Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0841
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0841, 342 aa
1>>>pF1KE0841 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2696+/-0.00113; mu= 16.5343+/- 0.067
mean_var=159.3864+/-69.064, 0's: 0 Z-trim(103.6): 264 B-trim: 991 in 2/46
Lambda= 0.101589
statistics sampled from 6989 (7507) to 6989 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 2255 343.4 1.7e-94
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 1880 288.4 5.9e-78
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 1625 251.0 1e-66
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 1019 162.2 5.6e-40
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 920 147.7 1.3e-35
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 851 137.6 1.5e-32
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 800 130.0 2.5e-30
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 405 72.2 7.1e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 405 72.3 7.3e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 405 72.3 7.4e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 405 72.3 7.4e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 405 72.3 7.7e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 405 72.4 7.8e-13
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 403 71.9 8.5e-13
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 403 72.1 9.6e-13
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 403 72.1 9.9e-13
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 403 72.1 1e-12
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 403 72.1 1e-12
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 383 69.0 6.7e-12
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 383 69.1 7e-12
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 377 68.3 1.3e-11
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 375 67.9 1.6e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 375 68.0 1.7e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 374 67.9 1.9e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 370 67.1 2.6e-11
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 369 67.1 3e-11
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 369 67.1 3e-11
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 367 66.8 3.8e-11
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 362 66.0 5.7e-11
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 359 65.7 9e-11
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 2255 init1: 2255 opt: 2255 Z-score: 1810.1 bits: 343.4 E(32554): 1.7e-94
Smith-Waterman score: 2255; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
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CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVESS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE0 YNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
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CCDS51 YNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
310 320 330 340
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 1890 init1: 1870 opt: 1880 Z-score: 1513.1 bits: 288.4 E(32554): 5.9e-78
Smith-Waterman score: 1880; 79.6% identity (92.7% similar) in 343 aa overlap (1-342:1-343)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSNFSQPV-VQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
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CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
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CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
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CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
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CCDS51 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
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CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
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CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
310 320 330 340
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 1657 init1: 1596 opt: 1625 Z-score: 1311.1 bits: 251.0 E(32554): 1e-66
Smith-Waterman score: 1625; 67.6% identity (89.8% similar) in 343 aa overlap (1-342:1-343)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSNFSQP-VVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
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CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
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CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
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CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
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CCDS75 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
:::::: ::::::::::::::... ::..::::: :: .:::.:.:.:: :.::: : .
CCDS75 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
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CCDS75 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
310 320 330 340
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 1063 init1: 690 opt: 1019 Z-score: 831.2 bits: 162.2 E(32554): 5.6e-40
Smith-Waterman score: 1019; 44.1% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (12-342:16-337)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSV
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CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCY
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CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 SSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGL
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CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSK
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CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICC
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CCDS51 LAGA--------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 WSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
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CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
300 310 320 330
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 887 init1: 481 opt: 920 Z-score: 752.7 bits: 147.7 E(32554): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 920; 39.3% identity (71.4% similar) in 336 aa overlap (9-342:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
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CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
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CCDS51 QLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
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CCDS51 HLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 -SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVE
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CCDS51 YKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKLQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWS
. : . ..::::.::::... .:.: : :. . ..: :. .. : . .. :
CCDS51 IGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 AYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
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CCDS51 GYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
300 310 320 330
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 846 init1: 516 opt: 851 Z-score: 697.9 bits: 137.6 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 851; 38.5% identity (68.6% similar) in 322 aa overlap (13-332:25-337)
10 20 30 40
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSL-LAVF
: : : :: :. : : :: .:. : ::. ...:
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYS-FMAGSIFITIF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 GNLLVMTSVLHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLH
::: .. :. .:::::.:::::: :.: .:::.: :.: .::.:.::.::::: :: ..
CCDS34 GNLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 SCCDVAFCYSSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVF
:. . .:..::: . :::. .. ::.:.::.:. : . . : .: ... .:
CCDS34 YSFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 YTGVNDDGLEELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQ
.. . ::.: . : ..: .. .. : :. :: : .:. .:.::: .....
CCDS34 FSEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AIKIETTSSKVESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFL
: ... :. . .: :...:::::::... .:.. :.: ::.: :..:
CCDS34 A-------HAINNLRENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TPAYIYEICCWSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
::. ... : .:.::. :::::..::::::.:.: :: : ....
CCDS34 TPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 801 init1: 471 opt: 800 Z-score: 658.1 bits: 130.0 E(32554): 2.5e-30
Smith-Waterman score: 800; 37.9% identity (69.8% similar) in 298 aa overlap (37-332:3-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 QPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSL-LAVFGNLLVMTSVLHFKQLHSP
.: ::. ...:::: .. :. .:::::.:
CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLHTP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVLHLCFI
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CCDS51 TNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLCSV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]