Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0738, 424 aa
1>>>pF1KE0738 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5644+/-0.00076; mu= 16.1083+/- 0.045
mean_var=144.7488+/-53.531, 0's: 0 Z-trim(109.8): 224 B-trim: 1393 in 2/47
Lambda= 0.106602
statistics sampled from 10595 (11148) to 10595 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 2883 455.6 4.2e-128
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 1252 204.7 1.4e-52
CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 ( 389) 812 137.0 3.1e-32
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 668 114.7 1.2e-25
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 668 114.8 1.4e-25
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 415 75.9 7.1e-14
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 415 75.9 7.2e-14
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 415 76.0 7.3e-14
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 355 66.8 4.8e-11
>>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 (424 aa)
initn: 2883 init1: 2883 opt: 2883 Z-score: 2413.3 bits: 455.6 E(32554): 4.2e-128
Smith-Waterman score: 2883; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLLTLG
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CCDS73 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLLTLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQVLSMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQVLSMFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 STYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLPQVFIFSLREVIQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 STYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLPQVFIFSLREVIQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKVKTQAWRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKVKTQAWRVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIACWAPFFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIACWAPFFSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRHLACCGGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRHLACCGGPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLELADGEGTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLELADGEGTAE
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TIIF
::::
CCDS73 TIIF
>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 1257 init1: 844 opt: 1252 Z-score: 1057.7 bits: 204.7 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 1254; 51.4% identity (75.5% similar) in 383 aa overlap (2-377:14-386)
10 20 30 40
pF1KE0 MDSGPLWD----ANPTPRGTLSAPNATTPWLG-RDEELAKVEIGVLAT
.:.: : :. : : . . ... : :.:::::.::.:::.
CCDS89 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VLVLATGGNLAVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGP
....:. :: .:::.: . :: ::::::. ::.:.:::::.::::::. :::::::.::
CCDS89 TFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 DLLCRAVKYLQVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAI
: :::.::.:::..::::.:::..:: :::.::::::..::::.. . :.::: :.:. .
CCDS89 DWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 FSLPQVFIFSLREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLIC
.: :: :.::. :: . . . :::: : ::: :::.:: : .::: ::..: .::..::
CCDS89 LSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFIC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HEICKNLKVKTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRG--LPSRVSSINTISRAKIRTVK
..: :.. :: . . : . .. .: .: : :::...::::::::::
CCDS89 YNIWCNVRGKTASRQSKG---------AEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVK
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 MTFVIVLAYIACWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGF
:::::: :::.:::::: .::::::: . .: : ..::. :::.::::::::::: :
CCDS89 MTFVIVTAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 NSHLLPRPLRHLACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRP
..::: .. . :: . . .. .. .: :.: :.:
CCDS89 SGHLLQDCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTD-SMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKS
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE0 RPEESPRDLELADGEGTAETIIF
CCDS89 IKFIPVST
>>CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 (389 aa)
initn: 1154 init1: 494 opt: 812 Z-score: 692.3 bits: 137.0 E(32554): 3.1e-32
Smith-Waterman score: 1224; 52.3% identity (75.5% similar) in 371 aa overlap (8-378:15-368)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNL
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CCDS25 MEGALAANWSAEAANASAAPPGAEGNRTAGPP--RRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 AVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYL
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CCDS25 CVLLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLPQVFIFS
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CCDS25 QVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRR--RTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKVK
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CCDS25 LREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIAC
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CCDS25 TAAAAAA-------EAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVC
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRHL
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CCDS25 WTPFFFVQMWSVWDANAPKEAS---AFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLELA
::.. . :: :.. : :.. ..
CCDS25 LCCSASYLKGRR-LGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
350 360 370 380
>>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 821 init1: 352 opt: 668 Z-score: 573.7 bits: 114.7 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 811; 44.3% identity (68.6% similar) in 309 aa overlap (10-313:13-303)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLL
.:. . : . : :: ::..:...:. :.: .. .: ::
CCDS55 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TLGQLGRKR--SRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQV
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CCDS55 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTY---LLIAAPWLLAAIFSLPQVFIF
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CCDS55 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA--WAFSLLLSLPQLFIF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SLREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKV
. :.: :::: :::: :. ::: :.:.:: .: .:: :. ..:: :: .:: .: :
CCDS55 AQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL-V
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIA
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CCDS55 PGPSERPGG---RRRGRRT---------GSPGEGAHV---SAAVAKTVRMTLVIVVVYVL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 CWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRH
:::::: ::.:..:: .:: :
CCDS55 CWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGGCSRG
290 300
>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (371 aa)
initn: 931 init1: 352 opt: 668 Z-score: 572.8 bits: 114.8 E(32554): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 933; 44.4% identity (67.4% similar) in 356 aa overlap (10-361:13-348)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLL
.:. . : . : :: ::..:...:. :.: .. .: ::
CCDS14 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TLGQLGRKR--SRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQV
.:.. ::. . .:.:. :: :.::::::::::::: : : ::.::: :::::::::.
