Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0878
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0878, 307 aa
1>>>pF1KE0878 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6227+/-0.00139; mu= 13.7694+/- 0.082
mean_var=189.9097+/-71.693, 0's: 0 Z-trim(100.1): 416 B-trim: 360 in 1/45
Lambda= 0.093068
statistics sampled from 5458 (5977) to 5458 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 1967 277.7 7.6e-75
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 1123 164.5 1e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 941 140.0 2.3e-33
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 923 137.6 1.2e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 918 136.9 2e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 910 135.8 4e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 909 135.7 4.5e-32
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 908 135.6 4.9e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 906 135.3 5.8e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 905 135.2 6.5e-32
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 904 135.1 7.2e-32
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 902 134.8 8.5e-32
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 901 134.6 9.4e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 898 134.2 1.2e-31
CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 894 133.7 1.8e-31
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 892 133.4 2.2e-31
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 891 133.3 2.4e-31
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 889 133.0 2.9e-31
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 889 133.0 2.9e-31
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 887 132.7 3.5e-31
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 887 132.8 3.5e-31
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 887 132.8 3.5e-31
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 886 132.6 3.8e-31
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 880 131.8 6.6e-31
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 879 131.7 7.4e-31
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 878 131.5 7.9e-31
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 878 131.5 8e-31
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 877 131.4 8.7e-31
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 877 131.4 8.8e-31
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 875 131.1 1e-30
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 875 131.2 1.1e-30
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 874 131.0 1.1e-30
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 871 130.6 1.5e-30
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 871 130.6 1.5e-30
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 871 130.6 1.5e-30
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 867 130.1 2.2e-30
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 867 130.1 2.2e-30
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 864 129.7 2.9e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 864 129.7 2.9e-30
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 863 129.5 3.2e-30
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 863 129.5 3.2e-30
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 862 129.4 3.5e-30
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 861 129.2 3.8e-30
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 861 129.3 3.9e-30
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 860 129.1 4.2e-30
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 858 128.8 5.1e-30
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 858 128.9 5.1e-30
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 858 128.9 5.3e-30
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 857 128.7 5.6e-30
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 857 128.7 5.6e-30
>>CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 (307 aa)
initn: 1967 init1: 1967 opt: 1967 Z-score: 1457.2 bits: 277.7 E(32554): 7.6e-75
Smith-Waterman score: 1967; 99.0% identity (99.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAIIYNNTLHTPMYVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS31 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVLAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPP
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILCIRTVEGKRKAFSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS31 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VFAFLKH
:::::::
CCDS31 VFAFLKH
>>CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 (328 aa)
initn: 1174 init1: 1112 opt: 1123 Z-score: 844.5 bits: 164.5 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 1123; 50.3% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (2-307:23-328)
10 20 30
pF1KE0 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGN
:...:::::. :....:: . ..: ::..: :. ::
CCDS31 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 MLIIIAIIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLF
.:: .:: .: ::.::: :::.::..:::::.::.:: :..... :..:::.:::.::.
CCDS31 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVLAIAVTNSWVHTAL
..::. ..:..:.:.::::::.::: :::::..:.. .: .: . : . ..:. .::.:
CCDS31 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 IMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFII
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CCDS31 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VAILCIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVT
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CCDS31 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE0 PTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
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CCDS31 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
310 320
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1006 init1: 927 opt: 941 Z-score: 712.5 bits: 140.0 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 941; 44.3% identity (78.7% similar) in 300 aa overlap (2-301:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAIIYNNTLHTPMY
:....:::::::... ::: ..: .:...:. .. ::.:::.. . . ::::::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVLAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
:::.::: ::.::.:... .: : . : . :: :::.: . : ::: : :..:::.
CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILCIRTVEGKRKAFST
::::: :::. . .::. . . . .. :. .:: :: .:: :.. ::.::::::
CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
:.:::..: :.:. .:.::.:: :.:....:..:..::..::: :::..:...:.... .
CCDS46 CASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 IRKVFAFLKH
.. .
CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
310 320
>>CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 (309 aa)
initn: 914 init1: 797 opt: 923 Z-score: 699.6 bits: 137.6 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 923; 45.2% identity (78.0% similar) in 305 aa overlap (1-303:4-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNH-SVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAIIYNNTLHTPM
.:: : :.:::.:::...:: : .:..:::::::.. ::.:::.:: .: :.:::
CCDS35 MERINHTSSVSEFILLGLSSRPEDQKTLFVLFLIVYLVTITGNLLIILAIRFNPHLQTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLG-AEMVLFTTM
: :: :...:: :::..:::: ..:. ..:::::::..:.. : ..:: .. :...:
CCDS35 YFFLSFLSLTDICFTTSVVPKMLMNFLSEKKTISYAGCLTQMY-FLYALGNSDSCLLAVM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVLAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFF
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CCDS35 AFDRYVAVCDPFHYVTTMSHHHCVLLVAFSCSFPHLHSLLHTLLLNRLTFCDSNVIHHFL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILCIRTVEGKRKAF
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CCDS35 CDLSPVLKLSCSSIFVNEIVQMTEAPIVLVTRFLCIAFSYIRILTTVLKIPSTSGKRKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
:::. .::::::.:. .. .:..: :.:. .:.:.. .::... :::..::..:....
CCDS35 STCGFYLTVVTLFYGSIFCVYLQPPSTYAV-KDHVATIVYTVLSSMLNPFIYSLRNKDLK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 AGIRKVFAFLKH
:.::...
CCDS35 QGLRKLMSKRS
300
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 988 init1: 909 opt: 918 Z-score: 695.8 bits: 136.9 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 918; 42.5% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (2-302:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAIIYNNTLHTPMY
:... :::...:.: :. .:: ::.:: ....::.:.:: . :..:. :::
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVLAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
:::.::: :: :.:.:....:: .. .. . :.: ::. : .::.::: : ..::::.
CCDS31 DRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILCIRTVEGKRKAFST
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CCDS31 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
:.::: .:::.:. ... :..:..::... :::::..::.: : .::..:::.:.... .
CCDS31 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 IRKVFAFLKH
..:..
CCDS31 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 910 init1: 910 opt: 910 Z-score: 690.1 bits: 135.8 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 910; 42.3% identity (75.3% similar) in 300 aa overlap (2-301:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAIIYNNTLHTPMY
:.: :.::..:::...:. : ..:.::: .::.. :::.:::... .. ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
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310
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CCDS31 STCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIK
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CCDS31 NAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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CCDS11 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
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CCDS11 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
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CCDS31 EVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFS
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CCDS31 ALRKLLSGKL
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CCDS41 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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CCDS41 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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