Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0861
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0861, 276 aa
1>>>pF1KE0861 276 - 276 aa - 276 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8141+/-0.0015; mu= 12.7727+/- 0.087
mean_var=161.0897+/-50.864, 0's: 0 Z-trim(99.5): 407 B-trim: 346 in 1/48
Lambda= 0.101051
statistics sampled from 5283 (5749) to 5283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1372 213.0 2.1e-55
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1280 199.6 2.3e-51
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 1202 188.3 6.3e-48
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 883 141.8 6.3e-34
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 864 139.0 4.2e-33
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 858 138.1 7.6e-33
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 846 136.3 2.6e-32
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 846 136.3 2.6e-32
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 838 135.2 5.7e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 802 129.9 2.2e-30
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 800 129.6 2.7e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 788 127.9 9e-30
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 779 126.6 2.2e-29
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 778 126.4 2.4e-29
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 774 125.8 3.7e-29
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 771 125.4 5.1e-29
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 766 124.7 8.3e-29
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 764 124.4 1e-28
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 762 124.1 1.2e-28
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 761 123.9 1.3e-28
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 760 123.8 1.5e-28
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 759 123.6 1.7e-28
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 759 123.6 1.7e-28
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 759 123.7 1.7e-28
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 755 123.1 2.5e-28
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 754 122.9 2.8e-28
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 754 122.9 2.8e-28
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 752 122.6 3.4e-28
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 746 121.8 6.2e-28
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 744 121.5 7.7e-28
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 744 121.5 7.8e-28
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 742 121.2 9.5e-28
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 741 121.1 1.1e-27
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 740 120.9 1.1e-27
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 739 120.7 1.3e-27
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 736 120.3 1.7e-27
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 735 120.2 1.9e-27
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 735 120.2 2.1e-27
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 733 119.9 2.3e-27
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 732 119.7 2.6e-27
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 732 119.7 2.6e-27
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 726 118.8 4.7e-27
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 725 118.7 5.3e-27
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 724 118.5 5.8e-27
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 724 118.6 5.8e-27
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 723 118.4 6.4e-27
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 722 118.2 7e-27
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 722 118.3 7.1e-27
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 720 118.0 8.6e-27
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 720 118.0 8.7e-27
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1372 init1: 1372 opt: 1372 Z-score: 1108.2 bits: 213.0 E(32554): 2.1e-55
Smith-Waterman score: 1372; 74.3% identity (90.9% similar) in 276 aa overlap (1-276:1-276)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHHITLFVVFLILYTLTVAGNAIIMTIICIDRHLHTPMY
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CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQTFFFVTLAINNCFLLTVMGY
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CCDS30 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DHYMAICNPLRYRVITSKKVCVQLVCGAFSIGLAMAAVQVTSIFTLPFCHTVVGHFFCDI
:.:.::: :::: :: :: .:.:::::.:.:::.::...::..:.:::: ::: ::::::
CCDS30 DRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFCGTVVDHFFCDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPVMKLSCINTTINEIINFVVRLFVILVPMGLVFISYVLIISTVLKIASAEGWKKTFATC
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CCDS30 YPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFATC
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE0 AFHLTVVIVHYGCASIAYLMPKSENSIEQDLLLSVT
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CCDS30 VSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDAL
250 260 270 280 290 300
CCDS30 CRVVGRNIS
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1280 init1: 1280 opt: 1280 Z-score: 1035.5 bits: 199.6 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1280; 70.3% identity (88.8% similar) in 276 aa overlap (1-276:12-287)
10 20 30 40
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHHITLFVVFLILYTLTVAGNAIIMTII
