Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0833
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0833, 224 aa
1>>>pF1KE0833 224 - 224 aa - 224 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4262+/-0.00124; mu= 13.7364+/- 0.073
mean_var=144.5613+/-48.512, 0's: 0 Z-trim(103.1): 380 B-trim: 903 in 2/46
Lambda= 0.106671
statistics sampled from 6725 (7237) to 6725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 837 141.0 8.2e-34
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 833 140.4 1.3e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 823 138.8 3.6e-33
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 770 130.7 1e-30
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 770 130.7 1e-30
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 753 128.1 6.4e-30
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 672 115.6 3.6e-26
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 670 115.3 4.5e-26
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 669 115.1 5e-26
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 668 115.0 5.5e-26
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 667 114.9 6.4e-26
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 666 114.7 6.9e-26
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 665 114.5 7.6e-26
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 664 114.4 8.6e-26
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 659 113.6 1.4e-25
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 653 112.7 2.8e-25
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 653 112.7 2.8e-25
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 650 112.2 3.7e-25
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 649 112.1 4.2e-25
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 648 111.9 4.6e-25
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 648 111.9 4.6e-25
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 647 111.8 5.2e-25
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 645 111.5 6.8e-25
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 644 111.3 7.1e-25
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 644 111.3 7.2e-25
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 644 111.4 7.6e-25
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 641 110.8 9.9e-25
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 638 110.4 1.3e-24
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 636 110.1 1.7e-24
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 635 109.9 1.9e-24
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 634 109.8 2.1e-24
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 634 109.8 2.1e-24
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 631 109.3 2.9e-24
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 629 109.0 3.5e-24
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 629 109.0 3.6e-24
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 629 109.0 3.6e-24
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 628 108.8 3.9e-24
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 628 108.8 3.9e-24
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 628 108.8 4e-24
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 627 108.7 4.4e-24
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 624 108.2 6.1e-24
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 622 107.9 7.4e-24
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 622 107.9 7.5e-24
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 622 107.9 7.5e-24
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 621 107.8 8.3e-24
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 618 107.3 1.1e-23
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 617 107.1 1.3e-23
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 617 107.1 1.3e-23
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 616 107.0 1.4e-23
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 616 107.0 1.4e-23
>>CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 579 init1: 579 opt: 837 Z-score: 720.5 bits: 141.0 E(32554): 8.2e-34
Smith-Waterman score: 837; 54.2% identity (81.3% similar) in 225 aa overlap (1-224:1-225)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLHTPMYFF
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CCDS31 MSNATLLTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 LCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYL-SGNSRAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLYTVMAYD
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CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVDYYFCDI
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CCDS31 RYLAISYPLRYTNMMTGRSCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 PVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
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CCDS31 PPILKLACADTSANEMVIFVNIGLVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGRHRAFQTC
190 200 210 220 230 240
CCDS31 ASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRDALHGVVAVFYTTLTPLFNPVVYTLRNKEVKKALLK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 563 init1: 563 opt: 833 Z-score: 717.2 bits: 140.4 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 833; 54.7% identity (80.4% similar) in 225 aa overlap (1-224:1-225)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLHTPMYFF
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CCDS31 MSNASLVTAFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 LCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYL-SGNSRAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLYTVMAYD
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CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVDYYFCDI
:..:: .::::: .:: : .:: :: . : .... : :::.:::: ::....::::
CCDS31 RYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 PVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
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CCDS31 PPILKLACADTSANVMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRRAFQTC
190 200 210 220 230 240
CCDS31 ASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 564 init1: 564 opt: 823 Z-score: 708.9 bits: 138.8 E(32554): 3.6e-33
Smith-Waterman score: 823; 54.7% identity (80.4% similar) in 225 aa overlap (1-224:1-225)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLHTPMYFF
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CCDS31 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 LCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYL-SGNSRAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLYTVMAYD
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CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVDYYFCDI
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CCDS31 RYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLCDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 PVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
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CCDS31 PPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQTC
190 200 210 220 230 240
CCDS31 ASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 771 init1: 640 opt: 770 Z-score: 664.8 bits: 130.7 E(32554): 1e-30
Smith-Waterman score: 770; 48.9% identity (82.8% similar) in 221 aa overlap (5-224:11-231)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLH
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CCDS32 MGKTKNTSLDAVVTDFILLGLSHPPNLRSLLFLVFFIIYILTQLGNLLILLTMWADPKLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 T-PMYFFLCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYLSGNSRAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLY
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CCDS32 ARPMYILLGVLSFLDMWLSSVTVPLLILDFTPSIKAIPFGGCVAQLYFFHFLGSTQCFLY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TVMAYDRFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVD
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CCDS32 TLMAYDRYLAICQPLRYPVLMNGRLCTVLVAGAWVAGSMHGSIQATLTFRLPYCGPNQVD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 YYFCDIPVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
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CCDS32 YFICDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDVGVVAASCFMLILLSYANIVNAILKIRTTDGRR
190 200 210 220 230 240
CCDS32 RAFSTCGSHLIVVTVYYVPCIFIYLRAGSKDPLDGAAAVFYTVVTPLLNPLIYTLRNQEV
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 528 init1: 528 opt: 770 Z-score: 664.8 bits: 130.7 E(32554): 1e-30
Smith-Waterman score: 770; 51.1% identity (78.7% similar) in 225 aa overlap (1-224:1-225)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLHTPMYFF
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CCDS31 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 LCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYLSGNS-RAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLYTVMAYD
: .:: .:..: .:. ::.: : : ::::. .: .::.:.:::: :::::: ::. :
CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMSCD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVDYYFCDI
:..:: .::::: .:. :.: .:: .: . : .... . :::.:::: :: ...:.::
CCDS31 RYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLCDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 PVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
: .::::::::::.: : :..::.. .::.::. :: .:: :::
CCDS31 PPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAFQTC
190 200 210 220 230 240
CCDS31 ASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKALLK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 622 init1: 622 opt: 753 Z-score: 650.6 bits: 128.1 E(32554): 6.4e-30
Smith-Waterman score: 753; 48.0% identity (79.8% similar) in 223 aa overlap (3-224:5-227)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRNFSVVSEFILLGIPHTEGLETILLVLFLSFYIFTLMGNLLILLAIVSSARLHT-PM
: .... ::: :::. :.:...:.:. .::.: .::::::... .. :::. ::
CCDS32 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLCKLSVFDLFFPSVSSPKMLCYLSGNSRAISYAGCASQLFFYHFLGCTECFLYTVMA
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CCDS32 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFVAICHPLRYTIIMSHRACIILAMGTSFFGCIQATFLTTLTFQLPYCVPNEVDYYFC
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CCDS32 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE0 DIPVMLKLACADTSALEMVGFISVGLMPLSCFLLILTSYSGIVFSIL
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CCDS32 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
190 200 210 220 230 240
CCDS32 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
250 260 270 280 290 300
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 710 init1: 535 opt: 672 Z-score: 583.3 bits: 115.6 E(32554): 3.6e-26
Smith-Waterman score: 672; 42.6% identity (78.0% similar) in 223 aa overlap (2-223:4-226)
10 20 30 40 50
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