FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0800, 1531 aa 1>>>pF1KE0800 1531 - 1531 aa - 1531 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1604+/-0.00137; mu= 5.6344+/- 0.082 mean_var=192.4636+/-37.941, 0's: 0 Z-trim(104.8): 43 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.092449 statistics sampled from 8074 (8088) to 8074 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 4.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45672.1 TOP2A gene_id:7153|Hs108|chr17 (1531) 10077 1358.3 0 CCDS82746.1 TOP2B gene_id:7155|Hs108|chr3 (1626) 6650 901.2 0 CCDS46776.1 TOP2B gene_id:7155|Hs108|chr3 (1621) 6648 901.0 0 >>CCDS45672.1 TOP2A gene_id:7153|Hs108|chr17 (1531 aa) initn: 10077 init1: 10077 opt: 10077 Z-score: 7272.1 bits: 1358.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 10077; 100.0% identity (100.0% similar) in 1531 aa overlap 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