FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0644, 431 aa
1>>>pF1KE0644 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8173+/-0.00125; mu= 14.2141+/- 0.074
mean_var=120.8075+/-39.307, 0's: 0 Z-trim(102.1): 295 B-trim: 865 in 2/46
Lambda= 0.116688
statistics sampled from 6417 (6817) to 6417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 2842 490.7 1.2e-138
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 649 121.5 1.6e-27
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 649 121.5 1.6e-27
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 649 121.6 1.8e-27
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 559 106.4 5.8e-23
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 556 105.8 7.6e-23
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 544 103.8 3e-22
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 541 103.3 4.3e-22
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 491 94.9 1.5e-19
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 487 94.2 2.4e-19
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 476 92.4 9.2e-19
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 475 92.2 1.1e-18
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 474 92.0 1.1e-18
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 448 87.6 2.2e-17
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 447 87.5 2.7e-17
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 446 87.3 2.9e-17
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 446 87.3 3e-17
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 439 86.1 6.6e-17
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 430 84.6 1.8e-16
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 419 82.8 6.8e-16
CCDS9461.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 442) 402 79.9 5.3e-15
CCDS55902.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 532) 402 80.0 6e-15
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 385 77.0 3.3e-14
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 386 77.2 3.4e-14
CCDS45059.1 EDNRB gene_id:1910|Hs108|chr13 ( 436) 383 76.7 4.8e-14
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 289) 369 74.2 1.9e-13
CCDS3769.1 EDNRA gene_id:1909|Hs108|chr4 ( 427) 368 74.2 2.8e-13
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 364 73.6 4.7e-13
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 359 72.6 7.1e-13
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 ( 332) 356 72.1 9.4e-13
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 357 72.3 9.7e-13
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 357 72.4 1e-12
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 347 70.5 2.6e-12
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 347 70.6 3.1e-12
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 345 70.2 3.5e-12
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 343 70.0 5.4e-12
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 340 69.5 6.9e-12
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 339 69.3 8.3e-12
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 329 67.5 2.2e-11
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 ( 326) 327 67.2 2.7e-11
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 325 66.9 3.6e-11
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 327 67.4 3.6e-11
>>CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 (431 aa)
initn: 2842 init1: 2842 opt: 2842 Z-score: 2602.8 bits: 490.7 E(32554): 1.2e-138
Smith-Waterman score: 2842; 100.0% identity (100.0% similar) in 431 aa overlap (1-431:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQALNITPEQFSRLLRDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIFALAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MQALNITPEQFSRLLRDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIFALAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FGNALVFYVVTRSKAMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FGNALVFYVVTRSKAMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICKM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VPFVQSTAVVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VPFVQSTAVVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSPM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 WHVQQLEIKYDFLYEKEHICCLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKIGYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 WHVQQLEIKYDFLYEKEHICCLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKIGYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LWIKKRVGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVVHMMIEYSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LWIKKRVGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVVHMMIEYSN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FEKEYDDVTIKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCYCIVNKTFSPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FEKEYDDVTIKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCYCIVNKTFSPAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLCEQTEEKKKLKRHLALFRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLCEQTEEKKKLKRHLALFRSE
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE0 LAENSPLDSGH
:::::::::::
CCDS37 LAENSPLDSGH
430
>>CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 588 init1: 334 opt: 649 Z-score: 607.8 bits: 121.5 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 649; 31.5% identity (65.6% similar) in 349 aa overlap (19-360:20-361)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQALNITPEQFSRLLRDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIFALA
: :.... . . . : . : : . .... ::: :
CCDS35 MNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAI-FIISYFLIFFLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LFGNALVFYVVTRSKAMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICK
..::..: ..: :.: :.::::.:: .::.::::. .::.:.:.:.:: .: : .::
CCDS35 MMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MVPFVQSTAVVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSP
. .::. .:.. ..:.. :::.: : .:.::: : : . ::... ..:..:. . ::
CCDS35 ISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPK--LTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ---MWHVQQLEIKYDFLYEKEHIC----CLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLI
: :::. . : ... : :.: . .::::: ... ..: :: ...:
CCDS35 SAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LYSKIGYELWIKKRVGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVV
.:..:: :. :.. . : . .. ..:::.. . :.. :. :: . : :. ..
CCDS35 MYGRIGISLF---RAAVPHTGRK-NQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 HMMIEYSNFEKEYDDVTIKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCYCIV
:. .:... . .. .:. ... ..:.:: :::.:.:.::::... : .
CCDS35 MMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 NKTFSPAQRHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLCEQTEEKKKLKR
.: .: .
CCDS35 QKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKE
360 370 380 390 400 410
>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 588 init1: 334 opt: 649 Z-score: 607.7 bits: 121.5 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 649; 31.5% identity (65.6% similar) in 349 aa overlap (19-360:23-364)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQALNITPEQFSRLLRDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIF
: :.... . . . : . : : . .... :::
CCDS47 MFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAI-FIISYFLIF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ALALFGNALVFYVVTRSKAMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAF
: ..::..: ..: :.: :.::::.:: .::.::::. .::.:.:.:.:: .: :
CCDS47 FLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ICKMVPFVQSTAVVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIV
.::. .::. .:.. ..:.. :::.: : .:.::: : : . ::... ..:..:. .
