Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0764, 437 aa
1>>>pF1KE0764 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1640+/-0.000814; mu= 5.3970+/- 0.049
mean_var=158.1555+/-31.604, 0's: 0 Z-trim(112.7): 37 B-trim: 758 in 1/53
Lambda= 0.101984
statistics sampled from 13434 (13466) to 13434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5245.1 IPCEF1 gene_id:26034|Hs108|chr6 ( 437) 2875 434.6 9.5e-122
CCDS47509.1 IPCEF1 gene_id:26034|Hs108|chr6 ( 438) 2863 432.8 3.2e-121
CCDS55389.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX ( 849) 623 103.4 9.2e-22
CCDS55387.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX ( 898) 623 103.4 9.6e-22
CCDS55388.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (1004) 623 103.4 1.1e-21
CCDS14198.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (1034) 623 103.4 1.1e-21
CCDS76124.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1 ( 455) 492 84.0 3.5e-16
CCDS276.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1 ( 713) 492 84.1 5e-16
CCDS72732.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1 ( 720) 492 84.1 5.1e-16
>>CCDS5245.1 IPCEF1 gene_id:26034|Hs108|chr6 (437 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 2299.2 bits: 434.6 E(32554): 9.5e-122
Smith-Waterman score: 2875; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLTMSRRRISCKDLGHADCQGWLYKKKEKGSFLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLTMSRRRISCKDLGHADCQGWLYKKKEKGSFLSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAFKISHPQIKTFYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAFKISHPQIKTFYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AAENVQEMNVWLNKLGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDPEIAAETPPPPHASQTQSLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AAENVQEMNVWLNKLGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDPEIAAETPPPPHASQTQSLTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 QQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPITF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVQVHSPVPSEAGIHKALENSFVTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AVQVHSPVPSEAGIHKALENSFVTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKIM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 DKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREWKVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREWKVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDDT
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE0 PQELKKSPSSPSVENSI
:::::::::::::::::
CCDS52 PQELKKSPSSPSVENSI
430
>>CCDS47509.1 IPCEF1 gene_id:26034|Hs108|chr6 (438 aa)
initn: 2861 init1: 2802 opt: 2863 Z-score: 2289.7 bits: 432.8 E(32554): 3.2e-121
Smith-Waterman score: 2863; 99.8% identity (99.8% similar) in 438 aa overlap (1-437:1-438)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSYMAIDGSAL-VPLRQKPRRKTQGFLTMSRRRISCKDLGHADCQGWLYKKKEKGSFLS
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTSYMAIDGSALQVPLRQKPRRKTQGFLTMSRRRISCKDLGHADCQGWLYKKKEKGSFLS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAFKISHPQIKTFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAFKISHPQIKTFY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FAAENVQEMNVWLNKLGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDPEIAAETPPPPHASQTQSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FAAENVQEMNVWLNKLGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDPEIAAETPPPPHASQTQSLT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AQQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AQQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPIT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FAVQVHSPVPSEAGIHKALENSFVTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FAVQVHSPVPSEAGIHKALENSFVTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 MDKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRPSTKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RTLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREWKVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREWKVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDD
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KE0 TPQELKKSPSSPSVENSI
::::::::::::::::::
CCDS47 TPQELKKSPSSPSVENSI
430
>>CCDS55389.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (849 aa)
initn: 529 init1: 529 opt: 623 Z-score: 504.2 bits: 103.4 E(32554): 9.2e-22
Smith-Waterman score: 623; 37.4% identity (66.4% similar) in 286 aa overlap (15-288:494-768)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHAD
:..: ..:..: .. :.:::::::::..:
CCDS55 PSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQSSLQHKSKKKNKGPIAGKSKRRISCKDLGRGD
470 480 490 500 510 520
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECK
:.:::.:::. :..:.::::.: .:: .::::: :. :::.::..::.: ..:::::.
CCDS55 CEGWLWKKKDAKSYFSQKWKKYWFVLKDASLYWYINEEDEKAEGFISLPEFKIDRASECR
530 540 550 560 570 580
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KKHAFKISHPQIKTFYFAAENVQEMNVWLNK---LGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDP
::.::: ::.::.::::::....:: :::. : .. ..: .... .:::..:.
CCDS55 KKYAFKACHPKIKSFYFAAEHLDDMNRWLNRINMLTAGYAERERIKQEQDYWSESDKEEA
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210
pF1KE0 EIAA----ETPPPPHASQTQSLTAQQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSK
. . ..::::. . . . : .:: . . .:: :. :. :: .
