Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0624
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0624, 370 aa
1>>>pF1KE0624 370 - 370 aa - 370 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0520+/-0.00118; mu= 8.5280+/- 0.068
mean_var=232.3008+/-53.078, 0's: 0 Z-trim(109.2): 693 B-trim: 105 in 1/49
Lambda= 0.084149
statistics sampled from 9892 (10724) to 9892 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 2508 317.9 9.1e-87
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 1801 232.0 6.1e-61
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 1801 232.1 6.4e-61
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 1516 197.4 1.6e-50
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 1516 197.5 1.8e-50
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 1482 193.5 3.3e-49
CCDS33762.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 501) 1005 135.6 9.2e-32
CCDS82776.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 470) 999 134.8 1.5e-31
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 927 126.1 6.3e-29
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 925 125.8 7e-29
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 871 119.6 9.4e-27
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 871 119.6 9.5e-27
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 850 116.7 3.9e-26
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 850 116.7 3.9e-26
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 850 117.0 5.3e-26
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 850 117.0 5.4e-26
CCDS6240.1 PSKH2 gene_id:85481|Hs108|chr8 ( 385) 833 114.6 1.5e-25
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 786 109.1 1.1e-23
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 784 108.8 1.2e-23
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 777 107.9 2e-23
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 777 107.9 2.1e-23
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 773 107.4 2.8e-23
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 772 107.3 2.9e-23
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 772 107.3 3e-23
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 766 106.6 5.1e-23
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 766 106.6 5.2e-23
CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845) 767 107.5 1e-22
CCDS46896.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1914) 767 107.5 1e-22
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 755 105.2 1.2e-22
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 755 105.2 1.2e-22
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 755 105.2 1.2e-22
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 755 105.2 1.3e-22
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 755 105.2 1.3e-22
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 755 105.2 1.3e-22
CCDS5487.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 492) 746 104.1 2.7e-22
CCDS5484.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 542) 746 104.2 2.8e-22
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 744 103.8 3e-22
CCDS5483.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 666) 746 104.3 3.2e-22
CCDS43573.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 517) 739 103.3 4.9e-22
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 738 103.1 5.1e-22
CCDS5486.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 503) 738 103.2 5.3e-22
CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 738 103.2 5.4e-22
CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 543) 737 103.1 6e-22
CCDS33629.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 586) 737 103.1 6.3e-22
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 736 103.5 1.2e-21
CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 ( 370) 689 97.0 2.7e-20
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 688 97.0 3.3e-20
CCDS2832.1 MAPKAPK3 gene_id:7867|Hs108|chr3 ( 382) 655 92.9 4.9e-19
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 658 93.7 5.6e-19
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 658 93.7 5.6e-19
>>CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 (370 aa)
initn: 2508 init1: 2508 opt: 2508 Z-score: 1671.2 bits: 317.9 E(32554): 9.1e-87
Smith-Waterman score: 2508; 100.0% identity (100.0% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEALEGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEALEGKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERDASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERDASR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLSTACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLSTACG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEFDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEFDSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKNFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKNFAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVEPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVEPGT
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE0 ELSPTLPHQL
::::::::::
CCDS25 ELSPTLPHQL
370
>>CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 (357 aa)
initn: 1847 init1: 1798 opt: 1801 Z-score: 1207.5 bits: 232.0 E(32554): 6.1e-61
Smith-Waterman score: 1801; 82.2% identity (94.2% similar) in 325 aa overlap (10-333:12-336)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGAVEGPRWK-QAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEALE
:: :::::. :..:...:::::::::.:::.: : :: :.::: :.::.
CCDS70 MARENGESSSSWKKQAEDIKKIFEFKETLGTGAFSEVVLAEEKATGKLFAVKCIPKKALK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERD
:::.:.:::::::.:::: :::::.::::: .::::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS70 GKESSIENEIAVLRKIKHENIVALEDIYESPNHLYLVMQLVSGGELFDRIVEKGFYTEKD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLST
:: :: :::::: ::: .:::::::::::::::: ::.:::::::::::::: :.:.::
CCDS70 ASTLIRQVLDAVYYLHRMGIVHRDLKPENLLYYSQDEESKIMISDFGLSKMEGKGDVMST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS70 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDSKLFEQILKAEYEF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKN
:::::::::::::::::.::::::.::.::::: .::::::::::.::::.::: ::.::
CCDS70 DSPYWDDISDSAKDFIRNLMEKDPNKRYTCEQAARHPWIAGDTALNKNIHESVSAQIRKN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVE
::::::.:::::::::::::::.::.: .... ..:
CCDS70 FAKSKWRQAFNATAVVRHMRKLHLGSSLDSSNASVSSSLSLASQKDCAYVAKPESLS
310 320 330 340 350
360 370
pF1KE0 PGTELSPTLPHQL
>>CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 (385 aa)
initn: 1827 init1: 1798 opt: 1801 Z-score: 1207.2 bits: 232.1 E(32554): 6.4e-61
Smith-Waterman score: 1801; 82.2% identity (94.2% similar) in 325 aa overlap (10-333:12-336)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGAVEGPRWK-QAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEALE
:: :::::. :..:...:::::::::.:::.: : :: :.::: :.::.
