FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0831, 252 aa
1>>>pF1KE0831 252 - 252 aa - 252 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8803+/-0.00122; mu= 17.2758+/- 0.073
mean_var=107.7302+/-28.520, 0's: 0 Z-trim(103.0): 351 B-trim: 860 in 2/48
Lambda= 0.123568
statistics sampled from 6826 (7222) to 6826 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 733 141.9 5e-34
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 733 141.9 5.1e-34
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CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 731 141.5 6.4e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 731 141.5 6.4e-34
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 730 141.3 7.3e-34
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 730 141.3 7.3e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 730 141.3 7.3e-34
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 730 141.3 7.4e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 729 141.1 8.2e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 728 141.0 9.3e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 728 141.0 9.6e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 727 140.8 1.1e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 725 140.4 1.4e-33
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 724 140.3 1.6e-33
>>CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1244; 73.1% identity (90.9% similar) in 253 aa overlap (1-252:59-311)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
::.:: :::::::: .. :::.:::.:::.
CCDS77 LVFLGIYVVTLMGNISIIVLIRRSHHLHTPMYIFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
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:.:::..: ::::::: :::.::::::.:::::::::::::. :: .:: .::.:::.
CCDS77 ETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMAYDRYVAICSPLLYSTCMSPGVCIILVGMS
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100 110 120 130 140 150
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:::::::: :: .::: :::::::...:::::.::::::.::. ::::.::::::::
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150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
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CCDS77 ATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFSTCTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYST
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEAL-RKATVRIYS
.::...:. ::::::.:::.::::::...: :: :. ..:.:
CCDS77 DQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGALKRELRIKIFS
270 280 290 300 310
>>CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 (322 aa)
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Smith-Waterman score: 1009; 60.6% identity (85.1% similar) in 249 aa overlap (1-249:55-303)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
::.:::::::.:.. .. ::: ::..:: .
CCDS77 ILRVILFMIILSGNLSIIILIRISSQLHHPMYFFLSHLAFADMAYSSSVTPNMLVNFLVE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
... .: :: :...:.: :: :::.:::::.:::::::. ::..: . . :. :
CCDS77 RNTVSYLGCAIQLGSAAFFATVECVLLAAMAYDRFVAICSPLLYSTKMSTQVSVQLLLVV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
:..: . : ..:. . : ::::::..::::::.:::.::::.::. .. :.:::::::
CCDS77 YIAGFLIAVSYTTSFYFLLFCGPNQVNHFFCDFAPLLELSCSDISVSTVVLSFSSGSIIV
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
::: .::. :::::::::::::.::.:::::::::::..:::.:::::::::::. ::::
CCDS77 VTVCVIAVCYIYILITILKMRSTEGHHKAFSTCTSHLTVVTLFYGTITFIYVMPNFSYST
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
.::...:. ::::::.:::.::::::...: ::.. ::
CCDS77 DQNKVVSVLYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKGALKRELVRKILSHDACYFSRTSNNDIT
270 280 290 300 310 320
>>CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 (326 aa)
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Smith-Waterman score: 835; 49.4% identity (78.7% similar) in 249 aa overlap (1-249:71-319)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
:: ::. :.:.:. .::::: ::..:: .
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pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
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CCDS31 NKSISFLGCATQMFLACTFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITAS
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pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
:... ..:. : .:::::: :.: : ::.. ::: .:::. . ... ::: .
CCDS31 YVASILHATIHTVATFSLSFCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEI
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
::.. . ::: .::..::::.:::::.:.:::: .::..::.:.::: :.:: :.:::..
CCDS31 VTILIVLISYGFILLAILKMQSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTS
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
... ..:. ::.:::.:::.::::::.:::::... ::
CCDS31 DNDMIVSIFYTIVIPMLNPIIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
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Smith-Waterman score: 821; 50.6% identity (76.3% similar) in 245 aa overlap (1-245:65-309)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
::.::: :.::: . .. ::: ::.... .
CCDS31 ALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAE
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
. :. .: ::. : .:::::: ::::::.:: .::. . .: ::.::...
CCDS31 NKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATS
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
.:.:: ::. :. . ::::: :.:.::.:: ::::::::. . :. :. :..
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pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
:. . :::. :.:..::: : ::::::::::.:.: :::...::: :.:. : ::::
CCDS31 SCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSM
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
:....:. :::.::.:::.::::.:.:::.::.:
CCDS31 EQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
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>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 810; 47.8% identity (80.0% similar) in 245 aa overlap (1-245:59-303)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
::.:: :::....: .::..: :::.:: .
