Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0773
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0773, 344 aa
1>>>pF1KE0773 344 - 344 aa - 344 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5256+/-0.00121; mu= 4.2527+/- 0.069
mean_var=210.5385+/-51.123, 0's: 0 Z-trim(108.4): 683 B-trim: 398 in 2/46
Lambda= 0.088391
statistics sampled from 9340 (10167) to 9340 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 344) 2311 307.9 7.8e-84
CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 345) 2299 306.4 2.3e-83
CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 303) 2034 272.5 3.1e-73
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 1590 215.9 3.5e-56
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 1578 214.4 9.6e-56
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 1576 214.1 1.1e-55
CCDS82065.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 312) 1433 195.9 3.7e-50
CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 ( 403) 1349 185.3 7.4e-47
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 633 94.4 4e-19
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 575 86.7 4.1e-17
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 575 86.8 4.7e-17
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 576 87.0 4.8e-17
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 568 86.3 1.5e-16
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 568 86.3 1.6e-16
CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 685) 562 85.2 1.7e-16
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX ( 358) 556 84.1 1.9e-16
CCDS6625.1 PRKACG gene_id:5568|Hs108|chr9 ( 351) 553 83.7 2.4e-16
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 554 84.2 3.4e-16
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 470) 551 83.6 3.5e-16
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 472) 551 83.6 3.5e-16
CCDS75150.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 342) 547 83.0 4e-16
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 547 83.1 5.1e-16
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 545 82.8 5.8e-16
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 548 83.4 5.9e-16
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 545 82.9 5.9e-16
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 545 82.9 6e-16
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 545 82.9 6e-16
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 544 82.7 6.2e-16
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 548 83.5 6.3e-16
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 544 82.7 6.3e-16
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 547 83.3 6.4e-16
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 544 82.7 6.4e-16
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 545 82.9 6.4e-16
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 762) 547 83.4 6.9e-16
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 547 83.4 7e-16
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 544 82.8 7e-16
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 547 83.4 7.1e-16
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 547 83.4 7.1e-16
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 540 82.1 7.5e-16
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 540 82.1 7.5e-16
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 540 82.1 7.6e-16
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 540 82.1 7.7e-16
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 357) 540 82.1 7.7e-16
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 358) 540 82.1 7.7e-16
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 540 82.1 8.3e-16
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 544 82.9 8.6e-16
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 544 83.0 8.7e-16
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 544 83.0 8.9e-16
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 544 83.0 8.9e-16
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 544 83.1 1e-15
>>CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (344 aa)
initn: 2311 init1: 2311 opt: 2311 Z-score: 1618.6 bits: 307.9 E(32554): 7.8e-84
Smith-Waterman score: 2311; 99.7% identity (99.7% similar) in 344 aa overlap (1-344:1-344)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS11 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE0 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
310 320 330 340
>>CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (345 aa)
initn: 1854 init1: 1854 opt: 2299 Z-score: 1610.3 bits: 306.4 E(32554): 2.3e-83
Smith-Waterman score: 2299; 99.4% identity (99.4% similar) in 345 aa overlap (1-344:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 SSGTPDILTR-HFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVE
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SSGTPDILTRRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 HQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTAT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS67 LPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 AQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
310 320 330 340
>>CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (303 aa)
initn: 2034 init1: 2034 opt: 2034 Z-score: 1428.3 bits: 272.5 E(32554): 3.1e-73
Smith-Waterman score: 2034; 99.7% identity (99.7% similar) in 303 aa overlap (42-344:1-303)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 YGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRH
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 FTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAH
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYC
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 HGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 EKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGAQDLISKLLRHN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS58 EKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGAQDLISKLLRHN
220 230 240 250 260 270
320 330 340
pF1KE0 PSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
280 290 300
>>CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1576 init1: 1576 opt: 1590 Z-score: 1122.2 bits: 215.9 E(32554): 3.5e-56
Smith-Waterman score: 1590; 77.0% identity (90.3% similar) in 309 aa overlap (35-339:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 ENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPT----AAPGQKVMEN
.: :.: .... ::. :. .: ...
