Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0828
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0828, 190 aa
1>>>pF1KE0828 190 - 190 aa - 190 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6746+/-0.00107; mu= 10.5359+/- 0.064
mean_var=61.8814+/-12.859, 0's: 0 Z-trim(103.0): 351 B-trim: 430 in 1/45
Lambda= 0.163040
statistics sampled from 6847 (7201) to 6847 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 1.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 911 223.0 1.4e-58
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 902 220.9 6.2e-58
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 890 218.1 4.4e-57
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 832 204.4 5.6e-53
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 830 203.9 7.7e-53
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 789 194.3 6.2e-50
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 784 193.1 1.4e-49
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 774 190.8 7.9e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 741 183.0 1.6e-46
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 706 174.8 4.9e-44
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 676 167.7 6.3e-42
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 661 164.2 7.1e-41
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 661 164.2 8.2e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 656 163.0 1.6e-40
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 646 160.7 8.7e-40
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 635 158.1 5e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 628 156.4 1.5e-38
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 625 155.7 2.6e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 620 154.6 5.8e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 618 154.1 8.3e-38
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 616 153.6 1.1e-37
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 612 152.7 2.1e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 612 152.7 2.2e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 609 152.0 3.5e-37
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 608 151.7 4e-37
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 598 149.4 2.1e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 592 148.0 5.5e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 592 148.0 5.6e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 591 147.7 6.5e-36
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 591 147.7 6.7e-36
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 585 146.3 1.7e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 584 146.1 2e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 581 145.4 3.2e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 581 145.4 3.3e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 581 145.4 3.5e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 579 144.9 4.6e-35
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 577 144.4 6.3e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 575 144.0 8.9e-35
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 574 143.7 1.1e-34
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 571 143.0 1.7e-34
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 571 143.0 1.7e-34
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 571 143.0 1.7e-34
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 569 142.6 2.4e-34
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 567 142.1 3.3e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 567 142.1 3.3e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 567 142.1 3.3e-34
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 566 141.9 3.8e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 565 141.6 4.5e-34
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 565 141.6 4.7e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 565 141.6 4.8e-34
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 704 init1: 704 opt: 911 Z-score: 1165.0 bits: 223.0 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 911; 75.8% identity (92.3% similar) in 182 aa overlap (4-185:124-304)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
:::::::::...:: ::: : :..:.:..
CCDS31 YVGCMTQLFFFLFFVISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.:: ::::::::::::.:: :.::.:::::::::::::::.::.::. ::::::.::. :
CCDS31 AGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCT
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
:.::: ::..:::::.: .::::::::::::.::.::::::.::::.. :: :::.. :.
CCDS31 ILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS31 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
280 290 300 310
>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 695 init1: 695 opt: 902 Z-score: 1153.6 bits: 220.9 E(32554): 6.2e-58
Smith-Waterman score: 902; 75.3% identity (91.2% similar) in 182 aa overlap (4-185:124-304)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
:::::::::...:: ::: : :..:.:..
CCDS31 NVGCMTRLFFFLFFVISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.:: ::::::::::::.:: :.::.:::::::::::::::.::.::. ::: :: ::. :
CCDS31 AGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCT
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
:.::: ::..:::::.: .::::::::::::.::.::::::.::::.. :: :::.. :.
CCDS31 ILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS31 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
280 290 300 310
>>CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 974 init1: 890 opt: 890 Z-score: 1138.3 bits: 218.1 E(32554): 4.4e-57
Smith-Waterman score: 890; 73.2% identity (89.6% similar) in 183 aa overlap (4-186:124-306)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
::::::::: ..::: :: :..: : :.:
CCDS84 YAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAYDRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGF
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.::::::.::. .::: : ..::.:::::::. .:::::.::::::.::::.: :::::
CCDS84 AGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCDILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVT
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
:::::..:::::.::.: :::::::::::::::::::::::::::::.: : .:.. :.
CCDS84 IFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
::.:::.:::::::::::::::::: ::.: :.
