Result of FASTA (omim) for
pF1KE0876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0876, 346 aa
1>>>pF1KE0876 346 - 346 aa - 346 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9415+/-0.000595; mu= 19.1405+/- 0.037
mean_var=98.6722+/-24.393, 0's: 0 Z-trim(106.4): 283 B-trim: 973 in 1/49
Lambda= 0.129115
statistics sampled from 14139 (14495) to 14139 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 7.350
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1001 197.7 2.8e-50
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1001 197.7 2.8e-50
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1001 197.7 2.8e-50
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 986 194.9 1.9e-49
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 959 189.9 6.2e-48
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 957 189.5 8.2e-48
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 956 189.3 9.3e-48
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 949 188.0 2.3e-47
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 924 183.4 5.9e-46
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 908 180.4 4.5e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 903 179.5 8.8e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 894 177.8 2.8e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 892 177.4 3.6e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 892 177.4 3.6e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 873 173.9 4.3e-43
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 870 173.3 6.2e-43
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 853 170.1 5.5e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 848 169.2 1e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 844 168.5 1.8e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 793 159.0 1.3e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 605 124.0 4.5e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 535 110.9 3.8e-24
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 199 48.4 2.7e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 196 47.8 3.9e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 185 45.8 0.00018
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 184 45.5 0.00018
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 185 45.9 0.00019
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 184 45.6 0.00019
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 183 45.4 0.00022
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 180 44.9 0.00034
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 176 44.2 0.00062
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 174 43.7 0.00068
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 175 44.0 0.0007
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 172 43.4 0.00098
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 170 42.9 0.0011
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 42.8 0.0014
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 42.8 0.0014
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 169 42.8 0.0014
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 169 42.8 0.0014
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 169 42.9 0.0014
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 42.9 0.0015
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 42.9 0.0015
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 169 42.9 0.0015
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 169 42.9 0.0015
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 169 42.9 0.0015
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 169 42.9 0.0015
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 169 42.9 0.0015
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 169 42.9 0.0015
XP_016861688 (OMIM: 600552) PREDICTED: chemokine X ( 333) 165 42.0 0.0022
XP_016861687 (OMIM: 600552) PREDICTED: chemokine X ( 333) 165 42.0 0.0022
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
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XP_011 FLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHK
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310 320 330 340
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XP_011 EKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
: : : . ..::.:.:::. . .. ::.:
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVL
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pF1KE0 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
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XP_011 FLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHK
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pF1KE0 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
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XP_011 AIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV
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pF1KE0 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
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XP_011 SGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTP
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pF1KE0 LLLIFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTS
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XP_011 FCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQ
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310 320 330 340
pF1KE0 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
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XP_011 EKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
280 290 300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1001; 48.9% identity (79.3% similar) in 305 aa overlap (33-337:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
: : : . ..::.:.:::. . .. ::.:
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVL
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pF1KE0 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
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NP_036 FLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHK
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pF1KE0 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
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NP_036 AIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV
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pF1KE0 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
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NP_036 SGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTP
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pF1KE0 LLLIFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTS
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NP_036 FCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQ
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pF1KE0 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
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NP_036 EKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 986; 45.0% identity (78.0% similar) in 309 aa overlap (37-345:3-311)
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pF1KE0 FDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLLCLIM
: :. :.:.:.:..: :. ::.. :
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pF1KE0 YMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERKSISF
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pF1KE0 IGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWIIGCL
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NP_009 LVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFF
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NP_009 GLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
280 290 300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 959; 46.3% identity (77.9% similar) in 294 aa overlap (37-330:3-296)
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pF1KE0 FDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLLCLIM
: :. :.:.:.:..: :. ::.. :
XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTS
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pF1KE0 YMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERKSISF
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XP_011 YLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISF
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pF1KE0 IGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWIIGCL
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XP_011 LDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLV
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pF1KE0 TSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVILLLLI
:..:: :. :::: . .: ..::. ::..: : : . : . ..:... ::. : ::
XP_011 ESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLI
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pF1KE0 FISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTSDEII
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XP_011 LVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFF
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pF1KE0 GLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
:: :.: .: :::.::.::::: :
XP_011 GLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
280 290 300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 964 init1: 944 opt: 957 Z-score: 979.4 bits: 189.5 E(85289): 8.2e-48
Smith-Waterman score: 957; 45.8% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (37-337:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 FDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLLCLIM
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERKSISF
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NP_001 YLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWIIGCL
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NP_001 AGCMIQLYFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVILLLLI
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NP_001 NSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILI
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pF1KE0 FISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTSDEII
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NP_001 LTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFI
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NP_001 ALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 956 init1: 956 opt: 956 Z-score: 978.4 bits: 189.3 E(85289): 9.3e-48
Smith-Waterman score: 956; 45.9% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (33-339:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLF
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NP_003 FLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKK
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NP_003 LLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQ
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pF1KE0 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
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NP_003 DKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 949 init1: 949 opt: 949 Z-score: 971.3 bits: 188.0 E(85289): 2.3e-47
Smith-Waterman score: 949; 46.7% identity (76.5% similar) in 302 aa overlap (36-337:6-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 DFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLLCLI
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLT
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NP_006 LYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSIS
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pF1KE0 FIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWIIGC
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NP_006 YYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGN
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pF1KE0 LTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVILLLL
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NP_006 MSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFII
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pF1KE0 IFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTSDEI
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NP_006 IIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKI
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pF1KE0 IGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
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NP_006 ISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 942 init1: 872 opt: 924 Z-score: 946.1 bits: 183.4 E(85289): 5.9e-46
Smith-Waterman score: 924; 46.5% identity (75.0% similar) in 312 aa overlap (33-343:1-312)
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFL
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pF1KE0 LCLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSER
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NP_835 TFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQD
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pF1KE0 KSISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSW
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NP_835 TTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASW
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pF1KE0 IIGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVI
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NP_835 FPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMI
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NP_835 PCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPE
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NP_835 SKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
280 290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 884 init1: 773 opt: 908 Z-score: 930.1 bits: 180.4 E(85289): 4.5e-45
Smith-Waterman score: 908; 45.0% identity (76.7% similar) in 309 aa overlap (33-341:1-307)
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pF1KE0 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIV
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NP_003 LLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKK
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pF1KE0 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
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NP_003 VIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWT
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pF1KE0 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
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NP_003 SGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]