Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0839
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0839, 312 aa
1>>>pF1KE0839 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3260+/-0.00123; mu= 15.9755+/- 0.074
mean_var=77.0004+/-18.000, 0's: 0 Z-trim(101.7): 80 B-trim: 398 in 1/46
Lambda= 0.146160
statistics sampled from 6560 (6636) to 6560 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 2031 438.1 4e-123
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 1029 226.9 1.6e-59
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 929 205.8 3.6e-53
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 792 176.9 1.8e-44
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 746 167.2 1.5e-41
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 715 160.6 1.4e-39
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 688 155.0 7.1e-38
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 686 154.5 9.8e-38
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 680 153.3 2.3e-37
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 656 148.2 7.6e-36
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 652 147.3 1.3e-35
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 650 146.9 1.8e-35
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 612 138.9 4.6e-33
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 584 133.0 2.9e-31
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 563 128.6 6.2e-30
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 536 122.9 3.1e-28
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 526 120.8 1.4e-27
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 483 111.8 7.8e-25
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 478 110.7 1.5e-24
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 478 110.7 1.6e-24
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 455 105.8 4.6e-23
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 406 95.5 5.5e-20
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 401 94.4 1.1e-19
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 400 94.2 1.3e-19
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 2323.9 bits: 438.1 E(32554): 4e-123
Smith-Waterman score: 2031; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
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CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLL
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLRFV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 KCFLRRRKPFVP
::::::::::::
CCDS86 KCFLRRRKPFVP
310
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 1035 init1: 538 opt: 1029 Z-score: 1181.9 bits: 226.9 E(32554): 1.6e-59
Smith-Waterman score: 1029; 48.2% identity (81.0% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . ... ..: .::...:: ::.:: ::::.::.:.: :. ::.:: :::::::::::
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDM---WYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FKQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
.: :::....:: .::.:::::..:: :: ....: ::: ::::::::.::.:::: :
CCDS86 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
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CCDS86 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 RFVKCFLRRRKPFVP
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CCDS86 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 902 init1: 476 opt: 929 Z-score: 1068.1 bits: 205.8 E(32554): 3.6e-53
Smith-Waterman score: 929; 48.6% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (1-304:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
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CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
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CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIIS----VPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
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CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAI-AKHKRNITEMFHVSKIP-
130 140 150 160 170
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pF1KE0 TFKQLTL-NLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
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CCDS86 YFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
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CCDS86 SFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ML--RFVKCFLRRRKPFVP
:: : . :..
CCDS86 MLTCRKIACMI
300
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 782 init1: 429 opt: 792 Z-score: 911.8 bits: 176.9 E(32554): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 792; 38.9% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . :....:: . ..:.:: : :: ::: .:.: . .:: :.:. .::. :: :::
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
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CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK-NDDMWYHLFK-VSHEENITWKFKVSKIPGTF
::: ....::. .:::..:.: .. :. : .:. . .:.: .:. .. .
CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 KQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL
.. .: . :.:. : :. ::.::: :::.:. ..:. :::.:::: :::. .. :.
CCDS58 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR
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CCDS58 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 FVKCFLRRRKPFVP
: . ::
CCDS58 ---CESGHLKPGSKGPIFS
310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 753 init1: 363 opt: 746 Z-score: 859.6 bits: 167.2 E(32554): 1.5e-41
Smith-Waterman score: 746; 40.3% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: ..:.:.:.....: ..:. ::::: :::::: : . .: : .:: .:::::: :.
CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
.: :::.... :. :... :. .. :...:.::.::.. :::::.:::::.:. .:.
CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE0 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
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CCDS86 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILND-----YKTKNDT--VWDLNMYKSEYF
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pF1KE0 FKQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
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CCDS86 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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pF1KE0 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
..:.:.:. . . : . ..::.::.: .:.:.: .::::::.:::::..: :..:
CCDS86 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
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300 310
pF1KE0 RFVKCFLRRRKPFVP
. .:: .:.
CCDS86 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 681 init1: 541 opt: 715 Z-score: 824.3 bits: 160.6 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 715; 40.5% identity (70.9% similar) in 299 aa overlap (1-294:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: ::. .:. ..: .:. :: .::::::.:::::...:..: .: .:: :::::: :.
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: .. :. : . . . ... . :. : .:. .::... .:::::::::..: : :.
CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGS--FLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTF
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CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRY----ERNTTWNFSMSDFE-TF
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pF1KE0 K---QLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
. ..:... ...:: . .:::.::.::: .: ....:. : ::: :..: :.: ::
CCDS86 SVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVI
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pF1KE0 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
:::. .. :. : : :. .. :. . . :. ::::::.::.::.:::.:::
CCDS86 SFLLFYASFFLCVLISWISELY-QNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 MLRFVKCFLRRRKPFVP
CCDS86 VAAKVWAKR
300
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 685 init1: 351 opt: 688 Z-score: 793.4 bits: 155.0 E(32554): 7.1e-38
Smith-Waterman score: 688; 38.9% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . . :. :::. ..:: ..::::.::: :.:.::. ::. : :: .::.::. ::
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
:. :. . : :. . : .. :: :. :. : :... :::::::::::.:. .:.
CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNV-WAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGS--FLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTF
:: ....:.:.:::: ::. .. . :. .: . . : :.:::.:. .
CCDS53 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEY----EGNMTWKIKLRSAMYLS
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pF1KE0 KQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL
. . :. .::: : ::::.::. :: .: :...::. : .::: ..:..:...: ::
CCDS53 NTTVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL
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pF1KE0 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR
:: .:. ... . : ..: :.:. . .. .::.: :::: ::.::...::..:
CCDS53 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 FVKCFLRRRKPFVP
:. ... .::
CCDS53 HVRYWVKGEKPSSS
300
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: :. ... :
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>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS86 QVTCWAKGQNQSTP
300
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNV-WAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
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CCDS53 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVI----NMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLS
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CCDS53 DATVTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFL
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CCDS53 QVRYWVKGEKPSSP
300
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]