CCDS84 SSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVALKKILNKNAFS
280 290 300 310
>>CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 861 init1: 831 opt: 832 Z-score: 1064.6 bits: 204.4 E(32554): 5.6e-53
Smith-Waterman score: 832; 66.8% identity (87.2% similar) in 187 aa overlap (4-190:123-308)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
::::::::: ..:: :: :..:.: :.:
CCDS31 FTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSAMAYDRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGF
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.::::::: .. :::: : ..:..:::::::.:::.:.:.:::::: ::.... .: ::
CCDS31 AGAMAHTGSIMNLTFCADNLVNHFMCDILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVT
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
.::::..::::::: :: :::::::::::::::.:::::::::::::.: : ... :.
CCDS31 VFISYALILSSILHNSSTEGRSKAFSTCSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
::.::: .::.:::::::::::::: :::..:. ::.
CCDS31 SSLFYTIIVPVLNPLIYSLRNKDVKVALRRTLG-RKIFS
280 290 300 310
>>CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 873 init1: 830 opt: 830 Z-score: 1062.1 bits: 203.9 E(32554): 7.7e-53
Smith-Waterman score: 830; 69.2% identity (87.4% similar) in 182 aa overlap (4-185:123-304)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
::::::::: ..::: :: ::::::...:
CCDS31 YVGCMTQLFFFCFFVNSECYVLVSMAYDRYVAICNPLLYMVTMSPRVCFLLMFGSYVVGF
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.::::::: ::::::::.:.::::.::.:::::::::::...::: : :::. .. ...
CCDS31 AGAMAHTGSMLRLTFCDSNVIDHYLCDVLPLLQLSCTSTHVSELVFFIVVGVITMLSSIS
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
: :::..:::.:: : : ::::::::: .::::::.::::::.: ::. : :::.. ..
CCDS31 IVISYALILSNILCIPSAEGRSKAFSTWGSHIIAVALFFGSGTFTYLTTSFPGSMNHGRF
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
.::::::::::::: :::::::: :.:: :.:
CCDS31 ASVFYTNVVPMLNPSIYSLRNKDDKLALGKTLKRVLF
280 290 300
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 845 init1: 788 opt: 789 Z-score: 1010.0 bits: 194.3 E(32554): 6.2e-50
Smith-Waterman score: 789; 61.0% identity (85.0% similar) in 187 aa overlap (4-190:124-310)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
.:::.:::: . .: .: ::..: :....
CCDS73 YPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGL
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
: .:::::.:. :: . :.:::::.::::.:::.: :.:.:... : ..::.::..:
CCDS73 VCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLT
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
:. :: ::..::::: : :::::::::::::..:: .::::.:::::.::: .:::. :.
CCDS73 ILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
:::::: .::::::::::::::::. .:.: :. : :
CCDS73 SSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL
280 290 300 310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 846 init1: 784 opt: 784 Z-score: 1003.7 bits: 193.1 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 784; 59.5% identity (89.7% similar) in 185 aa overlap (4-188:124-308)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
::::.::::. :: ::: :........:
CCDS31 YSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGF
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
.:..::. :..:.:: .. :.:::::.::::.:::..:..:::..: ..:.: .:::..
CCDS31 LSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLA
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 IFISYGFILSSILHISSKEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLNPSSAGSMDKRKL
. .::.::: ::::: :.:::::::.:::::..:: .:::: .:::..: :..:.:..:.
CCDS31 VAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKV
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190
pF1KE0 SSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKFALRKALSSRKL
::::::.:.:::::::::::::::: ::::.: ..
CCDS31 SSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK
280 290 300
>>CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 793 init1: 774 opt: 774 Z-score: 990.1 bits: 190.8 E(32554): 7.9e-49
Smith-Waterman score: 774; 63.2% identity (85.4% similar) in 185 aa overlap (4-188:159-343)
10 20 30
pF1KE0 MIAVAICNPLLYHIAMSPTVCSSLMFGSYLMAF
::::.:::: : .: .: ::.. :....
CCDS66 YPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKACFSLILVVYVIGL
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGAMAHTGCMLRLTFCDANTIDHYFCDILPLLQLSCTSTYINELVVFTVVGINIIVPTVT
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CCDS31 VLVSYTFILSSILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]