Result of FASTA (ccds) for pF1KE0808
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0808, 281 aa
  1>>>pF1KE0808 281 - 281 aa - 281 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7911+/-0.00133; mu= 12.1732+/- 0.076
 mean_var=150.4671+/-50.232, 0's: 0 Z-trim(102.1): 377  B-trim: 829 in 2/45
 Lambda= 0.104557
 statistics sampled from 6334 (6793) to 6334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  2.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11      ( 323) 1125 182.4 3.7e-46
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11      ( 318) 1123 182.1 4.5e-46
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11      ( 317) 1113 180.6 1.3e-45
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11      ( 335) 1098 178.3 6.4e-45
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11      ( 320) 1045 170.3 1.6e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11      ( 313) 1038 169.2 3.2e-42
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11      ( 312) 1027 167.6   1e-41
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11      ( 321) 1018 166.2 2.7e-41
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11       ( 320) 1002 163.8 1.4e-40
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11      ( 321)  998 163.2 2.2e-40
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11      ( 325)  982 160.8 1.2e-39
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11      ( 311)  978 160.2 1.7e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11      ( 329)  970 159.0 4.1e-39
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11      ( 324)  951 156.1   3e-38
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11      ( 314)  941 154.6 8.3e-38
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11      ( 314)  931 153.1 2.3e-37
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11       ( 314)  924 152.0 4.9e-37
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11        ( 320)  908 149.6 2.6e-36
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11       ( 312)  894 147.5 1.1e-35
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11      ( 318)  888 146.6 2.1e-35
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11      ( 316)  886 146.3 2.6e-35
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11      ( 317)  865 143.1 2.3e-34
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11      ( 312)  849 140.7 1.2e-33
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11      ( 314)  844 140.0 2.1e-33
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11      ( 342)  840 139.4 3.4e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11      ( 324)  830 137.9 9.2e-33
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11      ( 315)  822 136.7 2.1e-32
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11      ( 312)  821 136.5 2.3e-32
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11      ( 320)  808 134.6 9.1e-32
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11      ( 321)  807 134.4   1e-31
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11      ( 350)  803 133.9 1.6e-31
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11      ( 326)  798 133.1 2.6e-31
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11      ( 312)  793 132.3 4.3e-31
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11      ( 313)  793 132.3 4.3e-31
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11      ( 313)  780 130.3 1.7e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11      ( 324)  775 129.6 2.9e-30
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11      ( 312)  758 127.0 1.7e-29
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11      ( 317)  735 123.5 1.9e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11      ( 318)  705 119.0 4.3e-27
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11      ( 365)  705 119.1 4.7e-27
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11      ( 354)  700 118.3 7.8e-27
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11      ( 315)  684 115.8 3.9e-26
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11        ( 310)  679 115.1 6.5e-26
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11      ( 324)  665 113.0 2.9e-25
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11      ( 313)  662 112.5 3.8e-25
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11      ( 319)  626 107.1 1.7e-23
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11      ( 323)  604 103.8 1.7e-22
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19       ( 313)  601 103.3 2.3e-22
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19       ( 312)  572 98.9 4.7e-21
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1         ( 320)  570 98.7 5.9e-21


>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11           (323 aa)
 initn: 1014 init1: 541 opt: 1125  Z-score: 942.1  bits: 182.4 E(32554): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1125; 57.6% identity (85.5% similar) in 283 aa overlap (1-281:36-317)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     .::.:: :: .:: .:. ::.:: :.:.::
CCDS53 VTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMERNLHVPMYFFL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       ::::  ..::.....:..:::.:... .:.: .::.: ::.:..::.::::::::::::.
CCDS53 SMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAMAFDRF
          70        80        90       100       110       120     

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       :::: ::::: .::  .: .:..:...::: :  : :::. :: .:  ::.:::::::.:
CCDS53 VAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSYCEHIG
         130       140       150       160       170       180     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .:::::..:.::: ::..: .. . ::..:: .::..::.:::.. :  :: ::::::::
CCDS53 VARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKALSTCGS
         190       200       210       220       230       240     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :.:::.:::.:.::..:.:.:: ..::.:.:::...::: ::::::::.::::::::.. 
CCDS53 HLCVILMFYVPSFFTLLTHHFG-RNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQIREG
         250       260        270       280       290       300    

