Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0758
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0758, 432 aa
1>>>pF1KE0758 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4579+/-0.00166; mu= 13.6811+/- 0.099
mean_var=240.4998+/-45.647, 0's: 0 Z-trim(106.5): 948 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.082702
statistics sampled from 8021 (9046) to 8021 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS452.2 ZFP69B gene_id:65243|Hs108|chr1 ( 534) 3028 375.3 7.9e-104
CCDS30686.1 ZFP69 gene_id:339559|Hs108|chr1 ( 526) 1581 202.6 7.3e-52
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1370 177.5 2.8e-44
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1370 177.6 3e-44
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1362 176.6 5.6e-44
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1230 160.9 3.2e-39
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1205 157.9 2.6e-38
CCDS4443.1 ZNF354C gene_id:30832|Hs108|chr5 ( 554) 1204 157.7 2.6e-38
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1205 157.9 2.6e-38
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1205 158.0 2.7e-38
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1205 158.0 2.7e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1202 157.4 2.8e-38
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 1188 155.5 7.8e-38
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1192 156.4 7.9e-38
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 1187 155.7 1.1e-37
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1184 155.3 1.4e-37
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1184 155.3 1.4e-37
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1179 154.9 2.4e-37
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1173 154.2 4e-37
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1165 152.9 6e-37
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 1166 153.2 6.3e-37
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1161 152.7 9.8e-37
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1161 152.7 9.8e-37
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1161 152.7 1e-36
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1159 152.3 1e-36
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 1159 152.3 1e-36
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1159 152.3 1.1e-36
CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 ( 644) 1157 152.2 1.4e-36
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1154 151.6 1.5e-36
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1152 151.2 1.5e-36
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1154 151.7 1.5e-36
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 1153 151.6 1.7e-36
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 1152 151.4 1.7e-36
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1152 151.4 1.8e-36
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1152 151.5 1.9e-36
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1151 151.5 2.2e-36
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1148 150.9 2.5e-36
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 1151 151.7 2.7e-36
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1147 150.9 2.9e-36
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1147 150.9 2.9e-36
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1149 151.5 3.3e-36
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1144 150.7 4.1e-36
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1144 150.7 4.1e-36
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1144 150.7 4.2e-36
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1143 150.6 4.8e-36
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1140 150.0 5e-36
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1138 149.8 6e-36
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1140 150.3 6.1e-36
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1138 150.0 6.8e-36
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1138 150.0 6.9e-36
>>CCDS452.2 ZFP69B gene_id:65243|Hs108|chr1 (534 aa)
initn: 3028 init1: 3028 opt: 3028 Z-score: 1977.5 bits: 375.3 E(32554): 7.9e-104
Smith-Waterman score: 3028; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:103-534)
10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLTFKDVSVDFTQEEWGQLAPAHRNLYREVMLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 NKLESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NKLESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDRK
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 YDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKEC
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAF
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 SQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHST
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 YLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAK
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430
pF1KE0 HQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
500 510 520 530
>>CCDS30686.1 ZFP69 gene_id:339559|Hs108|chr1 (526 aa)
initn: 3126 init1: 1543 opt: 1581 Z-score: 1044.5 bits: 202.6 E(32554): 7.3e-52
Smith-Waterman score: 1914; 65.8% identity (79.9% similar) in 433 aa overlap (1-432:105-526)
10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
:::::.:::::: :::::.:::::::::::
CCDS30 LLTFKDISIDFTQEEWGQLAPAHQNLYREVMLENYSNLVSVGYQLSKPSVISQLEKGEEP
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
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CCDS30 WMAEKEGPGDPSSDLKSKIETIESTAKSTISQERLYHGIMMESFMRDDIIYSTLRKVSTY
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140
pF1KE0 NK-LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDR
. :: .::. : : :: : ::.:.: . : :.:.:. ..: .
