Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0858
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0858, 315 aa
1>>>pF1KE0858 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8081+/-0.00104; mu= 13.1828+/- 0.061
mean_var=144.7483+/-46.791, 0's: 0 Z-trim(105.2): 403 B-trim: 937 in 2/48
Lambda= 0.106603
statistics sampled from 7763 (8298) to 7763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 2104 335.8 2.6e-92
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1952 312.5 2.9e-85
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1828 293.4 1.6e-79
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 1484 240.5 1.3e-63
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 1458 236.5 2.1e-62
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1024 169.7 2.6e-42
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1008 167.3 1.4e-41
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1001 166.2 3e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 994 165.1 6.4e-41
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 950 158.4 7.2e-39
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 948 158.0 8.7e-39
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 940 156.8 2e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 940 156.8 2e-38
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 933 155.7 4.2e-38
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 933 155.7 4.2e-38
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 932 155.6 4.8e-38
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 916 153.1 2.7e-37
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 908 151.9 6.2e-37
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 902 151.0 1.2e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 901 150.8 1.3e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 891 149.3 3.7e-36
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 891 149.3 3.8e-36
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 887 148.6 5.7e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 882 147.9 1e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 881 147.7 1.1e-35
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 881 147.7 1.1e-35
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 879 147.4 1.3e-35
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 876 147.0 1.8e-35
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 875 146.8 2e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 875 146.8 2e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 873 146.5 2.6e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 873 146.5 2.6e-35
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 870 146.1 3.6e-35
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 866 145.4 5.4e-35
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 866 145.4 5.4e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 866 145.5 5.7e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 861 144.7 9.2e-35
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 861 144.7 9.3e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 860 144.5 1e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 857 144.0 1.4e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 855 143.7 1.7e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 854 143.6 1.9e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 853 143.4 2.2e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 852 143.3 2.4e-34
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 851 143.1 2.6e-34
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 850 143.0 3e-34
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 849 142.8 3.3e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 847 142.5 4.1e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 846 142.3 4.5e-34
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 845 142.2 5e-34
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 2104 init1: 2104 opt: 2104 Z-score: 1770.7 bits: 335.8 E(32554): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 2104; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 AMKKTCFTKLFPQNC
:::::::::::::::
CCDS32 AMKKTCFTKLFPQNC
310
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 2001 init1: 1952 opt: 1952 Z-score: 1644.3 bits: 312.5 E(32554): 2.9e-85
Smith-Waterman score: 1952; 93.6% identity (97.4% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
:: ::..:..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS12 MQRANHSTVTQFILVGFSVFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
::::::::::::::::: :::.: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFACH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 AMKKTCFTKLFPQNC
::::: :.::.:.
CCDS12 AMKKTFFSKLYPEKNVMM
310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1872 init1: 1823 opt: 1828 Z-score: 1541.3 bits: 293.4 E(32554): 1.6e-79
Smith-Waterman score: 1828; 88.4% identity (95.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
::::.::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFCH
::::::::::::::::: :::.: :::::::: :::::::::::.:.::: .::.::.::
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAFS
::::::::::..: .:: ::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS12 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
:::::: ::.::::::::::::::::.: ::::::. ::.::::::::::::::::::::
CCDS12 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 AMKKTCFTKLFPQNC
:::.: .. :.
CCDS12 AMKRTFLSTLYSSGT
310
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1491 init1: 1416 opt: 1484 Z-score: 1255.4 bits: 240.5 E(32554): 1.3e-63
Smith-Waterman score: 1484; 71.2% identity (87.2% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
: . :.. .::: : :::::: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :: ::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
:::::.::..:::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS32 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
:::::::::::::::::: : :. :.:.:::: ::::.::. .:::.::: . ::::::
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
:: :::::: . . : :: :::.:::.::..::.:::.:::::::.:::::::.:.:
CCDS32 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.::: ::::::: .: .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS32 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 VAMKKTCFTKLFPQNC
:..:. . :. :
CCDS32 NAINKNFYRKFCPPSS
310
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1464 init1: 1363 opt: 1458 Z-score: 1233.8 bits: 236.5 E(32554): 2.1e-62
Smith-Waterman score: 1458; 70.9% identity (86.9% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQL-MLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
: : :. ..::::: ::::::. : .::::.:::.::::::::::::::: :: :: ::
CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
:::::::::.:::.:::: :::::::: :.:::.:.::: :::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
::.::.:::::.::.::: :::. :. .:::: ::::.:: .:::.::: . ::::.:
CCDS12 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
:: :::::::. . : :: :::.:::.::..::.::..:::::::.:::::::.:.:
CCDS12 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.:::.::::::: .: .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS12 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 VAMKKTCFTKLFPQNC
:..:. .. :
CCDS12 NAINKNFCRRFCPLSS
310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1024 init1: 664 opt: 1024 Z-score: 873.1 bits: 169.7 E(32554): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 1024; 50.5% identity (77.8% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPMY
:. .:.: : ::...:::.. .:: .::..:::.::::: : .:..:. .:.:: :::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
.:: :: .:: :: .:.:.::.:::: ...:.::.:: ::: . :: .:::::..:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
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CCDS30 ISPVLKLASQHSGFSQLVIF----MLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYK
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300 310
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300 310
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.:.:.
CCDS30 TALKRVLGMPVATKMS
300 310
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CCDS30 AFSTCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKE
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CCDS30 FKSALCKIVRRTISLL
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CCDS30 ALRNAFRGRLLGKG
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