011 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::.:
XP_011 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
::..::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_011 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCS----KSKGFGSGSPGNSS
::::::::::::::.:::.:.:::::::::: :: :: ..:. ::: .:::. :..
XP_011 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 KDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
:: .:. .:: :.::.:::.:.:..:.::.:::.
XP_011 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
420 430 440
>>NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskeletal (468 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
::...:.:::..: :.:.: : .::.::.....: :: : : :::.: : ..: :::
NP_853 MSFRLSGGSRRICSRTGSG--RLSGGGTGFVAGNVCVGSGARSSFSCTLEG-ISS--GGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 --HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKI
..::.::..:: :: :.: .::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::
NP_853 FCNSGGGLGSGACAGFLGNEHSLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDHVHALEEANADLEQKI
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 KGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLK
:::::: ::: : ::::::: .::::: .:::.: ::...:: :::::.:::::::
NP_853 KGWYEKCEPGSSREHDHDYSRYFSVIEDLKRQIISATICNASIVLQNDNARLTADDFRLK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YENELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCA
:::::.::..:::: .:::::::::::: :: :.: :.::::.:::::.:::::..:: .
NP_853 YENELALHHSVEADTSGLRRVLDELTLCTTDLEIQCETLSEELTYLKKSHEEEMEVLQYT
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 AGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGA
:::::::::::.:::::.::::::::::: :::::::::::::::.::.:::::: ::
NP_853 AGGNVNVEMNATPGVDLTVLLNNMRAEYEDLAEQNRKDAEAWFNERSATLQQQISDHEGA
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pF1KE0 ATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQ
:: ::..:::..:.::::::.::::::.::: ::::.:::.:::.:: ::: :::..:::
NP_853 ATAARNELTELKRNLQTLEIELQSLMAVKHSYECSLAETEGNYCNQLQQIQDQIGVMEEQ
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:.:.::::::::::::.:::::. :::::. :: :.::. ..: ::::. . ::
NP_853 LQQIRTETEGQKLEYEQLLDVKIFLEKEIDIYCNLLDGEERKSKSTCYKSKGYRPVNSGN
360 370 380 390 400 410
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..:: .. :.:::::::::: :..:: :.::.:::.::..: .:::::
NP_853 QAKDSTEETIVKTVVEELDQIGNLLSLRVHSVEEKSSKISNITVEQRVPSKAP
420 430 440 450 460
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10 20
pF1KE0 MSLQFSNGSRHV-CL---RSGAGSVRPLNGGA--
:: :: :. .: :.. ..::.
NP_000 GGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR
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30 40 50 60 70 80
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: :::. ::: .:: . ..::: :: ::. .::..:.. :: :..:::::::
NP_000 GSYGSSSFGGSYGGSFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGF-GGDGGLLSGN
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90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIE
:::::::::::::::::.::::::.: ::: ::: ::::.: .: .: .:::.:. ::.
NP_000 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTID
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150 160 170 180 190 200
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::::.:.. :: :::..::::::::::::::::::::..:.:.:::::::::::::::::
NP_000 DLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTL
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210 220 230 240 250 260
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..: :.: :::.::..::::::::::: :. .. :.:::::::::::::. ::::::..
NP_000 TKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQ
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270 280 290 300 310 320
pF1KE0 YEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMA
:: ::::::::::::::::: : .:... . .:..::.::..:.:::.::: .:
NP_000 YEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLA
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330 340 350 360 370 380
pF1KE0 TKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEK
:.::: ::.:::. ::.::.::::::.::::::.:.:.::: :. ::..:::.:..::.
NP_000 LKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLEN
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390 400 410 420 430 440
pF1KE0 EIETYCRLIDGDGNSCSKSKG---FGSGSPGNSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSR
::.:: :..:.:.: . ..: ::.: :.::
NP_000 EIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSS
450 460 470 480 490 500
450 460
pF1KE0 IHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
NP_000 GGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSG
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>>XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) PREDI (624 aa)
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10 20
pF1KE0 MSLQFSNGSRHV-CL---RSGAGSVRPLNGGA--
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XP_005 GGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR
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30 40 50 60 70 80
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: :::. ::: .: . ..::: :: ::. .::..:.. :: :..:::::::
XP_005 GSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGF-GGDGGLLSGN
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90 100 110 120 130 140
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:::::::::::::::::.::::::.: ::: ::: ::::.: .: .: .:::.:. ::.
