Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0863
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0863, 313 aa
1>>>pF1KE0863 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3411+/-0.0012; mu= 9.7106+/- 0.069
mean_var=148.4225+/-47.226, 0's: 0 Z-trim(103.5): 396 B-trim: 824 in 2/45
Lambda= 0.105275
statistics sampled from 6922 (7434) to 6922 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 2002 316.6 1.6e-86
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1024 168.1 8.2e-42
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 988 162.6 3.6e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 976 160.8 1.3e-39
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 944 155.9 3.8e-38
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 941 155.5 5.1e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 940 155.3 5.8e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 939 155.2 6.5e-38
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 930 153.8 1.6e-37
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 922 152.6 3.8e-37
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 921 152.4 4.2e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 919 152.1 5.1e-37
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 918 152.0 5.7e-37
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 918 152.0 5.7e-37
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 916 151.6 7e-37
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 916 151.7 7.2e-37
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 912 151.0 1.1e-36
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 911 150.9 1.2e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 910 150.7 1.3e-36
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 909 150.6 1.5e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 905 150.0 2.2e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 900 149.2 3.8e-36
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 897 148.8 5.2e-36
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 896 148.6 5.8e-36
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 895 148.5 6.5e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 895 148.5 6.5e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 894 148.3 7.2e-36
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 893 148.2 8e-36
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 893 148.2 8.1e-36
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 888 147.4 1.4e-35
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 878 145.9 3.9e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 877 145.8 4.7e-35
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 876 145.6 4.8e-35
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 876 145.6 5.1e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 875 145.4 5.3e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 875 145.4 5.3e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 875 145.5 5.7e-35
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 872 145.0 7.2e-35
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 872 145.0 7.4e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 871 144.8 8.3e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 870 144.7 9e-35
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 870 144.7 9.1e-35
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 870 144.7 9.1e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 865 143.9 1.6e-34
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 865 143.9 1.6e-34
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 865 143.9 1.6e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 860 143.1 2.6e-34
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 859 143.0 2.9e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 857 142.7 3.5e-34
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 857 142.7 3.5e-34
>>CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 (313 aa)
initn: 2002 init1: 2002 opt: 2002 Z-score: 1666.9 bits: 316.6 E(32554): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 2002; 99.4% identity (99.7% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKALQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKALQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANLGSLHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTAMA
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANLGSPHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHFLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHFLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DILPVLRLASAGKHRSEISMMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKVFS
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DILPVLRLASAGKHRSEISVMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKVFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDVRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 ALRHLVKRQRPSP
:::::::::::::
CCDS31 ALRHLVKRQRPSP
310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1041 init1: 784 opt: 1024 Z-score: 864.2 bits: 168.1 E(32554): 8.2e-42
Smith-Waterman score: 1024; 51.1% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (5-311:4-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKALQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPMY
: . . :::::::: : ::: :: : : .::.:. :: ::..:.... ::.::::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 FFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANL--GSLHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTA
:::: ::..:. ::. :: : .: : : :: .::: ::. :. .: .:::::.:
CCDS34 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRH---ISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MAYDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHF
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CCDS34 MAYDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LCDILPVLRLASAGKHRSEISMMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKV
.:.: :::.:. . .:.... :: ..:. ::.::. :: ::: .:. . :. .:::.
CCDS34 FCEIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSTCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDV
::::::::..::::.::: . ::::.:. . .:: ..::::.:.::.::::::.::: .:
CCDS34 FSTCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RRALRHLVKRQRPSP
. ::.. ... :
CCDS34 KAALKRTIQKTVPMEI
300 310
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1003 init1: 753 opt: 988 Z-score: 834.6 bits: 162.6 E(32554): 3.6e-40
Smith-Waterman score: 988; 49.8% identity (79.9% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKA-LQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPM
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CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANLGSLHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTAM
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CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTL-IIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATM
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pF1KE0 AYDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHFL
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CCDS77 AYDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDILPVLRLASAGKHRSEISMMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKVF
:: ::. :. : :. .:::..::..:: ::. ::.:::..:. : :.......:
CCDS77 CDSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDVR
::::.::::::::..:: .::.:::...: . ..::: ::.:::::::::. :::.:.
CCDS77 STCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RALRHLVKRQRPSP
::..:..:
CCDS77 AALKRLIHRTLGSQKL
300 310
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 995 init1: 729 opt: 976 Z-score: 824.7 bits: 160.8 E(32554): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 976; 47.9% identity (78.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKALQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPMY
: :::: . ::.::::.. .: :: : .: :::::: ::. .:.:. ::..:::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANLGSLHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTAMA
:::..::..:. .: .::. :..: : . . ::: ::..::: :. .: ::: ::. ::
CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPR-KIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHFLC
:::.::::.::.::.... :. :. ::..:. .. ... ...::: . . ::.:
CCDS31 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DILPVLRLASAGKHRSEISMMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKVFS
: :::.:... :.. ...:..:::.:: ::..:: ::. .:: :.:. .:.:.::
CCDS31 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDVRR
::::::.:::::.::::.::.::....: . ...:: ::::::::::::: :::..:.
CCDS31 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 ALRHLVKRQRPSP
:... . ..
CCDS31 AVKRTITQKVLQKLDVF
300 310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 940 init1: 698 opt: 944 Z-score: 798.4 bits: 155.9 E(32554): 3.8e-38
Smith-Waterman score: 944; 49.8% identity (78.5% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKA-LQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPM
:: : : . ::.:..::.: . .:. :: . : .::::: :::::::.: ..: :::::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLRQLSVVELFYTTDIVPRTLANLGSLHPQAISFQGCAAQMYVFIVLGISECCLLTAM
:::::.:: .:. .. :::. :..: . . .::: :::.::: :. .:..:: ::..:
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLA-QDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAICQPLRYSTLLSPRACMAMVGTSWLTGIITATTHASLIFSLPFRSHPIIPHFL
:::::::::.::.: .... :. ....::. :. .::.... .::.:: . . ::.
CCDS77 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDILPVLRLASAGKHRSEISMMTATIVFIMIPFSLIVTSYIRILGAILAMASTQSRRKVF
:: :::.:. : :: ...::. .::: ::. :: :: .::: . :.....:.:
CCDS77 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCSSHLLVVSLFFGTASITYIRPQAGSSVTTDRVLSLFYTVITPMLNPIIYTLRNKDVR
:::::::::::::. ..:.::. :....: . ..::: :::.:::::::::.:::..:.
CCDS77 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RALRHLVKRQRPSP
::
CCDS77 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 953 init1: 712 opt: 941 Z-score: 796.0 bits: 155.5 E(32554): 5.1e-38
Smith-Waterman score: 941; 46.9% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGENHTTLPEFLLLGFSDLKALQGPLFWVVLLVYLVTLLGNSLIILLTQVSPALHSPMY
: .:.. . ::.:::::.. :: :: : :..:.:::.::..: .. ... .:: :::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
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310
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CCDS31 TLIKLWRRKVILHTF
300 310
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CCDS46 AVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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CCDS31 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHF-LVKRKTISFYGCMTQIIV
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