Result of FASTA (omim) for
pF1KE0871
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0871, 324 aa
1>>>pF1KE0871 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1165+/-0.000484; mu= 17.4567+/- 0.030
mean_var=129.5972+/-39.308, 0's: 0 Z-trim(109.1): 318 B-trim: 1131 in 1/53
Lambda= 0.112662
statistics sampled from 16792 (17256) to 16792 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 7.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 941 165.1 1.8e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 894 157.5 3.4e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 878 154.9 2.1e-37
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 874 154.2 3.3e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 864 152.6 1e-36
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 853 150.8 3.5e-36
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 853 150.8 3.5e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 850 150.3 4.9e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 835 147.9 2.6e-35
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 147.7 3e-35
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 834 147.7 3e-35
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 147.7 3e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 830 147.1 4.6e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 812 144.1 3.5e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 810 143.8 4.4e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 801 142.3 1.2e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 794 141.2 2.7e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 791 140.7 3.7e-33
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 783 139.4 9.2e-33
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 774 137.9 2.5e-32
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 552 101.9 1.9e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 549 101.4 2.6e-21
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 235 50.5 6.7e-06
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 233 50.1 8.1e-06
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 227 49.0 1.5e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 220 47.9 3.4e-05
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 215 47.1 6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 204 45.3 0.0002
NP_005675 (OMIM: 604106) probable G-protein couple ( 361) 201 44.9 0.0003
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 197 44.2 0.00046
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 197 44.2 0.00046
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 196 44.0 0.00049
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 196 44.2 0.00059
NP_002556 (OMIM: 300038) P2Y purinoceptor 4 [Homo ( 365) 193 43.6 0.00075
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 190 43.1 0.00098
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 190 43.1 0.00099
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 189 43.0 0.0012
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 189 43.0 0.0012
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 189 43.0 0.0012
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 189 43.0 0.0012
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 189 43.0 0.0012
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 189 43.0 0.0012
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 189 43.0 0.0013
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 189 43.0 0.0013
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 189 43.1 0.0013
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 189 43.1 0.0013
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 189 43.1 0.0014
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 189 43.1 0.0014
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 186 42.4 0.0015
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 186 42.4 0.0016
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 944 init1: 674 opt: 941 Z-score: 847.7 bits: 165.1 E(85289): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 941; 46.9% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (13-311:4-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIR
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70 80 90 100 110
pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNIL-SKT---KAISFSGCFLQFYFFFS
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NP_003 NHSTLHKPMYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLG
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LGTTECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQL
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NP_003 LGCTECVLLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 PFCGPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVF
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NP_003 SYCGPNIINHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVM
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QVPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFN
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NP_003 HIPSAAGRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 PLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_003 PIIYCLRNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 893 init1: 893 opt: 894 Z-score: 806.6 bits: 157.5 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 894; 43.4% identity (76.0% similar) in 304 aa overlap (12-315:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_006 MEFTDRNYT-LVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIR
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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NP_006 IDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADT
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pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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NP_006 ESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCD
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pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
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NP_006 KNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRS
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pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
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NP_006 FSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_006 SLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 878; 43.3% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (11-315:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIR
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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NP_003 ECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCD
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pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
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NP_003 SNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHS
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pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
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NP_003 GEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIY
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310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_003 SLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 901 init1: 870 opt: 874 Z-score: 788.9 bits: 154.2 E(85289): 3.3e-37
Smith-Waterman score: 874; 42.7% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (7-315:7-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 841 init1: 841 opt: 864 Z-score: 780.2 bits: 152.6 E(85289): 1e-36
Smith-Waterman score: 864; 44.6% identity (73.5% similar) in 294 aa overlap (19-311:9-302)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGC-WKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAV
..::::..: . .:: .:: ::.::..:: ::. :: ..
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVT
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pF1KE0 RCNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGT
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NP_835 LADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGV
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pF1KE0 TECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFC
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NP_835 AECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFC
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pF1KE0 GPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVP
: : ..::.:: :.. : :: . . : . . ::... . :: :: . .:....:
NP_835 GTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIP
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 SAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLI
:: :..::::::.:::.:::::: . . : : . .:.:.: :.:.::..::.:
NP_835 SAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPII
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pF1KE0 YTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
:.:::...: ::
NP_835 YSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 876 init1: 845 opt: 853 Z-score: 770.6 bits: 150.8 E(85289): 3.5e-36
Smith-Waterman score: 853; 42.3% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (11-315:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 876 init1: 845 opt: 853 Z-score: 770.6 bits: 150.8 E(85289): 3.5e-36
Smith-Waterman score: 853; 42.3% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (11-315:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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NP_036 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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NP_036 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
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NP_036 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
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NP_036 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_036 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 881 init1: 843 opt: 850 Z-score: 767.9 bits: 150.3 E(85289): 4.9e-36
Smith-Waterman score: 850; 44.5% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (20-319:10-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSR
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pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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NP_001 LDPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGV
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130 140 150 160 170
pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYIS-QLPFC
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NP_001 ECLLLAVMAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCG-VANSLAMSPVTLRLPRC
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVP
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NP_001 GHHEVDHFLREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIR
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLI
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NP_001 SASGRQKAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLI
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300 310 320
pF1KE0 YTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_001 YTLRNREVKGALGRLLLGKRELGKE
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 813 init1: 728 opt: 835 Z-score: 754.8 bits: 147.9 E(85289): 2.6e-35
Smith-Waterman score: 835; 40.9% identity (77.0% similar) in 296 aa overlap (20-315:10-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
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NP_002 SDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVAL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
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NP_002 DNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
: ...:.: :. ..:. :.. .. . . ..... ... ::.:.. :....::
NP_002 SRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
.. . ::::::.::: .:::::::. ..:..: . .. ... :..:.:.::..::.::
NP_002 VSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTY-SVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIY
240 250 260 270 280
310 320
pF1KE0 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
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NP_002 SLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 858 init1: 822 opt: 834 Z-score: 753.8 bits: 147.7 E(85289): 3e-35
Smith-Waterman score: 834; 41.3% identity (76.3% similar) in 300 aa overlap (19-316:9-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
:.::::::. . : .. :: ::::.::.:.::: :. .:
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
. :::::::.: :...... :..:..:..:...:.. ::: :..: :..: ..::
XP_011 LDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
: ..:::::::::.:.: :.: ::: .:..:. :. ::.. :. :::.:
XP_011 EFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSM-YILRSYILLLTAVFQVP
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XP_011 NKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMV-SSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQ
180 190 200 210 220
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]