Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0830, 253 aa
1>>>pF1KE0830 253 - 253 aa - 253 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4916+/-0.00134; mu= 13.3908+/- 0.078
mean_var=93.4009+/-24.693, 0's: 0 Z-trim(100.6): 351 B-trim: 721 in 2/47
Lambda= 0.132709
statistics sampled from 5793 (6188) to 5793 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1278 255.6 3e-68
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 922 187.4 9.8e-48
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 883 179.9 1.7e-45
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 850 173.6 1.4e-43
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 844 172.5 3e-43
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 832 170.2 1.5e-42
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 826 169.1 3.5e-42
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 825 168.9 4.3e-42
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 821 168.1 6.7e-42
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 815 166.9 1.4e-41
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 813 166.5 1.8e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 813 166.5 1.9e-41
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 807 165.4 4.1e-41
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 802 164.4 8.1e-41
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 799 163.9 1.3e-40
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 784 161.0 8.7e-40
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 779 160.0 1.7e-39
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 777 159.7 2.3e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 776 159.5 2.5e-39
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 775 159.3 2.9e-39
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 771 158.5 4.9e-39
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 768 157.9 7.3e-39
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 764 157.2 1.2e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 762 156.8 1.6e-38
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 754 155.3 4.7e-38
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 735 151.6 5.9e-37
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 735 151.6 5.9e-37
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 733 151.2 7.6e-37
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 732 151.0 8.6e-37
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 731 150.8 9.8e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 723 149.3 2.9e-36
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 722 149.1 3.3e-36
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 718 148.4 5.5e-36
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 716 148.0 7.8e-36
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 705 145.9 3.2e-35
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 705 145.9 3.4e-35
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 702 145.3 4.7e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 700 144.9 6.3e-35
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 696 144.1 1e-34
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 691 143.2 2e-34
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 687 142.4 3.4e-34
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 687 142.4 3.4e-34
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 687 142.4 3.4e-34
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 684 141.9 5.1e-34
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 682 141.5 6.6e-34
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 679 140.9 9.9e-34
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 666 138.4 5.6e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 648 135.0 6.2e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 643 134.1 1.3e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 615 128.7 5e-30
>>CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1333 init1: 1278 opt: 1278 Z-score: 1338.8 bits: 255.6 E(32554): 3e-68
Smith-Waterman score: 1278; 75.0% identity (91.3% similar) in 252 aa overlap (1-252:57-308)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
::::::::.:::::: :::.::::.:::.:
CCDS31 VLFLFCYIAIWMGNLLIMISITCTQLIHQPMYFFLNYLSLSDLCYTSTVTPKLMVDLLAE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
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CCDS31 RKTISYNNCMIQLFTTHFFGGIEIFILTGMAYDRYVAICKPLHYTIIMSRQKCNTIIIVC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
:::::::::::::::::.:::: ::::.::: :::::::: .:. ::.:::.:::::.:
CCDS31 CTGGFIHSASQFLLTIFVPFCGPNEIDHYFCDVYPLLKLACSNIHMIGLLVIANSGLIAL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
..::.:..:: .:: :::.:::: ..:::.:::::.:::::::.:::::::::. :: ::
CCDS31 VTFVVLLLSYVFILYTIRAYSAERRSKALATCSSHVIVVVLFFAPALFIYIRPVTTFSED
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:::.:: .::::::. ::: ::..:::::.::.:: :.:: :
CCDS31 KVFALFYTIIAPMFNPLIYTLRNTEMKNAMRKVWCCQILLKRNQLF
270 280 290 300 310
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 940 init1: 922 opt: 922 Z-score: 970.5 bits: 187.4 E(32554): 9.8e-48
Smith-Waterman score: 922; 52.6% identity (80.2% similar) in 253 aa overlap (1-253:57-309)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
:::::..:.. :.:: :..:::...:::..
CCDS31 VVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMYFFLSFLSFVDICYSSVTAPKMIVDLLAK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
: .:: .::.::: .::.: ::::: .::::.:.:::: ::: : ....:: ....
CCDS31 DKTISYVGCMLQLFGVHFFGCTEIFILTVMAYDRYVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
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CCDS31 WVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCDVHPVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIAL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
.::::..:: .:: ..: :::.. ::::::.::: .::.:: : :.:.:: :: ::
CCDS31 GSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTCGSHIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSED
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:. ..: .::.::.. ::: ::..:.:::..:.: ....: :
CCDS31 KMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKKLWGRNVFLEAKGK
270 280 290 300 310
>>CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 883; 51.2% identity (79.9% similar) in 244 aa overlap (1-244:57-300)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
:::::. :...:.:: ::. ::.. : ..:
CCDS31 VVFFLFHVLTVLGNLLVIITINARKTLKSPMYFFLSQLSFADICYPSTTIPKMIADTFVE
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
.::.:.:.:: ::: .::.: :::.: :::::.:.:::. :::: : ..:. . :
CCDS31 HKIISFNGCMTQLFSAHFFGGTEIFLLTAMAYDRYVAICRPLHYTAIMDCRKCGLLAGAS
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pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
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CCDS31 WLAGFLHSILQTLLTVQLPFCGPNEIDNFFCDVHPLLKLACADTYMVGLIVVANSGMISL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
.: ::..:: .:: ..: :.:.. ::.:::.::.:.:.: ..: .:.::::. :. :
CCDS31 ASFFILIISYVIILLNLRSQSSEDRRKAVSTCGSHVITVLLVLMPPMFMYIRPSTTLAAD
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:...:: .. :... ::: ::. ..:::.::..
