Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0872
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0872, 330 aa
1>>>pF1KE0872 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7577+/-0.00113; mu= 13.7937+/- 0.066
mean_var=155.8946+/-51.174, 0's: 0 Z-trim(103.8): 381 B-trim: 906 in 2/49
Lambda= 0.102721
statistics sampled from 7089 (7577) to 7089 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 1.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 2226 342.6 2.7e-94
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 1445 226.8 1.8e-59
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 1390 218.7 5.3e-57
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 1387 218.2 7.2e-57
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 1381 217.3 1.3e-56
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 1304 205.9 3.7e-53
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1019 163.7 1.8e-40
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 998 160.6 1.6e-39
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 971 156.6 2.6e-38
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 944 152.5 4e-37
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 935 151.2 1e-36
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 928 150.2 2.1e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 926 149.9 2.7e-36
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 922 149.3 3.8e-36
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 919 148.9 5.5e-36
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 915 148.2 8e-36
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 915 148.3 8e-36
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 914 148.1 8.8e-36
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 913 147.9 9.7e-36
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 913 147.9 9.8e-36
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 912 147.8 1.1e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 912 147.8 1.1e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 911 147.7 1.2e-35
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 910 147.6 1.4e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 908 147.2 1.6e-35
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 907 147.1 1.9e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 906 146.9 2e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 904 146.6 2.5e-35
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 901 146.2 3.3e-35
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 900 146.0 3.7e-35
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 900 146.0 3.7e-35
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 897 145.6 5.1e-35
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 896 145.4 5.7e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 894 145.2 7e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 892 144.8 8.5e-35
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 891 144.7 9.3e-35
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 891 144.7 9.4e-35
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 890 144.5 1e-34
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 890 144.6 1.1e-34
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 886 143.9 1.6e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 886 144.0 1.6e-34
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 883 143.5 2.1e-34
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 881 143.2 2.6e-34
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 880 143.0 2.9e-34
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 878 142.8 3.6e-34
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 877 142.6 4e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 877 142.6 4e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 876 142.5 4.4e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 875 142.3 4.8e-34
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 875 142.3 4.9e-34
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
initn: 2226 init1: 2226 opt: 2226 Z-score: 1806.4 bits: 342.6 E(32554): 2.7e-94
Smith-Waterman score: 2226; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
310 320 330
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 1404 init1: 1404 opt: 1445 Z-score: 1181.0 bits: 226.8 E(32554): 1.8e-59
Smith-Waterman score: 1445; 67.1% identity (84.5% similar) in 322 aa overlap (11-330:2-323)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTM-HFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLG
: :.. : :.::. :.::::.:::: : ..: .::..::.:.:::::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NGAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQF
::::. ::. . ::::::.::::::::::::.:::.:::::::::. :.::::::::::
CCDS32 NGAIIYAVRCNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YFFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIV
:::::::::::.::.:::::::::::.::.::.::: .:: :: ::. ::: ::.::
CCDS32 YFFFSLGTTECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLV
::::::::::::::..:: ::.::.: :: :: : :: .:...: . :: :: :.
CCDS32 YISQLPFCGPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAM
. ::. .::.::: ::::::::::.::::::::.:::::::: : :. .:::.::::..
CCDS32 LTAVFQVPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 TPFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVL-GLTVSQN
::..:::::.::::::: ::. :: :. . ::
CCDS32 TPLFNPLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
300 310 320
>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 1390 init1: 1390 opt: 1390 Z-score: 1136.9 bits: 218.7 E(32554): 5.3e-57
Smith-Waterman score: 1390; 64.6% identity (85.2% similar) in 311 aa overlap (14-324:11-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
: .. : .. ::.::.: :: . .: .::.. . : ::. ::
CCDS32 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
:::. .. : :::::::..::::.::::::.:::::.::::.::: :.:::.:::::::
CCDS32 GAIAFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
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CCDS32 FFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
:::.::::::::::.:::::: ::: :.::: .:.:::..:..::: :: :.::::::.
CCDS32 ISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
.::: .::..:: :::::::::: :::: :..:::::::: :. .::::: :: :. .:
CCDS32 KAVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVT
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
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CCDS32 PLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
300 310 320
>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 1387 init1: 1387 opt: 1387 Z-score: 1134.5 bits: 218.2 E(32554): 7.2e-57
Smith-Waterman score: 1387; 65.0% identity (85.2% similar) in 311 aa overlap (14-324:11-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
: .. : .. ::.::.: :: . .: .::.. ..: ::. ::
CCDS76 MCPLTLHVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTIYALTITGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
:::. .. :::::::::..::::.::::::.:::::.::::.::: :.:::.:::::::
CCDS76 GAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
:::::::.::..:.:::.:.:::::::: ::.::::.. :: .::: ::: . .::::
CCDS76 FFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
::: ::::::::::.:::::::::: :.::: .:.:::..:..::: :: :.::::::.
