Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0865
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0865, 335 aa
1>>>pF1KE0865 335 - 335 aa - 335 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7104+/-0.00125; mu= 14.2036+/- 0.073
mean_var=175.2125+/-59.567, 0's: 0 Z-trim(101.9): 378 B-trim: 393 in 1/47
Lambda= 0.096893
statistics sampled from 6280 (6722) to 6280 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 2177 317.6 9.2e-87
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1212 182.6 3.6e-46
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1164 175.9 3.8e-44
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1107 168.0 9.5e-42
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1106 167.8 1e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1085 164.9 7.9e-41
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1056 160.8 1.3e-39
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1023 156.2 3.2e-38
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1005 153.7 1.9e-37
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 989 151.5 8.6e-37
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 980 150.2 2.1e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 977 149.8 2.8e-36
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 977 149.8 2.9e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 973 149.2 4.1e-36
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 964 148.0 1e-35
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 962 147.7 1.2e-35
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 956 146.9 2.1e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 956 146.9 2.1e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 951 146.2 3.5e-35
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 950 146.0 3.8e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 950 146.0 3.8e-35
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 949 145.9 4.2e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 946 145.4 5.6e-35
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 946 145.5 5.6e-35
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 941 144.7 9e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 941 144.8 9.1e-35
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 939 144.5 1.1e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 935 143.9 1.6e-34
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 934 143.8 1.8e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 929 143.1 2.9e-34
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 929 143.2 3.1e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 928 142.9 3.2e-34
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 926 142.7 4e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 921 142.0 6.3e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 921 142.0 6.4e-34
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 919 141.7 7.8e-34
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 918 141.5 8.3e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 918 141.5 8.4e-34
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 916 141.3 1e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 916 141.3 1e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 916 141.3 1e-33
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 915 141.1 1.1e-33
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 915 141.2 1.2e-33
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 909 140.3 2e-33
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 909 140.3 2e-33
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 909 140.3 2.1e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 908 140.1 2.2e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 908 140.1 2.2e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 908 140.1 2.2e-33
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 907 140.0 2.5e-33
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 2177 init1: 2177 opt: 2177 Z-score: 1671.1 bits: 317.6 E(32554): 9.2e-87
Smith-Waterman score: 2177; 99.4% identity (99.7% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNGFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.:
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 915 init1: 869 opt: 1212 Z-score: 942.4 bits: 182.6 E(32554): 3.6e-46
Smith-Waterman score: 1212; 59.6% identity (85.3% similar) in 307 aa overlap (27-333:8-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
:.::.:.:.:::::::.:: :::.::.:::.::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
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CCDS30 ANVTIMAVIRFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
.::::::: :::::..:::::::.::::::.: ... .. .: . . ::. .:...
CCDS30 LFFFLGFACTNCLLIAVMGYDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVAT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNGFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYFC
::. .. ::. :.:::::::.. :: ::::.: :. ...: ..::..::::.: .::
CCDS30 NLICDMRFCGPNRVNHYFCDMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
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CCDS30 IVNTILKIPSAEGK-KAFVTCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTV
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
:::::::.:::::::.:. :...::: . :.
CCDS30 VTPLLNPLVYSLRNKEVKTALKRVLGMPVATKMS
290 300 310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1206 init1: 1138 opt: 1164 Z-score: 906.1 bits: 175.9 E(32554): 3.8e-44
Smith-Waterman score: 1164; 59.2% identity (83.6% similar) in 304 aa overlap (25-327:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
: :.: ::..::::::...: :::.::.::: :.
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
:. :::.: ::..:::::::::.::: :: :::::.::::..::: .:::: ::.:
CCDS30 TNAIIISTIVLDRALHTPMYFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVC-GKLAAACAIGGFLASLTV
:: :: :. .. .::..:::::: :::.::.: .::. :: : .::::: : : .::..
CCDS30 MFSFLFFGSSHSFLLAAMGYDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACG-FTVSLVT
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNGFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYF
..::: ::: :.:...:.::::: :. :: .. . .:::. ::..::.:.:.: :::.
CCDS30 TSLVFHLPFHSSNQLHHFFCDISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
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CCDS30 RIISAILKIPSSVGRYKTFSTCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE0 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
:.:::.:::.::::::. . :.:...:.
