Result of FASTA (omim) for
pF1KE0839
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0839, 312 aa
1>>>pF1KE0839 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9925+/-0.000506; mu= 17.5696+/- 0.031
mean_var=68.4779+/-15.002, 0's: 0 Z-trim(107.7): 96 B-trim: 946 in 1/48
Lambda= 0.154988
statistics sampled from 15629 (15725) to 15629 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 5.220
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 2031 463.6 2.2e-130
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 1029 239.6 6.3e-63
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 929 217.2 3.3e-56
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 792 186.6 5.7e-47
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 746 176.3 6.9e-44
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 715 169.4 8.3e-42
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 688 163.3 5.6e-40
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 686 162.9 7.8e-40
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 680 161.5 1.9e-39
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 656 156.2 7.9e-38
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 652 155.3 1.4e-37
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 650 154.8 2e-37
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 623 148.8 1.3e-35
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 623 148.8 1.3e-35
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 623 148.8 1.3e-35
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 612 146.3 7.1e-35
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 584 140.1 5.6e-33
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 563 135.4 1.5e-31
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 536 129.3 9.4e-30
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 526 127.1 4.6e-29
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 478 116.4 7.4e-26
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 478 116.4 7.8e-26
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 460 112.4 1.3e-24
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 406 100.3 5.2e-21
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 401 99.1 1.1e-20
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 400 98.9 1.3e-20
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 200 54.3 4.4e-07
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 200 54.3 4.4e-07
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 200 54.3 4.7e-07
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 200 54.3 4.7e-07
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 200 54.3 4.7e-07
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 157 44.7 0.00035
NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 141 41.1 0.0041
>>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 2461.6 bits: 463.6 E(85289): 2.2e-130
Smith-Waterman score: 2031; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLL
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFLLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLRFV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 KCFLRRRKPFVP
::::::::::::
NP_076 KCFLRRRKPFVP
310
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
initn: 1035 init1: 538 opt: 1029 Z-score: 1250.7 bits: 239.6 E(85289): 6.3e-63
Smith-Waterman score: 1029; 48.2% identity (81.0% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . ... ..: .::...:: ::.:: ::::.::.:.: :. ::.:: :::::::::::
NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
:: :: :...:.: .:... . :.. ::..:. :.::..::::.:..::.:. ::.:.
NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDM---WYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
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NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FKQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
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NP_076 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
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NP_076 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 RFVKCFLRRRKPFVP
: .:. ::
NP_076 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 902 init1: 476 opt: 929 Z-score: 1130.0 bits: 217.2 E(85289): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 929; 48.6% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (1-304:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
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NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
:. ..:. ..: : .: .. .. . ::::: ..:.:.::..::.::::. :::.:.
NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIIS----VPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
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NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAI-AKHKRNITEMFHVSKIP-
130 140 150 160 170
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pF1KE0 TFKQLTL-NLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
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NP_076 YFEPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
:......:: ..:: : :. . ::.. .:.:.....: .::.:::. :.:::..:..
NP_076 SFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ML--RFVKCFLRRRKPFVP
:: : . :..
NP_076 MLTCRKIACMI
300
>>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa)
initn: 782 init1: 429 opt: 792 Z-score: 964.3 bits: 186.6 E(85289): 5.7e-47
Smith-Waterman score: 792; 38.9% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . :....:: . ..:.:: : :: ::: .:.: . .:: :.:. .::. :: :::
NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
.: :.:.. . :.:. ......:..: :::.:. :.:...::...: ::::..::: :.
NP_058 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPK-NDDMWYHLFK-VSHEENITWKFKVSKIPGTF
::: ....::. .:::..:.: .. :. : .:. . .:.: .:. .. .
NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIFL
.. .: . :.:. : :. ::.::: :::.:. ..:. :::.:::: :::. .. :.
NP_058 IHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILSFF
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pF1KE0 LLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKMLR
.:...:. .::. . . ..:. :.. :::...:...:..::::::.:::::...:. :::
NP_058 FLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVMLR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 FVKCFLRRRKPFVP
: . ::
NP_058 ---CESGHLKPGSKGPIFS
310
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
initn: 753 init1: 363 opt: 746 Z-score: 908.9 bits: 176.3 E(85289): 6.9e-44
Smith-Waterman score: 746; 40.3% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
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NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
.: :::.... :. :... :. .. :...:.::.::.. :::::.:::::.:. .:.
NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
::: . : : :...:: : :... . .: .:.... .: ... :
NP_076 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILND-----YKTKNDT--VWDLNMYKSEYF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 FKQLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
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NP_076 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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pF1KE0 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
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NP_076 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RFVKCFLRRRKPFVP
. .:: .:.
NP_076 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa)
initn: 681 init1: 541 opt: 715 Z-score: 871.5 bits: 169.4 E(85289): 8.3e-42
Smith-Waterman score: 715; 40.5% identity (70.9% similar) in 299 aa overlap (1-294:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: ::. .:. ..: .:. :: .::::::.:::::...:..: .: .:: :::::: :.
NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
: .. :. : . . . ... . :. : .:. .::... .:::::::::..: : :.
NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGS--FLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTF
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NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRY----ERNTTWNFSMSDFE-TF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 K---QLTLNLGAMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVI
. ..:... ...:: . .:::.::.::: .: ....:. : ::: :..: :.: ::
NP_076 SVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLK
:::. .. :. : : :. .. :. . . :. ::::::.::.::.:::.:::
NP_076 SFLLFYASFFLCVLISWISELY-QNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 MLRFVKCFLRRRKPFVP
NP_076 VAAKVWAKR
300
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 685 init1: 351 opt: 688 Z-score: 838.8 bits: 163.3 E(85289): 5.6e-40
Smith-Waterman score: 688; 38.9% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
: . . :. :::. ..:: ..::::.::: :.:.::. ::. : :: .::.::. ::
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
:. :. . : :. . : .. :: :. :. : :... :::::::::::.:. .:.
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNV-WAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLKLKINKVMLAILLGS--FLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]