Result of FASTA (omim) for
pF1KE0875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0875, 347 aa
1>>>pF1KE0875 347 - 347 aa - 347 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3744+/-0.000594; mu= 22.1014+/- 0.037
mean_var=116.4360+/-32.861, 0's: 0 Z-trim(106.3): 319 B-trim: 1130 in 1/46
Lambda= 0.118859
statistics sampled from 13935 (14375) to 13935 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.486), E-opt: 0.2 (0.169), width: 16
Scan time: 7.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 995 182.6 9.6e-46
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 974 179.1 1.2e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 974 179.1 1.2e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 974 179.1 1.2e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 964 177.3 3.8e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 946 174.2 3.2e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 942 173.5 5.1e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 922 170.1 5.7e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 903 166.9 5.4e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 900 166.4 7.7e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 887 164.1 3.6e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 864 160.2 5.7e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 862 159.9 7.2e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 861 159.7 7.9e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 861 159.7 7.9e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 855 158.6 1.6e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 843 156.6 6.7e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 830 154.4 3.2e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 795 148.3 2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 649 123.3 6.9e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 569 109.6 9.5e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 561 108.2 2.5e-23
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 218 49.5 1.3e-05
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 218 49.5 1.3e-05
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 218 49.6 1.4e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 218 49.6 1.4e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 218 49.6 1.4e-05
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 218 49.6 1.4e-05
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 218 49.6 1.4e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 218 49.6 1.4e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 201 46.6 9.9e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 199 46.2 0.00012
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 196 45.9 0.0002
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 196 45.9 0.00021
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 193 45.3 0.00027
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 193 45.3 0.00028
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 191 44.9 0.00032
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 191 44.9 0.00034
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 191 45.0 0.00036
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 191 45.0 0.00036
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 191 45.0 0.00036
XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 182 43.4 0.00099
NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 182 43.4 0.00099
XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 182 43.4 0.00099
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 180 42.9 0.0011
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 177 42.6 0.0019
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 173 41.7 0.0026
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 171 41.4 0.0034
NP_940799 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 366) 170 41.3 0.004
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 170 41.3 0.0041
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 975 init1: 859 opt: 995 Z-score: 942.2 bits: 182.6 E(85289): 9.6e-46
Smith-Waterman score: 995; 45.7% identity (79.6% similar) in 313 aa overlap (29-341:2-308)
10 20 30 40 50 60
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVV
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70 80 90 100 110 120
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NP_001 VLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEK
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 974; 46.6% identity (79.6% similar) in 313 aa overlap (31-343:1-307)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
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pF1KE0 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
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XP_011 EKL------FSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 974; 46.6% identity (79.6% similar) in 313 aa overlap (31-343:1-307)
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pF1KE0 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVL
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pF1KE0 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
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pF1KE0 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
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XP_011 FCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQ
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pF1KE0 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
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XP_011 EKL------FSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 993 init1: 856 opt: 974 Z-score: 922.7 bits: 179.1 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 974; 46.6% identity (79.6% similar) in 313 aa overlap (31-343:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVL
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pF1KE0 ILVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKR
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NP_036 FLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHK
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pF1KE0 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
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NP_036 AIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV
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pF1KE0 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
:: :.: ::: ....::.: :..:.:..::.:::..:::.: : : .:...:....:. :
NP_036 SGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTP
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pF1KE0 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
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NP_036 FCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQ
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pF1KE0 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
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NP_036 EKL------FSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 964; 46.0% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (34-344:2-306)
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pF1KE0 QLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFALILV
.::. . :::::.: .: .: . :...:.
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pF1KE0 MYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKRNIS
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pF1KE0 FSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWLSGG
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..:.::: ...:::: . .. :.::. :...:.: : : : : ...... .::.:: .
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:...:::.: :: :::..:.::::.: : . ::.:.
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 946; 48.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (31-338:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
: .:::: :.:::::::: :. : . : .
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ILVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKR
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NP_003 LLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
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NP_003 VIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
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NP_003 SGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
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NP_003 VFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSS-----
220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
: : .: .:.::..:::::::..:::::::::::..
NP_003 -KQQ--EKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
270 280 290 300
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 941 init1: 854 opt: 942 Z-score: 893.3 bits: 173.5 E(85289): 5.1e-43
Smith-Waterman score: 942; 46.2% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (34-334:2-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 QLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFALILV
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKRNIS
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XP_011 SYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTIS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWLSGG
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XP_011 FLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 INSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLPLMV
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XP_011 VESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGEEKL
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XP_011 ILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNP--YAQER-
220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 QALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
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XP_011 ---GKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
270 280 290 300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 952 init1: 795 opt: 922 Z-score: 874.5 bits: 170.1 E(85289): 5.7e-42
Smith-Waterman score: 922; 44.1% identity (77.8% similar) in 311 aa overlap (35-344:7-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFALILVM
: :::.::.:::. :...:: : ..:..
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLVILIGN-GVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKRNIS
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NP_006 YAIILIGNIGLMLLIRI-DPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWLSGG
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NP_006 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 INSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLPLMV
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NP_006 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 IFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGEEKL
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NP_006 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSY--LYSPN--
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KE0 QALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
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NP_006 --TDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 914 init1: 769 opt: 903 Z-score: 856.9 bits: 166.9 E(85289): 5.4e-41
Smith-Waterman score: 903; 42.0% identity (76.0% similar) in 317 aa overlap (31-346:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
: : . ..:.:::.: :..: . :..
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ILVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKR
::. ::. :.:: ..:..: .: :.::::::::..:::::. .:.::.:. : .: . .
NP_001 ILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
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NP_001 TISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
: :: ... ...::: ::.. ..:: :. :....::.. :. . .. .. :
NP_001 CGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
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NP_001 LVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQP------GA
220 230 240 250 260
310 320 330 340
pF1KE0 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAV-KYLLNKKPIH
. : .. :::..:::.:::..:.:::..::.:. . ::.:. .
NP_001 SSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGALGRLLLGKRELGKE
270 280 290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 927 init1: 761 opt: 900 Z-score: 854.2 bits: 166.4 E(85289): 7.7e-41
Smith-Waterman score: 900; 42.4% identity (78.5% similar) in 316 aa overlap (31-344:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
: . : : ..::.::::. ...:. : .
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLF
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 ILVMYLVILIGN-GVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKK
.::.: . ..:: :.... : ::..::::::::.::::.:.: ... .:. :..:.:.:
NP_003 FLVIYTLTVLGNLGMILLIRI-DSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEK
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSW
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NP_003 KTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAF
90 100 110 120 130 140
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pF1KE0 LSGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLN-IITMVISNMAFLV
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NP_003 AAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IV
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 LPLMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLI
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NP_003 GTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]