CCDS30 ILTPLFNPMIYSLRNKEFKSALRRTIGQTFYPLS
280 290 300 310
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1090 init1: 588 opt: 1107 Z-score: 863.0 bits: 168.0 E(32554): 9.5e-42
Smith-Waterman score: 1107; 52.8% identity (81.9% similar) in 320 aa overlap (12-330:3-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
. . : .. ::.:..:.:.. ::::. : :..:: ::: ::.. :.
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
::. :...:..: :::::::::..:::::: ::.::::.:: .:..... ::. :: :
CCDS11 GNIIIVTIIRMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLA-AACAIGGFLASLTV
::::. :.::::.:: .::::::.:::.::.: ..:. .. .:. .::.:: .....:
CCDS11 MFFFVTFGITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIG-LIVAITQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNGFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYF
:. :: :::: : :: :.:::: :. :.: .: :: .. .: .:::::::. .. .::
CCDS11 VTSVFRLPFC-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
:. ::::: :.:::.:::.::::::.::::::.:::. ::.: .. . ..:.:..::::
CCDS11 LIISTILKIASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
..::::::.::.::::.:. :. ...: : :
CCDS11 VITPLLNPVVYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
290 300 310 320
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1097 init1: 1097 opt: 1106 Z-score: 862.3 bits: 167.8 E(32554): 1e-41
Smith-Waterman score: 1106; 56.2% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (25-331:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
: :.: : ..::::::...: :::.::.::: :.
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
:. :::.: ::..:: ::::::.::: :: :::.:.::::..::: .:::: ::.:
CCDS30 TNAIIISTIVLDRALHIPMYFFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVC-GKLAAACAIGGFLASLTV
:: :: .. .. .::.::::::: :::.::.: .::. :: : .::::: : : .. .
CCDS30 MFSFLFLGCSHSFLLAVMGYDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACG-FTVAQII
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNGFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYF
..::: ::: :.:...:.::::. :. :: .. . .:::. .:::..:.:.: :::
CCDS30 TSLVFHLPFYSSNQLHHFFCDIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
:: .::..::. :: ::::::.::: .: ::::::::::::: .:: :..: :..:.::
CCDS30 HILSAILQFPSTLGRCKAFSTCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330
pF1KE0 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
:.:::.:::.::::::. . :. :.. . ::
CCDS30 IITPLFNPMIYSLRNKEFKSALCKIVRRTISLL
280 290 300 310
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1084 init1: 1064 opt: 1085 Z-score: 846.5 bits: 164.9 E(32554): 7.9e-41
Smith-Waterman score: 1085; 53.9% identity (79.9% similar) in 308 aa overlap (25-327:5-312)
10 20 30 40 50 60
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CCDS30 SNVFIIIAIRLDSHLHTPMYLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQ
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::: ..: :::.::..::.:::.::: :::: . :. .:..:. . . :.: .: ..
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..: : :::.....:.::: :. ::: .: . . ::: ..:::.: :.:: .::
CCDS30 LVIFHLSFCSSHEIQHFFCDTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAY
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CCDS30 VTPLLNPIVYSLRNRAIQTALRNAFRGRLLGKG
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Smith-Waterman score: 1056; 49.2% identity (80.0% similar) in 305 aa overlap (24-328:4-307)
10 20 30 40 50 60
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CCDS46 GNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQ
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:.: ::::. :..:..:::: ...:.: ::.:: .... ::.. .::: : .::.:
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CCDS46 IISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSV
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CCDS46 VTPMLNPIIYTLRNKDIKEAV-KTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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10 20 30 40 50 60
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CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLV
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CCDS30 ANIIIVTIICIDHHLHTPMYFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQ
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CCDS30 MFFFVILATNNCFLLTAMGYDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHV
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CCDS30 LVISSILQIASAEGRKKTFATCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYT
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CCDS30 IITPLLNPVVYSLRNKEVKDALCRVVGRNIS
280 290 300
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
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CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILC
10 20 30 40
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CCDS31 GNTAIIWVVCTHSTLRTPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQ
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CCDS31 TALIFTLPFCGHHQEINHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSY
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CCDS31 GNATIAVIVQINHSLHTPMYFFLANLAVLEIFYTSSITPLALANLLSMGKTPVSITGCGT
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