CCDS47 MCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPK--LTIKTAFVIIMIIWVLAITI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 GSP---MWHVQQLEIKYDFLYEKEHIC----CLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMV
:: : :::. . : ... : :.: . .::::: ... ..: :: .
CCDS47 MSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 MLILYSKIGYELWIKKRVGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPF
..:.:..:: :. :.. . : . .. ..:::.. . :.. :. :: . : :.
CCDS47 IVIMYGRIGISLF---RAAVPHTGRK-NQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 HVVHMMIEYSNFEKEYDDVTIKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCY
.. :. .:... . .. .:. ... ..:.:: :::.:.:.::::... :
CCDS47 WTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CIVNKTFSPAQRHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLCEQTEEKKK
. .: .: .
CCDS47 QLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEE
360 370 380 390 400 410
>>CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (522 aa)
initn: 588 init1: 334 opt: 649 Z-score: 606.6 bits: 121.6 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 649; 31.5% identity (65.6% similar) in 349 aa overlap (19-360:122-463)
10 20 30 40
pF1KE0 MQALNITPEQFSRLLRDHNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLAL
: :.... . . . : . : : . .
CCDS35 AADRARRERFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAI-F
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VLTGVLIFALALFGNALVFYVVTRSKAMRTVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNIS
... ::: : ..::..: ..: :.: :.::::.:: .::.::::. .::.:.:.:.::
CCDS35 IISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNII
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 DNWLGGAFICKMVPFVQSTAVVTEILTMTCIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGV
.: : .::. .::. .:.. ..:.. :::.: : .:.::: : : . ::... .
CCDS35 AGWPFGNTMCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPK--LTIKTAFVIIMI
220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VWLVAVIVGSP---MWHVQQLEIKYDFLYEKEHIC----CLEEWTSPVHQKIYTTFILVI
.:..:. . :: : :::. . : ... : :.: . .::::: ...
CCDS35 IWVLAITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFAN
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LFLLPLMVMLILYSKIGYELWIKKRVGDGSVLRTIHGKEMSKIARKKKRAVIMMVTVVAL
..: :: ...:.:..:: :. :.. . : . .. ..:::.. . :.. :. :
CCDS35 IYLAPLSLIVIMYGRIGISLF---RAAVPHTGRK-NQEQWHVVSRKKQKIIKMLLIVALL
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FAVCWAPFHVVHMMIEYSNFEKEYDDVTIKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKK
: . : :. .. :. .:... . .. .:. ... ..:.:: :::.:.:.::::..
CCDS35 FILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAHWLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRR
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 NVLSAVCYCIVNKTFSPAQRHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAFSDGNIEVKLC
. : . .: .: .
CCDS35 GFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQNPHGETLLYRKSAEKP
450 460 470 480 490 500
>>CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 (430 aa)
initn: 455 init1: 308 opt: 559 Z-score: 525.8 bits: 106.4 E(32554): 5.8e-23
Smith-Waterman score: 559; 30.0% identity (65.1% similar) in 307 aa overlap (48-346:46-343)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 HNLTREQFIALYRLRPLVYTPELPGRAKLALVLTGVLIFALALFGNALVFYVVTRSKAMR
.... .::: : . ::.:: ..: ... :.
CCDS53 SQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVGNTLVCFIVLKNRHMH
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 TVTNIFICSLALSDLLITFFCIPVTMLQNISDNWLGGAFICKMVPFVQSTAVVTEILTMT
::::.:: .::.::::. .::.:.:...:. .: ::: .::. .: . ..:..
CCDS53 TVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSGLVQGMSVSASVFTLV
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 CIAVERHQGLVHPFKMKWQYTNRRAFTMLGVVWLVAVIVGSP-MWHVQQLEIKYDFLYEK
::::: . .::::. : : :.:.. ..:.: .:... : . . .. :. .
CCDS53 AIAVERFRCIVHPFREK--LTLRKALVTIAVIWALALLIMCPSAVTLTVTREEHHFMVDA
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EH-----ICCLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKIGYELWIKKRVGDGS
.. : : : ...::: .. ..: :: .....:..:. .: . :
CCDS53 RNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYARIARKLCQAPGPAPG-
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300
pF1KE0 VLRTIHGKEMS--KIARKKKRAVIMMVTVVALFAVCWAPFHVVHMMIEYSNFEKEYDDVT
:.: . . .:.. :.: :.: :. .:.. : :. .. ..:.:... ..
CCDS53 ------GEEAADPRASRRRARVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLIDYGQLSAPQLHLV
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 IKMIFAIVQIIGFSNSICNPIVYAFMNENFKKNVLSAVCYCIVNKTFSPAQRHGNSGITM
. : ... ..: :: :::.:...::::... .:
CCDS53 TVYAFPFAHWLAFFNSSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSHKEAYSERPGG
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CCDS73 QG-----RVFHKGTYSLRAGHMKQVNVVLVVMVVAFAVLWLPLHVFNSLEDW-----HHE
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CCDS73 AIPICHGNLIFLVCHLLAMASTCVNPFIYGFLNTNFKKEIKALVLTCQQSAPLEESEHLP
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CCDS73 LSTVHTEVSKGSLRLSGRSNPI
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CCDS14 TTLAVMGTVPGTGSIQMSEISVTSFTGCSVKQAEDRF
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CCDS51 VPEGWERDFLPASDGTTTELVIRCVIPSLYLLIITVGLLGNIMLVKIFITNSAMRSVPNI
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