     270        280       
pF1KE0 VILLFSPISV-CC      
       :   :  :.. ::      
CCDS53 VAHRFFDIKTWCCTSPLGS
          310       320   

>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11           (318 aa)
 initn: 1136 init1: 745 opt: 1123  Z-score: 940.6  bits: 182.1 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 1123; 58.5% identity (85.8% similar) in 275 aa overlap (1-274:37-311)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     ::.::..::  ::..:  . .:: :.::::
CCDS31 SDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHAPMYLFL
         10        20        30        40        50        60      

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
        .:. ... :.....:..:::::.:. .::::.:..::: .: :.. ::.::::::::::
CCDS31 CLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLAMAFDRY
         70        80        90       100       110       120      

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       :::: ::::: ::. ... .::.... ::  :  :::::. :: :::. .. :.::::::
CCDS31 VAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHTYCEHMG
        130       140       150       160       170       180      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       ::::::.::.:::.::::::::. ::: .:: ::: .::::::.. :  :. ::::::::
CCDS31 IARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHKALSTCGS
        190       200       210       220       230       240      

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :: .:..:: :::::::.:::: . .:.:.::....:::::::.::::.::..::.:..:
CCDS31 HIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGARTKEIRSR
        250       260       270       280       290       300      

     270       280 
pF1KE0 VILLFSPISVCC
       .. :.       
CCDS31 LLKLLHLGKTSI
        310        

>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11           (317 aa)
 initn: 777 init1: 602 opt: 1113  Z-score: 932.5  bits: 180.6 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1113; 59.1% identity (86.2% similar) in 276 aa overlap (1-274:40-312)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     .:.::. ::  :.:.:.::.:::::.: ::
CCDS31 HTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQSLHEPMYYFL
      10        20        30        40        50        60         

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       .:: : .. :..:. :..:.:.::.. .::::.:.:.::::::. . :: .:.:::::::
CCDS31 AMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIVLVAMAFDRY
      70        80        90       100       110       120         

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       .::: ::::: ::::. .  :.  ::.::...  :..::. :: .::. ::::.::::::
CCDS31 IAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMG
     130       140       150       160       170       180         

     150       160        170       180       190       200        
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGL-TVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCG
       ::::::..:.::: .:: ...::   ::..:::.::. ::.::: . :: ::.:::.:::
CCDS31 IARLACASIKVNIRFGLGNISLLL--LDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARLKALNTCG
     190       200       210         220       230       240       

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE0 SHICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKD
       ::: ::. :.::::::::.:::: ..::..:::....:::.::: :::.::::.::::..
CCDS31 SHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFG-HNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIRE
       250       260       270        280       290       300      

      270       280 
pF1KE0 RVILLFSPISVCC
       ::. .:       
CCDS31 RVLRIFLKTNH  
        310         

>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11           (335 aa)
 initn: 1118 init1: 967 opt: 1098  Z-score: 920.0  bits: 178.3 E(32554): 6.4e-45
Smith-Waterman score: 1098; 59.1% identity (84.2% similar) in 279 aa overlap (1-278:54-331)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     :::.:. :: .:: .:...  ::::.:.::
CCDS41 NSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALEGNGILICVILSQAILHEPMYIFL
            30        40        50        60        70        80   

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       ::::::. ::.... :..:: ::.    ::: .:..:::::::.:. .::.:::::::::
CCDS41 SMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQMFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRY
            90       100       110       120        130       140  

               100       110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       :::: :::: :::::... ::  ::. .::.:  : :::. .: ::  ::: :..:::::
CCDS41 VAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIFLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMG
            150       160       170       180       190       200  

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       ::.:.:..:..:. :::..:::::::::.:: .::  ::.:::.. :  :: ::::::::
CCDS41 IAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHILQAVFRLLSQDARSKALSTCGS
            210       220       230       240       250       260  

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :::::..::.::.:: .:.::::...: ..:::..::::..::::::.::::.:: : . 
CCDS41 HICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASLYVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEG
            270       280       290       300       310       320  

