Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0834
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0834, 269 aa
1>>>pF1KE0834 269 - 269 aa - 269 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5229+/-0.00118; mu= 13.7586+/- 0.070
mean_var=88.1792+/-22.460, 0's: 0 Z-trim(102.4): 351 B-trim: 723 in 2/46
Lambda= 0.136581
statistics sampled from 6526 (6913) to 6526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 981 203.8 1.3e-52
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 977 203.0 2.2e-52
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 967 201.0 8.4e-52
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 962 200.0 1.7e-51
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 962 200.0 1.7e-51
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 954 198.5 5.1e-51
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 944 196.5 2e-50
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 940 195.7 3.4e-50
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 939 195.5 4e-50
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 936 194.9 5.8e-50
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 936 194.9 6e-50
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 931 193.9 1.2e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 931 193.9 1.2e-49
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 929 193.5 1.5e-49
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 928 193.3 1.7e-49
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 928 193.3 1.8e-49
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 927 193.2 2.1e-49
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 926 192.9 2.3e-49
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 923 192.4 3.9e-49
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 920 191.7 5.2e-49
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 919 191.6 6e-49
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 917 191.2 7.8e-49
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 917 191.2 8e-49
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 916 191.0 9e-49
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 916 191.0 1e-48
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 914 190.6 1.2e-48
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 913 190.4 1.4e-48
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 912 190.2 1.6e-48
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 909 189.6 2.3e-48
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 909 189.6 2.4e-48
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 909 189.6 2.5e-48
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 903 188.4 5.3e-48
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 903 188.4 5.5e-48
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 902 188.2 6.1e-48
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 898 187.4 1.1e-47
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 895 186.8 1.6e-47
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 894 186.6 1.8e-47
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 893 186.4 2.1e-47
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 893 186.4 2.1e-47
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 889 185.6 3.6e-47
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 888 185.5 4.3e-47
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 886 185.0 5.3e-47
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 886 185.0 5.4e-47
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 882 184.3 9.3e-47
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 882 184.3 9.4e-47
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 876 183.1 2.1e-46
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 875 182.9 2.4e-46
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 870 181.9 4.7e-46
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 870 181.9 4.7e-46
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 870 181.9 4.9e-46
>>CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1002 init1: 974 opt: 981 Z-score: 1058.3 bits: 203.8 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 981; 54.3% identity (81.9% similar) in 265 aa overlap (1-265:48-312)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
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CCDS31 LGFTDHPELQALLFVTFLGIYLTTLAWNLALIFLIRGDTHLHTPMYFFLSNLSFIDICYS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
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CCDS31 SAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQFFFFVGMGLSECLLLTAMAYDRYAAISSPLLYPT
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
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CCDS31 IMTQGLCTRMVVGAYVGGFLSSLIQASSIFRLHFCGPNIINHFFCDLPPVLALSCSDTFL
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
.... :.:. .:: : : .:::: ::. :.:.: ::.:: :. .::.::: .: . .::
CCDS31 SQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEGRWKACNTCASHLMVVTLLFGT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE0 LFFIYVHPSATFSLDLNKVVSVFYTAVIPMLNPLIYSLRNKEVKDAIHRTVTQRKFCKA
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CCDS31 ALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLRNKEIKDALWKVLERKKVFS
260 270 280 290 300 310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1001 init1: 969 opt: 977 Z-score: 1053.9 bits: 203.0 E(32554): 2.2e-52
Smith-Waterman score: 977; 52.5% identity (84.3% similar) in 261 aa overlap (1-261:46-306)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
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CCDS31 LGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPMYFFLSNLSFLDICYV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
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CCDS31 SSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTV
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
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CCDS31 LISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFCDLPPVLALSCSDTFT
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
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CCDS31 SEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFSTCASHLTAVTLFYGS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE0 LFFIYVHPSATFSLDLNKVVSVFYTAVIPMLNPLIYSLRNKEVKDAIHRTVTQRKFCKA
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CCDS31 GFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKNAMRKAMERDPGISHG
260 270 280 290 300 310
CCDS31 GPFIFMTLG
320
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1005 init1: 958 opt: 967 Z-score: 1043.5 bits: 201.0 E(32554): 8.4e-52
Smith-Waterman score: 967; 53.0% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (1-264:45-308)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
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CCDS41 VGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMYFFLSNLAFVDFCYS
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
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CCDS41 SVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAYDRYVAICNPLLYMV
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pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
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CCDS41 VMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCDDMPLLRLTCSDTRF
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160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
..: .: :: . . : : ...::..:. ::::..::.:: :.::::.::. :: : :::
CCDS41 KQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFSTCGSHMLAVTIFYGT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE0 LFFIYVHPSATFSLDLNKVVSVFYTAVIPMLNPLIYSLRNKEVKDAIHRTVTQRKFCKA
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CCDS41 LIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEALKKIIINKN
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>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1028 init1: 962 opt: 962 Z-score: 1038.1 bits: 200.0 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 962; 54.8% identity (81.1% similar) in 259 aa overlap (1-259:45-303)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
::::::.: .:::::::::::::: : :.:
CCDS31 LGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
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CCDS31 TATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTV
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
::.:.: :..: :..:. ... : : :: : ::: : :: ::::. ::: : .::..