CCDS55 DTPSTPKQDSPPPPYDTYPRP---PSMSCASPYVEAKHSRLSSTET-----SQSQSSHEE
650 660 670 680 690
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPITFAVQVHSPVPSEAGIHK----ALENSFVTSESGFLNS
:: . . . .: .. ...:. : .:.: ::.: : :.:. . :
CCDS55 FRQEVTGSSAVSPIRKTASQRRSWQDLIETPLTS-SGLHYLQTLPLEDS-VFSDSAAI-S
700 710 720 730 740 750
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKIMDKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRR
:.: ... ::
CCDS55 PEHRRQSTLPTQKCHLQDHYGPYPLAESERMQVLNGNGGKPRSFTLPRDSGFNHCCLNAP
760 770 780 790 800 810
>>CCDS55387.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (898 aa)
initn: 529 init1: 529 opt: 623 Z-score: 503.8 bits: 103.4 E(32554): 9.6e-22
Smith-Waterman score: 623; 37.4% identity (66.4% similar) in 286 aa overlap (15-288:543-817)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHAD
:..: ..:..: .. :.:::::::::..:
CCDS55 PSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQSSLQHKSKKKNKGPIAGKSKRRISCKDLGRGD
520 530 540 550 560 570
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECK
:.:::.:::. :..:.::::.: .:: .::::: :. :::.::..::.: ..:::::.
CCDS55 CEGWLWKKKDAKSYFSQKWKKYWFVLKDASLYWYINEEDEKAEGFISLPEFKIDRASECR
580 590 600 610 620 630
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KKHAFKISHPQIKTFYFAAENVQEMNVWLNK---LGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDP
::.::: ::.::.::::::....:: :::. : .. ..: .... .:::..:.
CCDS55 KKYAFKACHPKIKSFYFAAEHLDDMNRWLNRINMLTAGYAERERIKQEQDYWSESDKEEA
640 650 660 670 680 690
170 180 190 200 210
pF1KE0 EIAA----ETPPPPHASQTQSLTAQQASSSSPSLSGTSYSFSSLENTVKTPSSFPSSLSK
. . ..::::. . . . : .:: . . .:: :. :. :: .
CCDS55 DTPSTPKQDSPPPPYDTYPRP---PSMSCASPYVEAKHSRLSSTET-----SQSQSSHEE
700 710 720 730 740
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ERQSLPDTVNSLSAAEDEGQPITFAVQVHSPVPSEAGIHK----ALENSFVTSESGFLNS
:: . . . .: .. ...:. : .:.: ::.: : :.:. . :
CCDS55 FRQEVTGSSAVSPIRKTASQRRSWQDLIETPLTS-SGLHYLQTLPLEDS-VFSDSAAI-S
750 760 770 780 790 800
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LSSDDTSSLSSNHDHLTVPDKPAGSKIMDKEETKVSEDDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRR
:.: ... ::
CCDS55 PEHRRQSTLPTQKCHLQDHYGPYPLAESERMQVLNGNGGKPRSFTLPRDSGFNHCCLNAP
810 820 830 840 850 860
>>CCDS55388.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (1004 aa)
initn: 854 init1: 529 opt: 623 Z-score: 503.1 bits: 103.4 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 898; 37.3% identity (64.0% similar) in 453 aa overlap (15-396:513-962)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHAD
:..: ..:..: .. :.:::::::::..:
CCDS55 PSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQSSLQHKSKKKNKGPIAGKSKRRISCKDLGRGD
490 500 510 520 530 540
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECK
:.:::.:::. :..:.::::.: .:: .::::: :. :::.::..::.: ..:::::.
CCDS55 CEGWLWKKKDAKSYFSQKWKKYWFVLKDASLYWYINEEDEKAEGFISLPEFKIDRASECR
550 560 570 580 590 600
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KKHAFKISHPQIKTFYFAAENVQEMNVWLNK---LGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDP
::.::: ::.::.::::::....:: :::. : .. ..: .... .:::..:.
CCDS55 KKYAFKACHPKIKSFYFAAEHLDDMNRWLNRINMLTAGYAERERIKQEQDYWSESDKEEA
610 620 630 640 650 660
170 180
pF1KE0 EIAA----ETPPPP--------------------HASQTQSLTAQQASS---------SS
. . ..:::: :. ... :.:. :: .:
CCDS55 DTPSTPKQDSPPPPYDTYPRPPSMSCASPYVEAKHSRLSSTETSQSQSSHEEFRQEVTGS
670 680 690 700 710 720
190 200 210 220 230
pF1KE0 PSLSGTSYSFS---SLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLP--DTVNSLSAA---EDEGQPIT
..: . : : .. ..:: . :: . :.:: :.: : ::: : . :
CCDS55 SAVSPIRKTASQRRSWQDLIETP--LTSSGLHYLQTLPLEDSVFSDSAAISPEHRRQSTL
730 740 750 760 770 780
240 250 260 270 280
pF1KE0 FAVQVH-----SPVP-SEAGIHKALEN------SF-VTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHD
. . : .: : .:. ..:.. :: . .::: : . : . .:
CCDS55 PTQKCHLQDHYGPYPLAESERMQVLNGNGGKPRSFTLPRDSGF-NHCCLNAPVSACDPQD
790 800 810 820 830
290 300 310 320 330
pF1KE0 HLTVPD------------KPAGSKIMDKEETKVSE-DDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRP
. :. . :: .: .: :.. . : .. ::..::::::::::..:
CCDS55 DVQPPEVEEEEEEEEEEGEAAGENIGEKSESREEKLGDSLQDLYRALEQASLSPLGEHRI
840 850 860 870 880 890
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 STKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIRTLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREW
::: : . ::.:::..: .:::::..: :.:::: .: ..:.:...::.: ::......:
CCDS55 STKMEYKLSFIKRCNDPVMNEKLHRLRILKSTLKAREGEVAIIDKVLDNPDLTSKEFQQW
900 910 920 930 940 950
400 410 420 430
pF1KE0 KVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDDTPQELKKSPSSPSVENSI
: :
CCDS55 KQMYLDLFLDICQNTTSNDPLSISSEVDVITSSLAHTHSYIETHV
960 970 980 990 1000
>>CCDS14198.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX (1034 aa)
initn: 854 init1: 529 opt: 623 Z-score: 502.9 bits: 103.4 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 898; 37.3% identity (64.0% similar) in 453 aa overlap (15-396:543-992)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHAD
:..: ..:..: .. :.:::::::::..:
CCDS14 PSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQSSLQHKSKKKNKGPIAGKSKRRISCKDLGRGD
520 530 540 550 560 570
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECK
:.:::.:::. :..:.::::.: .:: .::::: :. :::.::..::.: ..:::::.