CCDS31 LVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMYFFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVK
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. : .:: . ..: .:: ..::.::::::::::.::. . .: .:.:::..
CCDS31 KKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLT
90 100 110 120 130 140
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pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
:: : .: . . :..:.:.:. : :.::.::..::: ::::. ::: : ::... .:
CCDS31 YLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCDIAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLV
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160 170 180 190 200 210
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..... .::. :...::..:: :::.::::::.::. :::..:::. :.:..:....:
CCDS31 FSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFSTCASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
. ... :. ::.:::.:::.:::::: ::. ::.:
CCDS31 DTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVALKKFMENPCYSFKSM
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>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 831 init1: 808 opt: 808 Z-score: 796.6 bits: 155.2 E(32554): 4.7e-38
Smith-Waterman score: 808; 50.0% identity (77.8% similar) in 248 aa overlap (1-248:59-306)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
:: ::: :.:::. ..:.:: ::..:: .
CCDS31 LLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGK
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
... . : .:: :.: ..: .::..:::::::::::::. .. .: .: ::: .
CCDS31 KNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAA
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.. : ..: : :: ...:::: . :.:.::: :::.::::: . :.. : .: .
CCDS31 FFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTL
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pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
: ..:.:.:: .:: .::..::.::: :::.::.::: ::....:.:::.: : :: :
CCDS31 VPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
.:... :. ::.:::.:::.::::::.:::.::::. :
CCDS31 DQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK
270 280 290 300
>>CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 (362 aa)
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Smith-Waterman score: 794; 48.6% identity (76.3% similar) in 245 aa overlap (1-245:110-354)
10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
:: .:. :.:.:. ...:.: :..:: .
CCDS32 VVFLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAK
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
.. .: .:. . :.::::.:.:.::::::.:::.::. :: .:: .: :.
CCDS32 RKVISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGS
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
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CCDS32 YSAGFLNSLIHTGCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLL
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
...: :::. :: ::::: ::.:: ::::::.:::.:. :..:: :.:. :.::::
CCDS32 SCTLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSL
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
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CCDS32 TQDRTVAVIYTVVIPVLNPLMYSLRNKDVKKALIKVWGRKTME
320 330 340 350 360
>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 (340 aa)
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Smith-Waterman score: 793; 48.2% identity (75.3% similar) in 251 aa overlap (1-251:89-339)
10 20 30
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:: ::: :.:.: .::::: ::..:: .
CCDS31 LLFFAIYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAK
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
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CCDS31 NKSISFIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITAS
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
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CCDS31 YVAGILHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEI
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
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CCDS31 VTILIVLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYAS
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
... ..:. ::.::: :::.::::::..::.:..: .:
CCDS31 DHDIIVSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
300 310 320 330 340
>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 (327 aa)
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10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
::.:...:.:.:. ..: :: .: . . .
CCDS31 GVFLMLYLITLSGNMTLVILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSE
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
. ...: ::: . . .::.:::.:::::..:::.::. : .: .: ::.
CCDS31 DKRISLAGCGAQLFFSCVVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGS
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
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CCDS31 YIGGFLNAIAHTANTFRLHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVL
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VTVFAIAISYIYILITILKMRSAEGRHKAFSTCTSHLAAVTLYYGTITFIYVMPKSSYST
...:: :::. ::..::...:: :::::::::.::: .: :.::.. :.: :.:.::
CCDS31 SSILAILISYVNILLAILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSL
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250
pF1KE0 SQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
.... .: :::. :.:::.::::::.:.:::.:::: :
CCDS31 ERDKVAALFYTVINPLLNPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
290 300 310 320
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 770 init1: 770 opt: 784 Z-score: 773.3 bits: 151.0 E(32554): 9.4e-37
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10 20 30
pF1KE0 MYLFLSHLAFVDIGLATVVTPIMLMGFLRR
:: ::..:::.:: .: .: :.. .: .
CCDS46 TIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GTALPVTSCEAQLCSVVMFGTSECFLLATMAYDRYVAICSPLVNSTHLSPIICILLVGVC
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CCDS46 KKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASC
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGCVNASTFTSCLLSLSFCGPNQIDHFFCDFSPLLKLSCSNISIPEIIPSISSGSIIV
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CCDS46 WAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELA-LLSTGVFIG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
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: : :..::: :. :::...:.:::.::::::.:::: : :.::. : :: : :.::
CCDS46 WTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYS
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KE0 TSQNRLISLSYTVVIPILNPFIYSLRNRDVKEALRKATVRIYS
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CCDS46 LKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
270 280 290 300 310 320
252 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:24:42 2016 done: Sat Nov 5 03:24:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]