FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0850, 317 aa
1>>>pF1KE0850 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7193+/-0.00114; mu= 13.3314+/- 0.067
mean_var=148.1775+/-50.287, 0's: 0 Z-trim(102.0): 378 B-trim: 386 in 1/48
Lambda= 0.105362
statistics sampled from 6288 (6747) to 6288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 834 139.5 3.4e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 833 139.3 3.7e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 827 138.4 7.1e-33
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CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 792 133.1 2.8e-31
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 792 133.1 2.9e-31
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CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 790 132.8 3.6e-31
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 788 132.5 4.3e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 787 132.3 4.8e-31
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 787 132.3 4.8e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 787 132.3 4.8e-31
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 787 132.3 5e-31
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 785 132.0 5.9e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 784 131.9 6.7e-31
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 784 131.9 7e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 783 131.7 7.3e-31
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 783 131.7 7.4e-31
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 783 131.7 7.5e-31
>>CCDS31787.1 OR10AD1 gene_id:121275|Hs108|chr12 (317 aa)
initn: 2106 init1: 2106 opt: 2106 Z-score: 1754.3 bits: 332.8 E(32554): 2.1e-91
Smith-Waterman score: 2106; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNGLIIFITSWTDPKLNSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNGLIIFITSWTDPKLNSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 YFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFCVGVAECILLAFMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFCVGVAECILLAFMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGLINGIFLEYISFREPFRRDNHIESFFC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EAPIVIGLSCGDPQFSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRGKTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EAPIVIGLSCGDPQFSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRGKTFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNKEIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNKEIKE
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310
pF1KE0 AMVRALGRTRLAQPQSV
:::::::::::::::::
CCDS31 AMVRALGRTRLAQPQSV
310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
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Smith-Waterman score: 922; 43.8% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (3-316:4-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNGLIIFITSWTDPKLNSP
.: . .::::..::.. . . :::..:. : :.. : ::: .:. :::.:..:
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNE-LQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILII-LTTVTDPHLHTP
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pF1KE0 MYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMY-FVFCVGVAECILLAF
::.:::.:...:.:. :...:::..::. . . .:.: :..:.. ::: :: .::.:::
CCDS46 MYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVG-SECLLLAA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 MAYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGLINGIFLEYISFREPFRRDNHIESF
::::::.::: :: : :.:. .: .:... : :..:.. ..: :: .:.:. :
CCDS46 MAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYF
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pF1KE0 FCEAPIVIGLSCGDPQFSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRGKT
::. : .. ::::. . . :... .. . .:.. : ::. :..::: :: :: :.
CCDS46 FCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNKEI
::::::::..:...: ::.:.:. : ::.. ::. :.::...::: :::::..:::.:
CCDS46 FSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KEAMVRALGRTRLAQPQSV
::: :...: .. : :
CCDS46 KEA-VKTIG-SKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 885; 46.0% identity (73.3% similar) in 315 aa overlap (1-313:2-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNGLIIFITSWTDPKLNSP
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CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTI-ADSALQSP
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pF1KE0 MYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFCVGVAECILLAFM
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CCDS77 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATM
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pF1KE0 AYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGL-INGIFLEYISFREPFRRDNHIESF
::::::::: ::.: :... :..:....:: :. . . .: : :: :... :
CCDS77 AYDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWI-FSFPFCGPNRVNHF
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pF1KE0 FCEAPIVIGLSCGDPQ-FSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRGK
::..: ::.: :.: . : : :. : ... :: :..: . :::.::.::. :. :. .
CCDS77 FCDSPPVIALVCADTSVFELEALTA-TVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQ
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pF1KE0 TFSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNKE
.::::..:: :: ..:..:...:. :.:. . .. : .:: :..::: :::::: ::::
CCDS77 AFSTCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKE
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300 310
pF1KE0 IKEAMVRALGRTRLAQPQSV
.: :. : . :: .:
CCDS77 VKAALKRLIHRTLGSQKL
300 310
>>CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 (330 aa)
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Smith-Waterman score: 877; 42.9% identity (72.1% similar) in 312 aa overlap (4-315:21-330)
10 20 30 40
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNG
: ..:..::..:..:. .:. ::: ::: .: ::. :
CCDS31 MCSFFLCQTGKQAKISMGEENQTFVSKFIFLGLSQD-LQTQILLFILFLIIYLLTVLGNQ
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pF1KE0 LIIFITSWTDPKLNSPMYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMY
::: : . : .:..:::::: .::. :.:: :. .::.:.:..:. . .:: ::::.
