Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0711, 423 aa
1>>>pF1KE0711 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3874+/-0.000853; mu= 9.4009+/- 0.052
mean_var=174.8148+/-43.176, 0's: 0 Z-trim(112.7): 214 B-trim: 1396 in 2/49
Lambda= 0.097003
statistics sampled from 13155 (13442) to 13155 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 ( 423) 2815 405.9 3.7e-113
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 783 121.5 1.4e-27
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 751 117.0 3e-26
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 699 109.7 4.4e-24
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 580 93.0 4.3e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 418 70.4 3e-12
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 417 70.3 3.5e-12
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 404 68.5 1.2e-11
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 402 68.2 1.5e-11
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 396 67.4 2.7e-11
>>CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 (423 aa)
initn: 2815 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 2145.1 bits: 405.9 E(32554): 3.7e-113
Smith-Waterman score: 2815; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLCHRGGQLIVPIIPLCPEHSCRGRRLQNLLSGPWPKQPMELHNLSSPSPSLSSSVLPPS
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CCDS18 MLCHRGGQLIVPIIPLCPEHSCRGRRLQNLLSGPWPKQPMELHNLSSPSPSLSSSVLPPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSLALFIFCIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSLALFIFCIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFMLSTNRTASV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFMLSTNRTASV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLSTFSGPSCLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLSTFSGPSCLSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQAGPQRAMRVLAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQAGPQRAMRVLAMV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 NFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGKLKVQGEVSLEKEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGKLKVQGEVSLEKEGS
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SQG
:::
CCDS18 SQG
>>CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 (387 aa)
initn: 759 init1: 460 opt: 783 Z-score: 608.7 bits: 121.5 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 783; 41.8% identity (71.4% similar) in 294 aa overlap (83-362:18-301)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSL
: ..... : :.:.:::..::.::.:
CCDS53 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFML
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CCDS53 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMF
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220
pF1KE0 STNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLW---VGIL--LLNGHL
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CCDS53 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKL
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LLSTFSGPSCLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQ
:... .. :.:. . ..:::.:..::::::::..::: . : ..:.: . .
CCDS53 LIQNGTANVCISFSI----CHTFRWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDRH
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330
pF1KE0 AGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWL------SAC---RSLDLCTQLFH
: .::. . .:. :..::::::.. . . ::: . : ::.:: :
CCDS53 AKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVV---VRIHIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLA---FF
230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 GSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREAS
.:.:::.::.::::.: ::::.:
CCDS53 ITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNK
280 290 300 310 320 330
>>CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 (363 aa)
initn: 743 init1: 451 opt: 751 Z-score: 584.9 bits: 117.0 E(32554): 3e-26
Smith-Waterman score: 751; 41.7% identity (69.5% similar) in 295 aa overlap (83-362:18-301)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSL
: .... : :.:.:::..::.::.:
CCDS92 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGL
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFML
::.:::.: . : :. .:: .:..:::::: ::. .: :. . :.:: :.. ::::
CCDS92 ALWIFCFHLKSWKSSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFML
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220
pF1KE0 STNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILL-LNGHLL---
. :: .:..:::..:..::..::.:::.:.. : .:: .. :: :: . :. :::
CCDS92 AMNRQGSIIFLTVVAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLW-GITIGLTVHLLKKK
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LSTFSGPS--CLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGG
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CCDS92 MPIQNGGANLCSSFSI----CHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQMDR
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330
pF1KE0 QAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWL------SAC---RSLDLCTQLF
.: .::. . .:. :..::::::.. . . ::: . : ::.:: :
CCDS92 HAKIKRAITFIMVVAIVFVICFLPSVV---VRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLA---F
230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 HGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREA
.:.:::.::.::::.: ::::.:
CCDS92 FITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSPSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPN
280 290 300 310 320 330
>>CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 (346 aa)
initn: 545 init1: 440 opt: 699 Z-score: 545.8 bits: 109.7 E(32554): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 699; 39.8% identity (67.8% similar) in 289 aa overlap (81-362:4-285)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SLSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGN
: : .. .: . :.: . :::: .::
CCDS92 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGN
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SLALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLF
..:: ::.: . : .::.: .:..:::::. ::.:.:::: .. : :: :.:.::
CCDS92 GVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLF
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 MLSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLS
:. ::..:.::::..: .::.:::.:::... :. .:: .. ::. ..: . .:::
CCDS92 TLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280
pF1KE0 TF-----SGPSCLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRG-L
. .. :: :. . ::. ::. .. ::::.::..::: .: ..: : :
CCDS92 NHLCVQETAVSCESFIM---ESAN-GWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQL
160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 GGQAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQ-LFHGSLAF
. :: ..: : . .:. :. :.:::. : . .: . : .. .: .:.:
CCDS92 ARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYLPSV---SARLYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSF
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 TYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEA
::.::.:::..: ::::.:
CCDS92 TYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISV
270 280 290 300 310 320
>>CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 (319 aa)
initn: 527 init1: 299 opt: 580 Z-score: 456.2 bits: 93.0 E(32554): 4.3e-19
Smith-Waterman score: 580; 33.7% identity (68.6% similar) in 312 aa overlap (82-388:4-314)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNS
: . :..:.. .. .:.:: :::.::.