     270       280  
pF1KE0 VILLFSPISVCC 
       .  .:: ..    
CCDS41 AKQMFSNLAKGSK
            330     

>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11           (320 aa)
 initn: 477 init1: 477 opt: 1045  Z-score: 877.0  bits: 170.3 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 1045; 54.3% identity (84.1% similar) in 276 aa overlap (1-275:42-316)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     .:::::.:: .:..::..:.:::::...::
CCDS31 LSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFL
              20        30        40        50        60        70 

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       :::: ....:..:..:..:.:.:. . .:.: .:..::::.:. :: .::::.:::::.:
CCDS31 SMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDSAILMAMAFDHY
              80        90       100       110       120       130 

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       :::: ::::: ::: ... : ...   ::: :  : .::.  : .:   ::::.::::.:
CCDS31 VAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIG
             140       150       160       170       180       190 

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .:.:::..:..:. ::. : ....  :..:: .::. :: ::: . :  :  :::.::::
CCDS31 VAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQDACQKALGTCGS
             200       210       220       230       240       250 

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :.:::.:::::::::.:::::: ... . .::. ..::...:: :::..::::::::.:.
CCDS31 HVCVILMFYTPAFFSILAHRFG-HNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDK
             260       270        280       290       300       310

     270       280 
pF1KE0 VILLFSPISVCC
       ::::::      
CCDS31 VILLFSKGTG  
              320  

>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11           (313 aa)
 initn: 699 init1: 539 opt: 1038  Z-score: 871.4  bits: 169.2 E(32554): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1038; 56.2% identity (83.3% similar) in 276 aa overlap (1-274:36-308)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     .:..:. ::  ..:.:.::.:::::.:  :
CCDS53 DTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEPMYYCL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       .:: : .. :..:. :..:.:.::.  .::::. .::::::::. : :: .:.:::::::
CCDS53 AMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAMAFDRY
          70        80        90       100       110       120     

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       .::: :: :: ::::. .  :.  ::.::...  :..::. :: .::. ::::.::::::
CCDS53 IAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTYCEHMG
         130       140       150       160       170       180     

     150       160        170       180       190       200        
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGL-TVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCG
       ::::::..:.:::..:: ...::   ::..:::.:.  ::.::: . :: ::.:::.:::
CCDS53 IARLACASIKVNIMFGLGSISLLL--LDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALNTCG
         190       200         210       220       230       240   

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE0 SHICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKD
       ::: ::. : :::::::..: :: . ::..:::....:::.::: :::.::::.::.:..
CCDS53 SHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFG-HDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHIRE
           250       260        270       280       290       300  

      270       280 
pF1KE0 RVILLFSPISVCC
        :. .:       
CCDS53 TVLRIFFKTDH  
            310     

>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11           (312 aa)
 initn: 723 init1: 541 opt: 1027  Z-score: 862.4  bits: 167.6 E(32554): 1e-41
Smith-Waterman score: 1027; 50.9% identity (85.1% similar) in 275 aa overlap (1-274:36-308)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     .:..:..::. ..:.: ::.:::.:.. ::
CCDS31 DTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQPMFYFL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       .::.  .. :.... :..:.:.::. ..::::.:. ::::::..   :...:..::.::.
CCDS31 AMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVMAYDRF
          70        80        90       100       110       120     

              100        110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRYT-ILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       :::: ::.:: :::....  .. ..: :.. .  ::.::. :: .::.::.::.:::: :
CCDS31 VAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTYCEHRG
         130       140       150       160       170       180     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .: :::. :..:::::: : .    .:..::  ::..::.:::.. :  .:.::..::::
CCDS31 LAGLACAPIKINIIYGLMV-ISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFNTCGS
         190       200        210       220       230       240    

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :.::.. :::::::::..:::: ..:::.::::...:::.::: :::.::::.::::...
CCDS31 HVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFG-QNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQIREQ
          250       260        270       280       290       300   

     270       280 
pF1KE0 VILLFSPISVCC
       .. .:       
CCDS31 IVKIFVQKE   
           310     

>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11           (321 aa)
 initn: 1025 init1: 668 opt: 1018  Z-score: 854.9  bits: 166.2 E(32554): 2.7e-41
Smith-Waterman score: 1018; 53.6% identity (79.3% similar) in 276 aa overlap (1-275:36-311)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     ::.::..::  :..::  : .::.:.: ::
CCDS44 KTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKPMYYFL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       .::. ..... ... :..: :.:::  ::.:  :. :::: : .   ::..:. ::.:::
CCDS44 AMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLMALDRY
          70        80        90       100       110       120     