CCDS70 MARENGESSSSWKKQAEDIKKIFEFKETLGTGAFSEVVLAEEKATGKLFAVKCIPKKALK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERD
:::.:.:::::::.:::: :::::.::::: .::::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS70 GKESSIENEIAVLRKIKHENIVALEDIYESPNHLYLVMQLVSGGELFDRIVEKGFYTEKD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLST
:: :: :::::: ::: .:::::::::::::::: ::.:::::::::::::: :.:.::
CCDS70 ASTLIRQVLDAVYYLHRMGIVHRDLKPENLLYYSQDEESKIMISDFGLSKMEGKGDVMST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS70 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDSKLFEQILKAEYEF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKN
:::::::::::::::::.::::::.::.::::: .::::::::::.::::.::: ::.::
CCDS70 DSPYWDDISDSAKDFIRNLMEKDPNKRYTCEQAARHPWIAGDTALNKNIHESVSAQIRKN
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVE
::::::.:::::::::::::::.::.: .... ..:
CCDS70 FAKSKWRQAFNATAVVRHMRKLHLGSSLDSSNASVSSSLSLASQKDCLAPSTLCSFISSS
310 320 330 340 350 360
360 370
pF1KE0 PGTELSPTLPHQL
CCDS70 SGVSGVGAERRPRPTTVTAVHSGSK
370 380
>>CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX (360 aa)
initn: 1489 init1: 800 opt: 1516 Z-score: 1020.5 bits: 197.4 E(32554): 1.6e-50
Smith-Waterman score: 1516; 68.2% identity (90.3% similar) in 321 aa overlap (11-331:23-340)
10 20 30 40
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAI
:..::: ..:..:. ::.::::::.::... . .:::.
CCDS48 MWRRVCGGLAGRRPSGDMLLLKKHTEDISSVYEIRERLGSGAFSEVVLAQERGSAHLVAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KCIAKEALEGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIV
::: :.::.:::. .:::::::..:.:::::::.:..:: .:::: :.::.::::::::.
CCDS48 KCIPKKALRGKEALVENEIAVLRRISHPNIVALEDVHESPSHLYLAMELVTGGELFDRIM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EKGFYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKM
:.: :::.:::.:. ::: ::.:::.::::::::::::::: . ::::::.:::::::.
CCDS48 ERGSYTEKDASHLVGQVLGAVSYLHSLGIVHRDLKPENLLYATPFEDSKIMVSDFGLSKI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 EDPGSVLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFE
. :..:.::::::::::::.: ::::.:::: :..:::.:::::::::::::.: .::
CCDS48 Q-AGNMLGTACGTPGYVAPELLEQKPYGKAVDVWALGVISYILLCGYPPFYDESDPELFS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQ
:::.: ::::::.:::::.:::::::::.:.::.:::::.:::.: ::.::::.:..:
CCDS48 QILRASYEFDSPFWDDISESAKDFIRHLLERDPQKRFTCQQALRHLWISGDTAFDRDILG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SVSEQIKKNFAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAG
::::::.::::...::.:::::. .::.:: :: ::.: .
CCDS48 SVSEQIRKNFARTHWKRAFNATSFLRHIRK--LGQIPEGEGASEQGMARHSHSGLRAGQP
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE0 CCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
CCDS48 PKW
360
>>CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX (426 aa)
initn: 1489 init1: 800 opt: 1516 Z-score: 1019.7 bits: 197.5 E(32554): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 1516; 68.2% identity (90.3% similar) in 321 aa overlap (11-331:89-406)
10 20 30 40
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDK
:..::: ..:..:. ::.::::::.::...
CCDS35 AARASSGLGGGGRHPSRIPAIALQDMLLLKKHTEDISSVYEIRERLGSGAFSEVVLAQER
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RTQKLVAIKCIAKEALEGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSG
. .:::.::: :.::.:::. .:::::::..:.:::::::.:..:: .:::: :.::.:
CCDS35 GSAHLVALKCIPKKALRGKEALVENEIAVLRRISHPNIVALEDVHESPSHLYLAMELVTG
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GELFDRIVEKGFYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMI
:::::::.:.: :::.:::.:. ::: ::.:::.::::::::::::::: . ::::::.