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150 160 170 180 190 200
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::::.:.. :: :::..::::::::::::::::::::..:.:.:::::::::::::::::
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210 220 230 240 250 260
pF1KE0 CRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAE
..: :.: :::.::..::::::::::: :. .. :.:::::::::::::. ::::::..
XP_005 TKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQ
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270 280 290 300 310 320
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:: ::::::::::::::::: : .:... . .:..::.::..:.:::.::: .:
XP_005 YEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLA
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330 340 350 360 370 380
pF1KE0 TKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEK
:.::: ::.:::. ::.::.::::::.::::::.:.:.::: :. ::..:::.:..::.
XP_005 LKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLEN
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 EIETYCRLIDGDGNSCSKSKG---FGSGSPGNSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSR
::.:: :..:.:.: . ..: ::.: :.::
XP_005 EIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSS
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450 460
pF1KE0 IHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
XP_005 GGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGGYGGGSSGGGSSSGGGYGGGSSSG
510 520 530 540 550 560
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10 20 30 40 50
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NP_000 NTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARL
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::.:::.::::::.:.:.::::::::::::::::: ::: :.: :::.::..:.:::::.
NP_000 AAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHED
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240 250 260 270 280 290
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:..... .. :.:.:::.:::::::. :::.:::.::..:::::::::::: :::. :..
NP_000 ELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRK
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.:: .. ..:..:..::..:.:::.::: .: :.::: ::.:.:..::.::.:.:
NP_000 EISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQ
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pF1KE0 QIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGD--GNSCSKSKGFG
:. :: :: :::...: :......::.::..:: ::::: ::.::. :.. .: :
NP_000 LISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESL-FV
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pF1KE0 SGSPG-----NSSKDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVP
. : . .:::: .:: .::::.:. . :.:.::... :::
NP_000 TDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVN-GEVVSSQVQEIEELM
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pF1KE0 F
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::.::: : :..:.. . :::. ..:.:
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40 50 60 70
pF1KE0 -ACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPG-------GSHAGGALGNAACIGFAGS---------
: ::: .:. ::..:::.:.. : :: ::. : . :: ::
NP_061 GAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFGGVSGFGRGSGFCGSSRFSSGATG
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pF1KE0 --------------EGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYE
.:::.::.:: ::::::::::.:::.::::::::..:: ::: ::.
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pF1KE0 KYGPGSCRGLD-HDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYENE
:::::: : . .:::.:. ::::.:.::..:. ::..::.::::::::::::::::::
NP_061 KYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAADDFRLKYENE
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pF1KE0 LTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAGGN
: :.:.:::::::::.:::.::. :.: :.: ::..::..::.:::::::: .: ..::.
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pF1KE0 VNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAATFA
:.::::::::.::. :::.:::.:: ::::::..:: ::..::::: ::: :.:::: :
NP_061 VTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQISTDAGAATSA
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pF1KE0 RSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLHQV
....::..::::.:::.::: .: : ::: .:..::..: .::..::.::.::::.. :.
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::. :. ::..:::.:..:: ::::: ::.::.:.. : .. : .::: . .:.::
NP_061 WGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSGSVNMGSRDLV
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420 430 440 450 460
pF1KE0 ----------------SKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVP
::: ..::.:::: . :::.::.. :: :
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pF1KE0 F
>>XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, type I (494 aa)
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10 20 30
pF1KE0 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAG---FAGSS-
::.::: : :..:.. . :::. ..:.:
XP_016 MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSSGSR--C-GLGGSSAQGFRGGASSCSLSGGSS
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pF1KE0 -ACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPG-------GSHAGGALGNAACIGFAGS---------
: ::: .:. ::..:::.:.. : :: ::. : . :: ::
XP_016 GAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFGGVSGFGRGSGFCGSSRFSSGATG
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120
pF1KE0 --------------EGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKGWYE
.:::.::.:: ::::::::::.:::.::::::::..:: ::: ::.
XP_016 GFYSYGGGMGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTDLENKIKEWYD
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:::::: : . .:::.:. ::::.:.::..:. ::..::.::::::::::::::::::
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: :.:.:::::::::.:::.::. :.: :.: ::..::..::.:::::::: .: ..::.
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:.::::::::.::. :::.:::.:: ::::::..:: ::..::::: ::: :.:::: :
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....::..::::.:::.::: .: : ::: .:..::..: .::..::.::.::::.. :.
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::. :. ::..:::.:..:: ::::: ::.::.:
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