CCDS52 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFM
.::. : ...: : .:.:..:. ::.:: . ::. . .:: ..:..: ..: . :.
CCDS52 VALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALADLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALHFL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLN-GHLLLS
:. .:.....::.:.::.:::.::.:. .. : :: :.: .:. .. :. ::.:
CCDS52 LDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHPRLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLIS
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280
pF1KE0 TFSGPS--CLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQA
. : : :. . : :. :..:: :.: ::..::.: ..: ....: .
CCDS52 EAAQNSTRCHSFYSRADGSFSIIWQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 GP--QRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYL
: :::. ....::.....:::: .. . . :..::.: .. . ..:::
CCDS52 QPKLQRAQALVTLVVVLFALCFLPCFLARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYL
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 NSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGK
.:::.::.::::::.: . : .. ::. : ... ...:
CCDS52 HSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRVFHTLRGK-GQAAEPPDFNPRDSYS
280 290 300 310
410 420
pF1KE0 LKVQGEVSLEKEGSSQG
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 390 init1: 292 opt: 418 Z-score: 333.3 bits: 70.4 E(32554): 3e-12
Smith-Waterman score: 418; 25.9% identity (58.8% similar) in 347 aa overlap (57-396:8-343)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 LQNLLSGPWPKQPMELHNLSSPSPSLSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPT
: ::.: : ..:.. ... : :
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSN---NNSRNC--T
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 SSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSLALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLP
.. :. . . : :..::.:....: . :: .::...:. .:.:.::.::
CCDS94 IENFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGLSIYVFLQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFMLSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASV
.:.:::: .: :: ::.. . : .: .:. :::.... :.: .:.: ..: .:.
CCDS94 FRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSYSLYVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSI
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KE0 GAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLS----TFSGPSCLS---YRVGTKPSASLRWHQALYLL
.: . : .:. :. . :: : . : ::: :... . . . ::
CCDS94 RSAWILCGIIWILIMASSIMLLDSGSEQNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIALVVGCLL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 EFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRGLGGQAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASM
:: :.. . :. . : .. : ... ..:. .. ... .. .:::: . . .
CCDS94 PFFT-LSICYLLIIRVLLKVEVPESGLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 VAFWLSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGP
... .. :. : . . .::.. :. ..:.:: :.. :: ..: .: .:.
CCDS94 TTWKVGLCK--DRLHKALVITLALAAANACFNPLLYYFAGENF--KDRLKSALRKGHPQK
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KE0 VSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGKLKVQGEVSLEKEGSSQG
.. . . : : .:
CCDS94 AKTKCVF-PVSVWLRKETRV
330 340
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 358 init1: 241 opt: 417 Z-score: 332.2 bits: 70.3 E(32554): 3.5e-12
Smith-Waterman score: 417; 30.3% identity (59.5% similar) in 304 aa overlap (95-385:37-334)
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPI-LALEFVLGLVGNSLALFIFCIHTRP
: :. :. ::::: :. .:..: .. ::
CCDS14 SLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLFIFRLRP
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFMLSTNRTASVVFL
: ...... :. .: : . .:: . :: :. : ::. :: :.. : ::.::
CCDS14 WDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLYCSVLFL
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWV---GILLLNGHLLLSTFSGPSCLSY
: :...::: . .: ..: . :. . ..:. : :. : .. .. .: . : .
CCDS14 TCISVHRYLGICHPLRALRWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSNKGTTVLCH
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290
pF1KE0 RVGTKPSA---SLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRN--RGLGGQAGPQ---R
. :.: ... .:.. : : .: : ..: :: : . : :.: . :
CCDS14 DT-TRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPC---LVTLVCYGLMARRLYQPLPGSAQSSSRLR
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSA-CRSLDLCTQLFHGSLAFTYLNSVLD
..:..:.:..:...::.: : ..: : : :: :.. . ... . .. :: ::
CCDS14 SLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKVTRPLASANSCLD
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 PVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEAIGKLKVQG
:::: ... .. .: : : : :. : . ::
CCDS14 PVLYLLTGDKYRRQLRQLCG--GGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQDSSCSTP
310 320 330 340 350 360
420
pF1KE0 EVSLEKEGSSQG
CCDS14 RADRL
>>CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 (372 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KE0 PEHSCRGRRLQNLLSGPWPKQPMELHNLSSPSPSLSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGG
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CCDS32 MEPAPSAGAELQPPLFANASDAYPSACPSAGA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SSGGPCHPTSSSLVSAFLA-PILALE---FVLGLVGNSLALFIFCIHTRPWTSNTVFLVS
...:: : . : : :: : :: ..::.:: :..: . .:. :...... .
