Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0719
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0719, 305 aa
1>>>pF1KE0719 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5677+/-0.0012; mu= 4.2302+/- 0.069
mean_var=224.9163+/-52.352, 0's: 0 Z-trim(108.4): 711 B-trim: 85 in 1/49
Lambda= 0.085519
statistics sampled from 9393 (10218) to 9393 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 2029 263.5 1.5e-70
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1552 204.6 7.5e-53
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1320 176.0 3.1e-44
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1216 163.2 2.2e-40
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 1082 146.9 3e-35
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 1082 146.9 3e-35
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 1082 147.0 3.3e-35
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1079 146.5 4e-35
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 1079 146.5 4e-35
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 1039 141.6 1.1e-33
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 1039 141.6 1.2e-33
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 1003 137.1 2.3e-32
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 1003 137.1 2.4e-32
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 1003 137.1 2.5e-32
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 963 132.1 6.6e-31
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 963 132.1 6.8e-31
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 963 132.1 7.1e-31
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 919 126.6 2.6e-29
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 916 126.2 3.5e-29
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 912 126.1 8e-29
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 912 126.1 8.2e-29
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 912 126.2 8.3e-29
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 908 125.6 1.1e-28
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 908 125.7 1.2e-28
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 908 125.7 1.2e-28
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 908 125.7 1.2e-28
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 887 122.6 4.1e-28
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 879 121.7 8.4e-28
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 875 121.0 9.7e-28
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 867 120.1 2.2e-27
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 801 112.0 5.9e-25
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 794 111.2 1.2e-24
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 765 107.8 1.8e-23
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 765 107.8 1.9e-23
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 751 105.8 4.4e-23
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 748 105.8 8.9e-23
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 743 105.1 1.3e-22
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 743 105.2 1.3e-22
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 743 105.2 1.4e-22
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 727 102.8 3.1e-22
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 719 101.8 6.2e-22
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 707 101.0 3.9e-21
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 707 101.0 4e-21
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 705 100.6 4.1e-21
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 695 99.0 5.8e-21
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 696 99.3 6.9e-21
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 676 96.6 2.9e-20
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 672 96.0 3.3e-20
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 671 96.1 5.2e-20
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 671 96.3 6.1e-20
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 2029 init1: 2029 opt: 2029 Z-score: 1380.3 bits: 263.5 E(32554): 1.5e-70
Smith-Waterman score: 2029; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVL
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QRFRH
:::::
CCDS11 QRFRH
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
initn: 1536 init1: 1536 opt: 1552 Z-score: 1062.3 bits: 204.6 E(32554): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 1552; 76.4% identity (91.2% similar) in 297 aa overlap (1-296:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
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CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
::::.::::.:.: ::::::::: :::::.::.. . .:: ::::::::::::..::::
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
:::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :.:
CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSF
.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::: ::::.: .:::::..:::: ::
CCDS88 STAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 PKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSS-PEPSPAARQYV
:::.:. . ..:: :. .::.:: :.:.:::..::.::.:::::.:.. .: : :
CCDS88 PKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
250 260 270 280 290
300
pF1KE0 LQRFRH
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1310 init1: 898 opt: 1320 Z-score: 907.6 bits: 176.0 E(32554): 3.1e-44
Smith-Waterman score: 1320; 67.0% identity (86.1% similar) in 288 aa overlap (1-287:1-288)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
:. . :.:::::::::::::.... :::.::.:::::. : :::::::::::::::::.:
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTP-GSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCH
:::: : ::. .. .:::.:::::.:::::.:: : :. . :.::::.:.:::. :::
CCDS44 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFCH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKF
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CCDS44 SRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSAR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGS
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CCDS44 YSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKNT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYV
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CCDS44 FPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
250 260 270 280 290
300
pF1KE0 LQRFRH
>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa)
initn: 585 init1: 585 opt: 1216 Z-score: 838.4 bits: 163.2 E(32554): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 1216; 61.4% identity (85.3% similar) in 293 aa overlap (1-291:1-291)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
:. ..:.:::::::::.:.::::::: ..::::..::: . :::::.:.::: :::::::
CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
::::: ::.:...:: ::::: .::::::.:: :. : ...::.:::::.:..::::
CCDS47 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
. :.::::::::::::. : .::::::::::::.:.: :. :::::::: :..:.:.:.:
CCDS47 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 TTAVDIWSIGCIFAEMVTR-KALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGS
.:..:.:: ::::::... . ::::.. ::: ::::.::::.:. ::..:.:::::
CCDS47 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK-P
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FPKW-TRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQY
.: . . .: ..::.:. :::::..::. .: :::.:. :: :::::. :
CCDS47 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 VLQRFRH
>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
initn: 900 init1: 585 opt: 1082 Z-score: 746.4 bits: 146.9 E(32554): 3e-35
Smith-Waterman score: 1082; 54.3% identity (82.0% similar) in 289 aa overlap (1-288:162-448)
10 20 30
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLV
.. . :..:.:::::..:::.:.. : .::
CCDS14 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKY
:::.:::. : ::.: :::::.::::.::: ::: : :..:.:..: ::::.:..:::.:
CCDS14 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLAR
.:. :. . .: .: .:::::.:...:: ..:.::::::::::::: : .:::::::::
CCDS14 LDDC-GNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEID
: ..: .::..:::::::: :.::::: :.: .:.:..:::: ::.: . ::::.. .
CCDS14 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260
pF1KE0 QLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKG-SFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQY
:: :::.::::.:.::::. . ..: ..::. ..: .: :. .: ::: .:::.
CCDS14 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300
pF1KE0 DPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH
. .::.:. :. ::.: :
CCDS14 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
430 440 450 460 470 480
>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (502 aa)
initn: 900 init1: 585 opt: 1082 Z-score: 746.3 bits: 146.9 E(32554): 3e-35
Smith-Waterman score: 1082; 54.3% identity (82.0% similar) in 289 aa overlap (1-288:168-454)
10 20 30
pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLV
.. . :..:.:::::..:::.:.. : .::
CCDS48 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKY
:::.:::. : ::.: :::::.::::.::: ::: : :..:.:..: ::::.:..:::.:
CCDS48 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLAR
.:. :. . .: .: .:::::.:...:: ..:.::::::::::::: : .:::::::::
CCDS48 LDDC-GNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEID
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:: :::.::::.:.::::. . ..: ..::. ..: .: :. .: ::: .:::.
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CCDS55 AKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEE
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CCDS55 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQF
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270 280 290 300
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CCDS55 EGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAF
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CCDS53 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEID
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CCDS53 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KE0 QLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKG-SFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQY
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CCDS53 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQY
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. ..:..:. :. : :: : :
CCDS53 ESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVI
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pF1KE0 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLV
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CCDS90 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
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CCDS90 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KE0 MDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLAR
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CCDS90 MDDC-GNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLAR
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEID
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CCDS90 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVED
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KE0 QLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKG-SFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQY
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CCDS90 ELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQY
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300
pF1KE0 DPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH
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CCDS90 ESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKN
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>>CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 (474 aa)
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CCDS44 QKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLV
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pF1KE0 ALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKY
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CCDS44 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQY
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CCDS44 LDHC-GNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLAR
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 AFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEID
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CCDS44 AKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKE
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260
pF1KE0 QLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKG-SFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQY
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CCDS44 ELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLY
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 DPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH
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CCDS44 ESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]