CCDS31 KLIILFNIVMPPLLNPLIYTLRNNDVKNAMRKLFRVKRSLGEK
270 280 290 300
>>CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 850; 48.6% identity (77.5% similar) in 253 aa overlap (1-253:57-309)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
::::: ::...: :. ...::.:..: :.:
CCDS31 VIFLIFYMGTVVGNMLIIVTIKSSRTLGSPMYFFLFYLSFADSCFSTSTAPRLIVDALSE
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
.::..::.:: :.: :..: .:::.: :: :.:.:::: :.: : ..: : .:.
CCDS31 KKIITYNECMTQVFALHLFGCMEIFVLILMAVDRYVAICKPLRYPTIMSQQVCIILIVLA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
:..:::..:..:.. ::::: ::.: : . :::::: .: : :..:.. ::: :
CCDS31 WIGSLIHSTAQIILALRLPFCGPYLIDHYCCDLQPLLKLACMDTYMINLLLVSNSGAICS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
.:.::..:: .:: ..: .::... ::::.:.::::::.::: : .::: :: ::: :
CCDS31 SSFMILIISYIVILHSLRNHSAKGKKKALSACTSHIIVVILFFGPCIFIYTRPPTTFPMD
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:. ..: .: .:... ::: ::..:.:::.::.: ... :
CCDS31 KMVAVFYTIGTPFLNPLIYTLRNAEVKNAMRKLWHGKIISENKG
270 280 290 300 310
>>CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 844 init1: 844 opt: 844 Z-score: 889.8 bits: 172.5 E(32554): 3e-43
Smith-Waterman score: 844; 49.8% identity (78.5% similar) in 247 aa overlap (1-247:57-303)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
:::::. :.: .. : ::.:::..::::..
CCDS31 VVFLPVYLATVVGNGLIVLTVSISKSLDSPMYFFLSCLSLVEISYSSTIAPKFIIDLLAK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
: .: ..:. :.:. ::.: ::... .:::: :.:::: ::: : ..: :. .. .
CCDS31 IKTISLEGCLTQIFFFHFFGVAEILLIVVMAYDCYVAICKPLHYMNIISRQLCHLLVAGS
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
::: :: :.:. : ::::: : ::.::: . ::.::: : . : .:..::::.:.
CCDS31 WLGGFCHSIIQILVIIQLPFCGPNVIDHYFCDLQPLFKLACTDTFMEGVIVLANSGLFSV
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
..:.::. :: .:: ..: .:::.. ::::::.::: ::.::: ::.:.:.::. :: ::
CCDS31 FSFLILVSSYIVILVNLRNHSAEGRHKALSTCASHITVVILFFGPAIFLYMRPSSTFTED
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:. ..: ..:.::.. .:: ::..:.: :.:..: ..
CCDS31 KLVAVFYTVITPMLNPIIYTLRNAEVKIAIRRLWSKKENPGRE
270 280 290 300
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 832 init1: 832 opt: 832 Z-score: 877.4 bits: 170.2 E(32554): 1.5e-42
Smith-Waterman score: 832; 49.2% identity (79.1% similar) in 244 aa overlap (1-244:57-300)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLNYLALSDLCYISTVAPKLMIDLLTE
:::::..:.: : : :. ::::..: . :
CCDS31 VVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFFLTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RKIVSYNNCMIQLFITHFLGDIEIFILKAMAYDHYIAICKHLHYTIITTKQSCNTIIIAC
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CCDS31 KKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDCYVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CTGGFIHSASQFLLTIFLPFCGLNEIDQYFCYVYPLLKLARIDIYRIGFLVIVNSGLISL
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CCDS31 WVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLYPLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
: :.::.::: .:: ... : :.. :::::: :::::::::::: .:.:.: . :.: :
CCDS31 LNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCISHIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPID
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 KVFVLFCAIIAPMFSLLIYMLRKVEMKNAVRKMWCHQLLLARK
:. ..: ....::.. ..: ::..:.:.:.::.:
CCDS31 KAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLWRKKVTSDND
270 280 290 300
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10 20 30
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CCDS31 VMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFFLAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCD
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40 50 60 70 80 90
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CCDS31 VIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCISHIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFD
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220 230 240 250
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CCDS31 KLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLWCEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATN
270 280 290 300 310 320
CCDS31 RR
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
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10 20 30
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CCDS31 VFLFVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYV
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CCDS31 TKTISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVA
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CCDS31 WTGGLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICI
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CCDS31 INFSLLLVSYAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLD
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CCDS31 KMAAIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
330 340 350 360 370
>>CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 (329 aa)
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10 20 30
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CCDS31 VVFLLIYVVTVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYE
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CCDS31 GRTISYECCMAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVA
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CCDS31 WLGGFLHSLVQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICL
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CCDS31 LNFLMLAASYIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPID
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CCDS31 KNMALFYGILTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
300 310 320
>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa)
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CCDS73 VMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCD
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CCDS73 KKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVA
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CCDS73 MIGGFVHSAFQ-IVVYSLPFCGPNVIVHFSCDMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICM
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LAFVILMVSYYLILSTIRVYSAESHTKALSTCSSHIIVVVLFFVPALFIYIRPAITFPED
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CCDS73 VIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTD
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CCDS73 KFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]