Result of FASTA (ccds) for pF1KE0874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0874, 318 aa
  1>>>pF1KE0874 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1723+/-0.00137; mu= 10.9928+/- 0.080
 mean_var=209.6127+/-73.757, 0's: 0 Z-trim(100.8): 401  B-trim: 382 in 1/46
 Lambda= 0.088586
 statistics sampled from 5779 (6271) to 5779 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.193), width:  16
 Scan time:  2.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9       ( 318) 2052 276.1 2.5e-74
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9       ( 318) 1907 257.6 9.4e-69
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9       ( 318) 1900 256.7 1.7e-68
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9       ( 347) 1434 197.2 1.5e-50
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9       ( 318) 1405 193.4 1.9e-49
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9       ( 320) 1381 190.4 1.6e-48
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9          ( 319) 1344 185.7 4.3e-47
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9       ( 346) 1263 175.4 5.9e-44
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9          ( 316) 1179 164.6 9.5e-41
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9       ( 319) 1121 157.2 1.6e-38
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1         ( 309) 1058 149.1 4.2e-36
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9       ( 312) 1051 148.2 7.9e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6          ( 313) 1025 144.9 7.9e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321) 1024 144.8 8.8e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6        ( 313) 1019 144.1 1.4e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6          ( 357) 1018 144.1 1.6e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1        ( 316) 1005 142.3 4.7e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12      ( 316)  974 138.4 7.3e-33
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1       ( 317)  972 138.1 8.7e-33
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX       ( 308)  968 137.6 1.2e-32
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11       ( 314)  965 137.2 1.6e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6         ( 312)  964 137.1 1.8e-32
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1          ( 320)  964 137.1 1.8e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6        ( 311)  962 136.8 2.1e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6          ( 312)  958 136.3   3e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11       ( 324)  956 136.1 3.7e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11       ( 330)  956 136.1 3.7e-32
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6          ( 320)  948 135.0 7.4e-32
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7        ( 317)  940 134.0 1.5e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11       ( 308)  939 133.9 1.6e-31
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6          ( 316)  937 133.6 1.9e-31
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1       ( 335)  937 133.7   2e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7       ( 310)  930 132.7 3.6e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7        ( 310)  930 132.7 3.6e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11         ( 314)  928 132.5 4.3e-31
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1        ( 324)  928 132.5 4.4e-31
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16         ( 312)  927 132.3 4.7e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11        ( 311)  925 132.1 5.6e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7        ( 311)  921 131.6 7.9e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11       ( 315)  920 131.5 8.7e-31
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1         ( 317)  917 131.1 1.1e-30
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1       ( 323)  913 130.6 1.6e-30
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11       ( 326)  910 130.2 2.2e-30
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11     ( 301)  908 129.9 2.5e-30
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1         ( 369)  909 130.2 2.5e-30
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1         ( 312)  906 129.7   3e-30
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1        ( 312)  906 129.7   3e-30
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11       ( 315)  906 129.7   3e-30
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3        ( 309)  905 129.5 3.3e-30
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9        ( 311)  905 129.5 3.3e-30


>>CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9            (318 aa)
 initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052  Z-score: 1448.0  bits: 276.1 E(32554): 2.5e-74
Smith-Waterman score: 2052; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
       ::::::::::::::::::
CCDS35 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
              310        

>>CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9            (318 aa)
 initn: 1940 init1: 1907 opt: 1907  Z-score: 1347.9  bits: 257.6 E(32554): 9.4e-69
Smith-Waterman score: 1907; 92.8% identity (97.5% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.:::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLSLAMGTTECVLLGVMAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQTVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       ::::::::::::: ::::.::.::::.:::::::::::::::.::::::::::::: :::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFILLVTTTLFLLTPLLLIIVSYTLIILSIFKISSSEGRSKPSST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       :::.::::: : :::..:::::::.:::::::::::::.: .:: :::::::::::::::
CCDS35 CSARLTVVITFCGTIFLMYMKPKSQETLNSDDLDATDKLIFIFYRVMTPMMNPLIYSLRN
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
       ::::::::::: :. :.:
CCDS35 KDVKEAVKHLLRRKNFNK
              310        