CCDS35 GELFDRIMERGSYTEKDASHLVGQVLGAVSYLHSLGIVHRDLKPENLLYATPFEDSKIMV
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SDFGLSKMEDPGSVLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYD
:::::::.. :..:.::::::::::::.: ::::.:::: :..:::.::::::::::::
CCDS35 SDFGLSKIQ-AGNMLGTACGTPGYVAPELLEQKPYGKAVDVWALGVISYILLCGYPPFYD
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ENDAKLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDT
:.: .:: :::.: ::::::.:::::.:::::::::.:.::.:::::.:::.: ::.:::
CCDS35 ESDPELFSQILRASYEFDSPFWDDISESAKDFIRHLLERDPQKRFTCQQALRHLWISGDT
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ALDKNIHQSVSEQIKKNFAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTP
:.:..: ::::::.::::...::.:::::. .::.:: :: ::.: .
CCDS35 AFDRDILGSVSEQIRKNFARTHWKRAFNATSFLRHIRK--LGQIPEGEGASEQGMARHSH
360 370 380 390 400 410
350 360 370
pF1KE0 VAGGPAAGCCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
CCDS35 SGLRAGQPPKW
420
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGAVEGPRWK-QAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEALE
:: :. .:: . : .:::.::::::.:.... : :: :.::: :..
CCDS14 MGRKEEDDCSSWKKQTTNIRKTFIFMEVLGSGAFSEVFLVKQRLTGKLFALKCI-KKSPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTERD
...:.:::::::.:::: :::.:.::::: : ::.:::::::::::::.:.: :::.:
CCDS14 FRDSSLENEIAVLKKIKHENIVTLEDIYESTTHYYLVMQLVSGGELFDRILERGVYTEKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLST
:: .: :::.::::::. :::::::::::::: . .:.:::::.::::::::. : ..::
CCDS14 ASLVIQQVLSAVKYLHENGIVHRDLKPENLLYLTPEENSKIMITDFGLSKMEQNG-IMST
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLFEQILKAEYEF
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:...::::.: .. :::
CCDS14 ACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVITYILLCGYPPFYEETESKLFEKIKEGYYEF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQSVSEQIKKN
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CCDS14 ESPFWDDISESAKDFICHLLEKDPNERYTCEKALSHPWIDGNTALHRDIYPSVSLQIQKN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 FAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAGCCCRDCCVE
::::::.:::::.:::.:::::... . :
CCDS14 FAKSKWRQAFNAAAVVHHMRKLHMNLHSPGVRPEVENRPPETQASETSRPSSPEITITEA
300 310 320 330 340 350
>>CCDS33762.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 (501 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEAL
..: .. : ::. .:. : : :.. :.:: : :: . : . :.
CCDS33 MPFGCVTLGDKKNYNQPSEVTDRYDLGQVIKTEEFCEIFRAKDKTTGKLHTCKKFQKRDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 EGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTER
. . . .:::..:. .:::::. : :.. . . .....:..: :.:: :...:.:.::
CCDS33 RKVRKAAKNEIGILKMVKHPNILQLVDVFVTRKEYFIFLELATGREVFDWILDQGYYSER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLS
:.: .. :::.:: :::.: ::::.:: :::.::. ..:::.:::: :.:.:. ....
CCDS33 DTSNVVRQVLEAVAYLHSLKIVHRNLKLENLVYYNRLKNSKIVISDFHLAKLEN--GLIK
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 TACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDE--------NDAKLFE
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CCDS33 EPCGTPEYLAPEVVGRQRYGRPVDCWAIGVIMYILLSGNPPFYEEVEEDDYENHDKNLFR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQ
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CCDS33 KILAGDYEFDSPYWDDISQAAKDLVTRLMEVEQDQRITAEEAISHEWISGNAASDKNIKD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SVSEQIKKNFAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTP-VAGGPAA
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CCDS33 GVCAQIEKNFARAKWKKAVRVTTLMKRLRAPE--QSSTAAAQSASATDTATPGAAGGATA
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE0 GCCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
CCDS33 AAASGATSAPEGDAARAAKSDNVAPADRSATPATDGSATPATDGSVTPATDGSITPATDG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS82776.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 (470 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIKCIAKEAL
..: .. : ::. .:. : : :.. :.:: : :: . : . :.
CCDS82 MPFGCVTLGDKKNYNQPSEVTDRYDLGQVIKTEEFCEIFRAKDKTTGKLHTCKKFQKRDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 EGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVEKGFYTER
. . . .:::..:. .:::::. : :.. . . .....:..: :.:: :...:.:.::
CCDS82 RKVRKAAKNEIGILKMVKHPNILQLVDVFVTRKEYFIFLELATGREVFDWILDQGYYSER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKMEDPGSVLS
:.: .. :::.:: :::.: ::::.:: :::.::. ..:::.:::: :.:.:. ....