CCDS31 LII-ILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQII
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pF1KE0 FVFCVGVAECILLAFMAYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGLINGIFLEYI
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CCDS31 VFLLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSWASGALVSLVDTSF
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170 180 190 200 210 220
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.:. :. .: :. .::: : .. :. : . :::. ..:..:.:. : . :: .:.
CCDS31 TFHLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNII
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ATILSKASSSGRGKTFSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIIT
.:... :. :: :.::::.::: ::...: :..:.:: :.: . :: .:..:: .:
CCDS31 STVIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVT
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 PMCNPIIYSFRNKEIKEAMVRALGRTRLAQPQSV
:: ::::::.:::..: :. . .:: ... :
CCDS31 PMLNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
300 310 320 330
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 44.8% identity (76.3% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMN-GLIIFITSWTDPKLN
::..:::.:::.:... . . .:: :::.:: ::.: : .:: .: : .:.
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHP-QMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIK--MDSHLH
10 20 30 40 50
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pF1KE0 SPMYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFC-VGVAECILL
::::::..::.::.:....: :.:: ...... .::: : :: ::::: .:..::.::
CCDS31 MPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQ-YFVFCGMGLTECFLL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 AFMAYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGLINGIFLEYISFREPFRRDNHIE
: ::::::.::: :: :. .::. .:...: :. :...... : ... : :.
CCDS31 AAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMIN
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 SFFCEAPIVIGLSCGDPQFSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRG
:::. : :..:::.: : . : ..:: . ..... :: .:.:.... .:..::
CCDS31 HFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRT
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 KTFSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNK
:.:::::::::.: ..: :..: :: : :... ..:: :..:... :. ::::::::::
CCDS31 KAFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 EIKEAMVRALGRTRLAQPQSV
:::.:: .:. :
CCDS31 EIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
300 310 320
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
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Smith-Waterman score: 866; 44.8% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (4-308:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLRNGSIVTEFILVGFQQSSTSTRALLFALFLALYSLTMAMNGLIIFITSWTDPKLNSP
: . ..::::..:.. : ..::: ::..: .:. :.:::..: .:: :.::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVT-LADPMLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFCVGVAECILLAFM
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CCDS77 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAWFFGLINGIFLEYISFREPFRRDNHIESFF
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CCDS77 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CEAPIVIGLSCGDPQ-FSLWAIFADAIVVILSPMVLTVTSYVHILATILSKASSSGRGKT
:..: :. : :.: : ..:: . .:.:.. : .: . ::..: :.::. :..:. :.
CCDS77 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVG-TILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSLLYTIITPMCNPIIYSFRNKEI
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CCDS77 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KEAMVRALGRTRLAQPQSV
:.:. :.. .
CCDS77 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
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10 20 30
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CCDS31 LPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETS--GLIFAIISIIFFT
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 TMAMNGLIIFITSWTDPKLNSPMYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVC
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CCDS31 ALMANGVMIFLIQ-TDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFVG
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100 110 120 130 140 150
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CCDS31 CTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWFGGSLDG
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160 170 180 190 200 210
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..: :.. :: . .:. :::::: :. :.:.: . .... ....: :. ....
CCDS31 FLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLA
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SYVHILATILSKASSSGRGKTFSTCASHLTVVIFLYTSAMFSYMNPHSTHGPDKDKPFSL
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CCDS31 SYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLSV
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280 290 300 310
pF1KE0 LYTIITPMCNPIIYSFRNKEIKEAMVRALGRTRLAQPQSV
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CCDS31 FYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFK--GPQRVSGGVF
330 340 350 360
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10 20 30 40 50
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pF1KE0 PMYFFLGHLSLLDVCFITTTIPQMLIHLVVRDHIVSFVCCMTQMYFVFCVGVAECILLAF
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CCDS53 PMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAV
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pF1KE0 MAYDRYVAICYPLNYVPIISQKVCVRLVGTAW---FFG-LINGIFLEYISFREPFRRDNH
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CCDS53 MAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGP----NI
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:. :::. ...:.:.: . . . : :.:.:: :.. .:.::. :.:.:: .: :
CCDS53 INHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRG
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CCDS53 RHKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 NKEIKEAMVRA-LGRTRLAQPQSV
:::.:::. .. .::
CCDS53 NKEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLI-LLIHI----DSSL
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CCDS31 HTPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLL
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CCDS31 AAMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQ
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CCDS31 HFFCEVPAVLKLSCSDT--SLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEG
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CCDS31 RKKAFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFR
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CCDS31 NKDVTRALKKMLSVQKPPY
300 310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
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CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVT-LADPMLHSPM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]