Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0749
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0749, 326 aa
1>>>pF1KE0749 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0132+/-0.00104; mu= -4.2102+/- 0.059
mean_var=250.7149+/-58.113, 0's: 0 Z-trim(110.2): 482 B-trim: 378 in 1/51
Lambda= 0.081000
statistics sampled from 10848 (11464) to 10848 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33678.1 PIM3 gene_id:415116|Hs108|chr22 ( 326) 2224 273.3 1.8e-73
CCDS4830.1 PIM1 gene_id:5292|Hs108|chr6 ( 313) 1491 187.7 1.1e-47
CCDS14312.1 PIM2 gene_id:11040|Hs108|chrX ( 311) 1197 153.3 2.4e-37
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 527 75.4 1.7e-13
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 476 69.3 9.5e-12
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 476 69.3 9.6e-12
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 476 69.4 1e-11
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 468 68.4 1.8e-11
CCDS2545.1 PASK gene_id:23178|Hs108|chr2 (1323) 471 69.0 2.3e-11
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 465 68.2 2.9e-11
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 461 67.6 3.2e-11
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 460 67.5 3.8e-11
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 451 66.5 8e-11
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 450 66.4 8.8e-11
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 450 66.4 8.8e-11
>>CCDS33678.1 PIM3 gene_id:415116|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 2224 init1: 2224 opt: 2224 Z-score: 1432.4 bits: 273.3 E(32554): 1.8e-73
Smith-Waterman score: 2224; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
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CCDS33 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMVC
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CCDS33 RSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GDIPFEQDEEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWMLGADGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GDIPFEQDEEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWMLGADGGV
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 PESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
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CCDS33 PESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
310 320
>>CCDS4830.1 PIM1 gene_id:5292|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1421 init1: 1155 opt: 1491 Z-score: 969.7 bits: 187.7 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 1491; 69.5% identity (87.3% similar) in 315 aa overlap (1-313:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
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CCDS48 MLLSKINSLAHLRAAPCNDLHATK-LAPGK-EKEPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSL-GGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGF
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CCDS48 SDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSS--GFSGVIRLLDWFERPDSF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVD
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CCDS48 VLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILID
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
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CCDS48 LNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFEQDEEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWMLGADGG
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CCDS48 CGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWM--QDVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 VP-ESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
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CCDS48 LPQETAEIHLHSLSPGPSK
300 310
>>CCDS14312.1 PIM2 gene_id:11040|Hs108|chrX (311 aa)
initn: 1013 init1: 1013 opt: 1197 Z-score: 784.1 bits: 153.3 E(32554): 2.4e-37
Smith-Waterman score: 1197; 61.9% identity (78.0% similar) in 291 aa overlap (12-301:6-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
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CCDS14 MLTKPLQGPPAPPGTPTP--PPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTVFAGHRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGA-TVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGF
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CCDS14 TDRLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVD
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CCDS14 MLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILID
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
:: : :::::::::::.: :::::::::::::::: :.::. :::::::.::::::
CCDS14 LRRGCAKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFEQDEEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWMLGADGG
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CCDS14 CGDIPFERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQTPAED
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 VPESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
::
CCDS14 VPLNPSKGGPAPLAWSLLP
300 310
>>CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 (778 aa)
initn: 406 init1: 279 opt: 527 Z-score: 355.7 bits: 75.4 E(32554): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 532; 33.3% identity (61.0% similar) in 300 aa overlap (14-304:8-295)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVD--HLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGS
: :: ::: .: .. .. :.. .::.: : : :
CCDS12 MSSGAKEGGGGSPAYHLPHP--HPHPPQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RIADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDG
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CCDS12 HCITGQKVAIKIVNREKLSE-SVL--MKVEREIAILKLIEHPH----VLKLHDVYENKKY
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FLLVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLV
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CCDS12 LYLVLEHVSGGE-LFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIVSALDFCHSYSICHRDLKPENLLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DLRSGELKLIDFGSGAL-LKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYD
: ... ... ::: ..: . :.. :. :. :: :. ..: :: : .:: ::.:.
CCDS12 DEKNN-IRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIKGEKYDGRRADMWSCGVILFA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MVCGDIPFEQD------EEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHP
.. : .::..: :.. :: . . . . :.::.:.: . ..: .: ::.:: ::
CCDS12 LLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVEPEKRLSLEQIQKHP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 WMLGADGGVPESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
:.::. :. :
CCDS12 WYLGGKHE-PDPCLEPAPGRRVAMRSLPSNGELDPDVLESMASLGCFRDRERLHRELRSE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 (668 aa)
initn: 289 init1: 289 opt: 476 Z-score: 324.4 bits: 69.3 E(32554): 9.5e-12
Smith-Waterman score: 487; 30.8% identity (60.7% similar) in 308 aa overlap (31-321:10-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
:.. .. :.. .::.: : : : .
CCDS41 MTSTGKDGGAQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGVHC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGFL
. ::.: : .:...: . : :...:. . :..: : .: .