CCDS30 DDVLERHQETCMRDVRQAILTHKK-----RVQETNKFGENIIVHSNVII------EQRHH
200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKE
::::: ::. :..::.:: :: . ::.::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS30 KYDTPTKRNTYKLDLINHPTSYIRTKTYECNICEKIFKQPIHLTEHMRIHTGEKPFRCKE
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 CGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKA
::.:::::.:: ::::::::::.::.::::.::: :::.:: : ::::::: : :.::
CCDS30 CGRAFSQSASLSTHQRIHTGEKPFECEECGKAFRHRSSLNQHHRTHTGEKPYVCDKCQKA
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 FSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHS
:::.:.:.:::::: ::::::..:::.: ::::: .: :::: ::: :..: :::::
CCDS30 FSQNISLVQHLRTHSGEKPFTCNECGKTFRQIRHLSEHIRIHTGEKPYACTACCKTFSHR
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 TYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFA
.:::.::: :::::::::::::::: :::::: :. :::::: :::..::::.::::::
CCDS30 AYLTHHQRIHTGERPYKCKECGKAFRQRIHLSNHKTVHTGVKAYECNRCGKAYRHDSSFK
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430
pF1KE0 KHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
:::: :::::::.::::::::: .::: :: . : ::.: : :
CCDS30 KHQRHHTGEKPYECNECGKAFSYNSSLSRHHEIHRRNAFRNKV
490 500 510 520
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
initn: 3230 init1: 1213 opt: 1370 Z-score: 908.4 bits: 177.5 E(32554): 2.8e-44
Smith-Waterman score: 1370; 48.1% identity (72.0% similar) in 428 aa overlap (1-423:43-464)
10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
::::: :::.: .:::.:: ::.:. :
CCDS12 LVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
:...:... : . .:.: . ..:. .:: . ..: .:. . ::.: . ::
CCDS12 WMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDF-YEEHQSQKIIETLTSYNLEYSSLREEWKC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KE0 NK-LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRF----EKRINVKSEVMPGPIGLPR
. .: : ::. . . .. . .:: :: . . .. . ....: .
CCDS12 EGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWGSFHQNPLLCTQKIIP-----KE
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPF
.. .:.:: . . :. .. . .. : ..:: :::.:.: :: :.::::::::.
CCDS12 EKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPY
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 RCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRV
.: :::::::: :.:. :::::::::::::::: :.: . . :.::.:.:::::::::.:
CCDS12 KCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKV
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 CEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKT
:.::::: : :: :.:. :::. : .::::: . . ::. .::: ::: ::::.:.
CCDS12 CRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKA
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 FSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHD
:: .::: ::: :::::::.:::::::::: ::. :::.::: :::.:..: ::: .
CCDS12 FSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQI
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KE0 SSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. .:.:::.:::::::.: ::::::: .::: .: ..:
CCDS12 AYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLA
430 440 450 460 470 480
CCDS12 QHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGESLSPPNPVNHQVL
490 500 510 520 530
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 3230 init1: 1213 opt: 1370 Z-score: 908.0 bits: 177.6 E(32554): 3e-44
Smith-Waterman score: 1370; 48.1% identity (72.0% similar) in 428 aa overlap (1-423:99-520)
10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
::::: :::.: .:::.:: ::.:. :
CCDS74 LVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAP
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
:...:... : . .:.: . ..:. .:: . ..: .:. . ::.: . ::
CCDS74 WMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDF-YEEHQSQKIIETLTSYNLEYSSLREEWKC
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140
pF1KE0 NK-LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRF----EKRINVKSEVMPGPIGLPR
. .: : ::. . . .. . .:: :: . . .. . ....: .
CCDS74 EGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWGSFHQNPLLCTQKIIP-----KE
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPF
.. .:.:: . . :. .. . .. : ..:: :::.:.: :: :.::::::::.
CCDS74 EKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 RCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRV
.: :::::::: :.:. :::::::::::::::: :.: . . :.::.:.:::::::::.:
CCDS74 KCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKV
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 CEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKT
:.::::: : :: :.:. :::. : .::::: . . ::. .::: ::: ::::.:.
CCDS74 CRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKA
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 FSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHD
:: .::: ::: :::::::.:::::::::: ::. :::.::: :::.:..: ::: .
CCDS74 FSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQI
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430
pF1KE0 SSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. .:.:::.:::::::.: ::::::: .::: .: ..:
CCDS74 AYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLA
490 500 510 520 530 540
CCDS74 QHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGESLSPPNPVNHQVL
550 560 570 580 590
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10 20 30
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::::: .:::.: ..::: ::: ::.:.::
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40 50 60 70 80 90
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:..... . : : . :..: . ... : . . : . : : .: . .
CCDS12 WMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSKQETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQS
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100 110 120 130 140
pF1KE0 NK-LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDR
. ..: .:.. .:. . :. . . ...: :. . .. .. .. ..: :.
CCDS12 EDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILPEVQNKEYNKSWQTFH-QDTIFDIQQSFPTKEKA
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 KYDTPGKRS--RYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRC
. : :.: . .... .: . :.. : ..:: :::.:.: :: :.::::::::. :
CCDS12 HKHEPQKKSYRKKSVEM-KHRKVYVEKKLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYAC
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 KECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCE
::::.::::..: :.:::::::::::::: :.: . . :.:: :.:::::::.:. :.
