FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0764, 437 aa 1>>>pF1KE0764 437 - 437 aa - 437 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3869+/-0.000338; mu= -1.4216+/- 0.021 mean_var=193.1221+/-39.909, 0's: 0 Z-trim(120.9): 59 B-trim: 489 in 1/57 Lambda= 0.092291 statistics sampled from 36804 (36872) to 36804 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16 Scan time: 9.410 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001317700 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 819) 623 95.2 6.5e-19 XP_016884847 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 826) 623 95.2 6.5e-19 NP_001162120 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 849) 623 95.3 6.7e-19 XP_011543774 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 856) 623 95.3 6.7e-19 NP_001317702 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 868) 623 95.3 6.8e-19 XP_011543773 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 875) 623 95.3 6.9e-19 NP_001162119 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 898) 623 95.3 7e-19 NP_001317701 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 955) 623 95.3 7.4e-19 NP_001317699 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 985) 623 95.3 7.6e-19 NP_001162118 (OMIM: 300724) connector enhancer of (1004) 623 95.3 7.7e-19 NP_055742 (OMIM: 300724) connector enhancer of kin (1034) 623 95.3 7.9e-19 XP_011538786 (OMIM: 603272) PREDICTED: connector e ( 455) 492 77.7 6.9e-14 NP_001284577 (OMIM: 603272) connector enhancer of ( 455) 492 77.7 6.9e-14 XP_011538787 (OMIM: 603272) PREDICTED: connector e ( 463) 492 77.7 7.1e-14 NP_006305 (OMIM: 603272) connector enhancer of kin ( 713) 492 77.8 1e-13 NP_001284576 (OMIM: 603272) connector enhancer of ( 720) 492 77.8 1e-13 XP_016874990 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin ( 628) 238 43.9 0.0014 XP_016874989 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin ( 685) 238 44.0 0.0015 XP_016874988 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin ( 812) 238 44.0 0.0017 XP_016874987 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1093) 238 44.0 0.0022 NP_001243716 (OMIM: 607770) pleckstrin homology do (1098) 238 44.0 0.0023 NP_061885 (OMIM: 607770) pleckstrin homology domai (1116) 238 44.0 0.0023 XP_006719156 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1151) 238 44.1 0.0024 XP_016874986 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1168) 238 44.1 0.0024 NP_001137293 (OMIM: 607770) pleckstrin homology do (1174) 238 44.1 0.0024 XP_011519019 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1174) 238 44.1 0.0024 XP_005253457 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1179) 238 44.1 0.0024 XP_006719154 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1197) 238 44.1 0.0024 XP_016874985 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1208) 238 44.1 0.0025 XP_011519018 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1213) 238 44.1 0.0025 XP_011519017 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1237) 238 44.1 0.0025 XP_011519016 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1264) 238 44.1 0.0026 XP_016874984 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1271) 238 44.1 0.0026 XP_006719159 (OMIM: 607770) PREDICTED: pleckstrin (1276) 238 44.1 0.0026 NP_001243399 (OMIM: 607770) pleckstrin homology do (1282) 233 43.4 0.0041 NP_001154826 (OMIM: 607769) pleckstrin homology do ( 583) 224 42.1 0.0048 XP_011525462 (OMIM: 607769) PREDICTED: pleckstrin ( 666) 225 42.2 0.0049 XP_006723364 (OMIM: 607769) PREDICTED: pleckstrin ( 637) 224 42.1 0.0051 XP_011525459 (OMIM: 607769) PREDICTED: pleckstrin ( 783) 225 42.2 0.0056 XP_005259164 (OMIM: 607769) PREDICTED: pleckstrin ( 754) 224 42.1 0.0059 NP_065955 (OMIM: 607769) pleckstrin homology domai ( 779) 224 42.1 0.0061 XP_005245025 (OMIM: 607771) PREDICTED: pleckstrin (1048) 226 42.4 0.0066 NP_055750 (OMIM: 607771) pleckstrin homology domai (1048) 226 42.4 0.0066 XP_016856178 (OMIM: 607771) PREDICTED: pleckstrin (1128) 226 42.5 0.007 XP_005245023 (OMIM: 607771) PREDICTED: pleckstrin (1173) 226 42.5 0.0072 XP_016856179 (OMIM: 607771) PREDICTED: pleckstrin (1215) 226 42.5 0.0075 >>NP_001317700 (OMIM: 300724) connector enhancer of kina (819 aa) initn: 529 init1: 529 opt: 623 Z-score: 460.6 bits: 95.2 E(85289): 6.5e-19 Smith-Waterman score: 623; 37.4% identity (66.4% similar) in 286 aa overlap (15-288:464-738) 10 20 30 40 pF1KE0 MTSYMAIDGSALVPLRQKPRRKTQGFLT-MSRRRISCKDLGHAD :..: ..:..: .. :.:::::::::..: NP_001 PSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQSSLQHKSKKKNKGPIAGKSKRRISCKDLGRGD 440 450 460 470 480 490 50 60 70 80 90 100 pF1KE0 CQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECK :.:::.:::. :..:.::::.: .:: .::::: :. :::.::..::.: ..:::::. 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