CCDS41 VTCQKVAIKIVNREKLSESVLM---KVEREIAILKLIEHPH----VLKLHDVYENKKYLY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVDL
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CCDS41 LVLEHVSGGE-LFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIISALDFCHSHSICHRDLKPENLLLDE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 RSGELKLIDFGSGAL-LKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
... ... ::: ..: . :.. :. :. :: :: ..: ::.: ::: ::.:. ..
CCDS41 KNN-IRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIRGEKYDGRKADVWSCGVILFALL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFEQD------EEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWM
: .::..: :.. :: . . . . :.::.:.: . . ..: .:..: : :.
CCDS41 VGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVDAARRLTLEHIQKHIWY
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE0 LGA------DGGVPESCDLR----LCTLDPDDVASTTSSSESL
.:. . .:.. ..: : .::: . : :
CCDS41 IGGKNEPEPEQPIPRKVQIRSLPSLEDIDPDVLDSMHSLGCFRDRNKLLQDLLSEEENQE
280 290 300 310 320 330
CCDS41 KMIYFLLLDRKERYPSQEDEDLPPRNEIDPPRKRVDSPMLNRHGKRRPERKSMEVLSVTD
340 350 360 370 380 390
>>CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 (674 aa)
initn: 289 init1: 289 opt: 476 Z-score: 324.3 bits: 69.3 E(32554): 9.6e-12
Smith-Waterman score: 487; 30.8% identity (60.7% similar) in 308 aa overlap (31-321:10-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
:.. .. :.. .::.: : : : .
CCDS58 MTSTGKDGGAQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGVHC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGFL
. ::.: : .:...: . : :...:. . :..: : .: .
CCDS58 VTCQKVAIKIVNREKLSESVLM---KVEREIAILKLIEHPH----VLKLHDVYENKKYLY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVDL
::::. .. :::.....: : ::.:: :...:. ::: .. :::.: ::::.:
CCDS58 LVLEHVSGGE-LFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIISALDFCHSHSICHRDLKPENLLLDE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 RSGELKLIDFGSGAL-LKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
... ... ::: ..: . :.. :. :. :: :: ..: ::.: ::: ::.:. ..
CCDS58 KNN-IRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIRGEKYDGRKADVWSCGVILFALL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFEQD------EEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWM
: .::..: :.. :: . . . . :.::.:.: . . ..: .:..: : :.
CCDS58 VGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVDAARRLTLEHIQKHIWY
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE0 LGA------DGGVPESCDLR----LCTLDPDDVASTTSSSESL
.:. . .:.. ..: : .::: . : :
CCDS58 IGGKNEPEPEQPIPRKVQIRSLPSLEDIDPDVLDSMHSLGCFRDRNKLLQDLLSEEENQE
280 290 300 310 320 330
CCDS58 KMIYFLLLDRKERYPSQEDEDLPPRNEIDPPRKRVDSPMLNRHGKRRPERKSMEVLSVTD
340 350 360 370 380 390
>>CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 (736 aa)
initn: 289 init1: 289 opt: 476 Z-score: 323.8 bits: 69.4 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 487; 30.8% identity (60.7% similar) in 308 aa overlap (31-321:10-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
:.. .. :.. .::.: : : : .
CCDS58 MTSTGKDGGAQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGVHC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGATVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGFL
. ::.: : .:...: . : :...:. . :..: : .: .
CCDS58 VTCQKVAIKIVNREKLSESVLM---KVEREIAILKLIEHPH----VLKLHDVYENKKYLY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVDL
::::. .. :::.....: : ::.:: :...:. ::: .. :::.: ::::.:
CCDS58 LVLEHVSGGE-LFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIISALDFCHSHSICHRDLKPENLLLDE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 RSGELKLIDFGSGAL-LKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
... ... ::: ..: . :.. :. :. :: :: ..: ::.: ::: ::.:. ..
CCDS58 KNN-IRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIRGEKYDGRKADVWSCGVILFALL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFEQD------EEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWM
: .::..: :.. :: . . . . :.::.:.: . . ..: .:..: : :.
CCDS58 VGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVDAARRLTLEHIQKHIWY
220 230 240 250 260 270
300 310 320
pF1KE0 LGA------DGGVPESCDLR----LCTLDPDDVASTTSSSESL
.:. . .:.. ..: : .::: . : :
CCDS58 IGGKNEPEPEQPIPRKVQIRSLPSLEDIDPDVLDSMHSLGCFRDRNKLLQDLLSEEENQE
280 290 300 310 320 330
CCDS58 KMIYFLLLDRKERYPSQEDEDLPPRNEIDPPRKRVDSPMLNRHGKRRPERKSMEVLSVTD
340 350 360 370 380 390
>>CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 (661 aa)
initn: 373 init1: 254 opt: 468 Z-score: 319.4 bits: 68.4 E(32554): 1.8e-11
Smith-Waterman score: 468; 31.1% identity (64.6% similar) in 280 aa overlap (33-305:48-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRIAD
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CCDS31 GAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQETLGKGTYGKVKRATERFS
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