>>CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9            (318 aa)
 initn: 1900 init1: 1900 opt: 1900  Z-score: 1343.0  bits: 256.7 E(32554): 1.7e-68
Smith-Waterman score: 1900; 91.5% identity (96.2% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       :::::.:::::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       ::::::::::::::::::.::::::.:::. : ::::::..:::::::::.:.::::.::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       ::::::::::::: :::.::::: :: : :::::..::.::: ::.:: :::::::: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
       :::::::::: :::::::
CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
              310        

>>CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9            (347 aa)
 initn: 1458 init1: 1420 opt: 1434  Z-score: 1020.8  bits: 197.2 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 1434; 65.5% identity (91.3% similar) in 310 aa overlap (5-314:35-344)

                                         10        20        30    
pF1KE0                           MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIM
                                     :.:.. ::.: ::::.:..:...:.::..:
CCDS35 LICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFALILVM
           10        20        30        40        50        60    

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE0 YVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMYFFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISL
       :.:::.:::.::. ::.: :.:::::::::::::::::::..:.::::::..:....::.
CCDS35 YLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKRNISF
           70        80        90       100       110       120    

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE0 SGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAV
       ::::::::.:.:::.:::.::::::::::::::::::::::.:: ::: ::. ::. :..
CCDS35 SGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWLSGGI
          130       140       150       160       170       180    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE0 NSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCEILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLI
       :::::......:::: :::::::.::::::.:::::::: : . :....  :.. ::..:
CCDS35 NSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLPLMVI
          190       200       210       220       230       240    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE0 IVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASSTCSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLD
       . :: .:. .:....:. :: :: :::::::::::::::::.::: ::::.. .. . :.
CCDS35 FFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGEEKLQ
          250       260       270       280       290       300    

          280       290       300       310        
pF1KE0 ATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRNKDVKEAVKHLLNRRFFSK
       : ::.::.::::.:::.::..::::::::: :::.:::..    
CCDS35 ALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH 
          310       320       330       340        

>>CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9            (318 aa)
 initn: 1425 init1: 1392 opt: 1405  Z-score: 1001.1  bits: 193.4 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1405; 65.3% identity (88.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       :.  :.:.. ::.: ::::.:.::..::.::..::::::.:::.::. :::: .:: :::
CCDS35 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       :::::::::::::::.::::::::..:....::.::::::::.:.:::.::: :::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       ::::::::::::::::.: .:: ... ::. :..::.::. .... ::: ::::::: ::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       ::::.::::.::: :   . :..  :.. :::.:. :: .:. .:.. .:. :: :: ::
CCDS35 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       :::::::::::::::.::: ::::.. :..:.:.::. ..::::::.:::.::.::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
       :::: :.:.::.:.    
CCDS35 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
              310        

>>CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9            (320 aa)
 initn: 1381 init1: 1381 opt: 1381  Z-score: 984.5  bits: 190.4 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 1381; 63.1% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       ::  : .  .:::: :::.::.:. .:::::. ::..::::::.:: . :.: :::::::
CCDS35 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       ::: ::::::.:::..:.:  :.:::. .: .:.::: ::::...:::.:::..:: ::.
CCDS35 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       ::::::: :::::.:::: ::: ::::::. : :.:.::..:..::::: ::.:.::.::
CCDS35 DRYVAICYPLRYPVIMSKGAYVAMAAGSWVTGLVDSVVQTAFAMQLPFCANNVIKHFVCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       :::..:::::::: : . :  .. . .. :::.: .:: .:...:..: :.::. :: ::
CCDS35 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       :::::::::::::::.::: ::.:: ...: . :  . .::.::::::::.:::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
              250       260       270       280       290       300

              310          
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK  
       :::: :::..: :. ::   
CCDS35 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
              310       320

>>CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9               (319 aa)
 initn: 1326 init1: 1326 opt: 1344  Z-score: 959.0  bits: 185.7 E(32554): 4.3e-47
Smith-Waterman score: 1344; 63.6% identity (87.1% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-319)

               10         20        30        40        50         
pF1KE0 MEWENHTILVE-FFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPM
       ::  :.:  :  : :  ::.::.::  :::::..::.:::::::.:::..::: .:::::
CCDS65 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 YFFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMA
       :::::::::::::.::.:.: .: :::. ..:::.:.::::: :..::. :::.::.:::
CCDS65 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 FDRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTC
       ::::::::::::: .:::: ::.::::.:: ::.. :.:.. ...::::: .:.::::::
CCDS65 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 EILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASS
       :::::.:::::::: : . : :....:. .:.:.:  ::..::..:..: :.:::.:. :
CCDS65 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVFS
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 TCSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLR
       ::::::::::.::::..::: :::::.....:  : .::.: .::::.:::.::.:::::
CCDS65 TCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSLR
              250       260       270       280       290       300

