Result of FASTA (omim) for
pF1KE0883
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0883, 314 aa
1>>>pF1KE0883 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0203+/-0.000444; mu= 17.6981+/- 0.028
mean_var=120.7926+/-35.705, 0's: 0 Z-trim(110.0): 404 B-trim: 1077 in 1/52
Lambda= 0.116695
statistics sampled from 17726 (18316) to 17726 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 7.210
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1252 222.6 8.3e-58
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1252 222.6 8.3e-58
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1252 222.6 8.4e-58
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1082 194.0 3.4e-49
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1007 181.3 2.2e-45
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 932 168.7 1.4e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 926 167.7 2.8e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 904 164.0 3.6e-40
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 892 162.0 1.4e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 877 159.4 8.4e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 855 155.7 1.1e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 854 155.6 1.2e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 850 154.9 2e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 846 154.2 3.1e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 846 154.2 3.2e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 846 154.2 3.2e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 846 154.2 3.2e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 830 151.5 2e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 826 150.9 3.2e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 794 145.5 1.4e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 573 108.3 2.2e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 551 104.6 2.8e-22
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 228 50.2 6.8e-06
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 222 49.4 1.6e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 220 49.0 2e-05
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 217 48.5 2.8e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 215 48.0 3e-05
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 213 47.7 3.8e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 212 47.5 4.3e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 212 47.6 4.8e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 212 47.6 4.8e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 211 47.4 4.9e-05
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 209 47.1 6.8e-05
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 204 46.3 0.00012
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 201 45.7 0.00016
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 200 45.6 0.00019
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 200 45.6 0.00019
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 200 45.6 0.00019
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 200 45.6 0.0002
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 200 45.6 0.0002
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 198 45.1 0.00021
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 198 45.1 0.00022
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 198 45.2 0.00022
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 198 45.2 0.00023
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 198 45.2 0.00024
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 198 45.2 0.00024
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 198 45.2 0.00024
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 198 45.3 0.00026
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 198 45.3 0.00026
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 198 45.4 0.00027
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1252 Z-score: 1158.8 bits: 222.6 E(85289): 8.3e-58
Smith-Waterman score: 1252; 60.0% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1252 Z-score: 1158.8 bits: 222.6 E(85289): 8.3e-58
Smith-Waterman score: 1252; 60.0% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:..
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1240 init1: 1240 opt: 1252 Z-score: 1158.7 bits: 222.6 E(85289): 8.4e-58
Smith-Waterman score: 1252; 60.0% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIG
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FDSHLHSPMYFFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNM
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE0 DSLLLCVMAYDRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCA
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE0 SNIIHHFFCDLNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TQGKQRAVSTCSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 TLRNRDMKRGLQKMLLKCTVFQQQ
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1129 init1: 1082 opt: 1082 Z-score: 1004.1 bits: 194.0 E(85289): 3.4e-49
Smith-Waterman score: 1082; 51.1% identity (81.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
.:...::.. .: ...... .::.. :.. :: ::. : :... ..::.:: .: ::
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:...:
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1016 init1: 870 opt: 1007 Z-score: 935.9 bits: 181.3 E(85289): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 1007; 47.2% identity (81.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTY-SVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
: ..: :
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 995 init1: 932 opt: 932 Z-score: 867.6 bits: 168.7 E(85289): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 932; 43.0% identity (75.8% similar) in 302 aa overlap (4-305:6-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYFFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CDLNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAV
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 RGLQKMLLKCTVFQQQ
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 948 init1: 905 opt: 926 Z-score: 862.2 bits: 167.7 E(85289): 2.8e-41
Smith-Waterman score: 926; 43.0% identity (78.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
: ...
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 941 init1: 898 opt: 904 Z-score: 842.3 bits: 164.0 E(85289): 3.6e-40
Smith-Waterman score: 904; 42.9% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
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pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
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310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
..:..
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 854 init1: 765 opt: 892 Z-score: 831.3 bits: 162.0 E(85289): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 892; 45.7% identity (76.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
:::::::.::.: :. .::::..: : : ... :..: .: . .:: : ::::.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE0 LNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLLALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAVST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 CSCHLSVVVLFYGTAIAVYFSPSSPHMPESDTLSTIMYSMVAPMLNPFIYTLRNRDMKRG
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSV--SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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310
pF1KE0 LQKMLLKCTVFQQQ
:.:.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 898 init1: 848 opt: 877 Z-score: 817.6 bits: 159.4 E(85289): 8.4e-39
Smith-Waterman score: 877; 42.2% identity (74.5% similar) in 306 aa overlap (5-308:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEKRNLTVVREFVLLGLPSSAEQQHLLSVLFLCMYLATTLGNMLIIATIGFDSHLHSPM
:.: . :.:::. . . ..: ..:: .:... :. .:. : .:::::.::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE0 YDRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE0 DLNPLLQLSCSDVSFNVMIIFAVGGLL-ALTPLVCILVSYGLIFSTVLKITSTQGKQRAV
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NP_001 DMPQLLILSCTD-TFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
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NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
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60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 03:52:36 2016 done: Sat Nov 5 03:52:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]