CCDS12 VECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKECK
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270 280 290 300 310 320
pF1KE0 KAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFS
::::: : :: :.:. :.:: : .::::: . : ::. :::: :::.::::.:.::
CCDS12 KAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECGKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFS
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330 340 350 360 370 380
pF1KE0 HSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSS
: :: ::: :::::::.:::: ::::: ::. ::::::: :::::. : ::: . .
CCDS12 HRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFSQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAY
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390 400 410 420 430
pF1KE0 FAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. .:::.:::::::.: ::::::: :::: .: ..:
CCDS12 LDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSSLAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQH
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CCDS12 QRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLHQRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHERIH
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10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
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CCDS32 PLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEA
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: :.: : .: . : . .:. : : . : : . :: : .::
CCDS32 WSMKRHEIMV------AKPTVMCSHFAQDL-WPEQN--------IKDSFQKVTLKRYGKC
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pF1KE0 NK--------LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIG
. ::..: . : : : :: . . ... : . :. :
CCDS32 RHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIR
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150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LPRKRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGE
.:. : :: . :..::: .:... ..:. : : :. ::.: ::::::
CCDS32 HTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGE
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pF1KE0 KPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYE
::..:.::::::.:::.:: :..::::::::.:.:::::: . :.:: : ::::::::.
CCDS32 KPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYK
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270 280 290 300 310 320
pF1KE0 CRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVC
:. : :::..: : : . :. :::. :..::::: : .: :.::::: ::: :. :
CCDS32 CKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKC
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pF1KE0 SKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAF
.:.:..:..:: :. ::::.::::..:::::.. ::. :. .::: :::.:..:::::
CCDS32 GKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAF
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390 400 410 420 430
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CCDS32 KHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSS
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CCDS32 EKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPY
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.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
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::.: ::::.: : ::::.: :::::::::::. : :::.: :::: :::. :::. :
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pF1KE0 KDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECG
.::::: : : .:. :::: ::: :: :.::::::. :.::.::::::.::.:..::
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::: : ::. :::.::: :::::. ::::: :.::..::::::::::::.::.::.:::
CCDS74 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. ::.: . :
CCDS74 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
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pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
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CCDS74 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
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pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
.:.:::::: . : .:. :::
CCDS74 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610
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CCDS44 PVTFRDVAVFFSQDEWLHLDSAQRALYREVMLENYSSLVSLGIPFSMPKLIHQLQQGEDP
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
..::.. . .:. .:. ..:: :: :.. .. : . .. . .
CCDS44 CMVEREVPSDTRLGFKTWLETEALPHRQDIFIEETSQGMVKKESIKDGHWDINFEEAVEF
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pF1KE0 -NKLESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKR-D
...: .::.. . :. .::.... .. : .. : . ... .. ..: .:
CCDS44 ESEIEEEQEKKPLR--QMIDSHEKTISEDGNHTSLELGKSLFTNTALVTQQ-SVPIERIP
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 RKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCK
: : :: . :.::.. . : : :: : : ::: .:: ::.::::::::..:.
CCDS44 NMYYTFGKDFKQNFDLMKCFQIYPGGKPHICNECGKSFKQNLHLIEHQRIHTGEKPYKCN
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pF1KE0 ECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEK
:: :.::. :::. :::::::::::.:.:: :.: . :.: .:.:.:::::::.:: : :
CCDS44 ECEKTFSHRSSLLSHQRIHTGEKPYKCNECEKAFSNSSTLIKHLRVHTGEKPYRCRECGK
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:::: : : : :. :: . : .: ::: .:..:. :::: ::: :. :.: .:.
CCDS44 AFSQCSTLTVHQRIHTGEKLYKCGECEKAFNCRAKLHRHQRIHTGEKPYKCSECGKGYSQ
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CCDS44 FTSLAEHQRFHTGEQLYTCLECGRTFTRIVTLIEHQRIHTGQKPYQCNECEKAFNQYSSF
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CCDS44 NEHRKIHTGEKLYTCEECGKAFGCKSNLYRHQRIHTGEKPYQCNQCGKAFSQYSFLTEHE
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CCDS44 RIHTGEKLYKCMECGKAYSYRSNLCRHKKVHTKEKLYKWKEYGKPFICSSSLTQYQRFFK
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. ..:.: :.. :..: :. : :
CCDS74 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
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.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
CCDS74 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTG------------EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
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: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
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.::::: : : .:. :::: ::: :: :.::::::. :.::.::::::.::.:..::
CCDS74 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
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CCDS74 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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. ::.: . :
CCDS74 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
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initn: 541 init1: 541 opt: 541 Z-score: 373.0 bits: 78.7 E(32554): 1.9e-14
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
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CCDS74 IHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]