               100       110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       ::::::::: ::::. .. :.: :. .:. ..  :: ::.  : ::  ::.::.::.::.
CCDS44 VAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTYCDHMS
         130       140       150       160       170       180     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .:.:.:::..:: :::: ::::  :.::. :  ::::::.:: ..::  :: ::..:: .
CCDS44 VAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAFNTCTA
         190       200       210       220       230       240     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :::.: . ::::::::..:::: . ::   ::.:...:.:.:: .:::.::::::::.: 
CCDS44 HICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTKQIRDC
         250       260       270       280       290       300     

     270       280     
pF1KE0 VILLFSPISVCC    
       :: ..:          
CCDS44 VIRILSGSKDTKSYSM
         310       320 

>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11            (320 aa)
 initn: 1032 init1: 685 opt: 1002  Z-score: 841.9  bits: 163.8 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1002; 50.9% identity (82.2% similar) in 275 aa overlap (1-274:36-310)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     :: .:..::. :..::. ...::.:.:.::
CCDS31 GTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRPMYVFL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       ..:. .. :. ... :..: ::::.  .:.: .:..::::.: .   ::..:. ::.:. 
CCDS31 ALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLMALDHC
          70        80        90       100       110       120     

               100       110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       ::::.:::: ::::.:.. : :. . .:. ..  :  ::. :: ::  :.:::.::.::.
CCDS31 VAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKGNVIPHTYCDHMS
         130       140       150       160       170       180     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .:...:::. :: :::: ::::  :.::. : :::::::.:: ..::  :: ::.::: .
CCDS31 VAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAFSTCTA
         190       200       210       220       230       240     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :.:.: . :.::::.:..:.:::.::: ::::....::.:.:: .:::.:::::.:... 
CCDS31 HFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTRQVRES
         250       260       270       280       290       300     

     270       280    
pF1KE0 VILLFSPISVCC   
       :: .:          
CCDS31 VIRFFLKGKDNSHNF
         310       320

>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11           (321 aa)
 initn: 655 init1: 655 opt: 998  Z-score: 838.6  bits: 163.2 E(32554): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 998; 53.3% identity (81.6% similar) in 272 aa overlap (1-271:36-307)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MYIVAVAGNIFLIFLIMTERSLHEPLYLFL
                                     :::.::.::  :: ::  :..::.:.: ::
CCDS31 SSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRPMYYFL
          10        20        30        40        50        60     

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 SMLASANFLLAAAAAPEVLAILWFHSMDISFGSCVSQMFFIHFIFVAESAILLAMAFDRY
       ..:. ..  : .. .:..: :.::.  .:.:..:..::::.:..   ::..:. ::.:::
CCDS31 ALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLMALDRY
          70        80        90       100       110       120     

               100       110       120       130       140         
pF1KE0 VAICYPLRY-TILTSSAVRKIGIAAVVRSFFICCPFIFLVYRLTYCGRNIIPHSYCEHMG
       ::::::::: ::::. .. : :.:. .:. ..  :: .:. :: ::  :.:::.::.::.
CCDS31 VAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTYCDHMS
         130       140       150       160       170       180     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 IARLACGNINVNIIYGLTVALLSTGLDIVLIIISYTMILHAVFQMSSWAARFKALSTCGS
       .:...:::..:: :::: ::::   .::  : .::::::.::...::  :: ::.::: :
CCDS31 VAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAFSTCTS
         190       200       210       220       230       240     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KE0 HICVIFMFYTPAFFSFLAHRFGGKTIPHHIHILVGSLYVLVPPMLNPIIYGVKTKQIKDR
       :.: : . :. :::.:..::: :..::.::::.:..::.:.:: .:::.::::::::.. 
CCDS31 HMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTKQIQEG
         250       260       270       280       290       300     

     270       280     
pF1KE0 VILLFSPISVCC    
       ::              
CCDS31 VIKFLLGDKVSFTYDK
         310       320 




281 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:16:03 2016 done: Sat Nov  5 03:16:04 2016
 Total Scan time:  2.150 Total Display time:  0.020

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com