CCDS14 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQ-PGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLPQVFIFSL
..:.::.::.:::::::. :.:.:. . .. : . . : .. ..::::.:::.
CCDS14 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 REVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKVKT
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CCDS14 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL-VPG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIACW
. : :: : : . : :.. . . : : .::.::.:::..:. ::
CCDS14 PSERPGG---RRRGRRT---------GSPGEGAHV---SAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCW
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 APFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRHLA
:::: ::.:..:: .:: : .. :.. :::..:::: ::::: .:.: . :: :
CCDS14 APFFLVQLWAAWDPEAPLE---GAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSV-SSELRSLL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 CCG-GPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLELA
::. : :
CCDS14 CCARGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS
350 360 370
>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (371 aa)
initn: 477 init1: 267 opt: 415 Z-score: 362.5 bits: 75.9 E(32554): 7.1e-14
Smith-Waterman score: 539; 30.4% identity (63.4% similar) in 352 aa overlap (3-345:15-337)
10 20 30 40
pF1KE0 MDSGPLWDANP---TPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVL
.: :..: : :.. : . . .. .: ...
CCDS54 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VLATGGNLAVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDL
:.. :: .::.. . .:.::: .:: .::.:: ..: ..: .. : .: : .:::
CCDS54 VFTIVGNSVVLFSTWRR-KKKSRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LCRAVKYLQVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFS
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CCDS54 VCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIA-WSLSFLFS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LPQVFIFSLREVIQGSGVLDCWA---DFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLI
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CCDS54 IPTLIIFGKRTL--SNGEVQCWALWPDDSY-WTP--YMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CHEICKNLKVKTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAAT-TRGLPSRVSSINTISRAKIRTVK
... .:...... . . : . : .. .::: ::.:::...:
CCDS54 ----IRTIWIKSKTYET------VISNCSDGKLCSSYNRGL---------ISKAKIKAIK
240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KE0 MTFVIVLAYIACWAPFFSVQMWSVWDKNA--PDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYM
....:.::.: ::.:.: .... :. :: . : .: . : ::: :: ::
CCDS54 YSIIIILAFICCWSPYF---LFDILDNFNLLPDTQERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYC
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 GFNSHLLPRPLRHLACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSG
:.: .
CCDS54 VFSSSISFPCREQRSQDSRMTFRERTERHEMQILSKPEFI
340 350 360 370
>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa)
initn: 477 init1: 267 opt: 415 Z-score: 362.5 bits: 75.9 E(32554): 7.2e-14
Smith-Waterman score: 539; 30.4% identity (63.4% similar) in 352 aa overlap (3-345:15-337)
10 20 30 40
pF1KE0 MDSGPLWDANP---TPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVL
.: :..: : :.. : . . .. .: ...
CCDS54 MPANFTEGSFDSSGTGQTLDSSPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 VLATGGNLAVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDL
:.. :: .::.. . .:.::: .:: .::.:: ..: ..: .. : .: : .:::
CCDS54 VFTIVGNSVVLFSTWRR-KKKSRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LCRAVKYLQVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFS
.::.:.::::. ..::::.:.....::: :. .:.. :: :. :.. : : :. .::
CCDS54 VCRVVRYLQVVLLYASTYVLVSLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIA-WSLSFLFS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LPQVFIFSLREVIQGSGVLDCWA---DFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLI
.: ..::. : . ..: ..::: : .. : : :.: ... .. .:.:... :...
CCDS54 IPTLIIFGKRTL--SNGEVQCWALWPDDSY-WTP--YMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 CHEICKNLKVKTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAAT-TRGLPSRVSSINTISRAKIRTVK
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