CCDS31 NMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCDIPPLLLLSRSDTQV
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
:.:..: : : . . . ..::: ::....:.:.::.:: :..:::.:::.:: : ::
CCDS31 NELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALSTCTSHLSAVAIFQGT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE0 LFFIYVHPSATFSLDLNKVVSVFYTAVIPMLNPLIYSLRNKEVKDAIHRTVTQRKFCKA
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CCDS31 LLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEALKKLKNKILF
260 270 280 290 300 310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 997 init1: 956 opt: 962 Z-score: 1038.1 bits: 200.0 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 962; 53.4% identity (80.3% similar) in 264 aa overlap (1-264:47-310)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
...::::: .:.::::::::.::::: :.
CCDS79 LGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYF
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
: . ::::..:. . :.::. ::::: .:: :. .. :.: .:::: ::::::::::.:
CCDS79 SDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTV
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
.::. .:..:.: :. : :....::. :: : .: :::: ::::. :::.: :.:: .
CCDS79 VMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
:. . ...: .. . :.:::..::...:.::: .:: ::::::.::::.: : ::
CCDS79 NEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE0 LFFIYVHPSATFSLDLNKVVSVFYTAVIPMLNPLIYSLRNKEVKDAIHRTVTQRKFCKA
:.::: .:: .: . .:..::::: ::.:::::::::::.:::: .... ..
CCDS79 LLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
260 270 280 290 300 310
>>CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 967 init1: 943 opt: 954 Z-score: 1029.4 bits: 198.5 E(32554): 5.1e-51
Smith-Waterman score: 954; 51.9% identity (82.6% similar) in 264 aa overlap (1-264:41-304)
10 20 30
pF1KE0 MIVLIRIDSRLHTPMYFFLSHLSFVDTCFS
.:.::::.:.:: :::::::::.:.: .:
CCDS77 ALTGFILLGLTDDPILRVILFMIILSGNLSIIILIRISSQLHHPMYFFLSHLAFADMAYS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SVVSPKMLTDFFVKRKAISFLGCALQQWFFGFFVAADCFLLESMAYDCYVAICNPLLYSV
: :.:.::..:.:.:...:.::::.: .::....: :: .:::: .::::.:::::.
CCDS77 SSVTPNMLVNFLVERNTVSYLGCAIQLGSAAFFATVECVLLAAMAYDRFVAICSPLLYST
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AMSQRLCIQLVVGPYVIGLMNTMTHTTNAFCLPFCGPNVINPFFCDMSPLLSLVCADTRL
:: .. .::.. :. :.. ....::. . : ::::: .: ::::..::: : :.: .
CCDS77 KMSTQVSVQLLLVVYIAGFLIAVSYTTSFYFLLFCGPNQVNHFFCDFAPLLELSCSDISV
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 NKLAVFIVAGAVGVFSGLTILISYIYILMAILRIRSADGRCKTFSTCSSHLTAVFISYGT
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CCDS77 STVVLSFSSGSIIVVTVCVIAVCYIYILITILKMRSTEGHHKAFSTCTSHLTVVTLFYGT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]