Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0840
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0840, 345 aa
1>>>pF1KE0840 345 - 345 aa - 345 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2863+/-0.00124; mu= 16.6076+/- 0.073
mean_var=179.5253+/-76.222, 0's: 0 Z-trim(103.3): 332 B-trim: 963 in 2/47
Lambda= 0.095722
statistics sampled from 6769 (7366) to 6769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 2317 333.3 1.9e-91
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 1880 272.9 2.7e-73
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 1690 246.7 2.2e-65
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 1025 154.8 9.4e-38
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 941 143.2 2.9e-34
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 894 136.7 2.7e-32
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 861 132.1 5.9e-31
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 468 77.9 1.4e-14
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 468 78.1 1.5e-14
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 468 78.1 1.6e-14
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 468 78.1 1.6e-14
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 468 78.1 1.6e-14
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 429 72.6 5.8e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 429 72.6 6.1e-13
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 427 72.4 7.6e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 418 71.0 1.7e-12
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 418 71.1 1.7e-12
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 418 71.1 1.7e-12
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 418 71.1 1.7e-12
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 418 71.1 1.8e-12
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 418 71.2 1.8e-12
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 414 70.6 2.6e-12
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 403 69.1 8e-12
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 400 68.6 9.8e-12
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 397 68.3 1.4e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 395 67.9 1.5e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 390 67.3 2.8e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 387 67.0 3.8e-11
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 385 66.6 4.3e-11
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 386 66.9 4.3e-11
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 380 65.9 6.9e-11
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 378 65.7 8.6e-11
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 2317 init1: 2317 opt: 2317 Z-score: 1755.4 bits: 333.3 E(32554): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2317; 100.0% identity (100.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
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CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
310 320 330 340
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 1890 init1: 1870 opt: 1880 Z-score: 1429.3 bits: 272.9 E(32554): 2.7e-73
Smith-Waterman score: 1880; 79.6% identity (92.7% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
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CCDS51 MTSNFSQPV-VQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
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CCDS51 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
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CCDS51 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
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CCDS51 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
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CCDS51 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
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CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
300 310 320 330 340
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 1730 init1: 1682 opt: 1690 Z-score: 1287.4 bits: 246.7 E(32554): 2.2e-65
Smith-Waterman score: 1690; 69.0% identity (89.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
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CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
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CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
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CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
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CCDS75 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
:::::: :::.::::::::::....::..::::: .:..:::.:.:::: .::: ::.
CCDS75 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
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CCDS75 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
310 320 330 340
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 1037 init1: 699 opt: 1025 Z-score: 791.2 bits: 154.8 E(32554): 9.4e-38
Smith-Waterman score: 1025; 43.8% identity (74.9% similar) in 331 aa overlap (13-343:16-337)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISI
.:: .::::: . . : ....:.. . : .. :.::..: ...
CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCY-QVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCY
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CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL
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CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSK
. . . :.:.:: ..:. : .: ::.: .::: :: .::.:: :::..: .: ::
CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICC
. ... :..:::::::::..: ... :::..::...:... :::: ...:
CCDS51 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 WCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
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CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
300 310 320 330
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 932 init1: 506 opt: 941 Z-score: 728.5 bits: 143.2 E(32554): 2.9e-34
Smith-Waterman score: 941; 41.1% identity (72.1% similar) in 333 aa overlap (13-343:4-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
.:. .: :::: .: :. :: .. . . .. :::.:..:: ::
CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
::::.:::.:. :.: .:::.: :::.::::..: :::::. :: .:: :. . .:.
CCDS51 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
::: ::::::: :: ::: : .:... : . : .:: .: ... .... . : ::.
CCDS51 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 S-DALNCIGGCQTVVNQ-NWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKT
..: :::.. .. . ::: . ::.:: ::. .: :.:.:..::. : ....:
CCDS51 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCW
. . : .. .::::.::::... .:.: : :. : ...: :. .: : . .. :
CCDS51 QIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 CAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
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CCDS51 FGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
300 310 320 330
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 867 init1: 500 opt: 894 Z-score: 693.3 bits: 136.7 E(32554): 2.7e-32
Smith-Waterman score: 894; 39.6% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (14-333:25-337)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFG
: : :: . : : :: .: .. . ...::
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 NLLVMISILHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHT
:: ..::: .:::::.:::::. :.: .:::.: :.::.::.:.::.::::: .:: ..
CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CCDVAFCYSSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFY
:. . .:.:::: ..:::. :. ::.: ::.:. : . . : .: .. .: .
CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TGVYDDGLEELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLS-FFIPTFIMIILYGNIFLVARRQA
. .: ::.: . . : ..: .. :. : : :.. :: : .:. .::.:: :.:..:
CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KKIENTGSKTESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFIT
. :.: :. . .: ....:::::::... .:.. :.: . :.: :..: :
CCDS34 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 PACIYEICCWCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
:. ... : .:.::. :::::..::::::.:.: :. :.....
CCDS34 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 833 init1: 466 opt: 861 Z-score: 669.2 bits: 132.1 E(32554): 5.9e-31
Smith-Waterman score: 861; 40.4% identity (72.4% similar) in 297 aa overlap (39-333:4-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAV-LAVFGNLLVMISILHFKQLHSPT
: :.. ...:::: ..::: .:::::.::
CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLHTPT
10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]