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CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CIDRHLHTPMYFFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQTFFFVTLAI
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CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NNCFLLTVMGYDHYMAICNPLRYRVITSKKVCVQLVCGAFSIGLAMAAVQVTSIFTLPFC
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CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 HTVVGHFFCDILPVMKLSCINTTINEIINFVVRLFVILVPMGLVFISYVLIISTVLKIAS
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CCDS11 ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIAS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE0 AEGWKKTFATCAFHLTVVIVHYGCASIAYLMPKSENSIEQDLLLSVT
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CCDS11 VEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVVY
250 260 270 280 290 300
CCDS11 TLRNKEVKDALCRAVGGKFS
310 320
>>CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 691 init1: 659 opt: 1202 Z-score: 973.9 bits: 188.3 E(32554): 6.3e-48
Smith-Waterman score: 1202; 65.1% identity (86.7% similar) in 278 aa overlap (1-276:1-278)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHH-ITLFVVFLILYTLTVAGNAIIMTIICIDRHLHTPM
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CCDS30 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTIIRLDHHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 YFFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQTFFFVTLAINNCFLLTVMG
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CCDS30 YFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFGINNCFLLTVMG
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDHYMAICNPLRYRVITSKKVCVQLVCGAFSIGLAMAAVQVTSIFTLPFCHT-VVGHFFC
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CCDS30 YDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPFCDAFVISHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DILPVMKLSCINTTINEIINFVVRLFVILVPMGLVFISYVLIISTVLKIASAEGWKKTFA
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CCDS30 DVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKIASAEGQKKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE0 TCAFHLTVVIVHYGCASIAYLMPKSENSIEQDLLLSVT
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CCDS30 TCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCCVQPEEQGGQRC
250 260 270 280 290 300
CCDS30 SAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
310 320
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 876 init1: 529 opt: 883 Z-score: 722.5 bits: 141.8 E(32554): 6.3e-34
Smith-Waterman score: 883; 48.4% identity (79.6% similar) in 275 aa overlap (4-276:24-297)
10 20 30 40
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHHITLFVVFLILYTLTVA
.::: ::::..:::: . . ...::::::.:: . ..
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 GNAIIMTIICIDRHLHTPMYFFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQ
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CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TFFFVTLAINNCFLLTVMGYDHYMAICNPLRYRVITSKKVCVQLVCGAFSIGLAMAAVQV
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CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLA-AACAIGGFLASLTV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE0 TS-IFTLPFCHTV-VGHFFCDILPVMKLSCINTTINEIINFVVRLFVILVPMGLVFISYV
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CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LIISTVLKIASAEGWKKTFATCAFHLTVVIVHYGCASIAYLMPKSENSIEQDLLLSVT
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CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 847 init1: 526 opt: 864 Z-score: 707.8 bits: 139.0 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 864; 45.2% identity (77.4% similar) in 270 aa overlap (5-270:9-276)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHHITLFVVFLILYTLTVAGNAIIMTIICIDRHLH
: .: ::::: .:. . .. ::..::.:: . . ::. :. ..: :.
CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TPMYFFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQTFFFVTLAINNCFLLT
:::::::: :. . :: ..: :::... .::::::: .: ::::::. ..::::.
CCDS31 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VMGYDHYMAICNPLRYRVITSKKVCVQLVCGAFSIGLAM-AAVQVTS-IFTLPFC--HTV
.:.::.:.:::.::.: .: ....:.:.. :: .:::. ..:.:. ::::::: :
CCDS31 IMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGA--LGLALFPSLQLTALIFTLPFCGHHQE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VGHFFCDILPVMKLSCINTTINEIINFVVRLFVILVPMGLVFISYVLIISTVLKIASAEG
..::.::. ::..:.: . ... . .:: ..:. .:. :. .:::.: ..:.: ::::
CCDS31 INHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSIRSAEG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE0 WKKTFATCAFHLTVVIVHYGCASIAYLMPKSENSIEQDLLLSVT
...:.::.::::::...::: :..:: :.: .: ..:
CCDS31 RRRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLNPLLYSLR
240 250 260 270 280 290
CCDS31 NKDVKGALRSAIIRKAASDAN
300 310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 889 init1: 532 opt: 858 Z-score: 703.1 bits: 138.1 E(32554): 7.6e-33
Smith-Waterman score: 858; 46.4% identity (76.3% similar) in 278 aa overlap (1-276:1-277)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRRKNLTEVTEFVFLGFSRFHKHHITLFVVFLILYTLTVAGNAIIMTIICIDRHLHTPMY
:.. : : : ::: :::: . . . :::.::.:: .:.. ::::.. : .:: ::::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSMLASSKTVYTLFIIPQMLSSFVTQTQPISLAGCTTQTFFFVTLAINNCFLLTVMGY
:::..:. :. ::. :.:.:: ....: . ::. ::. : : :. .. .. :::..:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
70 80 90 100 110 120
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