CCDS14 CEGWLWKKKDAKSYFSQKWKKYWFVLKDASLYWYINEEDEKAEGFISLPEFKIDRASECR
580 590 600 610 620 630
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 KKHAFKISHPQIKTFYFAAENVQEMNVWLNK---LGSAVIHQESTTKDEECYSESEQEDP
::.::: ::.::.::::::....:: :::. : .. ..: .... .:::..:.
CCDS14 KKYAFKACHPKIKSFYFAAEHLDDMNRWLNRINMLTAGYAERERIKQEQDYWSESDKEEA
640 650 660 670 680 690
170 180
pF1KE0 EIAA----ETPPPP--------------------HASQTQSLTAQQASS---------SS
. . ..:::: :. ... :.:. :: .:
CCDS14 DTPSTPKQDSPPPPYDTYPRPPSMSCASPYVEAKHSRLSSTETSQSQSSHEEFRQEVTGS
700 710 720 730 740 750
190 200 210 220 230
pF1KE0 PSLSGTSYSFS---SLENTVKTPSSFPSSLSKERQSLP--DTVNSLSAA---EDEGQPIT
..: . : : .. ..:: . :: . :.:: :.: : ::: : . :
CCDS14 SAVSPIRKTASQRRSWQDLIETP--LTSSGLHYLQTLPLEDSVFSDSAAISPEHRRQSTL
760 770 780 790 800 810
240 250 260 270 280
pF1KE0 FAVQVH-----SPVP-SEAGIHKALEN------SF-VTSESGFLNSLSSDDTSSLSSNHD
. . : .: : .:. ..:.. :: . .::: : . : . .:
CCDS14 PTQKCHLQDHYGPYPLAESERMQVLNGNGGKPRSFTLPRDSGF-NHCCLNAPVSACDPQD
820 830 840 850 860
290 300 310 320 330
pF1KE0 HLTVPD------------KPAGSKIMDKEETKVSE-DDEMEKLYKSLEQASLSPLGDRRP
. :. . :: .: .: :.. . : .. ::..::::::::::..:
CCDS14 DVQPPEVEEEEEEEEEEGEAAGENIGEKSESREEKLGDSLQDLYRALEQASLSPLGEHRI
870 880 890 900 910 920
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 STKKELRKSFVKRCKNPSINEKLHKIRTLNSTLKCKEHDLAMINQLLDDPKLTARKYREW
::: : . ::.:::..: .:::::..: :.:::: .: ..:.:...::.: ::......:
CCDS14 STKMEYKLSFIKRCNDPVMNEKLHRLRILKSTLKAREGEVAIIDKVLDNPDLTSKEFQQW
930 940 950 960 970 980
400 410 420 430
pF1KE0 KVMNTLLIQDIYQQQRASPAPDDTDDTPQELKKSPSSPSVENSI
: :
CCDS14 KQMYLDLFLDICQNTTSNDPLSISSEVDVITSSLAHTHSYIETHV
990 1000 1010 1020 1030
>>CCDS76124.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1 (455 aa)
initn: 661 init1: 378 opt: 492 Z-score: 404.1 bits: 84.0 E(32554): 3.5e-16
Smith-Waterman score: 567; 28.1% identity (56.4% similar) in 427 aa overlap (20-432:116-439)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHADCQGWL
:.:..:. : .::::.::..::. ::.:::
CCDS76 PIPPEPPAILPAGVAGTPGLPESPDKSPVGRKKSKGLATRLSRRRVSCRELGRPDCDGWL
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 YKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAF
.: :.:.. .:.. : .::: .:::: . . :::.:..:. ....: . . :::..:
CCDS76 LLRKAPGGFMGPRWRRRWFVLKGHTLYWYRQPQDEKAEGLINVSNYSLESGHDQKKKYVF
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pF1KE0 TVNSLSAAEDEGQPITFAVQVHSPVPSEAGIHKALENSFVTSESGFLNSLSSDDTSSLSS
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