FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0740, 424 aa 1>>>pF1KE0740 424 - 424 aa - 424 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4830+/-0.00133; mu= 13.1609+/- 0.079 mean_var=220.7162+/-42.829, 0's: 0 Z-trim(109.5): 910 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.086329 statistics sampled from 9909 (10905) to 9909 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16 Scan time: 3.030 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10505.1 ZNF597 gene_id:146434|Hs108|chr16 ( 424) 2953 381.1 1.1e-105 CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 668 96.9 7.3e-20 CCDS45395.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 ( 394) 625 91.1 2e-18 CCDS42112.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 ( 394) 625 91.1 2e-18 CCDS10497.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 ( 395) 625 91.1 2e-18 CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 587 86.7 6.7e-17 CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 587 86.8 7.2e-17 CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 587 86.8 7.3e-17 CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 583 86.1 9.3e-17 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 573 85.1 2.7e-16 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 573 85.1 2.7e-16 CCDS33132.2 ZNF749 gene_id:388567|Hs108|chr19 ( 778) 571 84.8 3.1e-16 CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 561 83.2 5.4e-16 CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 350) 555 82.3 7.9e-16 CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 555 82.6 9.9e-16 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 555 82.6 1e-15 CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 555 82.6 1e-15 CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 551 82.1 1.4e-15 CCDS59371.1 ZNF730 gene_id:100129543|Hs108|chr19 ( 503) 550 82.0 1.5e-15 CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 549 81.9 1.8e-15 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 547 81.5 1.8e-15 CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 546 81.5 2.2e-15 CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 546 81.6 2.3e-15 CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 546 81.6 2.4e-15 CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 540 80.5 2.9e-15 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 546 81.9 3e-15 CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 539 80.6 4e-15 CCDS33131.1 ZNF547 gene_id:284306|Hs108|chr19 ( 402) 535 79.9 4.8e-15 CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 539 80.9 5.2e-15 CCDS12837.1 ZNF175 gene_id:7728|Hs108|chr19 ( 711) 533 80.1 7.8e-15 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 533 80.1 8.2e-15 CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 528 79.0 8.3e-15 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 533 80.1 8.5e-15 CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 528 79.2 9.6e-15 CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 528 79.2 9.9e-15 CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 528 79.4 1.1e-14 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 529 79.6 1.2e-14 CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 528 79.4 1.2e-14 CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 527 79.2 1.2e-14 CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 527 79.2 1.2e-14 CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 527 79.2 1.2e-14 CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 529 79.7 1.3e-14 CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 529 79.7 1.3e-14 CCDS10686.1 ZNF689 gene_id:115509|Hs108|chr16 ( 500) 525 78.8 1.3e-14 CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 525 78.9 1.3e-14 CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 527 79.3 1.3e-14 CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 525 78.9 1.4e-14 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 525 79.0 1.4e-14 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 528 79.7 1.5e-14 CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 524 78.8 1.5e-14 >>CCDS10505.1 ZNF597 gene_id:146434|Hs108|chr16 (424 aa) initn: 2953 init1: 2953 opt: 2953 Z-score: 2010.9 bits: 381.1 E(32554): 1.1e-105 Smith-Waterman score: 2953; 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CCDS42 NPYECKECGKAFKGSSNLVLHQRIHSRGKPYLCNKCGKAFSQSTDLIIHHRIHTGEKPYE 210 220 230 240 250 260 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 CGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSIC : :::..:.. ..: :.:::::::: :: .: .:::::::..:. : :::: : : CCDS42 CYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGEKPLKCNECEKAFRQHSHLTEHQRLHSGEKPYECHRC 270 280 290 300 310 320 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 GRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSF :. : .. .::. :..:. : :.: :.. .: .. : ..: ..: CCDS42 GKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEE---CEKTFSKDEELREEQRIHQEEKAYWCNQCGRNF 330 340 350 360 370 380 310 320 330 340 350 pF1KE0 RQSLYPALSEKSHD-EDSERCSDDGDNFFSFSKF----------KPLQCPDCDMTFPCFS . . . .: : .:.. : .: . : . :: : : .: : CCDS42 QGTSDLIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPCVCSKCGKSFRGSS 390 400 410 420 430 440 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 ELISHQNIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLIT .:: :. .:: :.:..:. : ..:. :.:. ::: : .:..:: :::.:. :: CCDS42 DLIRHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLVTHQKIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQ 450 460 470 480 490 500 420 pF1KE0 HKRTHIKNTT :.: : CCDS42 HRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEA 510 520 530 540 550 560 >-- initn: 988 init1: 416 opt: 474 Z-score: 339.5 bits: 72.8 E(32554): 1.4e-12 Smith-Waterman score: 551; 33.5% identity (60.6% similar) in 254 aa overlap (160-405:544-797) 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 VELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDC ::...::. : .::::. : . :..: CCDS42 KPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAYWCNQC 520 530 540 550 560 570 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 GKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGF :. :. ..: :. :: ::::.: .:. .: : : : :: : ::::.:. ::..: CCDS42 GRAFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPYVCNKCGKSF 580 590 600 610 620 630 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 MWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSL : .:.. :..:. :: ..: : :... .:: .. .. :: ..: ..::. CCDS42 RGSSDLIKHHRIHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLATHQKIHTGEKPYQCSECGNAFRRRS 640 650 660 670 680 690 310 320 330 340 350 360 pF1KE0 YPALSEKSHD-EDSERCSDDGDNFF---SFSKFKPLQC----PDCDMTFPCFSELISHQN .. :. : .:.. : :. .: : . :. .:. :: :: ..: CCDS42 LLIQHRRLHSGEKPYECKECGKLFMWHTAFLKHQRLHAGEKLEECEKTFSKDEELRKEQR 700 710 720 730 740 750 370 380 390 400 410 420 pF1KE0 IHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLITHKRTHIK : :.. . :. : ..: .:.: :: .: .:..: :::: CCDS42 THQEKKVYWCNQCSRTFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTQSELRPSETS 760 770 780 790 800 pF1KE0 NTT >>CCDS45395.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 (394 aa) initn: 781 init1: 437 opt: 625 Z-score: 444.3 bits: 91.1 E(32554): 2e-18 Smith-Waterman score: 637; 36.8% identity (61.8% similar) in 296 aa overlap (14-307:116-393) 10 20 30 40 pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGT ..:::: :. :::::.: :.:. :. 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CCDS45 RQNSHRSRHEGIHIREKIFKCPECGKTFPKNEEFVLHLQSHEAERPYGCKKCGRRFGRLS 320 330 340 350 360 370 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 NLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKPL : . :.: :. : :. .: CCDS45 NCTRHEKT--------HSAC-KTRKQK 380 390 >>CCDS42112.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 (394 aa) initn: 781 init1: 437 opt: 625 Z-score: 444.3 bits: 91.1 E(32554): 2e-18 Smith-Waterman score: 637; 37.0% identity (62.0% similar) in 297 aa overlap (14-307:115-393) 10 20 30 40 pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGT ..:::: :. :::::.: :.:. :. 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