     300       310        
pF1KE0 NKDVKEAVKHLLNRRFFSK
       ::::: ::..::  . :..
CCDS65 NKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
              310         

>>CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9            (346 aa)
 initn: 1324 init1: 1119 opt: 1263  Z-score: 902.7  bits: 175.4 E(32554): 5.9e-44
Smith-Waterman score: 1263; 59.7% identity (87.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:33-341)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVL
                                     :: .:.. ..:::: ::: .:.:.:..:.:
CCDS35 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
             10        20        30        40        50        60  

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 IFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMYFFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERK
        .:::..:::::. ::.:.::: .::::::::::::::::::::..:::  :. :.::::
CCDS35 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
             70        80        90       100       110       120  

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 TISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWI
       .::. :::.:: ..:..:.::::::..::.:.:::::::::: :::.   :: ::: :::
CCDS35 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
            130       140       150       160       170       180  

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 IGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCEILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTP
       :: ..: .:.:....:::: ::.:.:.::::::..::.:.::. : .:: :.. . ..  
CCDS35 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
            190       200       210       220       230       240  

              220       230       240       250       260       270
pF1KE0 LLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASSTCSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNS
       ::::..::..:. ::..:. .:::.:: ::::::  :::.:::. ::::::::::.:   
CCDS35 LLLIFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNT---
            250       260       270       280       290            

              280       290       300       310          
pF1KE0 DDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRNKDVKEAVKHLLNRRFFSK  
          ...:.::.. :::..::.::.:::::::.::::::..:.:..     
CCDS35 ---NTSDEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
        300       310       320       330       340      

>>CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9               (316 aa)
 initn: 1202 init1: 686 opt: 1179  Z-score: 845.0  bits: 164.6 E(32554): 9.5e-41
Smith-Waterman score: 1179; 56.9% identity (85.9% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
       :. :: ::   :::.:.: .: ::...::. ..::.. ::::.:::::.::: .:.::::
CCDS67 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       .:::::::.:::::..:.:. ::..:: .::: .:::::::.:.::::.::::::..::.
CCDS67 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       :::::::::::: :::.. . . ::. ::. : ... ... :..:.:.: .:.:.:::::
CCDS67 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLC-GNLIDHFTCE
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       ::::.::::..    . ::::.. :..  :.::. .:: .:. .:..:.:.:::.:: ::
CCDS67 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       :.:::::::..::. : ::.::.:.   :.. .:   ::::..:::.:::.::.::::::
CCDS67 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSS---NAQKID---KIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRN
     240       250       260          270          280       290   

              310             
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK     
       :.::.:.:.::..          
CCDS67 KEVKDAMKKLLGKITLHQTHEHL
           300       310      

>>CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9            (319 aa)
 initn: 1159 init1: 988 opt: 1121  Z-score: 804.9  bits: 157.2 E(32554): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 1121; 54.0% identity (82.7% similar) in 313 aa overlap (5-317:5-311)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
           : : .  ::. :.  .:......:.. ..::.. ::::  :: :.::: :::::::
CCDS35 MFPANWTSVKVFFFLGFFHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
       .::.::::::: :.....   :..:.: :.:::.::::.::.:.::::.:::::: :::.
CCDS35 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQMYLSLAMGSTECVLLPMMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
       :::::::::::::.::.. . : .:::::. : ... :. . :. : .: :.::::::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPVIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
       :::..::.:.: :  ..:::: ..:..  :.::: .::..:..::..::: :::::: ::
CCDS35 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
       :.::: ::..:::: : :..::..   ..:...:   :.... :. .:::.::.::::::
CCDS35 CTAHLMVVVLFYGTALSMHLKPSA---VDSQEID---KFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRN
              250       260          270          280       290    

              310               
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK       
       :.:: :.:.:: :  :.        
CCDS35 KEVKVALKKLLIRNHFNTAFISILK
          300       310         




318 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:48:35 2016 done: Sat Nov  5 03:48:35 2016
 Total Scan time:  2.340 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com