CCDS76 ISQKPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
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CCDS76 KAVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVT
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
:..:::::::.::..: ::..:::
CCDS76 PLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
300 310 320
>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 1381 init1: 1381 opt: 1381 Z-score: 1129.7 bits: 217.3 E(32554): 1.3e-56
Smith-Waterman score: 1381; 64.3% identity (85.2% similar) in 311 aa overlap (14-324:11-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
: .. : .. ::.::.: :: . .: .::.. . : ::. ::
CCDS74 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
:::. .. :::::::::..::::.::::::.:::::.::::.::: :.:::.:::::::
CCDS74 GAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
:::::::.::..:.:::.:.:::::::: ::.::::.. :: .::: ::: . .::::
CCDS74 FFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
:::.::::::::::.:::::: ::: :.::: .:.:::..:..::: :: :.::::::.
CCDS74 ISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
.:.: .::..:: :::::::::: :::: :..:::::::: :. .::::: :: :. .:
CCDS74 KAMLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVT
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
:..:::::::.::..: ::..:::
CCDS74 PLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
300 310 320
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 1322 init1: 1287 opt: 1304 Z-score: 1067.8 bits: 205.9 E(32554): 3.7e-53
Smith-Waterman score: 1304; 60.6% identity (81.1% similar) in 322 aa overlap (3-324:29-344)
10 20 30
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLG
: :: . ..: . :.: . : :.:::
CCDS32 MHFLSQNDLNINLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHM-KIFNS---PSNSSTF--TGFILLG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 FHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGNGAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISS
: :: : .: .. :.:::::.:::.:.:::. :.:::.::::::.::.:::: :..:
CCDS32 FPCPREGQILLFVLFTVVYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFYFFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIM
:::.::.:.::. : :::::::::::::::::.::::::.:::.::::::::::.::.::
CCDS32 TVPSMLANFLSDTKIISFSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIM
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 TGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVLISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTE
: ..: :: ::: ::. . .::: :::. ::: ::::..:::.::..:.: ..: :
CCDS32 TRRLCTNLVVNCWVLGFIWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVIRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLM
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CCDS32 LVFSVLSPLPVFMLFLFIVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
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CCDS32 VMYGSPPSKNEAGKQKTVTLFYSVVTPLLNPVIYSLRNKDMRKALKKFWGT
300 310 320 330 340
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10 20 30 40 50 60
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CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGN
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70 80 90 100 110 120
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CCDS30 LLIFLVVCLDSRLHTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIY
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CCDS30 FFHSLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISL
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CCDS30 ISRLPFCGPNRIQHVFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQII
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CCDS30 CTVLRIPSAAGKRKAISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLT
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:::::.:::::::..:.:..: :
CCDS30 PFLNPFIYSLRNKEIKEAVRRQLKRIGILA
290 300 310
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
..:::.::: . ... .: ..:. ::.:. ::
CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGN
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CCDS30 MLIFSVIRLDAALHTPMYHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTY
50 60 70 80 90 100
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pF1KE0 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
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CCDS30 FFHSLGASECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVIL
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::::::. : :.:. :: ::..::: .. .. :. ...:..::. :. :. ::. .:
CCDS30 ASQLPFCAYNEIQHIFCDFPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARII
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pF1KE0 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
::: : ...:: ::::::.::: :: .:.:... ::: .. ... ...::...:
CCDS30 GAVLKIKTASGRKKAFSTCASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLT
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pF1KE0 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
:..::.:::::::.. :.::..
CCDS30 PMVNPIIYSLRNKEIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
290 300 310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MEPQNTST--VTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGN
10 20 30 40
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CCDS31 VVIITVVSQGLRLHSPMYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLY
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CCDS31 FFVFLGATECFLLAFMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCARLVVVSWCTGVSTGFLPSLM
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CCDS31 ISRLDFCGRNQINHFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIV
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..: ::: .:: :.:::::::: ::.:.:::.. ::: :. ..:::.. ::..:
CCDS31 SSILRIPSTSGRRKTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVT
230 240 250 260 270 280
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CCDS31 PLLNPVIYSLRNKDFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
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CCDS43 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGN
10 20 30 40
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CCDS43 GIILGLIYLDSRLHTPMYVFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTF
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CCDS43 LYLAFAITECLILVMMCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITL
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pF1KE0 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
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CCDS43 ILRLPFCGPQKINHFFCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]