CCDS32 NASGP--PGARSASSLALAIAITALYSAVCAVGLLGNVLVMFGIVRYTKMKTATNIYIFN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLFMLSTNRTASVVFLTAIALNRYLK
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CCDS32 LALADALATSTLPFQSAKYLM-ETWPFGELLCKAVLSIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIA
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pF1KE0 VVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLSTFSGPSCLSYRVGTK-PSASLRW
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CCDS32 VCHPVKALDFRTPAKAKLINICIWVLASGVGVPIMVMAVTRPRDGAVVCMLQFPSPSWYW
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260 270 280 290 300
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CCDS32 DTVTKICVFLFAFVVPILIITVCYGLMLLRLRSVRLLSGSKEKDRSLRRITRMVLVVVGA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YTICFLPSIIFGMASMVAFW--LSACRSLDLCTQLFHGSLAFTYLNSVLDPVLYCFSSPN
...:. : :: : : .. : : . .: .:. : :: :.:::: : . :
CCDS32 FVVCWAPIHIF-----VIVWTLVDIDRRDPLVVAALHLCIALGYANSSLNPVLYAFLDEN
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: . : : :: : ::.. .:. ::
CCDS32 FKRCFRQLCRKPCGRPDP----SSFSRAREATARERVTACTPSDGPGGGAAA
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pF1KE0 QG
>>CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 (365 aa)
initn: 335 init1: 205 opt: 402 Z-score: 320.9 bits: 68.2 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 402; 29.2% identity (56.9% similar) in 343 aa overlap (78-412:8-336)
50 60 70 80 90 100
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CCDS98 MGNITADNSSMSC--TIDHTIHQTLAPVVYVTVLVVG
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LVGNSLALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACK
. .: :.:.. .. . . :.: .:..::.. : .::. ..: : :..: : .:.
CCDS98 FPANCLSLYFGYLQIKARNELGVYLCNLTVADLFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQ
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pF1KE0 VNLFMLSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGH
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CCDS98 VCGILLYENIYISVGFLCCISVDRYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIY
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230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LLLSTFSGPSCLSYRVGTKPSASLRWHQAL----YLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNR
.:. . ..:: . :..:. .:. :..:. :.: . .: ..: :
CCDS98 FLMHEEVIEDENQHRVCFEHYPIQAWQRAINYYRFLVGFLFPICLLLASYQGILRAVR-R
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pF1KE0 GLGGQAGPQRAMRVLAM-VVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQLFHGSL
. : : . . .. :.. .:... :::: .. .. : : ..: . .: ::
CCDS98 SHGTQKSRKDQIQRLVLSTVVIFLACFLPYHVLLLVRSV--WEASCDFAKGVFNAYHFSL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 AFTYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASR--
.: .: : ::::::: : . :.. : : :: . . :: : :::
CCDS98 LLTSFNCVADPVLYCFVSET-THRDLARL---RG-----ACLAFLTCSRTGRAREAYPLG
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pF1KE0 KAEAIGKLKVQGEVSLEKEGSSQG
:: :: .:::
CCDS98 APEASGKSGAQGEEPELLTKLHPAFQTPNSPGSGGFPTGRLA
330 340 350 360
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 328 init1: 268 opt: 396 Z-score: 316.3 bits: 67.4 E(32554): 2.7e-11
Smith-Waterman score: 396; 27.9% identity (55.3% similar) in 380 aa overlap (37-403:12-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GQLIVPIIPLCPEHSCRGRRLQNLLSGPWPKQPMELHNLSSPSPSLSSSVLPPSFSPSPS
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CCDS21 MSKRSWWAGSRKPPREMLKLSGSDSSQSMNGLEV----APP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGNSLALFIFCIHTRPWTS
. . :. . . . : : . : ..: :.:.:.::::.:::..: . :
CCDS21 GLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASF----YLLDFILALVGNTLALWLFIRDHKSGTP
40 50 60 70 80 90
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.:::. :..::. . :: :. :.. . : :: ::... :.. : ::. ::: :
CCDS21 ANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYFLTCI
100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 ALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLSTFSGPS-----CLS-Y
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CCDS21 SADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQTNHTVVCLQLY
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CCDS21 REKASHHALVSLAVA-FTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVEKR------LKTKAVRMIA
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CCDS21 IVLAIFLVCFVPYHV-NRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDPIMY
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CCDS21 FFVAEKFRH---ALCNLLCGKRLKGP-------PPSFEGKTNESSLSAKSEL
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420
pF1KE0 SLEKEGSSQG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]