CCDS82 DTSNVVRQVLEAVAYLHSLKIVHRNLKLENLVYYNRLKNSKIVISDFHLAKLEN--GLIK
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 TACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDE--------NDAKLFE
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CCDS82 EPCGTPEYLAPEVVGRQRYGRPVDCWAIGVIMYILLSGNPPFYEEVEEDDYENHDKNLFR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDKNIHQ
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CCDS82 KILAGDYEFDSPYWDDISQAAKDLVTRLMEVEQDQRITAEEAISHEWISGNAASDKNIKD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SVSEQIKKNFAKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTASHGELLTPVAGGPAAG
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CCDS82 GVCAQIEKNFARAKWKKAVRVTTLMKRLRAPE--QSSTAAAQSASATDTATPGAADRSA-
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE0 CCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
: . :.:. : :
CCDS82 TPATDGSATPATDGSVTPATDGSITPATDGSVTPATDRSATPATDGRATPATEESTVPTT
360 370 380 390 400 410
>>CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 (473 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKL
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CCDS41 SSCSSVTASAAPGTASLVPDYWIDGSNRDALSDFFEVESELGRGATSIVYRCKQKGTQKP
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VAIKCIAKEALEGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFD
:.: . :.... : ...::.:: ...::::. : .:.:. .. :...::.::::::
CCDS41 YALK-VLKKTVDKK--IVRTEIGVLLRLSHPNIIKLKEIFETPTEISLVLELVTGGELFD
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RIVEKGFYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGL
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CCDS41 RIVEKGYYSERDAADAVKQILEAVAYLHENGIVHRDLKPENLLYATPAPDAPLKIADFGL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SKMEDPGSVLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDE-NDA
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CCDS41 SKIVEHQVLMKTVCGTPGYCAPEILRGCAYGPEVDMWSVGIITYILLCGFEPFYDERGDQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KLFEQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALDK
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CCDS41 FMFRRILNCEYYFISPWWDEVSLNAKDLVRKLIVLDPKKRLTTFQALQHPWVTGKAA--N
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NIHQSVSEQIKKNF-AKSKWKQAFNATAVVRHMRKLQLGTSQEGQGQTA-SHGELLTPVA
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CCDS41 FVHMDTAQKKLQEFNARRKLKAAVKA--VVASSR---LGSASSSHGSIQESHKASRDPSP
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KE0 GGPAAGCCCRDCCVEPGTELSPTLPHQL
CCDS41 IQDGNEDMKAIPEGEKIQGDGAQAAVKGAQAELMKVQALEKVKGADINAEEAPKMVPKAV
370 380 390 400 410 420
>>CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 (424 aa)
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Smith-Waterman score: 925; 45.9% identity (77.2% similar) in 303 aa overlap (20-317:98-399)
10 20 30 40
pF1KE0 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVILAEDKRTQKLVAIK
::.. ..: :.::.:. .: . :.. :::
CCDS10 AGHTEPPSEPPRRARVAKYRAKFDPRVTAKYDIKALIGRGSFSRVVRVEHRATRQPYAIK
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CIAKEALEGKEGSMENEIAVLHKIKHPNIVALDDIYESGGHLYLIMQLVSGGELFDRIVE
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CCDS10 MIETKYREGRE-VCESELRVLRRVRHANIIQLVEVFETQERVYMVMELATGGELFDRIIA
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KGFYTERDASRLIFQVLDAVKYLHDLGIVHRDLKPENLLYYSLDEDSKIMISDFGLSKME
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CCDS10 KGSFTERDATRVLQMVLDGVRYLHALGITHRDLKPENLLYYHPGTDSKIIITDFGLASAR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 DPGS--VLSTACGTPGYVAPEVLAQKPYSKAVDCWSIGVIAYILLCGYPPFYDENDAKLF
:. ...:.:::: :.:::::..:::...:: :..:::::::: : :: :.: ..:.
CCDS10 KKGDDCLMKTTCGTPEYIAPEVLVRKPYTNSVDMWALGVIAYILLSGTMPFEDDNRTRLY
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EQILKAEYEFDSPYWDDISDSAKDFIRHLMEKDPEKRFTCEQALQHPWIAGDTALD--KN
.:::...: ... : ..:. ::::: .:. :: :.: :::.:::... .: . ::
CCDS10 RQILRGKYSYSGEPWPSVSNLAKDFIDRLLTVDPGARMTALQALRHPWVVSMAASSSMKN
310 320 330 340 350 360
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CCDS10 LHRSISQNLLKRASSRCQSTKSAQSTRSSRSTRSNKSRRVRERELRELNLRYQQQYNG
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350 360 370
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370 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]