CCDS33 MSSPRAVVQLGKA--QPAGEELATANQTAQQP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
:: : . :..:.::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.::
CCDS33 SS--PAM--RRLTVDDFEIGRPLGKGKFGNVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEH
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
::::::::::::.:::::::::::.: ::.::::::::::::::::::: .::::::::
CCDS33 QLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARRVYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATI
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
.::::::: ::: ::::::::::::::::..::.::::::::::.:::::::::::::::
CCDS33 IEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLGFRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGA
:::::::: ..:::::::::::::::::: ::::::::.::::::.:::..:: :.: ::
CCDS33 PPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVGYPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
.::::.:::..: :::::::. ::::.:.::::::: :
CCDS33 RDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQAHSRRVLPPCAQMAS
270 280 290 300
>>CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 (290 aa)
initn: 1559 init1: 1559 opt: 1578 Z-score: 1114.3 bits: 214.4 E(32554): 9.6e-56
Smith-Waterman score: 1578; 80.6% identity (92.4% similar) in 289 aa overlap (51-339:2-286)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 LSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIG
:. .: ... :: : . :..:.::::::
CCDS46 MATANQTAQQPSS--PAM--RRLTVDDFEIG
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 RPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRL
::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::
CCDS46 RPLGKGKFGNVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRL
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 YNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRD
::::.: ::.::::::::::::::::::: .::::::::.::::::: ::: :::::::
CCDS46 YNYFHDARRVYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRD
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 IKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIG
:::::::::..::.::::::::::.::::::::::::::::::::::: ..:::::::::
CCDS46 IKPENLLLGFRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIG
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 VLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQ
::::::::: ::::::::.::::::.:::..:: :.: ::.::::.:::..: :::::::
CCDS46 VLCYELLVGYPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQ
210 220 230 240 250 260
330 340
pF1KE0 VSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
. ::::.:.::::::: :
CCDS46 ILKHPWVQAHSRRVLPPCAQMAS
270 280 290
>>CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 (275 aa)
initn: 1559 init1: 1559 opt: 1576 Z-score: 1113.2 bits: 214.1 E(32554): 1.1e-55
Smith-Waterman score: 1576; 84.4% identity (94.8% similar) in 270 aa overlap (70-339:2-271)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VLMSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKS
:..:.::::::::::::::::::::: :.:
CCDS46 MRRLTVDDFEIGRPLGKGKFGNVYLARLKES
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 HFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPR
::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::::.: ::.:::::::::
CCDS46 HFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARRVYLILEYAPR
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADF
:::::::::: .::::::::.::::::: ::: ::::::::::::::::..::.:::::
CCDS46 GELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLGFRGEVKIADF
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHN
:::::.::::::::::::::::::::::: ..:::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS46 GWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVGYPPFESASHS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 ETYRRIVKVDLKFPASVPTGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSA
::::::.:::..:: :.: ::.::::.:::..: :::::::. ::::.:.::::::: :
CCDS46 ETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQAHSRRVLPPCA
220 230 240 250 260 270
340
pF1KE0 LQSVA
CCDS46 QMAS
>>CCDS82065.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 1990 init1: 1433 opt: 1433 Z-score: 1014.0 bits: 195.9 E(32554): 3.7e-50
Smith-Waterman score: 1926; 87.2% identity (87.8% similar) in 344 aa overlap (1-344:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
::::::::::::::::::::::::: :: :. : .:
CCDS82 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGK------------------ALLCLWP---EASSVSS
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 P-----------SHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS82 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
270 280 290 300 310
>>CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 (403 aa)
initn: 1332 init1: 1332 opt: 1349 Z-score: 954.7 bits: 185.3 E(32554): 7.4e-47
Smith-Waterman score: 1353; 65.7% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (31-342:99-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
:.:. ::: ..: . : :: :.
CCDS13 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
.. :.....::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.:.:: ::::
CCDS13 KK-------RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEH
130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
:::::.:::.::.::::::::.::.: :.:::::::: : .:.:::: ::::::::
CCDS13 QLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATY
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
. :::.:: :::.:.:::::::::::::: :::::::::::::::: :: :.:::::::
CCDS13 ITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYL
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPTGA
::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. :: : ::
CCDS13 PPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGA
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340
pF1KE0 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
.::::.::.::::.: : .: :::. ::: . :: :.
CCDS13 RDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
360 370 380 390 400
>>CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 (970 aa)
initn: 635 init1: 289 opt: 633 Z-score: 456.7 bits: 94.4 E(32554): 4e-19
Smith-Waterman score: 633; 36.8% identity (70.9% similar) in 261 aa overlap (74-331:9-269)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIV
:.::..: ::::.:..:: :. .. . :
CCDS37 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEV
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELY
:.:.. :. . : :. .... :..:. .:.::.::.::::: : .::.::. ::.
CCDS37 AIKMIDKKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPSILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMN
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KELQKSCT-FDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWS
. :.. :.:... .:... ...: :.. ..:::. :::: . ..:::::: .
CCDS37 RYLKNRVKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VH--APSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNE
.. : .. :.::: .:. ::. :. . :.: .: . : ::.: :::.. . ..
CCDS37 TQLKMPHEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLESDVWSLGCMFYTLLIGRPPFDTDTVKN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TYRRIVKVDLKFPASVPTGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSAL
: ..: .: ..:. . :.::: .:::.::..:: :..: ::.. ::
CCDS37 TLNKVVLADYEMPSFLSIEAKDLIHQLLRRNPADRLSLSSVLDHPFMSRNSSTKSKDLGT
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 QSVA
CCDS37 VEDSIDSGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSSTDFSSSG
280 290 300 310 320 330
>>CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 (454 aa)
initn: 561 init1: 376 opt: 575 Z-score: 420.7 bits: 86.7 E(32554): 4.1e-17
Smith-Waterman score: 577; 33.8% identity (63.4% similar) in 325 aa overlap (32-337:34-356)
10 20 30 40 50
pF1KE0 AQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSN--VQPTAA---PGQK
: :: .. ::.. .. ::: ::
CCDS58 TTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRPGAG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKE
..... :. :. .::..:. ::.:.:..: :::: . :.:.: : .: ::
CCDS58 SLQHAQPPPQ--PRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIKE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQR
. . :: .....: :: ...:: : : ...:. : :: ::: : ..: .:::
CCDS58 NKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWS-VHAP---SLRRKT
: :...:: : ::: .::::.::::.::. ...:.::: . : .: . : ..
CCDS58 TRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARANS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKF
. :: .:. ::.. . .. ::: .: . :.:..: :::..... ...:.:.. :
CCDS58 FVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYDF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 PASVPTGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQV------SAHPWVRA----NSRRVLPPSALQS
: . :.::. ::: . ..:: .. .:::. .. : .. ::
CCDS58 PEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTAY
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 VA
CCDS58 LPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLDS
370 380 390 400 410 420
344 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 18:38:53 2016 done: Sat Nov 5 18:38:53 2016
Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]