Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0816, 226 aa
1>>>pF1KE0816 226 - 226 aa - 226 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4495+/-0.00105; mu= 13.0582+/- 0.062
mean_var=154.0864+/-52.307, 0's: 0 Z-trim(105.2): 382 B-trim: 1047 in 2/46
Lambda= 0.103322
statistics sampled from 7793 (8295) to 7793 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 1.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 1062 170.6 1e-42
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 967 156.5 1.9e-38
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 898 146.2 2.4e-35
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 858 140.2 1.5e-33
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 851 139.2 3e-33
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 841 137.7 8.5e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 715 118.9 3.8e-27
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 702 117.0 1.5e-26
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 686 114.6 7.6e-26
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 680 113.7 1.4e-25
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 659 110.5 1.2e-24
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 658 110.4 1.4e-24
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 646 108.6 4.7e-24
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 644 108.3 5.7e-24
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 642 108.0 7e-24
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 641 107.8 7.8e-24
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 639 107.6 9.7e-24
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 638 107.4 1.1e-23
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 637 107.3 1.2e-23
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 634 106.8 1.6e-23
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 634 106.8 1.6e-23
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 633 106.7 1.8e-23
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 632 106.5 2e-23
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 631 106.4 2.2e-23
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 631 106.4 2.2e-23
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 630 106.2 2.5e-23
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 629 106.1 2.7e-23
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 627 105.8 3.3e-23
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 625 105.5 4.1e-23
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 624 105.3 4.5e-23
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 624 105.3 4.6e-23
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 622 105.0 5.7e-23
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 619 104.6 7.8e-23
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 616 104.2 1.1e-22
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 616 104.2 1.1e-22
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 614 103.8 1.3e-22
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 614 103.8 1.3e-22
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 614 103.8 1.3e-22
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 614 103.8 1.3e-22
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 612 103.5 1.6e-22
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 610 103.2 1.9e-22
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 609 103.1 2.2e-22
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 607 102.8 2.6e-22
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 607 102.8 2.6e-22
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 606 102.6 3e-22
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 605 102.5 3.3e-22
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 604 102.3 3.6e-22
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 604 102.3 3.6e-22
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 602 102.0 4.4e-22
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 602 102.0 4.4e-22
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 1094 init1: 1062 opt: 1062 Z-score: 880.3 bits: 170.6 E(32554): 1e-42
Smith-Waterman score: 1062; 68.1% identity (85.4% similar) in 226 aa overlap (1-226:11-236)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVR
:: : ::.:..::::: :::::..::..:..:..:: :: ::: :::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 WDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFFFSLGTT
. :::::: ::.::.:::::::. :.::::::..::::.::::::: ::.::::::::
CCDS32 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCG
::.:: ::::::::::::::.::.::: ..:: :::.::::::::. : ::.: ::::::
CCDS32 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 PNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRTVL
::::::::::.::::::: ::. : .:.. ::: . .: .::: :: :.: .:.
CCDS32 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
190 200 210 220 230 240
CCDS32 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
250 260 270 280 290 300
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
initn: 960 init1: 960 opt: 967 Z-score: 803.7 bits: 156.5 E(32554): 1.9e-38
Smith-Waterman score: 967; 63.9% identity (83.7% similar) in 227 aa overlap (3-226:21-244)
10 20 30 40
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGN
: . ::.::.::: : ..: :::.::..:..:: ::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 MAIICAVRWDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFH
::.:::. :.:::::::.::.::.::::::.. ::::::::..:. ::::::::: ::.
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFF
::::::::::::: :::::::::::.::::::::::..: ::: .::. ::: . . : .
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE0 IFQLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALS--SAP-THIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYT
: ::::::::::::..:: ::.::. ::: :..: ..:.: ..: .. ::::::
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNS---MIIFGPFLSILGSYT
190 200 210 220 230
220
pF1KE0 LVLRTVL
::.:.::
CCDS32 LVIRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYT
240 250 260 270 280 290
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 898 init1: 898 opt: 898 Z-score: 747.9 bits: 146.2 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 898; 59.6% identity (79.4% similar) in 223 aa overlap (4-226:42-264)
10 20 30
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILL
:. :: : :..:::: : . ::..: .. .
CCDS32 NLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTGFILLGFPCPREGQILLFVLFTV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTIS
::..:: :: .:::::.::.:::.:::.:::::::::: ::: :::.::.::.: :: ::
CCDS32 VYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTSTVPSMLANFLSDTKIIS
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FSGCFTQFHFFFSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGF
::::: ::.::::::.:::::: :::.:::::::.::.::.::: .:: :: ::..::
CCDS32 FSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIMTRRLCTNLVVNCWVLGF
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LGHSISIFFIFQLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVY
. : : : :. ::: :::::::: ::..:. .: :: .: : . . ...
CCDS32 IWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIELVFSVLSPLPVFMLFLF
200 210 220 230 240 250
220
pF1KE0 ILGSYTLVLRTVL
:.:::.::.:.::
CCDS32 IVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVLVMYGSPPSKNEAGKQKT
260 270 280 290 300 310
>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 858 init1: 858 opt: 858 Z-score: 715.9 bits: 140.2 E(32554): 1.5e-33
Smith-Waterman score: 858; 57.3% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)
10 20 30 40
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
::... :..:.. :: : :::..::.. .: .:.::: ::
CCDS32 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
: : : :::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS32 AF-VLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
:::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.::. :: :::. ::: : : .:
CCDS32 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
:.:::::::::: .:: : .::. . . : ...::: : ....:.:::::::..
CCDS32 QMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VL
::
CCDS32 VLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 851 init1: 851 opt: 851 Z-score: 710.3 bits: 139.2 E(32554): 3e-33
Smith-Waterman score: 851; 57.3% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)
10 20 30 40
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
::... :..:.. :: : :::..::.. .: .:.::: ::
CCDS76 MCPLTLHVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTIYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
: : :.:::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS76 AF-VLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
:::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.: . :: :::. ::: : : .:
CCDS76 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
: :::::::::: .:: ::.::. . . : ...::: : ....:.:::::::..
CCDS76 QKPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VL
::
CCDS76 VLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 872 init1: 841 opt: 841 Z-score: 702.2 bits: 137.7 E(32554): 8.5e-33
Smith-Waterman score: 841; 56.4% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)
10 20 30 40
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
::... :..:.. :: : :::..::.. .: .:.::: ::
CCDS74 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
: : :.:::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS74 AF-VLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
:::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.: . :: :::. ::: : : .:
CCDS74 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
:.:::::::::: .:: : .::. . . : ...::: : ....:.:::::::..
CCDS74 QMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VL
.:
CCDS74 MLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 715 init1: 715 opt: 715 Z-score: 600.9 bits: 118.9 E(32554): 3.8e-27
Smith-Waterman score: 715; 47.3% identity (75.2% similar) in 226 aa overlap (1-226:1-226)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPMY
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... .:: :. :.. :.:.::.:..:. ::::::::. :..:: :::.:::..: .:::
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:...:. . : : : ..: : :.. :: ::. .. :::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]